Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_03s0038g04250.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:3:3070831:3079639:1 gene:VIT_03s0038g04250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Cellulose synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:F6I0N5]
Sequence	ATGGAGGCCAGTGCTGGTTTAGTGGCTGGTTCTCACAACCGGAACGAGCTTGTGGTCATC CGTCGTGAGGGAGAAGCTGCCGGTCGGAAGCCATTGGCGAATCTAAGTGGGCAAACATGC CAGATTTGTGGGGATGATGTTGGACTTACTGCGGAGGGAGAGTTGTTTGTGGCCTGCAAT GAGTGCGCATTTCCGATTTGCAGGACTTGTTATGAGTACGAGCGCAGCGAAGGAAACCAG GTCTGCCCTCAGTGCAAGACTCGCTTCAAACGTCTCAAGGGATGTGCTAGAGTTGAAGGC GATGAAGAAGAAGATGATGTTGATGACTTGGAGAATGAGTTCAATTTCGTGGGGAGAAGG AGGGATACCCAAGATATGCAGTACATTGCAGAGGGCATGCTTCAGGGCCACATGACTTAT GGCCGTGCTGGGGATGCTGACATGCTTCCTCAAGTTGTCAACACCATGCCTACGGTTCCT CTGCTAACCAACGGCCAAATGGTTGATGATATTCCTCCTGAGCACCATGCTTTGGTTCCT TCTTTTCTTGGTGGCGGAGGCAAAAGAATCCACCCTCTTCCTTTCTCTGACCCAGCCTTC CCTGTACAACCTAGGTCCATGGATCCTTCCAAGGACTTGGCTGCTTATGGCTATGGAAGT GTGGCTTGGAAGGAGAGGATGGAAAATTGGAAGCAGAAGCAAGAGAAGCTACAGGTGATG AACGAAAATGGTGGGAAAGATTGGGACAACGATGGGGATGGGCCAGATCTACCCCTGATG GATGAGGCAAGGCAACCATTATCAAGGAAGCTACCTGTTCCATCAAGCCAAATTAATCCA TATCGAATGATAATTATAATCCGGCTTGTAGTTCTCGGGTTCTTCTTCCATTATCGGGTC ATGCATCCTGTAAATGATGCTTATGCACTGTGGCTTGTATCTGTGATCTGTGAGATTTGG TTTGCCATTTCATGGATTCTTGATCAGTTTCCAAAATGGCTCCCAATTGACAGGGAAACT TATCTAGACAGGCTGTCATTGAGGTATGATAAGGAAGGTCAACCTTCTCAACTTTCTTCA GTTGATATATTTGTCAGTACTGTGGATCCTTTAAAAGAGCCGCCTTTGGTTACTGCAAAC ACGGTGTTGTCCATTCTGGCTGTGGACTACCCAGTTGACAAGGTTTCCTGTTATGTTTCT GATGATGGTGCTGCCATGTTGACATTTGAAGCCTTGTCTGAAACATCCGAATTTGCGAGA AAGTGGGTGCCTTTCTGCAAGAAATTCAACATTGAGCCACGTGCACCAGAGTTTTATTTT GCTCAGAAGATAGATTATCTTCAGGATAAGGTTTTAACTTCATTTGTTAAGGACCGAAGG GCTATGAAGAGAGAGTATGAGGAATTTAAAGTTCGGATTAATGCCTTGGTTGCCAAAGCT CAAAAGGTCCCAGAAGAAGGGTGGACAATGCAGGATGGGACGCCTTGGCCAGGAAATAAT GTCCGTGATCACCCTGGAATGATTCAGGTTTTTCTAGGTCAAAGTGGGGGGCATGACACA