Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_03s0063g00330.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:3:3900266:3903036:1 gene:VIT_03s0063g00330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAAAAACGTATCCAAGAAATTCTCATCATATGGCCTTGGAAACCAGAATGAAGAGATT GATTTCAATTTTTTATTTGACTCCAGCACCAAAACCCCCTTTGCAAAGTGCCTTCATGCC CTTCTTGTGGTGGCGGGGAAAGTTCAAAGCATTTTTATCTCAACCCGACTTGTCAATCTT TACGCTAACCTTGGTGATGTATCCTTGTCTCGCTGCACCTTTGATCAGATCCCACAAAAG GATGTCTATGCCTGGAACTCAATGATATCTGCCTATGTTCATAATGGCCATTTCCATGAA GCCATAGGCTGTTTCTATCAGCTGTTATTGGTGTCCGAAATTCGACCTGATTTTTACACT TTTCCTCCAGTGTTGAAAGCTTGCGGAACTCTAGTTGATGGGAGGAAGATTCATTGCTGG GCTTTCAAACTGGGTTTCCAATGGAATGTATTTGTGGCTGCTTCCTTGATCCATATGTAT TCTCGGTTTGGTTTTACAGGTATTGCCCGTAGCTTGTTTGATGATATGCCGTTTCGAGAT ATGGGTTCTTGGAATGCCATGATTTCTGGGCTCATTCAAAATGGAAATGCTGCACAGGCA TTGGATGTCTTAGATGAAATGAGATTGGAGGGAATAAAGATGAATTTTGTTACAGTTGTC AGCATTCTTCCTGTCTGTCCACAATTGGGGGACATTTCAACTGCAATGCTAATCCATTTG TATGTCATAAAACATGGGTTAGAGTTTGACTTATTTGTGTCTAATGCCTTGATTAATATG TATGCTAAATTTGGTAACTTGGAGGATGCACGGAAAGCTTTTCAACAAATGTTTATAACA GATGTAGTGTCATGGAACTCAATAATTGCTGCCTATGAGCAGAATGATGATCCAGTCACT GCACATGGGTTCTTTGTCAAAATGCAACTTAATGGATTTCAGCCTGATTTATTAACACTA GTGAGTTTAGCTTCTATTGTTGCTCAGTCTAGGGATTGTAAAAATAGCAGATCTGTTCAC GGATTCATCATGAGAAGGGGTTGGCTTATGGAAGATGTTGTCATTGGAAATGCAGTTGTG GACATGTATGCAAAATTGGGTCTTCTAGATTCTGCACATAAAGTTTTTGAGATAATCCCA GTTAAAGATGTGATTTCATGGAACACTTTGATAACAGGTTATGCTCAAAATGGTCTTGCA AGTGAGGCAATTGAAGTATATAAAATGATGGAAGAGTGCAAGGAGATCATACCTAATCAA GGGACTTGGGTTAGCATTCTGCCAGCTTATGCGCATGTTGGAGCCTTGCAACAAGGAATG AAAATTCATGGGCGGGTGATTAAGACCAATCTCCACTTGGATGTTTTTGTGGCTACCTGC CTCATTGATGTGTATGGAAAATGTGGAAGATTGGTTGATGCAATGTCCTTGTTCTATCAA GTGCCCCAAGAGAGTTCTGTCACTTGGAATGCCATAATATCCTGTCATGGAATTCATGGA CATGCTGAGAAAACTCTAAAGCTATTTGGAGAAATGCTAGATGAGGGGGTTAAGCCTGAT CATGTTACATTTGTCTCGTTATTGTCAGCTTGTAGCCATTCGGGTTTTGTTGAGGAGGGT AAATGGTGCTTTCGTCTGATGCAGGAGTATGGAATTAAGCCTAGTTTGAAGCACTATGGG TGCATGGTAGACTTGCTTGGTCGAGCTGGTTATCTAGAAATGGCATATGATTTTATAAAG GACATGCCTTTACAGCCTGATGCTTCCATCTGGGGTGCCCTTCTTGGCGCTTGTAGAATA CATGGGAATATTGAGTTGGGTAAATTCGCTTCAGATCGCTTATTTGAAGTTGATTCAAAA