Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_04s0008g04120.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:4:3451691:3463259:1 gene:VIT_04s0008g04120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGACTGGTGGTGATAATTCACAATTCTCTCTCGTCACATCCAATGGCTACTGCGAAGGA GTCCTGGCCCCACCAGATAGAGGCACCTCCCTTGAGCTCTTTCCATCCCATCTCAGCCAC ATTCCTCTTCAGTTAGAGAGCTTTCATGGAGTTTTACCTCCTTCCCCTTCTGGCATTTCT CTCCCCATTATATATATCCATCAATTGATTTCATTTCTTCATACCAACGTACAGCTTAGC TTGCGGTTCACAGCTTCTATGGAGCTTCATCTTCTTCCCATTCTAACTTGCCTCTCTGTG AGACTTCGCTTTTACCTTTCTTTTGTTTTTATTTTTCTAACCACTCAAAAACAAGGGGAT GCTAGTCCAATTGCTGGATATGATGCAGTCTATGGAAGCACTCAAAAACAAAGGGATGCT AGTCCGATTGCTGGATATGATGCAGTCTATGGAAGCACTCAAAAACAAGGGGATGCTAGT CCAATTGCTGGATATGATGCAGTCTATGGAAGCACGAAAAAACAGGGGGATGCTAGTCCA ATTGCTGGATATGATGCAGTCTATGGAAGCACGAAAAAACAAGGGAATGCTAGTCCAATT GCTGGATATGATGCAGTCTATGGAAGCACTCGAAAACAAGGGGATGCTAGTCCAATTGCT GGATATGCTGCAGTCTATGGAAGCACGAAAAAACAAGGGGATGCCAGTCCAATTTCTGGA TATGATGCAGTCTATGGAACCTCTCAAAAAGCAGAAGGAAGTTCCATCAATGTTCACAAG GATGCTAGCTCAATTGCCGGATATGATGCAGTCTATGGAACCCCTAAAAAAGCAATAGAA AGTTCCACCAAAGCTCACAAGGATGCTAGCCAAATTGCTGGATATGATGCAGTCTATGGA AACTCTCAACAAAAAGCAGGAGGAAGTTCTATCAATGCTCACAAAGATTCTAGCCCAGTT GCGAGTTATGGTGCAGTTAATGTGTTTTTGGAAAAAGACCTGCATCCTGGGACAAAAATG GCTGTGCGCTTCACAAAAACCTCAAGTGCAGCTCATTTCTTGCCCCATCAAGTTGCTGAA TCCATACCTTTTTCATCAAACAAGCTACCAGAAATTTTGAAGCGATTCTCCGTGAAAGAA AACTCCGCAGAAGCCCAGATGATACAGAAAACAATAAAACAATGTGAGACACCTGCCATA GTAGGAGAAGTTAAGTACTGTGCGAGGTCCTTGGAGTCCCTAATTGATTTCAGCACTTCA AGGCTGGGAAAAAACATTCGAGTTCTCTCCAATGAGGTGGAAGCGGATATCCAGGAGTAT AAATTTGGAGAGGGAGTGAAGATGGTGGGAGAGAAATCAGTGGTGTGCCACCAGCTGAAC TATCCATATGCTGTGGCATTCTGCCATACACTTCACATGACAAAGATTTACATGGTTCCA TCGGTGGGTGCTGATGGAACCGGAGTTGAAGCTGTAGCAGTTTGTCACCGGGACACTTCA ACTTGGGACCCAAAGGCTTTGGTCTTTCAAAGGCTCAAAGTTAAGCCAGGAACTTTGCCC ATCTGCCATTTCCTTCCCAATGGTCATATTGTCTGGGTTCCAAAATTTAATGGAGTTTCA TCTCCTTCCCATTCTGACTTCTTTCTTGGTGACTGGTGGTGGTCAGCCATGCTTATTCTC TACCTTCCGAGGTTGATTGGAAGTCGGCTTTGCCTAACACTCCCTTCCCGAAAGCTATGC GGAATCTCTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_04s0008g04120.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:4:3451691:3463259:1 gene:VIT_04s0008g04120 transcript:VIT_04s0008g04120.