Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_03s0038g03740.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:3:2729683:2731911:-1 gene:VIT_03s0038g03740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGCGTTTCCCAACCACTCCTTTAGCTCCAAAACTCCCAAACTGGAACTTGGGAATCAAA
GATTCAACTAATCGCAAATGGTGGGACTCGTGGGAAGCCTGTTCTCGCTACCACCAAATG
AAGAAAGCTGGAGCTCAGCTTACAGACCCTACATTGGTCCACTCCATCCTCAAGGCCTGT
TCAAGCCTCCCTGTTCGGCACGGAAAATCCATCCATGCCTCTTTGCTCAAGCAGGGATTT
GATTCCCTCACCTCCACTGGAAACTCCGTCCTGGACTTTTACATGAAAACTGGAGCCTTG
GATTCTGCATTGTTTGTTTTTGATTCCATGAGGAGCCGTGATTCAGTTTCTTGGAATATA
ATGATCCATGGACATCTTAGTCGGGGTGCTTCTGATAAAGGCCTGTGGTGGTTTAGGCAA
GCAAGAGTTATTGCATTTGAACCCAATGTTTCCACCTTGGTGCTTGCGATTCATGCTTGT
CGCAGTCTTGGAGCCATGGAGGAAGGACTTAAAATGCATGGCTACATAATTCGAAGCGGG
TTTTTGGATATTCCTTCTGTGCAGAACTCTCTGTTGAGCATGTATGCAGACAATGACATG
GAGCGTGCTGAGGAATTGTTTGATGAAATGTGTGAGAGGGATGTTATCTCTTGGAGTGTC
ATGATTGGGGGTTATGTGCAGACTGGGGAAGCTAAAATGGCTTTGCAGTTGTTCCTGGAG
ATGACATCTAATGCCAGCATTGAACTGGATGGAATAACAATGGTGAGTGTCCTAAAAGCC
TGCGCCAACACAGGTGACATTAGCATGGGAAGGTCGGTCCATGGGGTTGTCATCTGTAGA
GGTTTGGATTATGATTTGTTTGTTGGGAATTCCATAATTGATATGTACTCCAAGTGTGAT
GACCATGAATCAGCATTTAAAGCTTTCAATGAGATGCCCTGCAGGAACACTGTTTCTTGG
AATTCGATCATATCTGGACTGGTTCGTACTGAGAAGCATTCAGAAGCTCTGTCACTGTTT
TATTCAATGGGGAAGGCAGGGTTCAGGGCAGATGAGGTGACTCTTGTGAATCTTCTTCAA
TCCTGTAAGTACTTTGTAGATCCATTTCAGTGCAAATTCATCCATTCTATAGTAATCCGG
TGGGGCTATGAATTAAACGAGTTTGTGATAAATTCGTTGATTGATGCTTATTCGAAGTGT
GATCTCATTGAGCTTGCATGGAAACTGTTTGATCGGTTGAAGACAAAGGACACGGTCTCA
TGGAGTGCGATGATAGCAGGTTTTAACCACTGTGGCAAGCCTGATGAAGCAATAGCTCTC
TTCCAAGAGATGAACCAGGCACAAGAGAAGCCTAATGGGGTTACCATTTTAAGTCTTCTT
GAGGCTTTCTCAGTTTCAGCTGATCTAAAAAGGTCAAAATGGGCACATGGGATAGCGATT
AGAAGAGGCTTGGCAGCAGAAGTAGCAGTTGGAACTGCAATCCTGGATATGTATGCAAAG
TGTGGGGAAATAGGATTGTCAAGGAAGGCATTTGATCAAATACCCGAAAAGAATATTGTG
TCATGGGGAGCCATGATAGCAGCTTGTGGCATGAATGGCCTAGCGCGTGATGCCCTAGCT
CTGCTGTCTGAAATGAAGCTGCATGGTTTGAAGCCCAATGTAGTGACGACCCTGTCAGTG
TTATCTGCATGTAGCCATGGAGGACTGGTTGAAGAGGGGCTCTCCTTTTTTGAAAACATG
