Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_03s0038g02870.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:3:2034642:2037175:-1 gene:VIT_03s0038g02870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCTTCAACCTTCCCTCACACCTACTTCTACAATTCCAAACGACCCAGAAACGCTTCG AGGGAAAAACGAGCCCGAACCCCACAAACAAACCCGGACACTGACCTAATACTGAAGCCA CGGATCTTCAAAACAGCCCGAAGTAAGAGAAATCAATCGTTTTTGGTTGAACGAAACAGT GTCTCGCTCACTAGAGCTCTTTCCTCGTATGTGGAACGTGGGTACATGAAGAATGCACTC GACCTGTTTGAGAATATGCGTCAGTGTGATACTTTCATTTGGAATGTGATGATTAGAGGG TTTGTTGATAATGGATTGTTTTGGGATGCGGTTGATTTTTACCATAGAATGGAATTCGGA GGGGTTAGAGGTGATAATTTCACTTACCCGTTTGTGATAAAGGCGTGTGGTGGGTTGTAT GATTTGGCAGAAGGAGAGAGGGTTCATGGGAAAGTGATTAAGAGTGGGTTGGATTTGGAT ATTTATATTGGGAATTCACTTATTATTATGTATGCGAAGATTGGGTGTATTGAGTCTGCG GAGATGGTGTTCCGGGAAATGCCTGTTAGGGACTTGGTTTCTTGGAATTCTATGATTAGT GGGTACGTTTCAGTTGGGGATGGTTGGAGATCACTGTCGTGTTTTCGTGAAATGCAAGCA TCTGGTATTAAACTGGATAGGTTCAGTGTGATTGGCATACTTGGTGCTTGTTCGCTTGAG GGTTTTCTGCGAAATGGGAAGGAAATTCACTGCCAAATGATGCGAAGTAGGCTTGAATTG GATGTCATGGTTCAGACATCACTGGTAGACATGTATGCAAAATGTGGTAGGATGGATTAT GCAGAGAGGTTGTTTGATCAAATTACTGATAAAAGCATTGTGGCATGGAATGCTATGATA GGTGGATATTCTCTAAATGCACAATCCTTTGAGTCATTTGCTTATGTGAGAAAGATGCAG GAGGGTGGAAAATTGCATCCTGATTGGATTACAATGATAAACTTGCTCCCTCCTTGTGCA CAGTTAGAAGCAATCTTGCTGGGTAAATCTGTTCATGGCTTTGCAATTAGAAATGGGTTT CTCCCTCATCTGGTCTTGGAGACCGCTCTGGTAGATATGTATGGAGAGTGCGGAAAGCTG AAACCAGCAGAATGTTTGTTTGGTCAAATGAATGAAAGGAATTTGATATCTTGGAATGCC ATGATCGCTTCTTATACGAAAAATGGGGAGAACAGGAAGGCCATGACACTGTTCCAAGAT CTTTGCAACAAGACTCTTAAACCAGATGCAACTACAATTGCTAGCATCCTGCCCGCCTAT GCCGAGTTAGCCTCATTGAGAGAGGCAGAACAAATTCATGGTTATGTCACGAAATTGAAG CTTGATTCAAATACCTTTGTCTCTAATTCTATTGTTTTTATGTATGGAAAATGTGGGAAT CTCCTGAGAGCAAGGGAAATTTTTGATAGGATGACTTTTAAGGATGTCATTTCATGGAAC ACGGTCATTATGGCTTATGCCATTCATGGGTTCGGGAGAATTTCCATTGAATTGTTCTCT GAGATGAGGGAAAAGGGCTTTGAACCTAATGGCAGTACTTTTGTTTCCTTGTTATTATCT TGTAGTGTTGCTGGCTTGGTCAATGAAGGGTGGGAATACTTCAATTCAATGAAAAGGGAC TACAATATCAATCCGGGAATAGAGCATTATGGTTGTATACTTGATCTTATTGGTCGCACC GGGAATCTTGACCATGCCAAGAATTTCATTGAAGAAATGCCACTGGCTCCCACAGCCAGA ATATGGGGATCTTTGTTGACTGCAAGTAGAAACAAAGGAGACGTAGAGTTAGCTGAAATT GCAGCTGAGCACATTTTATCCCTGGAACACGACAATACTGGTTGTTATGTCTTGCTTTCT