GAAGGAAATGAATTACCACGCTTAGTCTATGTGTCCAGAGAAAAGAGACCTGGATTTAAT CACCACAAGAAGGCTGGTGCCATGAATGCTCTGGTCCGAGTCTCTGCTGTTCTTACGAAT GCACCTTATCTATTGAATTTGGATTGTGATCACTACTTCAACAACAGCAAGGCTCTCAAG GAGGCAATGTGTTTCATGATGGATCCACTGCTGGGAAAGAAAGTGTGCTATGTTCAGTTC CCACAGAGGTTTGATGGGATTGATAGGCATGATCGATATGCTAACCGGAACATTGTATTC TTTGATATCAACATGAAAGGCTTGGACGGAATTCAAGGACCCATTTATGTGGGTACTGGG TGTGTCTTTAGAAGACAGGCATTCTATGGTAATGATGCTCCAAAAACAAAGAAGCCTCCA ACAAGGACCTGTAACTGCTGGCCAAACTGGTGCTGTTGTGGTTGCTGTTTCTCTGGAAAG AAGAAAAAGAAAACCACAAAGTCCAAGTCTGAGAAGAAGCAGAAGAAGTTTAGGAGATTG GATTCTGGAGCACCTGTATTTGCTTTAGAGGGCATTGAGGAGGGCATTGAAGGGATTGAG AGTGAGAAGTCAACTATGTTGTCTGAGACGAAATTGGAGAAGAAGTTTGGGCAGTCTCCT GTGTTTGTTGCATCAACTCTTCTTGAGGATGGTGGAACACTGAAAATTGCGAGTCCTGCA TCTCTATTAAAGGAAGCTATCCATGTGATTAGCTGTGGTTATGAAGATAAAACGGACTGG GGAAAAGAGGTGGGTTGGATCTATGGATCTGTTACAGAAGATATCTTGACAGGTTTTAAA ATGCATTGCCATGGATGGCGATCCATATACTGCATCCCTGACAGGCCAGCTTTTAAAGGG TCCGCACCCATCAATCTTTCTGATCGTCTGCACCAGGTGCTTCGATGGGCCCTTGGTTCC GTTGAAATTTTCTTGAGCAGGCACTGTCCCCTCTGGTATGGGTATGGTGGTGGTCTGAAA TGGTTAGAACGTCTTTCTTACATCAACGCAACTGTATATCCATGGACATCAATTCCATTG GTCGCTTATTGTACCTTACCTGCTGTTTGCTTGCTCACAGGCAAATTCATCACTCCAGAG CTAAGCAATGTTGCGAGTTTGTGGTTTTTATCCCTTTTTATCTGTATTTTTGCGACTAGC ATCCTGGAAATGAGATGGAGTGGTGTTGGAATTGATGATTGGTGGAGAAATGAGCAGTTT TGGGTCATTGGAGGTGTTTCAGCCCATCTTTTTGCTGTCTTCCAGGGGCTTCTTAAGGTG TTAGCTGGTATTGACACAGATTTCACTGTGACTTCAAAAGCCGGGGATGATGAGGATTTC TCTGAGTTGTATGCATTCAAGTGGACAACATTGCTAATTCCACCTACCACACTTCTGATA ATTAACCTGATTGGGGTGGTTGCTGGTGTTTCAAATGCAATTAATAATGGGTACGAGTCC TGGGGACCTCTGTTTGGTAAGCTCTTCTTTGCCTTCTGGGTGATTGTCCATCTCTATCCT TTCCTCAAGGGTCTACTAGGACGGCAGAACAGGACACCCACCATCATCATTGTCTGGTCC ATTCTTCTTGCTTCAATCTTCTCCCTTTTGTGGGTCAGGGTTGATCCTTTCTTGGCCAAG TCAGATGGCCCTGTGCTGGAGGAATGCGGGTTAGACTGTCATTAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_03s0038g04250.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:3:3070831:3079639:1 gene:VIT_03s0038g04250 transcript:VIT_03s0038g04250.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Cellulose synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:F6I0N5]
