Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_03s0180g00120.t01

CDS Infomation

cds chromosome:12X:3:6037870:6059709:1 gene:VIT_03s0180g00120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGGCTTCCTTCTCAATCTCCACCAGCCTCTCTCCTTCACACTCACTCTCAAAACGATCA
CCTCTGTCACCTGCTTACTCTCGTCCTTGGGTCCCATCTCACCCTCGTCTTAACTCCTCT
ACTTGGAGGTTCAGACCTCCGAAATTGAACGCCCGACTCGAAAACAAGCCCGGAGACCCA
CCCTCCACCCCGCGAGAGGCCCAATCCTTGTCTGACAAACAGCTTCAGGAACTGACACCA
TCATCTGGATCATGTGATCCCCTATGTTCTGTTGATGAAACAAGCTCACAAGATTTTGAA
GCCACATACCAGCCAAAGACCGATTTGCTGAAAGCTCTTGCAATTCTTGCAGCAGCTACA
ACAGGGGCAGTTGCAATTAATCAGTCGTGGGTTGCTGCTAATCAGGATGCTGCTATGGCA
TTGCTATTTGGAGTGGGATATGCTGGAATAATTTTTGAAGAATCTCTAGCCTTTAACAAA
AGTGGAGTGGGGTTATTGATGGCTGTGAGCTTATGGGTTATAAGAAGCATTGGGGCACCT
TCAACTGATATAGCTGTTTCAGAGCTAACTCATGCATCTGCTGAAGTTAGTGAAATAGTG
TTTTTCTTGCTTGGTGCAATGACCATTGTTGAGATTGTTGATGCTCATCAAGGGTTTAAG
CTGGTTACTGACAATATAACAACTCGCAAGCCACAAACTCTACTTTGGGTGGTTGGTTTT
GTGACTTTTTTCCTCAGTTCGATCCTTGACAACCTGACGACCACCATTATCATGGTTTCC
TTATTGAGAAAACTGGTGCCTCCATCAGAATTCCGCAAGTTCCTAGGAGCAGTTGTTGTG
ATAGCCGCAAATGCTGGTGGTGCTTGGACTCCCATTGGTGATGTTACCACTACTATGCTG
TGGATTCATGGTCAGATATCCACATTGCAGACAATGAAGGGTTTGTTTATACCTTCTGCT
GTTTCTCTGGCTGTCCCGCTGGCTCTTATGTCCCTCACTAGTGAAGTTAATGGGAAAGGA
CAGGATTCTCCCAATGTTTTGGCATCTGAACAGATGGCTCCAAGAGGACAGCTTGTTTTC
GCTGTTGGAGTTGGAGCTTTGGTGTTTGTTCCAGTGTTCAAGGCTGTGACTGGTTTGCCT
CCTTTTATGGGTATTCTGCTTGGGCTTGGAGTTCTTTGGATTCTGACAGATGCCATTCAT
TATGGTGAATCGGAAAGACAAAGATTGAAAGTTCCACAGGCTTTATCACGCATTGACACT
CAAGGAGCCCTTTTCTTCCTTGGAATCCTTTTATCTGTCAGCAGTCTCGAGGCAGCAGGG
ATTCTCCGGGAATTAGCAAATTACCTTGATGCACATATCCCTAATGTTGAACTTATTGCA
AGTTCAATAGGTGTCGTGTCAGCAATTATAGACAATGTTCCACTGGTTGCAGCGACAATG
GGAATGTATGACCTTACCTCATACCCCCAAGACTCTGAGTTCTGGCAGCTGATTGCCTAT
TGTGCTGGTACGGGTGGATCCATGCTAGTTATTGGCTCTGCTGCTGGAGTTGCATTTATG
GGGATGGAAAAAGTGGACTTCTTTTGGTACTTAAGGAAGGTGAGTGGGTTTGCCTTTGCA
GGCTATGCTGCTGGTATTGCTGCCTACCTAGCACTTCATAACCTCCACATTTCCACAACT
CTAGCTCATGTTCCTTTCTTCTCTGGTTCATAA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_03s0180g00120.t01

PEP Infomation

pep chromosome:12X:3:6037870:6059709:1 gene:VIT_03s0180g00120 transcript:VIT_03s0180g00120.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

MASFSISTSLSPSHSLSKRSPLSPAYSRPWVPSHPRLNSSTWRFRPPKLNARLENKPGDP
PSTPREAQSLSDKQLQELTPSSGSCDPLCSVDETSSQDFEATYQPKTDLLKALAILAAAT
TGAVAINQSWVAANQDAAMALLFGVGYAGIIFEESLAFNKSGVGLLMAVSLWVIRSIGAP
STDIAVSELTHASAEVSEIVFFLLGAMTIVEIVDAHQGFKLVTDNITTRKPQTLLWVVGF
VTFFLSSILDNLTTTIIMVSLLRKLVPPSEFRKFLGAVVVIAANAGGAWTPIGDVTTTML
WIHGQISTLQTMKGLFIPSAVSLAVPLALMSLTSEVNGKGQDSPNVLASEQMAPRGQLVF
AVGVGALVFVPVFKAVTGLPPFMGILLGLGVLWILTDAIHYGESERQRLKVPQALSRIDT
QGALFFLGILLSVSSLEAAGILRELANYLDAHIPNVELIASSIGVVSAIIDNVPLVAATM
GMYDLTSYPQDSEFWQLIAYCAGTGGSMLVIGSAAGVAFMGMEKVDFFWYLRKVSGFAFA
GYAAGIAAYLALHNLHISTTLAHVPFFSGS