AATATGTATGCTGAAGCGGGGAGGTGGGAAGATGTGGAGCGGATTAAATTTCACATGAAG AAAGAGGGATTAGAAAAATCAGTTGGATGTAGTGTGGTTGACCTCAGTAGTAAGACTTTC AGGTTCGTGAATCAAGATCGGTCCGACAATGAAATCAACATGGTCTATGATGTGTTAGAT ATCATCTCAAAGAAGATAGGAGAAGATGTTTATGTTCATAGTCTCACCAAGTTCAGACCA TCTGATTTGGAGAAAAAAAGAGCAAACTCAGCAAAAAGTCACAGTTTGAGGTTAGCAATT TGCTTTGGCTTGATCTCAACAACTATTGGAAACCCTGTTCTTGTAAGAAAAAACATTAGA ATATGTGAAGCTTGCCATAGATTTGCAAAGAGGATTTCAGAGACAACTAAAAGAGAGATA ATAGTCAGGGATTCAAAGATCTTTCACCACTTCAATGGTGGGCATTGTTCATGTGGAGAT TATTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_03s0038g02870.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:3:2034642:2037175:-1 gene:VIT_03s0038g02870 transcript:VIT_03s0038g02870.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MASTFPHTYFYNSKRPRNASREKRARTPQTNPDTDLILKPRIFKTARSKRNQSFLVERNS VSLTRALSSYVERGYMKNALDLFENMRQCDTFIWNVMIRGFVDNGLFWDAVDFYHRMEFG GVRGDNFTYPFVIKACGGLYDLAEGERVHGKVIKSGLDLDIYIGNSLIIMYAKIGCIESA EMVFREMPVRDLVSWNSMISGYVSVGDGWRSLSCFREMQASGIKLDRFSVIGILGACSLE GFLRNGKEIHCQMMRSRLELDVMVQTSLVDMYAKCGRMDYAERLFDQITDKSIVAWNAMI GGYSLNAQSFESFAYVRKMQEGGKLHPDWITMINLLPPCAQLEAILLGKSVHGFAIRNGF LPHLVLETALVDMYGECGKLKPAECLFGQMNERNLISWNAMIASYTKNGENRKAMTLFQD LCNKTLKPDATTIASILPAYAELASLREAEQIHGYVTKLKLDSNTFVSNSIVFMYGKCGN LLRAREIFDRMTFKDVISWNTVIMAYAIHGFGRISIELFSEMREKGFEPNGSTFVSLLLS CSVAGLVNEGWEYFNSMKRDYNINPGIEHYGCILDLIGRTGNLDHAKNFIEEMPLAPTAR IWGSLLTASRNKGDVELAEIAAEHILSLEHDNTGCYVLLSNMYAEAGRWEDVERIKFHMK KEGLEKSVGCSVVDLSSKTFRFVNQDRSDNEINMVYDVLDIISKKIGEDVYVHSLTKFRP SDLEKKRANSAKSHSLRLAICFGLISTTIGNPVLVRKNIRICEACHRFAKRISETTKREI IVRDSKIFHHFNGGHCSCGDYW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_03s0038g02870.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:3:2034642:2037175:-1 gene:VIT_03s0038g02870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCTTCAACCTTCCCTCACACCTACTTCTACAATTCCAAACGACCCAGAAACGCTTCG AGGGAAAAACGAGCCCGAACCCCACAAACAAACCCGGACACTGACCTAATACTGAAGCCA CGGATCTTCAAAACAGCCCGAAGTAAGAGAAATCAATCGTTTTTGGTTGAACGAAACAGT GTCTCGCTCACTAGAGCTCTTTCCTCGTATGTGGAACGTGGGTACATGAAGAATGCACTC GACCTGTTTGAGAATATGCGTCAGTGTGATACTTTCATTTGGAATGTGATGATTAGAGGG TTTGTTGATAATGGATTGTTTTGGGATGCGGTTGATTTTTACCATAGAATGGAATTCGGA GGGGTTAGAGGTGATAATTTCACTTACCCGTTTGTGATAAAGGCGTGTGGTGGGTTGTAT