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MTGGDNSQFSLVTSNGYCEGVLAPPDRGTSLELFPSHLSHIPLQLESFHGVLPPSPSGIS LPIIYIHQLISFLHTNVQLSLRFTASMELHLLPILTCLSVRLRFYLSFVFIFLTTQKQGD ASPIAGYDAVYGSTQKQRDASPIAGYDAVYGSTQKQGDASPIAGYDAVYGSTKKQGDASP IAGYDAVYGSTKKQGNASPIAGYDAVYGSTRKQGDASPIAGYAAVYGSTKKQGDASPISG YDAVYGTSQKAEGSSINVHKDASSIAGYDAVYGTPKKAIESSTKAHKDASQIAGYDAVYG NSQQKAGGSSINAHKDSSPVASYGAVNVFLEKDLHPGTKMAVRFTKTSSAAHFLPHQVAE SIPFSSNKLPEILKRFSVKENSAEAQMIQKTIKQCETPAIVGEVKYCARSLESLIDFSTS RLGKNIRVLSNEVEADIQEYKFGEGVKMVGEKSVVCHQLNYPYAVAFCHTLHMTKIYMVP SVGADGTGVEAVAVCHRDTSTWDPKALVFQRLKVKPGTLPICHFLPNGHIVWVPKFNGVS SPSHSDFFLGDWWWSAMLILYLPRLIGSRLCLTLPSRKLCGIS

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_04s0008g04120.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:4:3451691:3463259:1 gene:VIT_04s0008g04120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGACTGGTGGTGATAATTCACAATTCTCTCTCGTCACATCCAATGGCTACTGCGAAGGA GTCCTGGCCCCACCAGATAGAGGCACCTCCCTTGAGCTCTTTCCATCCCATCTCAGCCAC ATTCCTCTTCAGTTAGAGAGCTTTCATGGAGTTTTACCTCCTTCCCCTTCTGGCATTTCT CTCCCCATTATATATATCCATCAATTGATTTCATTTCTTCATACCAACGTACAGCTTAGC TTGCGGTTCACAGCTTCTATGGAGCTTCATCTTCTTCCCATTCTAACTTGCCTCTCTGTG AGACTTCGCTTTTACCTTTCTTTTGTTTTTATTTTTCTAACCACTCAAAAACAAGGGGAT GCTAGTCCAATTGCTGGATATGATGCAGTCTATGGAAGCACTCAAAAACAAAGGGATGCT AGTCCGATTGCTGGATATGATGCAGTCTATGGAAGCACTCAAAAACAAGGGGATGCTAGT CCAATTGCTGGATATGATGCAGTCTATGGAAGCACGAAAAAACAGGGGGATGCTAGTCCA ATTGCTGGATATGATGCAGTCTATGGAAGCACGAAAAAACAAGGGAATGCTAGTCCAATT GCTGGATATGATGCAGTCTATGGAAGCACTCGAAAACAAGGGGATGCTAGTCCAATTGCT GGATATGCTGCAGTCTATGGAAGCACGAAAAAACAAGGGGATGCCAGTCCAATTTCTGGA TATGATGCAGTCTATGGAACCTCTCAAAAAGCAGAAGGAAGTTCCATCAATGTTCACAAG GATGCTAGCTCAATTGCCGGATATGATGCAGTCTATGGAACCCCTAAAAAAGCAATAGAA AGTTCCACCAAAGCTCACAAGGATGCTAGCCAAATTGCTGGATATGATGCAGTCTATGGA AACTCTCAACAAAAAGCAGGAGGAAGTTCTATCAATGCTCACAAAGATTCTAGCCCAGTT GCGAGTTATGGTGCAGTTAATGTGTTTTTGGAAAAAGACCTGCATCCTGGGACAAAAATG GCTGTGCGCTTCACAAAAACCTCAAGTGCAGCTCATTTCTTGCCCCATCAAGTTGCTGAA TCCATACCTTTTTCATCAAACAAGCTACCAGAAATTTTGAAGCGATTCTCCGTGAAAGAA AACTCCGCAGAAGCCCAGATGATACAGAAAACAATAAAACAATGTGAGACACCTGCCATA GTAGGAGAAGTTAAGTACTGTGCGAGGTCCTTGGAGTCCCTAATTGATTTCAGCACTTCA AGGCTGGGAAAAAACATTCGAGTTCTCTCCAATGAGGTGGAAGCGGATATCCAGGAGTAT AAATTTGGAGAGGGAGTGAAGATGGTGGGAGAGAAATCAGTGGTGTGCCACCAGCTGAAC TATCCATATGCTGTGGCATTCTGCCATACACTTCACATGACAAAGATTTACATGGTTCCA TCGGTGGGTGCTGATGGAACCGGAGTTGAAGCTGTAGCAGTTTGTCACCGGGACACTTCA ACTTGGGACCCAAAGGCTTTGGTCTTTCAAAGGCTCAAAGTTAAGCCAGGAACTTTGCCC ATCTGCCATTTCCTTCCCAATGGTCATATTGTCTGGGTTCCAAAATTTAATGGAGTTTCA TCTCCTTCCCATTCTGACTTCTTTCTTGGTGACTGGTGGTGGTCAGCCATGCTTATTCTC TACCTTCCGAGGTTGATTGGAAGTCGGCTTTGCCTAACACTCCCTTCCCGAAAGCTATGC GGAATCTCTTAA