Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_04s0008g01300.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:4:1067727:1074097:1 gene:VIT_04s0008g01300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Glycine cleavage system P protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:F6H3P2]
Sequence	ATGGAACGTGCACGGCGGATTGCGAACCGGGCGATTCTGCGTCGCCTGGTTTCGGAGTCT AAGCAGCAGAGGCCGTGCCCGAGGCCCCAGAATGAGGGCTTGGTGAATTCTTCTTTTTCG GGTTGGAGGTATGTTTCCTCATTGCCTACTTGTGCTTTTCCCAATAAAACTGTGAGATCA GACGTGTTATTAGGGAGAAATGTGATGTCTAGTGTTGGTTTTGGTATGGGGTGTCAAACC CGGTCTATATCGGTTGAGGCATTGAAGCCTAGTGATACTTTCCCCCGCCGGCATAATTCG GCAACCCCAGAGGAACAGACCAAAATGGCTGAGTCTTGTGGGTATGAGAGTCTGGACTCT CTTGTTGATGCCACAGTGCCTAAGTCGATTCGACTCGAATCGTTGAAGTTTAGTAAGTTT GATGAGGGGCTTACAGAGAGTCAAATGATTGAACATATGATGCAGTTGGCAGCTAAGAAT AAGGTTTTTAAGTCGTATATTGGGATGGGATATTATAACACTTTTGTTCCCCCAGTGATT CTAAGAAACATCATGGAAAATCCGGGTTGGTATACCCAGTACACACCCTACCAGGCTGAG ATTGCCCAAGGACGTTTGGAGTCATTGCTGAATTACCAGACCTTGATTTCTGATTTAACT GGCCTACCCATGTCCAACGCATCGTTACTTGATGAAGGAACTGCTGCAGCTGAGGCAATG GCTATGTGTAATAACATTATGAAGGGAAAGAAGAAAACTTTTATTATTGCTAGCAATTGC CACCCACAGACAATTGATATTTGTAAGACTAGAGCTGAAGGTTTTGATCTTAAAGTAGTT ACTGCTGATCTTAAGGATATTGATTACAAATCGGGTGATGTTTGTGGTGTCCTGGTTCAG TATCCAGACACTGAGGGTGAAGTTCTGGATTACGGGGAGTTCATAAAGAATGCTCATGCT AATGGGGTTAAGGTTGTTATGGCAAGTGATCTGTTGGCATTGACAATGTTGAAGCCTCCA GGTGAGTTTGGGGCAGATATTGTTGTTGGCTCAGCTCAGCGGTTTGGAGTACCGATGGGG TATGGTGGTCCTCATGCTGCTTTCTTGGCCACCTCCCAAGAGTACAAGAGGATGATGCCA GGAAGAATTATTGGAGTCAGTGTTGATGCTTCAGGAAAGCCTGCTCTGCGTATGGCAATG CAGACGAGAGAACAACATATCCGGAGGGACAAGGCTACGAGCAACATATGCACTGCTCAG GCATTACTTGCAAATATGGCTGCTATGTTTGCTGTTTATCATGGGCCTGAAGGCCTTAAA ACCATTGCTCAACGTGTCCATGGTCTTGCTGGGGTATTTGCACTTGGACTGAAGAAACTT GGGACAGTGGAAGTCCAGGGCCTTCCCTTCTTTGACACCGTGAAGGTTAAGTGTGCTGAT GCACATGCGATTGCTGATGCTGCTTGCAAGAGTGAGATAAATTTGCGAATTGTGGACTCA AAAACAATCACTGTTTCCTTTGATGAAACAACAACAATAGAGGATGTGGACAAGCTTTTC AAAGTTTTTGCATGTGGCAAGCCTGTCAATTTCACTGCTGCATCCCTTGCACCAGAAGTT CAGACTGTGATCCCTTCTGGGCTCATAAGAGAAAGCCCATTTCTCACTCATCCAATCTTC AACTTGTATCATACAGAACATGAGTTGCTAAGATACATGCAAAGGCTACAATCAAAGGAT CTTTCATTATGCCATAGTATGATTCCTTTGGGATCTTGTACAATGAAATTGAATGCAACA ACTGAGATGATGCCGGTGACATGGCCTGGCTTTACAGATATTCACCCTTTTGCCCCCACT