AATGTTGGATATTATGTTCTGTTGTCAAATATTTATGCTAATGTTGGGAAATGGGAGGGA GTTGATAAAGTGAGATCACTGGCTAGAGAGAGGGGATTGAAGAAAACTCCCGGTTGGAGC ACAATTGAAGTGAACCGCAAGGTTGATGTCTTTTATACTGGGAACCAATCCCATCCGAAA TGCAAGGAGATATATGAGGAGTTGCGAGTTTTGACTGCCAAAATGAAGAGCCTTGGTTAT ATTCCAGACTATAGCTTTGTGTTGCAGGATGTCGAGGAGGACGAAAAAGAGCATATCCTC ACTAGTCATAGCGAGAGATTAGCTATTGCATTTGGAATCATTAGCACCCCTCCTAAAAGT CCTATCCGGATCTTCAAGAACTTGAGGGTTTGTGGGGATTGCCACAATGCAACTAAATTC ATCTCAAGGATTACCCAGAGGGAGATTGTAGTGAGGGATTCTAATCGCTTCCATCACTTC AAGGATGGAATATGTTCTTGTGGAGACTACTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_03s0063g00330.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:3:3900266:3903036:1 gene:VIT_03s0063g00330 transcript:VIT_03s0063g00330.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MKNVSKKFSSYGLGNQNEEIDFNFLFDSSTKTPFAKCLHALLVVAGKVQSIFISTRLVNL YANLGDVSLSRCTFDQIPQKDVYAWNSMISAYVHNGHFHEAIGCFYQLLLVSEIRPDFYT FPPVLKACGTLVDGRKIHCWAFKLGFQWNVFVAASLIHMYSRFGFTGIARSLFDDMPFRD MGSWNAMISGLIQNGNAAQALDVLDEMRLEGIKMNFVTVVSILPVCPQLGDISTAMLIHL YVIKHGLEFDLFVSNALINMYAKFGNLEDARKAFQQMFITDVVSWNSIIAAYEQNDDPVT AHGFFVKMQLNGFQPDLLTLVSLASIVAQSRDCKNSRSVHGFIMRRGWLMEDVVIGNAVV DMYAKLGLLDSAHKVFEIIPVKDVISWNTLITGYAQNGLASEAIEVYKMMEECKEIIPNQ GTWVSILPAYAHVGALQQGMKIHGRVIKTNLHLDVFVATCLIDVYGKCGRLVDAMSLFYQ VPQESSVTWNAIISCHGIHGHAEKTLKLFGEMLDEGVKPDHVTFVSLLSACSHSGFVEEG KWCFRLMQEYGIKPSLKHYGCMVDLLGRAGYLEMAYDFIKDMPLQPDASIWGALLGACRI HGNIELGKFASDRLFEVDSKNVGYYVLLSNIYANVGKWEGVDKVRSLARERGLKKTPGWS TIEVNRKVDVFYTGNQSHPKCKEIYEELRVLTAKMKSLGYIPDYSFVLQDVEEDEKEHIL TSHSERLAIAFGIISTPPKSPIRIFKNLRVCGDCHNATKFISRITQREIVVRDSNRFHHF KDGICSCGDYW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_03s0063g00330.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:3:3900266:3903036:1 gene:VIT_03s0063g00330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAAAAACGTATCCAAGAAATTCTCATCATATGGCCTTGGAAACCAGAATGAAGAGATT GATTTCAATTTTTTATTTGACTCCAGCACCAAAACCCCCTTTGCAAAGTGCCTTCATGCC CTTCTTGTGGTGGCGGGGAAAGTTCAAAGCATTTTTATCTCAACCCGACTTGTCAATCTT TACGCTAACCTTGGTGATGTATCCTTGTCTCGCTGCACCTTTGATCAGATCCCACAAAAG GATGTCTATGCCTGGAACTCAATGATATCTGCCTATGTTCATAATGGCCATTTCCATGAA