Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_03s0038g02250.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:3:1549919:1551865:-1 gene:VIT_03s0038g02250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAAAACCCCACTTGCTATTCTGCAACTTTACAGCATCCATACTTCAACCCAACGCTAC CCACATGGAAGCGACCCCATCAACTATTCAAAACTCTTGAGTTGTTATTTGAAGTCTGGG GATATCATAAATGCAGGGAAGCTGTTTGAAGAAATTCCTAAACGGGATGTAGTTTCATGG TCTATAATGATCCATGGTTATAATAGAAATGGGTTTCGGAGAAAATCCATGGAACTGTTT TCCCAGATGAGGATTTCAAGTTTGGTTCCAACTTCTTTCACCATGGTTGGTGTTCTTGTC AGCATTGCAGGCTTAGGAGACCCTGTGCTTGGGCAATGTGTTCACGGACTAATTCTCAAA TATGGGCTTGACTCTGATTTTAGAGTGGTTACTGCTTTGTTGAATGCATATGCAAAATGC GGAAATGTGGTTGATTCTTATAGAGTGTTTGAGCAACTAGAGAATCCGGGTTTGGTCTCA TGCAGTGCAATTGTTTCCGGGTTTGTCTACAATGAGCTCTTTGAAGAGGCTGTTGTATTG TTTAACCAGTTCCGGAAGCTTGGCATGGTGCCTAATGCTGCAACAGTATTGACTCTCATT CGAGCTTGTGTGGCTTTAGAGTCGCGGCGACTGTGTGAATCCATTCATGGGATGGTTGTA AAACTGAGTCTTGTTTTGGATGTGGCTGTTAACAACTCGGTTCTTGATATGTATTCAAGT ATGCTGGATTTGGATGCTGCAACAAGAGTTTTTGAAGGGATGGAATGTAGAGATGTAATA AGCTGGACTACAATGATTAATTTACTGGTCTGTCTTGAATATGCTTCTGATGCTCTCATG CTTTTTCGCCAGATGAGAAATACCGGGATCTGTAATGATGTGGTGGTTGTCATGAATCTG ATTTCAGCTTGTGCTATTTTAGGAGATTTGAAGAGAGGCAGAGAAATCCATACTCAAGCT ATTGTATGTGGATTTGGATCAGAGCTCCCGCTTACAAACTCGATCATTGCAATGTATTCA AAGTGTGGCGACCTAGATTCTTCAAGAACTGTGTTTGATCAAACTACTGGGAAGAGTCTT GTTTCCTGGACAGCGATGATTTTAGGATGTGTGCAGAATGGATACCCAAGAGAAGCACTG AAGCTCTTGATTAAAATGAGAGGAGAAGAGAGTTTTTACCTTGATTCAATAATGCTGATA GGGGTTCTATCAGCTTCTGGTGAACTTGCTCTTTTGGAGCTCTGCCAGCAGCTCCATTGC TATGCTTTTGAATCTGGTTTCCCCCGATATAGATTGGTTCAGAATAGTCTGATATCAGCA TACTCAAAGTGTGGAGATGTGGAACCTGCTTACAATGTGTTTGGGCAGATGGGTTATATC CGAGATATAGTATCTTGGAATGCAATTCTAAACGGGTATGGGATCAATGGCCATGGAGAA ATTGCTGTCGCCCTCTACCATGAAATGAGGAAGGGCCGGGAAAATCCTGATGCTGCGACG TACCTTTGTGTTTTGAGTGCTTGTAGTCACTCAGGGTTGGTGGATGATGGTCTGGTTATT TTCAATCAGATGGTGGAAGAGCGTACAATCAGGCCTAGCCAAGACCACTGCGGGTGCATC GTTGACTTGCTTGCAAGAGCAGGCTGCTTCTCAGATGCAAGAGAGTTTGTAAGCCGATAT ATGGAGAAGATGGGTCCAAATGCTTGGAGGGCTTTGCTCAGTGGATGTCAGCTTCATGGT AATGTAGGGCTTGCAGAACTTGCAGCTAGAAGGGTGTGTGAACTGGATCCAGAAGAGCCC GGTCAAGTCGTTCTACTTTCAAATGTTTATGCATCAGTTGGGAGGTTCCAGGATGCTGAA GCTTTGAGAGCAAGTATGAAGAAGAAGGAATTGATCAAGAATCCGGGGATAAGCTTGCTT AATAGAATCCCATATGATGTTGGTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_03s0038g02250.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:3:1549919:1551865:-1 gene:VIT_03s0038g02250 transcript:VIT_03s0038g02250.