GAACAGGCACAGGGTTATCAGGAAATGTTCAATAACTTGGGTGAACTATTATGTACCATC ACTGGATTTGACTCTTTCTCATTGCAACCCAATGCTGGTGCTTCTGGCGAGTATGCTGGC CTGATGGTTATTCGTGCATATCATAAGTCAAGAGGAGACCACCACCGTGATGTGTGCATC ATACCTGTTTCGGCACATGGGACTAATCCTGCAAGTGCTGCTATGTGTGGAATGAAAATT GTTGCTGTTGGAACTGATGCCAAGGGAAACATCAACATTGAAGAGTTAAGGAAGGCTGCT GAAGCAAATAAGGAAAACCTATCTGCTCTTATGGTTACATATCCTTCAACCCATGGAGTC TATGAAGAAGGGATAGATGAAATATGTAAGATAATTCATGACAATGGAGGTCAAGTTTAC ATGGATGGTGCTAACATGAATGCACAGGTGGGTCTCACAAGCCCAGGTTGGATTGGAGCT GATGTTTGCCATCTAAATCTCCACAAAACATTTTGCATTCCCCATGGTGGAGGTGGTCCT GGCATGGGTCCTATTGGTGTGAAAAAACACCTGGCACCATTTCTGCCTTCCCATCCTGTG GTATCTACGGGTGGTATACCAGCTCCTGACAAATTACAGCCACTTGGTACCATATCTGCT GCACCTTGGGGCTCTGCACTTATTTTGCCAATATCATATACTTACATAGCAATGATGGGA TCTAAGGGACTCACTGATGCATCAAAGATAGCTATTCTCAATGCAAACTACATGGCAAAA CGTTTGGAGAAGCACTATCCCATTCTTTTCCGTGGCGTCAATGGAACAGTTGCCCATGAA TTCATTGTTGACTTGAGAGGCTTCAAGAATACTGCTGGGATAGAGCCTGAAGATATTGCT AAGCGTCTTATGGACTATGGATTTCATGGACCGACAATGTCATGGCCAGTGCCTGGTACA CTCATGATTGAACCCACTGAAAGTGAAAGCAAGGCAGAGTTAGACAGGTTTTGTGATGCT CTTATCTCCATTAGAAAAGAAATTGCACAGATTGAGAATGGAAAAGCTGACGTTCACAAC AATGTCCTAAAGTGCAGGGTGCTCCTCATCCCCCATCCCTGCTTATGGGAGATACCTGGA CAAAACCATACTCTCGGGAATATGCAGCCTTCCCAGCTCCCTGGCTTCGGGTTGCCAAGT TCTGGCCAACTACAGGACGTGTTGACAATGTGTACGGTGACCGCAACCTCATCTGCACTC TTCTTCCAGCATCACAGATTGAAGAACAAGCTGCAGCTACTGCCTAGGCTTCAGCTTGGT GCTCCATTCTGCAAGGTTTCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_04s0008g01300.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:4:1067727:1074097:1 gene:VIT_04s0008g01300 transcript:VIT_04s0008g01300.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Glycine cleavage system P protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:F6H3P2]
Sequence	MERARRIANRAILRRLVSESKQQRPCPRPQNEGLVNSSFSGWRYVSSLPTCAFPNKTVRS DVLLGRNVMSSVGFGMGCQTRSISVEALKPSDTFPRRHNSATPEEQTKMAESCGYESLDS LVDATVPKSIRLESLKFSKFDEGLTESQMIEHMMQLAAKNKVFKSYIGMGYYNTFVPPVI LRNIMENPGWYTQYTPYQAEIAQGRLESLLNYQTLISDLTGLPMSNASLLDEGTAAAEAM AMCNNIMKGKKKTFIIASNCHPQTIDICKTRAEGFDLKVVTADLKDIDYKSGDVCGVLVQ YPDTEGEVLDYGEFIKNAHANGVKVVMASDLLALTMLKPPGEFGADIVVGSAQRFGVPMG YGGPHAAFLATSQEYKRMMPGRIIGVSVDASGKPALRMAMQTREQHIRRDKATSNICTAQ ALLANMAAMFAVYHGPEGLKTIAQRVHGLAGVFALGLKKLGTVEVQGLPFFDTVKVKCAD AHAIADAACKSEINLRIVDSKTITVSFDETTTIEDVDKLFKVFACGKPVNFTAASLAPEV