Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_03s0063g02230.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:3:5462377:5464132:-1 gene:VIT_03s0063g02230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAGGTCAATCAAAGATGGGTTTCGATTTCACGCCCACGCCATAAAAAACGGCATCACA TCCACCGTCTTCACATCAAATCAACTCATTCATCTGTACTCCAAACACGGTTTTTTGGCA GAAGCCCATAAGTTGTTCGATGAAATGCCTGAGCGAAATGTTTTCACTTGGAATGCCATA ATTTGGGCTTATATAAAAACCCAGAACTTGAAACAAGCGCGGGAGCTATTTGACTCTGCT CCAAGCAAAGATTTGGTGACTTACAATTCAATGTTATCGGGTTATATAAACACTGATGGA TATGAGACTAATGCGCTTAAATTATTCATTGAAATGCAATCATTGAATGATGAAACTCGA ATTGATGAGTTTTCTTTGACGAGGATGCTTAACTTGTCCGCAAAGTTATCCATGGAGTCT TATGGGAAGCAACTGCACTCATATATGGTGAAAACTGCAAACAATATAAGTGGGTTTGCT GTGAGCTCTCTTATTGACATGTATTCCAAGTGTGGGTGTTTCCGTGAAGTATGCCAAGTG TTTGATGGATGTGCTGGGGTGCTTGATTTGGTTTCAAAGAATGCAATGGTGGCAGCTTGT TGCAGAGAAGGTGAGTTGGAAATGGGCGTGAATTTATTTTGGAGAGACCTGGAGTTGAAT GATGTGGTGTCTTGGAACACATTGATTTCAGGGTATGTTCAGAATGGTTGTGAGGAGGAT GCACTGAAGTTGTTTGTTCATATGGAGGAGAATGAAGTGAGATGGAATGAGCACACTATC GCGGGTCTTTTGAGTGCTTGTGCTGGTTTAAGGAGTTTGAAGCTTGGGAAGGAAGTGCAT GGTTGGGTTTTGAAATATGAGTTGGGTTTCAACCCATTCATAAGCAGTGGCCTTGTTGAT GTCTATTGCAAGTGTGGTAATATGAAGTATGCAGAGTTAGTTTATGCGACAATTGGGACT GGGAATGCCTTTTCTATCACTTCAATGATTGTGGGGCATTCCTCTCAAGGCAACATGGGA GAAGCTCGGAGGCTTTTTGATTCTTTAACTGAGAAGAGTTCTATCATCTGGACAGCTTTG TTTACTGGGTATGTCAAATCACAGCAATGTGAAGCTGTGTTTGAACTTTTGAGTGAGTTC AGAGTGAAGGAAGCAATGGTTCCAGATGCTTTGATCCTCATCAGTGTACTGGGTGCATGT GCAATACAAGCTGCTCTTAATCCTGGAAAGCAGATTCATGCTTATGTTCTAAGAATTGGG ATTGAACTAGATGAGAAGTTGGTCAGTGCTATGGTTGATATGTATTCAAAATCTGGGAAT ATAAAATATGCAGAAAAGATCTTCCAAAGAGTTACTAACAGAGATGCAGTCATTTACAAT ATAATGACAGCTGGGTATGCACACCATGGGCATGAGAATCAAGCTATCCAGCAATTTGAG GAAATGTTGGAGAGAGGTGTTAGACCTGATGCAGTCACCTTTGTTGCACTTCTATCAGCT TGCCGCCATTGTGGTTTAGTAGAACTAGGGGAGAAGTATTTTGCTTCCATGACAGATTAC AATATATTGCCTGAAATTGATCACTATGCATGTATGATTGATTTGTATGGGAGGGCTAAC CAACTAGAGAAGGCACAAGAGAGGCAGAAGAGAAGATATTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_03s0063g02230.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:3:5462377:5464132:-1 gene:VIT_03s0063g02230 transcript:VIT_03s0063g02230.