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_03s0180g00120.t01

Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:3:6037870:6059709:1 gene:VIT_03s0180g00120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

GCTGATTCCACAGATGCTGGGGGAGTGGATATAGGCAAAAAGTTGCATCCATCGTCCATT
CAACTGGGTTGAGTCCTCACTCCATAGTGGTTCTTGGCTGTAGCATCTCCTCATCTTCTG
CAAGCCCTAGCTGAGCTCCAATGGCTTCCTTCTCAATCTCCACCAGCCTCTCTCCTTCAC
ACTCACTCTCAAAACGATCACCTCTGTCACCTGCTTACTCTCGTCCTTGGGTCCCATCTC
ACCCTCGTCTTAACTCCTCTACTTGGAGGTTCAGACCTCCGAAATTGAACGCCCGACTCG
AAAACAAGCCCGGAGACCCACCCTCCACCCCGCGAGAGGCCCAATCCTTGTCTGACAAAC
AGCTTCAGGAACTGACACCATCATCTGGATCATGTGATCCCCTATGTTCTGTTGATGAAA
CAAGCTCACAAGATTTTGAAGCCACATACCAGCCAAAGACCGATTTGCTGAAAGCTCTTG
CAATTCTTGCAGCAGCTACAACAGGGGCAGTTGCAATTAATCAGTCGTGGGTTGCTGCTA
ATCAGGATGCTGCTATGGCATTGCTATTTGGAGTGGGATATGCTGGAATAATTTTTGAAG
AATCTCTAGCCTTTAACAAAAGTGGAGTGGGGTTATTGATGGCTGTGAGCTTATGGGTTA
TAAGAAGCATTGGGGCACCTTCAACTGATATAGCTGTTTCAGAGCTAACTCATGCATCTG
CTGAAGTTAGTGAAATAGTGTTTTTCTTGCTTGGTGCAATGACCATTGTTGAGATTGTTG
ATGCTCATCAAGGGTTTAAGCTGGTTACTGACAATATAACAACTCGCAAGCCACAAACTC
TACTTTGGGTGGTTGGTTTTGTGACTTTTTTCCTCAGTTCGATCCTTGACAACCTGACGA
CCACCATTATCATGGTTTCCTTATTGAGAAAACTGGTGCCTCCATCAGAATTCCGCAAGT
TCCTAGGAGCAGTTGTTGTGATAGCCGCAAATGCTGGTGGTGCTTGGACTCCCATTGGTG
ATGTTACCACTACTATGCTGTGGATTCATGGTCAGATATCCACATTGCAGACAATGAAGG
GTTTGTTTATACCTTCTGCTGTTTCTCTGGCTGTCCCGCTGGCTCTTATGTCCCTCACTA
GTGAAGTTAATGGGAAAGGACAGGATTCTCCCAATGTTTTGGCATCTGAACAGATGGCTC
CAAGAGGACAGCTTGTTTTCGCTGTTGGAGTTGGAGCTTTGGTGTTTGTTCCAGTGTTCA
AGGCTGTGACTGGTTTGCCTCCTTTTATGGGTATTCTGCTTGGGCTTGGAGTTCTTTGGA
TTCTGACAGATGCCATTCATTATGGTGAATCGGAAAGACAAAGATTGAAAGTTCCACAGG
CTTTATCACGCATTGACACTCAAGGAGCCCTTTTCTTCCTTGGAATCCTTTTATCTGTCA
GCAGTCTCGAGGCAGCAGGGATTCTCCGGGAATTAGCAAATTACCTTGATGCACATATCC
CTAATGTTGAACTTATTGCAAGTTCAATAGGTGTCGTGTCAGCAATTATAGACAATGTTC
CACTGGTTGCAGCGACAATGGGAATGTATGACCTTACCTCATACCCCCAAGACTCTGAGT
TCTGGCAGCTGATTGCCTATTGTGCTGGTACGGGTGGATCCATGCTAGTTATTGGCTCTG
CTGCTGGAGTTGCATTTATGGGGATGGAAAAAGTGGACTTCTTTTGGTACTTAAGGAAGG
TGAGTGGGTTTGCCTTTGCAGGCTATGCTGCTGGTATTGCTGCCTACCTAGCACTTCATA
ACCTCCACATTTCCACAACTCTAGCTCATGTTCCTTTCTTCTCTGGTTCATAAATCATGG
TGCTCAGATTTTGATGCTTTCTGGCTCCCCAAATGGCAGTGTACATCACAAATTGTGGTG
GCTCACATGATATTGGCATGACAATATTATGGGACCATTCTAATTAGACCCAGAGATGCA
GATTGTGGCAACTTTTATGGAAAAAAAAAATATAATGCTGCCAAGAGTCTAATAATATTC
TCTTTCCTGCTAAGAAAGCAGCCCTGAAGGAAGCATGTATGAAGTGCACT