Sequence	MEASAGLVAGSHNRNELVVIRREGEAAGRKPLANLSGQTCQICGDDVGLTAEGELFVACN ECAFPICRTCYEYERSEGNQVCPQCKTRFKRLKGCARVEGDEEEDDVDDLENEFNFVGRR RDTQDMQYIAEGMLQGHMTYGRAGDADMLPQVVNTMPTVPLLTNGQMVDDIPPEHHALVP SFLGGGGKRIHPLPFSDPAFPVQPRSMDPSKDLAAYGYGSVAWKERMENWKQKQEKLQVM NENGGKDWDNDGDGPDLPLMDEARQPLSRKLPVPSSQINPYRMIIIIRLVVLGFFFHYRV MHPVNDAYALWLVSVICEIWFAISWILDQFPKWLPIDRETYLDRLSLRYDKEGQPSQLSS VDIFVSTVDPLKEPPLVTANTVLSILAVDYPVDKVSCYVSDDGAAMLTFEALSETSEFAR KWVPFCKKFNIEPRAPEFYFAQKIDYLQDKVLTSFVKDRRAMKREYEEFKVRINALVAKA QKVPEEGWTMQDGTPWPGNNVRDHPGMIQVFLGQSGGHDTEGNELPRLVYVSREKRPGFN HHKKAGAMNALVRVSAVLTNAPYLLNLDCDHYFNNSKALKEAMCFMMDPLLGKKVCYVQF PQRFDGIDRHDRYANRNIVFFDINMKGLDGIQGPIYVGTGCVFRRQAFYGNDAPKTKKPP TRTCNCWPNWCCCGCCFSGKKKKKTTKSKSEKKQKKFRRLDSGAPVFALEGIEEGIEGIE SEKSTMLSETKLEKKFGQSPVFVASTLLEDGGTLKIASPASLLKEAIHVISCGYEDKTDW GKEVGWIYGSVTEDILTGFKMHCHGWRSIYCIPDRPAFKGSAPINLSDRLHQVLRWALGS VEIFLSRHCPLWYGYGGGLKWLERLSYINATVYPWTSIPLVAYCTLPAVCLLTGKFITPE LSNVASLWFLSLFICIFATSILEMRWSGVGIDDWWRNEQFWVIGGVSAHLFAVFQGLLKV LAGIDTDFTVTSKAGDDEDFSELYAFKWTTLLIPPTTLLIINLIGVVAGVSNAINNGYES WGPLFGKLFFAFWVIVHLYPFLKGLLGRQNRTPTIIIVWSILLASIFSLLWVRVDPFLAK SDGPVLEECGLDCH

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_03s0038g04250.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:3:3070831:3079639:1 gene:VIT_03s0038g04250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Cellulose synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:F6I0N5]