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MRSIKDGFRFHAHAIKNGITSTVFTSNQLIHLYSKHGFLAEAHKLFDEMPERNVFTWNAI IWAYIKTQNLKQARELFDSAPSKDLVTYNSMLSGYINTDGYETNALKLFIEMQSLNDETR IDEFSLTRMLNLSAKLSMESYGKQLHSYMVKTANNISGFAVSSLIDMYSKCGCFREVCQV FDGCAGVLDLVSKNAMVAACCREGELEMGVNLFWRDLELNDVVSWNTLISGYVQNGCEED ALKLFVHMEENEVRWNEHTIAGLLSACAGLRSLKLGKEVHGWVLKYELGFNPFISSGLVD VYCKCGNMKYAELVYATIGTGNAFSITSMIVGHSSQGNMGEARRLFDSLTEKSSIIWTAL FTGYVKSQQCEAVFELLSEFRVKEAMVPDALILISVLGACAIQAALNPGKQIHAYVLRIG IELDEKLVSAMVDMYSKSGNIKYAEKIFQRVTNRDAVIYNIMTAGYAHHGHENQAIQQFE EMLERGVRPDAVTFVALLSACRHCGLVELGEKYFASMTDYNILPEIDHYACMIDLYGRAN QLEKAQERQKRRY

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_03s0063g02230.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:3:5462377:5464132:-1 gene:VIT_03s0063g02230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAGGTCAATCAAAGATGGGTTTCGATTTCACGCCCACGCCATAAAAAACGGCATCACA TCCACCGTCTTCACATCAAATCAACTCATTCATCTGTACTCCAAACACGGTTTTTTGGCA GAAGCCCATAAGTTGTTCGATGAAATGCCTGAGCGAAATGTTTTCACTTGGAATGCCATA ATTTGGGCTTATATAAAAACCCAGAACTTGAAACAAGCGCGGGAGCTATTTGACTCTGCT CCAAGCAAAGATTTGGTGACTTACAATTCAATGTTATCGGGTTATATAAACACTGATGGA TATGAGACTAATGCGCTTAAATTATTCATTGAAATGCAATCATTGAATGATGAAACTCGA ATTGATGAGTTTTCTTTGACGAGGATGCTTAACTTGTCCGCAAAGTTATCCATGGAGTCT TATGGGAAGCAACTGCACTCATATATGGTGAAAACTGCAAACAATATAAGTGGGTTTGCT GTGAGCTCTCTTATTGACATGTATTCCAAGTGTGGGTGTTTCCGTGAAGTATGCCAAGTG TTTGATGGATGTGCTGGGGTGCTTGATTTGGTTTCAAAGAATGCAATGGTGGCAGCTTGT TGCAGAGAAGGTGAGTTGGAAATGGGCGTGAATTTATTTTGGAGAGACCTGGAGTTGAAT GATGTGGTGTCTTGGAACACATTGATTTCAGGGTATGTTCAGAATGGTTGTGAGGAGGAT GCACTGAAGTTGTTTGTTCATATGGAGGAGAATGAAGTGAGATGGAATGAGCACACTATC GCGGGTCTTTTGAGTGCTTGTGCTGGTTTAAGGAGTTTGAAGCTTGGGAAGGAAGTGCAT GGTTGGGTTTTGAAATATGAGTTGGGTTTCAACCCATTCATAAGCAGTGGCCTTGTTGAT GTCTATTGCAAGTGTGGTAATATGAAGTATGCAGAGTTAGTTTATGCGACAATTGGGACT GGGAATGCCTTTTCTATCACTTCAATGATTGTGGGGCATTCCTCTCAAGGCAACATGGGA GAAGCTCGGAGGCTTTTTGATTCTTTAACTGAGAAGAGTTCTATCATCTGGACAGCTTTG TTTACTGGGTATGTCAAATCACAGCAATGTGAAGCTGTGTTTGAACTTTTGAGTGAGTTC AGAGTGAAGGAAGCAATGGTTCCAGATGCTTTGATCCTCATCAGTGTACTGGGTGCATGT GCAATACAAGCTGCTCTTAATCCTGGAAAGCAGATTCATGCTTATGTTCTAAGAATTGGG ATTGAACTAGATGAGAAGTTGGTCAGTGCTATGGTTGATATGTATTCAAAATCTGGGAAT ATAAAATATGCAGAAAAGATCTTCCAAAGAGTTACTAACAGAGATGCAGTCATTTACAAT ATAATGACAGCTGGGTATGCACACCATGGGCATGAGAATCAAGCTATCCAGCAATTTGAG GAAATGTTGGAGAGAGGTGTTAGACCTGATGCAGTCACCTTTGTTGCACTTCTATCAGCT TGCCGCCATTGTGGTTTAGTAGAACTAGGGGAGAAGTATTTTGCTTCCATGACAGATTAC AATATATTGCCTGAAATTGATCACTATGCATGTATGATTGATTTGTATGGGAGGGCTAAC CAACTAGAGAAGGCACAAGAGAGGCAGAAGAGAAGATATTGA