GTTCAAGACCATGGAGTTGAGCCTGGACTTGAACACTACTCATGCATGGTTGACATGTTG
AGCCGTGCAGGAAAGCTCAACTCTGCAATGAATTTGATCGAGAAGATGCCTGAAAGGATG
AGAGATGGTGCAGGCCTTTGGGGGGCACTATTGAGCGCTTGCAGAAGCAGTGGAAACAGC
AGGCTTGGAGCAGGAGCTGCTTTTCGTGTGCTCGAGCTCGAGCCTCAGAGCTCAGCAGGC
TATTTTCTGGCATCAAGCATGTATGCTGCAAGCGGCTTATGGGCAGATGCAGCAAGGATG
AGATGGTTGGTGAAGGCGAGAGGGGTCAGGGTTGTGGCTGGTTACAGCTTGGTACATGTT
GAAGATAAGGCATGGAGATTTGTTGCTGGAGATGAGTCTCACCCAAGGGCTGGCGAGATA
TGGGGTGTTGTTGAGCAGTTGCATGACTGCATGAAGATTGCTGAGAGGAATGAGAGTGAC
TGCAGTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_03s0038g03740.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:3:2729683:2731911:-1 gene:VIT_03s0038g03740 transcript:VIT_03s0038g03740.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MRFPTTPLAPKLPNWNLGIKDSTNRKWWDSWEACSRYHQMKKAGAQLTDPTLVHSILKAC
SSLPVRHGKSIHASLLKQGFDSLTSTGNSVLDFYMKTGALDSALFVFDSMRSRDSVSWNI
MIHGHLSRGASDKGLWWFRQARVIAFEPNVSTLVLAIHACRSLGAMEEGLKMHGYIIRSG
FLDIPSVQNSLLSMYADNDMERAEELFDEMCERDVISWSVMIGGYVQTGEAKMALQLFLE
MTSNASIELDGITMVSVLKACANTGDISMGRSVHGVVICRGLDYDLFVGNSIIDMYSKCD
DHESAFKAFNEMPCRNTVSWNSIISGLVRTEKHSEALSLFYSMGKAGFRADEVTLVNLLQ
SCKYFVDPFQCKFIHSIVIRWGYELNEFVINSLIDAYSKCDLIELAWKLFDRLKTKDTVS
WSAMIAGFNHCGKPDEAIALFQEMNQAQEKPNGVTILSLLEAFSVSADLKRSKWAHGIAI
RRGLAAEVAVGTAILDMYAKCGEIGLSRKAFDQIPEKNIVSWGAMIAACGMNGLARDALA
LLSEMKLHGLKPNVVTTLSVLSACSHGGLVEEGLSFFENMVQDHGVEPGLEHYSCMVDML
SRAGKLNSAMNLIEKMPERMRDGAGLWGALLSACRSSGNSRLGAGAAFRVLELEPQSSAG
YFLASSMYAASGLWADAARMRWLVKARGVRVVAGYSLVHVEDKAWRFVAGDESHPRAGEI
WGVVEQLHDCMKIAERNESDCS

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_03s0038g03740.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:3:2729683:2731911:-1 gene:VIT_03s0038g03740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGCGTTTCCCAACCACTCCTTTAGCTCCAAAACTCCCAAACTGGAACTTGGGAATCAAA
GATTCAACTAATCGCAAATGGTGGGACTCGTGGGAAGCCTGTTCTCGCTACCACCAAATG
AAGAAAGCTGGAGCTCAGCTTACAGACCCTACATTGGTCCACTCCATCCTCAAGGCCTGT
TCAAGCCTCCCTGTTCGGCACGGAAAATCCATCCATGCCTCTTTGCTCAAGCAGGGATTT
GATTCCCTCACCTCCACTGGAAACTCCGTCCTGGACTTTTACATGAAAACTGGAGCCTTG