QTVIPSGLIRESPFLTHPIFNLYHTEHELLRYMQRLQSKDLSLCHSMIPLGSCTMKLNAT TEMMPVTWPGFTDIHPFAPTEQAQGYQEMFNNLGELLCTITGFDSFSLQPNAGASGEYAG LMVIRAYHKSRGDHHRDVCIIPVSAHGTNPASAAMCGMKIVAVGTDAKGNINIEELRKAA EANKENLSALMVTYPSTHGVYEEGIDEICKIIHDNGGQVYMDGANMNAQVGLTSPGWIGA DVCHLNLHKTFCIPHGGGGPGMGPIGVKKHLAPFLPSHPVVSTGGIPAPDKLQPLGTISA APWGSALILPISYTYIAMMGSKGLTDASKIAILNANYMAKRLEKHYPILFRGVNGTVAHE FIVDLRGFKNTAGIEPEDIAKRLMDYGFHGPTMSWPVPGTLMIEPTESESKAELDRFCDA LISIRKEIAQIENGKADVHNNVLKCRVLLIPHPCLWEIPGQNHTLGNMQPSQLPGFGLPS SGQLQDVLTMCTVTATSSALFFQHHRLKNKLQLLPRLQLGAPFCKVS

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_04s0008g01300.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:4:1067727:1074097:1 gene:VIT_04s0008g01300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Glycine cleavage system P protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:F6H3P2]
Sequence	ACTGAGGAGCATTTCCAGAAAGGGCTTTGATTTTGTGAAGGAATTGGTGGGTTGGGGTTG ATTTTCTCTTCTCTGTACATTAATGGAACGTGCACGGCGGATTGCGAACCGGGCGATTCT GCGTCGCCTGGTTTCGGAGTCTAAGCAGCAGAGGCCGTGCCCGAGGCCCCAGAATGAGGG CTTGGTGAATTCTTCTTTTTCGGGTTGGAGGTATGTTTCCTCATTGCCTACTTGTGCTTT TCCCAATAAAACTGTGAGATCAGACGTGTTATTAGGGAGAAATGTGATGTCTAGTGTTGG TTTTGGTATGGGGTGTCAAACCCGGTCTATATCGGTTGAGGCATTGAAGCCTAGTGATAC TTTCCCCCGCCGGCATAATTCGGCAACCCCAGAGGAACAGACCAAAATGGCTGAGTCTTG TGGGTATGAGAGTCTGGACTCTCTTGTTGATGCCACAGTGCCTAAGTCGATTCGACTCGA ATCGTTGAAGTTTAGTAAGTTTGATGAGGGGCTTACAGAGAGTCAAATGATTGAACATAT GATGCAGTTGGCAGCTAAGAATAAGGTTTTTAAGTCGTATATTGGGATGGGATATTATAA CACTTTTGTTCCCCCAGTGATTCTAAGAAACATCATGGAAAATCCGGGTTGGTATACCCA GTACACACCCTACCAGGCTGAGATTGCCCAAGGACGTTTGGAGTCATTGCTGAATTACCA GACCTTGATTTCTGATTTAACTGGCCTACCCATGTCCAACGCATCGTTACTTGATGAAGG AACTGCTGCAGCTGAGGCAATGGCTATGTGTAATAACATTATGAAGGGAAAGAAGAAAAC TTTTATTATTGCTAGCAATTGCCACCCACAGACAATTGATATTTGTAAGACTAGAGCTGA AGGTTTTGATCTTAAAGTAGTTACTGCTGATCTTAAGGATATTGATTACAAATCGGGTGA TGTTTGTGGTGTCCTGGTTCAGTATCCAGACACTGAGGGTGAAGTTCTGGATTACGGGGA GTTCATAAAGAATGCTCATGCTAATGGGGTTAAGGTTGTTATGGCAAGTGATCTGTTGGC ATTGACAATGTTGAAGCCTCCAGGTGAGTTTGGGGCAGATATTGTTGTTGGCTCAGCTCA GCGGTTTGGAGTACCGATGGGGTATGGTGGTCCTCATGCTGCTTTCTTGGCCACCTCCCA AGAGTACAAGAGGATGATGCCAGGAAGAATTATTGGAGTCAGTGTTGATGCTTCAGGAAA GCCTGCTCTGCGTATGGCAATGCAGACGAGAGAACAACATATCCGGAGGGACAAGGCTAC