GCCATAGGCTGTTTCTATCAGCTGTTATTGGTGTCCGAAATTCGACCTGATTTTTACACT TTTCCTCCAGTGTTGAAAGCTTGCGGAACTCTAGTTGATGGGAGGAAGATTCATTGCTGG GCTTTCAAACTGGGTTTCCAATGGAATGTATTTGTGGCTGCTTCCTTGATCCATATGTAT TCTCGGTTTGGTTTTACAGGTATTGCCCGTAGCTTGTTTGATGATATGCCGTTTCGAGAT ATGGGTTCTTGGAATGCCATGATTTCTGGGCTCATTCAAAATGGAAATGCTGCACAGGCA TTGGATGTCTTAGATGAAATGAGATTGGAGGGAATAAAGATGAATTTTGTTACAGTTGTC AGCATTCTTCCTGTCTGTCCACAATTGGGGGACATTTCAACTGCAATGCTAATCCATTTG TATGTCATAAAACATGGGTTAGAGTTTGACTTATTTGTGTCTAATGCCTTGATTAATATG TATGCTAAATTTGGTAACTTGGAGGATGCACGGAAAGCTTTTCAACAAATGTTTATAACA GATGTAGTGTCATGGAACTCAATAATTGCTGCCTATGAGCAGAATGATGATCCAGTCACT GCACATGGGTTCTTTGTCAAAATGCAACTTAATGGATTTCAGCCTGATTTATTAACACTA GTGAGTTTAGCTTCTATTGTTGCTCAGTCTAGGGATTGTAAAAATAGCAGATCTGTTCAC GGATTCATCATGAGAAGGGGTTGGCTTATGGAAGATGTTGTCATTGGAAATGCAGTTGTG GACATGTATGCAAAATTGGGTCTTCTAGATTCTGCACATAAAGTTTTTGAGATAATCCCA GTTAAAGATGTGATTTCATGGAACACTTTGATAACAGGTTATGCTCAAAATGGTCTTGCA AGTGAGGCAATTGAAGTATATAAAATGATGGAAGAGTGCAAGGAGATCATACCTAATCAA GGGACTTGGGTTAGCATTCTGCCAGCTTATGCGCATGTTGGAGCCTTGCAACAAGGAATG AAAATTCATGGGCGGGTGATTAAGACCAATCTCCACTTGGATGTTTTTGTGGCTACCTGC CTCATTGATGTGTATGGAAAATGTGGAAGATTGGTTGATGCAATGTCCTTGTTCTATCAA GTGCCCCAAGAGAGTTCTGTCACTTGGAATGCCATAATATCCTGTCATGGAATTCATGGA CATGCTGAGAAAACTCTAAAGCTATTTGGAGAAATGCTAGATGAGGGGGTTAAGCCTGAT CATGTTACATTTGTCTCGTTATTGTCAGCTTGTAGCCATTCGGGTTTTGTTGAGGAGGGT AAATGGTGCTTTCGTCTGATGCAGGAGTATGGAATTAAGCCTAGTTTGAAGCACTATGGG TGCATGGTAGACTTGCTTGGTCGAGCTGGTTATCTAGAAATGGCATATGATTTTATAAAG GACATGCCTTTACAGCCTGATGCTTCCATCTGGGGTGCCCTTCTTGGCGCTTGTAGAATA CATGGGAATATTGAGTTGGGTAAATTCGCTTCAGATCGCTTATTTGAAGTTGATTCAAAA AATGTTGGATATTATGTTCTGTTGTCAAATATTTATGCTAATGTTGGGAAATGGGAGGGA GTTGATAAAGTGAGATCACTGGCTAGAGAGAGGGGATTGAAGAAAACTCCCGGTTGGAGC ACAATTGAAGTGAACCGCAAGGTTGATGTCTTTTATACTGGGAACCAATCCCATCCGAAA TGCAAGGAGATATATGAGGAGTTGCGAGTTTTGACTGCCAAAATGAAGAGCCTTGGTTAT ATTCCAGACTATAGCTTTGTGTTGCAGGATGTCGAGGAGGACGAAAAAGAGCATATCCTC ACTAGTCATAGCGAGAGATTAGCTATTGCATTTGGAATCATTAGCACCCCTCCTAAAAGT CCTATCCGGATCTTCAAGAACTTGAGGGTTTGTGGGGATTGCCACAATGCAACTAAATTC ATCTCAAGGATTACCCAGAGGGAGATTGTAGTGAGGGATTCTAATCGCTTCCATCACTTC AAGGATGGAATATGTTCTTGTGGAGACTACTGGTGACATGG