Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_04s0008g04970.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:4:4457279:4468969:1 gene:VIT_04s0008g04970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGGTACTGCTTGTGCTCAGTACCCGTTTGAAGTGACTGCCCATTTCCAAGAAAAATGT AGGGTTTTACATCCGAAAACGAAGTTCTCAAGCTTTAATTTTCCTCCCAAATTGGATTCT TCGAGAATGAACTTATACCCATGTTCATCTTCCACCACCTCCTCCAAGAGGTATGTTGGT CAAATATGTTCTCTACCTGAGTTTGGTGATTTCTTCTGGGACAGAATCCCAACCCCCATG CTTGACATGGTCGAAAGCCCTATGTGCTTGAAGAATTTGACTCCTAAGGAGCTGAAACAA TTAGCTGATGAAATCCGTGTAGAGTTGTTTTGTATAATGTCAAAAATGCAAAAACCTTTT AAAGCCAGTCTGGCAGTGGTGGAGCTGACTGTTGCAATTCACTACATTTTCCATGCTCCA ATGGACAAGATACTTTGGGATGTGGGGGAAGTGACATATGCACATAAAATTCTCACTGGA AGGCGGGCCCTTATGCATACACTGAGAGAAAGGGGTGGTCTTTCAGGTTTTACATCTCGT TCTGAGAGTGAATATGACCCATTTGGTGCAGGGCATGGATGCAGCAGTATTTCTGCTGGG CTTGGCATGGCGGTTGCTCGAGATTTGAAAGGGAAACGGGAACGTATAGTTACGGTGATT GGCAATGGAACAACTATGGCTGGTCAGGTTTATGAGGCAATGGGCAATGCAGGTTATTTG GACACAAATATGGTAGTAATATTAAATGACAGTCGTCATTCTTTACACCCAAAGCTCGAG GATGGTCAGGCTACACCAATTAACGCTTTATCTAGTACTCTAACCAAGCTCCAGTCAAGT AAATCCTTCCGAAAATTTAGAGAAGCTGCTAAGGGTGTTACCAAGAGAATTGGTAAGGGC ATGCATGAGCTGGCTGCTAAAGTAGATGAGTATGCCCGTGGTATGGTGGGTCCACTGGGA GCAACACTCTTTGAAGAGCTTGGTCTATATTATATTGGCCCTGTTGATGGACACAACATT GAAGATCTCATTTCTGTTTTACAAGGGGTGGCATCTTTGGATCCAACTGGTCCTGTGTTG GTTCATGTAATAACAAAGGAATACCAGGGAGTAGAAGCTAGCCAAAAGAGTATGATTTCA AATGGACATCTGAAAGGTTTCTACACCTCCGAATTATCACCATATCCTCTCCCGAGAATG TATAGTGATTGCTTTGTGGAGGCTTTGGTTAATGAGGCAGAAAAGGACAAAGACATTGTG GTGGTTCATGCAGGAATGGGAATGGAACCACCACTTCAACTATTTCAGGAAAAATTTCCT TATAAATTTTTTGATGTGGGAATGGCGGAGCAACATGCAGTTACATTTTCTGCTGGTTTG GCTTGTGGGGGATTGAAACCATTTTGCATAATCCCATCTACCTTCCTACAGAGAGCTTAT GATCAGGTAGTTCATGATGTGGATCGGCAGAGAATTCCTGTTCGTTTTGCCATTACAAGT GCAGGACTGGTAGGGTCTGATGGTCCCACACGCTGTGGAGCTTTTGACATAACATTCATG TCCTGTTTACCTAACATGATTGTCATGGCACCATCTGATGAAAATGAGCTCATGCACATG GTGGCCACTGCAGCTCATGTTGATGATAGACCAATTTGCTTCCGATATCCTAGGGGCGCC ACTGCTGGAATGAGTAACTCTATATGGAATGGAATTCCCATTGAGATTGGAAAAGGTAAA GTCCTCATAGAGGGTAAAGATGTTGCTCTGCTTGGGTACGGAGTTATGGTTCAGAATTGC