GATTCTGCATTGTTTGTTTTTGATTCCATGAGGAGCCGTGATTCAGTTTCTTGGAATATA
ATGATCCATGGACATCTTAGTCGGGGTGCTTCTGATAAAGGCCTGTGGTGGTTTAGGCAA
GCAAGAGTTATTGCATTTGAACCCAATGTTTCCACCTTGGTGCTTGCGATTCATGCTTGT
CGCAGTCTTGGAGCCATGGAGGAAGGACTTAAAATGCATGGCTACATAATTCGAAGCGGG
TTTTTGGATATTCCTTCTGTGCAGAACTCTCTGTTGAGCATGTATGCAGACAATGACATG
GAGCGTGCTGAGGAATTGTTTGATGAAATGTGTGAGAGGGATGTTATCTCTTGGAGTGTC
ATGATTGGGGGTTATGTGCAGACTGGGGAAGCTAAAATGGCTTTGCAGTTGTTCCTGGAG
ATGACATCTAATGCCAGCATTGAACTGGATGGAATAACAATGGTGAGTGTCCTAAAAGCC
TGCGCCAACACAGGTGACATTAGCATGGGAAGGTCGGTCCATGGGGTTGTCATCTGTAGA
GGTTTGGATTATGATTTGTTTGTTGGGAATTCCATAATTGATATGTACTCCAAGTGTGAT
GACCATGAATCAGCATTTAAAGCTTTCAATGAGATGCCCTGCAGGAACACTGTTTCTTGG
AATTCGATCATATCTGGACTGGTTCGTACTGAGAAGCATTCAGAAGCTCTGTCACTGTTT
TATTCAATGGGGAAGGCAGGGTTCAGGGCAGATGAGGTGACTCTTGTGAATCTTCTTCAA
TCCTGTAAGTACTTTGTAGATCCATTTCAGTGCAAATTCATCCATTCTATAGTAATCCGG
TGGGGCTATGAATTAAACGAGTTTGTGATAAATTCGTTGATTGATGCTTATTCGAAGTGT
GATCTCATTGAGCTTGCATGGAAACTGTTTGATCGGTTGAAGACAAAGGACACGGTCTCA
TGGAGTGCGATGATAGCAGGTTTTAACCACTGTGGCAAGCCTGATGAAGCAATAGCTCTC
TTCCAAGAGATGAACCAGGCACAAGAGAAGCCTAATGGGGTTACCATTTTAAGTCTTCTT
GAGGCTTTCTCAGTTTCAGCTGATCTAAAAAGGTCAAAATGGGCACATGGGATAGCGATT
AGAAGAGGCTTGGCAGCAGAAGTAGCAGTTGGAACTGCAATCCTGGATATGTATGCAAAG
TGTGGGGAAATAGGATTGTCAAGGAAGGCATTTGATCAAATACCCGAAAAGAATATTGTG
TCATGGGGAGCCATGATAGCAGCTTGTGGCATGAATGGCCTAGCGCGTGATGCCCTAGCT
CTGCTGTCTGAAATGAAGCTGCATGGTTTGAAGCCCAATGTAGTGACGACCCTGTCAGTG
TTATCTGCATGTAGCCATGGAGGACTGGTTGAAGAGGGGCTCTCCTTTTTTGAAAACATG
GTTCAAGACCATGGAGTTGAGCCTGGACTTGAACACTACTCATGCATGGTTGACATGTTG
AGCCGTGCAGGAAAGCTCAACTCTGCAATGAATTTGATCGAGAAGATGCCTGAAAGGATG
AGAGATGGTGCAGGCCTTTGGGGGGCACTATTGAGCGCTTGCAGAAGCAGTGGAAACAGC
AGGCTTGGAGCAGGAGCTGCTTTTCGTGTGCTCGAGCTCGAGCCTCAGAGCTCAGCAGGC
TATTTTCTGGCATCAAGCATGTATGCTGCAAGCGGCTTATGGGCAGATGCAGCAAGGATG
AGATGGTTGGTGAAGGCGAGAGGGGTCAGGGTTGTGGCTGGTTACAGCTTGGTACATGTT
GAAGATAAGGCATGGAGATTTGTTGCTGGAGATGAGTCTCACCCAAGGGCTGGCGAGATA
TGGGGTGTTGTTGAGCAGTTGCATGACTGCATGAAGATTGCTGAGAGGAATGAGAGTGAC
TGCAGTTGA