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MKTPLAILQLYSIHTSTQRYPHGSDPINYSKLLSCYLKSGDIINAGKLFEEIPKRDVVSW SIMIHGYNRNGFRRKSMELFSQMRISSLVPTSFTMVGVLVSIAGLGDPVLGQCVHGLILK YGLDSDFRVVTALLNAYAKCGNVVDSYRVFEQLENPGLVSCSAIVSGFVYNELFEEAVVL FNQFRKLGMVPNAATVLTLIRACVALESRRLCESIHGMVVKLSLVLDVAVNNSVLDMYSS MLDLDAATRVFEGMECRDVISWTTMINLLVCLEYASDALMLFRQMRNTGICNDVVVVMNL ISACAILGDLKRGREIHTQAIVCGFGSELPLTNSIIAMYSKCGDLDSSRTVFDQTTGKSL VSWTAMILGCVQNGYPREALKLLIKMRGEESFYLDSIMLIGVLSASGELALLELCQQLHC YAFESGFPRYRLVQNSLISAYSKCGDVEPAYNVFGQMGYIRDIVSWNAILNGYGINGHGE IAVALYHEMRKGRENPDAATYLCVLSACSHSGLVDDGLVIFNQMVEERTIRPSQDHCGCI VDLLARAGCFSDAREFVSRYMEKMGPNAWRALLSGCQLHGNVGLAELAARRVCELDPEEP GQVVLLSNVYASVGRFQDAEALRASMKKKELIKNPGISLLNRIPYDVG

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_03s0038g02250.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:3:1549919:1551865:-1 gene:VIT_03s0038g02250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAAAACCCCACTTGCTATTCTGCAACTTTACAGCATCCATACTTCAACCCAACGCTAC CCACATGGAAGCGACCCCATCAACTATTCAAAACTCTTGAGTTGTTATTTGAAGTCTGGG GATATCATAAATGCAGGGAAGCTGTTTGAAGAAATTCCTAAACGGGATGTAGTTTCATGG TCTATAATGATCCATGGTTATAATAGAAATGGGTTTCGGAGAAAATCCATGGAACTGTTT TCCCAGATGAGGATTTCAAGTTTGGTTCCAACTTCTTTCACCATGGTTGGTGTTCTTGTC AGCATTGCAGGCTTAGGAGACCCTGTGCTTGGGCAATGTGTTCACGGACTAATTCTCAAA TATGGGCTTGACTCTGATTTTAGAGTGGTTACTGCTTTGTTGAATGCATATGCAAAATGC GGAAATGTGGTTGATTCTTATAGAGTGTTTGAGCAACTAGAGAATCCGGGTTTGGTCTCA TGCAGTGCAATTGTTTCCGGGTTTGTCTACAATGAGCTCTTTGAAGAGGCTGTTGTATTG TTTAACCAGTTCCGGAAGCTTGGCATGGTGCCTAATGCTGCAACAGTATTGACTCTCATT CGAGCTTGTGTGGCTTTAGAGTCGCGGCGACTGTGTGAATCCATTCATGGGATGGTTGTA AAACTGAGTCTTGTTTTGGATGTGGCTGTTAACAACTCGGTTCTTGATATGTATTCAAGT ATGCTGGATTTGGATGCTGCAACAAGAGTTTTTGAAGGGATGGAATGTAGAGATGTAATA AGCTGGACTACAATGATTAATTTACTGGTCTGTCTTGAATATGCTTCTGATGCTCTCATG CTTTTTCGCCAGATGAGAAATACCGGGATCTGTAATGATGTGGTGGTTGTCATGAATCTG ATTTCAGCTTGTGCTATTTTAGGAGATTTGAAGAGAGGCAGAGAAATCCATACTCAAGCT ATTGTATGTGGATTTGGATCAGAGCTCCCGCTTACAAACTCGATCATTGCAATGTATTCA AAGTGTGGCGACCTAGATTCTTCAAGAACTGTGTTTGATCAAACTACTGGGAAGAGTCTT GTTTCCTGGACAGCGATGATTTTAGGATGTGTGCAGAATGGATACCCAAGAGAAGCACTG AAGCTCTTGATTAAAATGAGAGGAGAAGAGAGTTTTTACCTTGATTCAATAATGCTGATA GGGGTTCTATCAGCTTCTGGTGAACTTGCTCTTTTGGAGCTCTGCCAGCAGCTCCATTGC TATGCTTTTGAATCTGGTTTCCCCCGATATAGATTGGTTCAGAATAGTCTGATATCAGCA TACTCAAAGTGTGGAGATGTGGAACCTGCTTACAATGTGTTTGGGCAGATGGGTTATATC CGAGATATAGTATCTTGGAATGCAATTCTAAACGGGTATGGGATCAATGGCCATGGAGAA ATTGCTGTCGCCCTCTACCATGAAATGAGGAAGGGCCGGGAAAATCCTGATGCTGCGACG TACCTTTGTGTTTTGAGTGCTTGTAGTCACTCAGGGTTGGTGGATGATGGTCTGGTTATT TTCAATCAGATGGTGGAAGAGCGTACAATCAGGCCTAGCCAAGACCACTGCGGGTGCATC GTTGACTTGCTTGCAAGAGCAGGCTGCTTCTCAGATGCAAGAGAGTTTGTAAGCCGATAT ATGGAGAAGATGGGTCCAAATGCTTGGAGGGCTTTGCTCAGTGGATGTCAGCTTCATGGT AATGTAGGGCTTGCAGAACTTGCAGCTAGAAGGGTGTGTGAACTGGATCCAGAAGAGCCC GGTCAAGTCGTTCTACTTTCAAATGTTTATGCATCAGTTGGGAGGTTCCAGGATGCTGAA GCTTTGAGAGCAAGTATGAAGAAGAAGGAATTGATCAAGAATCCGGGGATAAGCTTGCTT AATAGAATCCCATATGATGTTGGTTGA