GAGCAACATATGCACTGCTCAGGCATTACTTGCAAATATGGCTGCTATGTTTGCTGTTTA TCATGGGCCTGAAGGCCTTAAAACCATTGCTCAACGTGTCCATGGTCTTGCTGGGGTATT TGCACTTGGACTGAAGAAACTTGGGACAGTGGAAGTCCAGGGCCTTCCCTTCTTTGACAC CGTGAAGGTTAAGTGTGCTGATGCACATGCGATTGCTGATGCTGCTTGCAAGAGTGAGAT AAATTTGCGAATTGTGGACTCAAAAACAATCACTGTTTCCTTTGATGAAACAACAACAAT AGAGGATGTGGACAAGCTTTTCAAAGTTTTTGCATGTGGCAAGCCTGTCAATTTCACTGC TGCATCCCTTGCACCAGAAGTTCAGACTGTGATCCCTTCTGGGCTCATAAGAGAAAGCCC ATTTCTCACTCATCCAATCTTCAACTTGTATCATACAGAACATGAGTTGCTAAGATACAT GCAAAGGCTACAATCAAAGGATCTTTCATTATGCCATAGTATGATTCCTTTGGGATCTTG TACAATGAAATTGAATGCAACAACTGAGATGATGCCGGTGACATGGCCTGGCTTTACAGA TATTCACCCTTTTGCCCCCACTGAACAGGCACAGGGTTATCAGGAAATGTTCAATAACTT GGGTGAACTATTATGTACCATCACTGGATTTGACTCTTTCTCATTGCAACCCAATGCTGG TGCTTCTGGCGAGTATGCTGGCCTGATGGTTATTCGTGCATATCATAAGTCAAGAGGAGA CCACCACCGTGATGTGTGCATCATACCTGTTTCGGCACATGGGACTAATCCTGCAAGTGC TGCTATGTGTGGAATGAAAATTGTTGCTGTTGGAACTGATGCCAAGGGAAACATCAACAT TGAAGAGTTAAGGAAGGCTGCTGAAGCAAATAAGGAAAACCTATCTGCTCTTATGGTTAC ATATCCTTCAACCCATGGAGTCTATGAAGAAGGGATAGATGAAATATGTAAGATAATTCA TGACAATGGAGGTCAAGTTTACATGGATGGTGCTAACATGAATGCACAGGTGGGTCTCAC AAGCCCAGGTTGGATTGGAGCTGATGTTTGCCATCTAAATCTCCACAAAACATTTTGCAT TCCCCATGGTGGAGGTGGTCCTGGCATGGGTCCTATTGGTGTGAAAAAACACCTGGCACC ATTTCTGCCTTCCCATCCTGTGGTATCTACGGGTGGTATACCAGCTCCTGACAAATTACA GCCACTTGGTACCATATCTGCTGCACCTTGGGGCTCTGCACTTATTTTGCCAATATCATA TACTTACATAGCAATGATGGGATCTAAGGGACTCACTGATGCATCAAAGATAGCTATTCT CAATGCAAACTACATGGCAAAACGTTTGGAGAAGCACTATCCCATTCTTTTCCGTGGCGT CAATGGAACAGTTGCCCATGAATTCATTGTTGACTTGAGAGGCTTCAAGAATACTGCTGG GATAGAGCCTGAAGATATTGCTAAGCGTCTTATGGACTATGGATTTCATGGACCGACAAT GTCATGGCCAGTGCCTGGTACACTCATGATTGAACCCACTGAAAGTGAAAGCAAGGCAGA GTTAGACAGGTTTTGTGATGCTCTTATCTCCATTAGAAAAGAAATTGCACAGATTGAGAA TGGAAAAGCTGACGTTCACAACAATGTCCTAAAGTGCAGGGTGCTCCTCATCCCCCATCC CTGCTTATGGGAGATACCTGGACAAAACCATACTCTCGGGAATATGCAGCCTTCCCAGCT CCCTGGCTTCGGGTTGCCAAGTTCTGGCCAACTACAGGACGTGTTGACAATGTGTACGGT GACCGCAACCTCATCTGCACTCTTCTTCCAGCATCACAGATTGAAGAACAAGCTGCAGCT ACTGCCTAGGCTTCAGCTTGGTGCTCCATTCTGCAAGGTTTCTTGACAAACACGAAACCA TTTTCTTCTTTCTTGTATATAAAACCATCCATCATGATACATTTCTCTCCAGCTGCTGAT GTTCATCTTCTTGATATGATGATCCCTAATAACAATTGTTGCTAATTGCAACTTGTAATT ATTCTTGTATTTCTGTGATATTAGCTGTTATGAACCATATGTTTCGCCCAAGTGAAGCAA TAGACAAATTACTTGTCGAATCAAATT