GATTTGGCAGAAGGAGAGAGGGTTCATGGGAAAGTGATTAAGAGTGGGTTGGATTTGGAT ATTTATATTGGGAATTCACTTATTATTATGTATGCGAAGATTGGGTGTATTGAGTCTGCG GAGATGGTGTTCCGGGAAATGCCTGTTAGGGACTTGGTTTCTTGGAATTCTATGATTAGT GGGTACGTTTCAGTTGGGGATGGTTGGAGATCACTGTCGTGTTTTCGTGAAATGCAAGCA TCTGGTATTAAACTGGATAGGTTCAGTGTGATTGGCATACTTGGTGCTTGTTCGCTTGAG GGTTTTCTGCGAAATGGGAAGGAAATTCACTGCCAAATGATGCGAAGTAGGCTTGAATTG GATGTCATGGTTCAGACATCACTGGTAGACATGTATGCAAAATGTGGTAGGATGGATTAT GCAGAGAGGTTGTTTGATCAAATTACTGATAAAAGCATTGTGGCATGGAATGCTATGATA GGTGGATATTCTCTAAATGCACAATCCTTTGAGTCATTTGCTTATGTGAGAAAGATGCAG GAGGGTGGAAAATTGCATCCTGATTGGATTACAATGATAAACTTGCTCCCTCCTTGTGCA CAGTTAGAAGCAATCTTGCTGGGTAAATCTGTTCATGGCTTTGCAATTAGAAATGGGTTT CTCCCTCATCTGGTCTTGGAGACCGCTCTGGTAGATATGTATGGAGAGTGCGGAAAGCTG AAACCAGCAGAATGTTTGTTTGGTCAAATGAATGAAAGGAATTTGATATCTTGGAATGCC ATGATCGCTTCTTATACGAAAAATGGGGAGAACAGGAAGGCCATGACACTGTTCCAAGAT CTTTGCAACAAGACTCTTAAACCAGATGCAACTACAATTGCTAGCATCCTGCCCGCCTAT GCCGAGTTAGCCTCATTGAGAGAGGCAGAACAAATTCATGGTTATGTCACGAAATTGAAG CTTGATTCAAATACCTTTGTCTCTAATTCTATTGTTTTTATGTATGGAAAATGTGGGAAT CTCCTGAGAGCAAGGGAAATTTTTGATAGGATGACTTTTAAGGATGTCATTTCATGGAAC ACGGTCATTATGGCTTATGCCATTCATGGGTTCGGGAGAATTTCCATTGAATTGTTCTCT GAGATGAGGGAAAAGGGCTTTGAACCTAATGGCAGTACTTTTGTTTCCTTGTTATTATCT TGTAGTGTTGCTGGCTTGGTCAATGAAGGGTGGGAATACTTCAATTCAATGAAAAGGGAC TACAATATCAATCCGGGAATAGAGCATTATGGTTGTATACTTGATCTTATTGGTCGCACC GGGAATCTTGACCATGCCAAGAATTTCATTGAAGAAATGCCACTGGCTCCCACAGCCAGA ATATGGGGATCTTTGTTGACTGCAAGTAGAAACAAAGGAGACGTAGAGTTAGCTGAAATT GCAGCTGAGCACATTTTATCCCTGGAACACGACAATACTGGTTGTTATGTCTTGCTTTCT AATATGTATGCTGAAGCGGGGAGGTGGGAAGATGTGGAGCGGATTAAATTTCACATGAAG AAAGAGGGATTAGAAAAATCAGTTGGATGTAGTGTGGTTGACCTCAGTAGTAAGACTTTC AGGTTCGTGAATCAAGATCGGTCCGACAATGAAATCAACATGGTCTATGATGTGTTAGAT ATCATCTCAAAGAAGATAGGAGAAGATGTTTATGTTCATAGTCTCACCAAGTTCAGACCA TCTGATTTGGAGAAAAAAAGAGCAAACTCAGCAAAAAGTCACAGTTTGAGGTTAGCAATT TGCTTTGGCTTGATCTCAACAACTATTGGAAACCCTGTTCTTGTAAGAAAAAACATTAGA ATATGTGAAGCTTGCCATAGATTTGCAAAGAGGATTTCAGAGACAACTAAAAGAGAGATA ATAGTCAGGGATTCAAAGATCTTTCACCACTTCAATGGTGGGCATTGTTCATGTGGAGAT TATTGGTGACCAGAGTAGTTTCAAAAACATTTTCTTTGGTAATTAACACGATGTAAACAT CTCTTCATCCATGTATTTATTGTATCACAGGAGTAATGAAATTAATCTGTTTCATCTTGG GTTCAGAATCCACC