Sequence	ATGGAGGCCAGTGCTGGTTTAGTGGCTGGTTCTCACAACCGGAACGAGCTTGTGGTCATC CGTCGTGAGGGAGAAGCTGCCGGTCGGAAGCCATTGGCGAATCTAAGTGGGCAAACATGC CAGATTTGTGGGGATGATGTTGGACTTACTGCGGAGGGAGAGTTGTTTGTGGCCTGCAAT GAGTGCGCATTTCCGATTTGCAGGACTTGTTATGAGTACGAGCGCAGCGAAGGAAACCAG GTCTGCCCTCAGTGCAAGACTCGCTTCAAACGTCTCAAGGGATGTGCTAGAGTTGAAGGC GATGAAGAAGAAGATGATGTTGATGACTTGGAGAATGAGTTCAATTTCGTGGGGAGAAGG AGGGATACCCAAGATATGCAGTACATTGCAGAGGGCATGCTTCAGGGCCACATGACTTAT GGCCGTGCTGGGGATGCTGACATGCTTCCTCAAGTTGTCAACACCATGCCTACGGTTCCT CTGCTAACCAACGGCCAAATGGTTGATGATATTCCTCCTGAGCACCATGCTTTGGTTCCT TCTTTTCTTGGTGGCGGAGGCAAAAGAATCCACCCTCTTCCTTTCTCTGACCCAGCCTTC CCTGTACAACCTAGGTCCATGGATCCTTCCAAGGACTTGGCTGCTTATGGCTATGGAAGT GTGGCTTGGAAGGAGAGGATGGAAAATTGGAAGCAGAAGCAAGAGAAGCTACAGGTGATG AACGAAAATGGTGGGAAAGATTGGGACAACGATGGGGATGGGCCAGATCTACCCCTGATG GATGAGGCAAGGCAACCATTATCAAGGAAGCTACCTGTTCCATCAAGCCAAATTAATCCA TATCGAATGATAATTATAATCCGGCTTGTAGTTCTCGGGTTCTTCTTCCATTATCGGGTC ATGCATCCTGTAAATGATGCTTATGCACTGTGGCTTGTATCTGTGATCTGTGAGATTTGG TTTGCCATTTCATGGATTCTTGATCAGTTTCCAAAATGGCTCCCAATTGACAGGGAAACT TATCTAGACAGGCTGTCATTGAGGTATGATAAGGAAGGTCAACCTTCTCAACTTTCTTCA GTTGATATATTTGTCAGTACTGTGGATCCTTTAAAAGAGCCGCCTTTGGTTACTGCAAAC ACGGTGTTGTCCATTCTGGCTGTGGACTACCCAGTTGACAAGGTTTCCTGTTATGTTTCT GATGATGGTGCTGCCATGTTGACATTTGAAGCCTTGTCTGAAACATCCGAATTTGCGAGA AAGTGGGTGCCTTTCTGCAAGAAATTCAACATTGAGCCACGTGCACCAGAGTTTTATTTT GCTCAGAAGATAGATTATCTTCAGGATAAGGTTTTAACTTCATTTGTTAAGGACCGAAGG GCTATGAAGAGAGAGTATGAGGAATTTAAAGTTCGGATTAATGCCTTGGTTGCCAAAGCT CAAAAGGTCCCAGAAGAAGGGTGGACAATGCAGGATGGGACGCCTTGGCCAGGAAATAAT GTCCGTGATCACCCTGGAATGATTCAGGTTTTTCTAGGTCAAAGTGGGGGGCATGACACA GAAGGAAATGAATTACCACGCTTAGTCTATGTGTCCAGAGAAAAGAGACCTGGATTTAAT CACCACAAGAAGGCTGGTGCCATGAATGCTCTGGTCCGAGTCTCTGCTGTTCTTACGAAT GCACCTTATCTATTGAATTTGGATTGTGATCACTACTTCAACAACAGCAAGGCTCTCAAG GAGGCAATGTGTTTCATGATGGATCCACTGCTGGGAAAGAAAGTGTGCTATGTTCAGTTC CCACAGAGGTTTGATGGGATTGATAGGCATGATCGATATGCTAACCGGAACATTGTATTC TTTGATATCAACATGAAAGGCTTGGACGGAATTCAAGGACCCATTTATGTGGGTACTGGG TGTGTCTTTAGAAGACAGGCATTCTATGGTAATGATGCTCCAAAAACAAAGAAGCCTCCA ACAAGGACCTGTAACTGCTGGCCAAACTGGTGCTGTTGTGGTTGCTGTTTCTCTGGAAAG AAGAAAAAGAAAACCACAAAGTCCAAGTCTGAGAAGAAGCAGAAGAAGTTTAGGAGATTG