CTTAAGGCTTGGTCGCTCCTTTCAGAGCTTGGAATTAGAGTAACTGTTGCTGATGCGAGA TTTTGCAAGCCTCTTGACATCCAGCTTGTTAGAGAGCTCTGTGAAAACCATGCCTTCTTA ATTACTGTTGAGGAAGGCTCTGTTGGAGGGTTTGGATCCCATGTTGCACAATTCATTGCT CTTGATGGAAAGCTGGATGGAAGAATAAAGTGGCGACCCATCGCTCTACCCGACAACTAC ATAGAACAGGCATCACCAGAGGAGCAGCTGGCTATTGCAGGGCTCACCGGCCATCACATT GCTGCAACAGTACTAAGTCTGCTCGGCCGTAACCGTGAAGCTCTCCTGTTAATGCAGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_04s0008g04970.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:4:4457279:4468969:1 gene:VIT_04s0008g04970 transcript:VIT_04s0008g04970.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MGTACAQYPFEVTAHFQEKCRVLHPKTKFSSFNFPPKLDSSRMNLYPCSSSTTSSKRYVG QICSLPEFGDFFWDRIPTPMLDMVESPMCLKNLTPKELKQLADEIRVELFCIMSKMQKPF KASLAVVELTVAIHYIFHAPMDKILWDVGEVTYAHKILTGRRALMHTLRERGGLSGFTSR SESEYDPFGAGHGCSSISAGLGMAVARDLKGKRERIVTVIGNGTTMAGQVYEAMGNAGYL DTNMVVILNDSRHSLHPKLEDGQATPINALSSTLTKLQSSKSFRKFREAAKGVTKRIGKG MHELAAKVDEYARGMVGPLGATLFEELGLYYIGPVDGHNIEDLISVLQGVASLDPTGPVL VHVITKEYQGVEASQKSMISNGHLKGFYTSELSPYPLPRMYSDCFVEALVNEAEKDKDIV VVHAGMGMEPPLQLFQEKFPYKFFDVGMAEQHAVTFSAGLACGGLKPFCIIPSTFLQRAY DQVVHDVDRQRIPVRFAITSAGLVGSDGPTRCGAFDITFMSCLPNMIVMAPSDENELMHM VATAAHVDDRPICFRYPRGATAGMSNSIWNGIPIEIGKGKVLIEGKDVALLGYGVMVQNC LKAWSLLSELGIRVTVADARFCKPLDIQLVRELCENHAFLITVEEGSVGGFGSHVAQFIA LDGKLDGRIKWRPIALPDNYIEQASPEEQLAIAGLTGHHIAATVLSLLGRNREALLLMQ

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_04s0008g04970.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:4:4457279:4468969:1 gene:VIT_04s0008g04970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGGTACTGCTTGTGCTCAGTACCCGTTTGAAGTGACTGCCCATTTCCAAGAAAAATGT AGGGTTTTACATCCGAAAACGAAGTTCTCAAGCTTTAATTTTCCTCCCAAATTGGATTCT TCGAGAATGAACTTATACCCATGTTCATCTTCCACCACCTCCTCCAAGAGGTATGTTGGT CAAATATGTTCTCTACCTGAGTTTGGTGATTTCTTCTGGGACAGAATCCCAACCCCCATG CTTGACATGGTCGAAAGCCCTATGTGCTTGAAGAATTTGACTCCTAAGGAGCTGAAACAA TTAGCTGATGAAATCCGTGTAGAGTTGTTTTGTATAATGTCAAAAATGCAAAAACCTTTT AAAGCCAGTCTGGCAGTGGTGGAGCTGACTGTTGCAATTCACTACATTTTCCATGCTCCA ATGGACAAGATACTTTGGGATGTGGGGGAAGTGACATATGCACATAAAATTCTCACTGGA AGGCGGGCCCTTATGCATACACTGAGAGAAAGGGGTGGTCTTTCAGGTTTTACATCTCGT TCTGAGAGTGAATATGACCCATTTGGTGCAGGGCATGGATGCAGCAGTATTTCTGCTGGG CTTGGCATGGCGGTTGCTCGAGATTTGAAAGGGAAACGGGAACGTATAGTTACGGTGATT GGCAATGGAACAACTATGGCTGGTCAGGTTTATGAGGCAATGGGCAATGCAGGTTATTTG GACACAAATATGGTAGTAATATTAAATGACAGTCGTCATTCTTTACACCCAAAGCTCGAG GATGGTCAGGCTACACCAATTAACGCTTTATCTAGTACTCTAACCAAGCTCCAGTCAAGT AAATCCTTCCGAAAATTTAGAGAAGCTGCTAAGGGTGTTACCAAGAGAATTGGTAAGGGC ATGCATGAGCTGGCTGCTAAAGTAGATGAGTATGCCCGTGGTATGGTGGGTCCACTGGGA GCAACACTCTTTGAAGAGCTTGGTCTATATTATATTGGCCCTGTTGATGGACACAACATT GAAGATCTCATTTCTGTTTTACAAGGGGTGGCATCTTTGGATCCAACTGGTCCTGTGTTG GTTCATGTAATAACAAAGGAATACCAGGGAGTAGAAGCTAGCCAAAAGAGTATGATTTCA AATGGACATCTGAAAGGTTTCTACACCTCCGAATTATCACCATATCCTCTCCCGAGAATG TATAGTGATTGCTTTGTGGAGGCTTTGGTTAATGAGGCAGAAAAGGACAAAGACATTGTG GTGGTTCATGCAGGAATGGGAATGGAACCACCACTTCAACTATTTCAGGAAAAATTTCCT TATAAATTTTTTGATGTGGGAATGGCGGAGCAACATGCAGTTACATTTTCTGCTGGTTTG GCTTGTGGGGGATTGAAACCATTTTGCATAATCCCATCTACCTTCCTACAGAGAGCTTAT GATCAGGTAGTTCATGATGTGGATCGGCAGAGAATTCCTGTTCGTTTTGCCATTACAAGT GCAGGACTGGTAGGGTCTGATGGTCCCACACGCTGTGGAGCTTTTGACATAACATTCATG TCCTGTTTACCTAACATGATTGTCATGGCACCATCTGATGAAAATGAGCTCATGCACATG GTGGCCACTGCAGCTCATGTTGATGATAGACCAATTTGCTTCCGATATCCTAGGGGCGCC ACTGCTGGAATGAGTAACTCTATATGGAATGGAATTCCCATTGAGATTGGAAAAGGTAAA GTCCTCATAGAGGGTAAAGATGTTGCTCTGCTTGGGTACGGAGTTATGGTTCAGAATTGC CTTAAGGCTTGGTCGCTCCTTTCAGAGCTTGGAATTAGAGTAACTGTTGCTGATGCGAGA TTTTGCAAGCCTCTTGACATCCAGCTTGTTAGAGAGCTCTGTGAAAACCATGCCTTCTTA ATTACTGTTGAGGAAGGCTCTGTTGGAGGGTTTGGATCCCATGTTGCACAATTCATTGCT CTTGATGGAAAGCTGGATGGAAGAATAAAGTGGCGACCCATCGCTCTACCCGACAACTAC ATAGAACAGGCATCACCAGAGGAGCAGCTGGCTATTGCAGGGCTCACCGGCCATCACATT GCTGCAACAGTACTAAGTCTGCTCGGCCGTAACCGTGAAGCTCTCCTGTTAATGCAGTAG AGATCTGGCCACCAGTTGCAAAAACACAAGAGACTGAAGCTGCCTGGGAGGATTGATTGA AATTGAAGAAGAGCATTAGTTTTTGTGCCATATAGTTTTGTTTTGTAGGTACCATGAATA TTACCTTAGTGATGGTTTCTTAGCCTAGTTTAATAATACTCTTTGTGATCCCATGGAAAC TACTTCAGGTCTTCTGAGCACCTAAATCAATGATGATTTCAGTGGGAGACCGACCACCTT CTCCCTTCTCA