GATTCTGGAGCACCTGTATTTGCTTTAGAGGGCATTGAGGAGGGCATTGAAGGGATTGAG AGTGAGAAGTCAACTATGTTGTCTGAGACGAAATTGGAGAAGAAGTTTGGGCAGTCTCCT GTGTTTGTTGCATCAACTCTTCTTGAGGATGGTGGAACACTGAAAATTGCGAGTCCTGCA TCTCTATTAAAGGAAGCTATCCATGTGATTAGCTGTGGTTATGAAGATAAAACGGACTGG GGAAAAGAGGTGGGTTGGATCTATGGATCTGTTACAGAAGATATCTTGACAGGTTTTAAA ATGCATTGCCATGGATGGCGATCCATATACTGCATCCCTGACAGGCCAGCTTTTAAAGGG TCCGCACCCATCAATCTTTCTGATCGTCTGCACCAGGTGCTTCGATGGGCCCTTGGTTCC GTTGAAATTTTCTTGAGCAGGCACTGTCCCCTCTGGTATGGGTATGGTGGTGGTCTGAAA TGGTTAGAACGTCTTTCTTACATCAACGCAACTGTATATCCATGGACATCAATTCCATTG GTCGCTTATTGTACCTTACCTGCTGTTTGCTTGCTCACAGGCAAATTCATCACTCCAGAG CTAAGCAATGTTGCGAGTTTGTGGTTTTTATCCCTTTTTATCTGTATTTTTGCGACTAGC ATCCTGGAAATGAGATGGAGTGGTGTTGGAATTGATGATTGGTGGAGAAATGAGCAGTTT TGGGTCATTGGAGGTGTTTCAGCCCATCTTTTTGCTGTCTTCCAGGGGCTTCTTAAGGTG TTAGCTGGTATTGACACAGATTTCACTGTGACTTCAAAAGCCGGGGATGATGAGGATTTC TCTGAGTTGTATGCATTCAAGTGGACAACATTGCTAATTCCACCTACCACACTTCTGATA ATTAACCTGATTGGGGTGGTTGCTGGTGTTTCAAATGCAATTAATAATGGGTACGAGTCC TGGGGACCTCTGTTTGGTAAGCTCTTCTTTGCCTTCTGGGTGATTGTCCATCTCTATCCT TTCCTCAAGGGTCTACTAGGACGGCAGAACAGGACACCCACCATCATCATTGTCTGGTCC ATTCTTCTTGCTTCAATCTTCTCCCTTTTGTGGGTCAGGGTTGATCCTTTCTTGGCCAAG TCAGATGGCCCTGTGCTGGAGGAATGCGGGTTAGACTGTCATTAGAACTGTATTTATTCA GCCTTTGGATGCTCATGGTTCAGAATGCTGCGATGCTTTTGGGGGTTTTATTATCAGATA TGTTTCAGTCACCACACCTCAGATGACCACGGATGGATTTTCACAAGAGGAAGCTTTTAG AATCTGCATATAAAAGATGTGTGGCATTGTGTTGGCTTTTTTCCTTTTTATCCACTTCAA GTTTGTCTTGCAAATCACCTCTTCAAAGAGGAGGGCATCTGGGACTTGCTACACTGTAAG TTATTGTTTGTGGCAGTCGTCCTCCTAAATTCTTTATTATTTGGACAAAACTGGAGAGTA ATGATCCTCAAGCTCATTAGTCATTGCCCCTTACCAATGGGATTAGTCCTACCCTCTTTC AAACGTTCATGTTGATACTGATGCACAGATGACCGGCAACATGTGATCTATTTTAGGTAA ATAGTTAAATGCTGTCATATATGAGCGATAGGAGAAGAAACAATCTGGATGGTATTACAG TTGGATGGTGTAAGAGGTCAATGTCCCTTTAGTTTTTGTGTTGGTAATAAGTTTCCCACT GTGTTAAAAACTACTATATTGTATGTCAAAAGGTGGTGGCATCTGTGTTGTTTGAAGTTG AGCCTCTGGAAGTGAATAAAACTGTAAAGGCCCACAAAATTCAATTGGTCTTTTTCTCTT ACAA