Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_03s0038g02080.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:3:1436852:1438855:1 gene:VIT_03s0038g02080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGCCCTCTCTCTCCTCTCCAAATCTCAATTTCTCACCGTTCCGTACAAATCCCAGGAAG CCCAGACGCCGTCCCTGTCTCGTAGAAGCCATCGTCAAGCTCTGCAAGAAAAACAAGCTA AACGAAGCCGTTTCGTCTCTGGAAAACCTCGCACGGCGAGGCCTGCGCCTCGATTCTCGA ACACTTGCGTCCCTCTTGCAACACTGCGCGGATTCCAGGGCTCTCAGAGAAGGCAAAAGG GTCCACCTCCATTTGAAGCTTACGGGTCTGAAGAGGCCCGGTACATTTTTATCTAATCAT TTAATTAATATGTATGCGAAATGTGGCAAAGAGGTTGAAGCTCGTAAAGTGTTTGATAAA ATGTCTGCTAGAAATCTGTATTCTTGGAACAATATGCTTTCTGGGTATGCTAAATTGGGA ATGATAAAGCCAGCTAGGAAGTTGTTTGACAAAATGCCTGAGAAGGATGTTGTGTCATGG AATACTATGGTAATCGCCCATGCTCAGTGTGGTTATTGGGATGAAGCATTGAGGTTTTAC AGTGAGTTTCGGCAGTTGGGTATTCAGTGTAACGGGTTTAGTTTCGCTGGCGTCTTGACT GTTTGTGTAAAGTTGAAGGAAGTAGGGCTTACTAGGCAGGTTCATGGGCAGATTCTGGTA GCTGGGTTTTTGTCTAATGTTGTGCTTTCAAGCTCAGTTCTCGATGCTTATGTGAAATGC GGGTTGATGGGTGATGCGAGGAAGTTGTTTGATGAGATGTCTGCTAGAGACGTTCTTGCA TGGACTACCATGGTTTCAGGATATGCCAAATGGGGTGATATGAAATCAGCTAATGAATTA TTTGTTGAGATGCCTGAGAAGAATCCAGTCTCATGGACTGCTTTGATTTCTGGGTATGCC AGAAATGGTATGGGGCACAAGGCCCTTGAATTGTTCACAAAGATGATGCTGTTTCATGTT AGACCTGATCAATTCACGTTCAGTAGTTGCCTTTGTGCTTGTGCTAGTATAGCTTCACTT AAGCATGGTAAACAAATTCATGCCTATTTGTTACGAATTAATTTCCAACCTAATACCATA GTTGTTAGCGCACTCATCGACATGTACTCAAAATGTGGAAGCTTGGGAATTGGAAGGAAG GTTTTTGATCTTATGGGTAATAAGCTAGATGTTGTATTGTGGAACACGATTATATCTGCT TTGGCACAGCATGGTTGTGGAGAAGAGGCAATACAGATGCTTGATGACATGGTAAGATCA GGAGCAAAGCCAGATAAAATTACCTTTGTCGTCATTCTTAATGCATGTAGTCATTCAGGC CTTGTGCAGCAAGGGCTTAATTTCTTTGAGTCCATGTCTTGTGATTATGGCATTGTTCCC AGTCAGGAACATTATGCATGCTTAATTGATCTGTTGGGTCGAGCTGGATGTTTTGAGGAG GTAATGGACCAGCTTGAGAAGATGCCTTATAAGCCTGATGATCGTGTTTGGAATGCCTTA CTAGGTGTTTGTAGGATTCATGGACATATAGAGTTGGGAAGAAAAGCAGCTGAACGCCTT ATTGAGTTGGAACCTCAATCCTCCACAGCCTATGTATTACTTTCAAGTATATATGCTGTA CTTGGGAGGTGGGAGTCAGTACAGAAGGTTAGACAGCTTATGAATGAGAGACAGGTCAAG AAAGAGCGAGCCATTAGTTGGCTTGAAATTGAAAATAAGGTGCATAGTTTTAGTGTATCA GATAGTTCACACCCTCTGAAAGAACAAATATACTCGGTTTTGGAACAGTTAGCTGGCCAG ATGGAAGAAGATGCTTCATTATTTATCGCTCAAAGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_03s0038g02080.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:3:1436852:1438855:1 gene:VIT_03s0038g02080 transcript:VIT_03s0038g02080.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MPSLSSPNLNFSPFRTNPRKPRRRPCLVEAIVKLCKKNKLNEAVSSLENLARRGLRLDSR TLASLLQHCADSRALREGKRVHLHLKLTGLKRPGTFLSNHLINMYAKCGKEVEARKVFDK MSARNLYSWNNMLSGYAKLGMIKPARKLFDKMPEKDVVSWNTMVIAHAQCGYWDEALRFY SEFRQLGIQCNGFSFAGVLTVCVKLKEVGLTRQVHGQILVAGFLSNVVLSSSVLDAYVKC GLMGDARKLFDEMSARDVLAWTTMVSGYAKWGDMKSANELFVEMPEKNPVSWTALISGYA RNGMGHKALELFTKMMLFHVRPDQFTFSSCLCACASIASLKHGKQIHAYLLRINFQPNTI VVSALIDMYSKCGSLGIGRKVFDLMGNKLDVVLWNTIISALAQHGCGEEAIQMLDDMVRS GAKPDKITFVVILNACSHSGLVQQGLNFFESMSCDYGIVPSQEHYACLIDLLGRAGCFEE VMDQLEKMPYKPDDRVWNALLGVCRIHGHIELGRKAAERLIELEPQSSTAYVLLSSIYAV LGRWESVQKVRQLMNERQVKKERAISWLEIENKVHSFSVSDSSHPLKEQIYSVLEQLAGQ MEEDASLFIAQR

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_03s0038g02080.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:3:1436852:1438855:1 gene:VIT_03s0038g02080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGCCCTCTCTCTCCTCTCCAAATCTCAATTTCTCACCGTTCCGTACAAATCCCAGGAAG CCCAGACGCCGTCCCTGTCTCGTAGAAGCCATCGTCAAGCTCTGCAAGAAAAACAAGCTA AACGAAGCCGTTTCGTCTCTGGAAAACCTCGCACGGCGAGGCCTGCGCCTCGATTCTCGA ACACTTGCGTCCCTCTTGCAACACTGCGCGGATTCCAGGGCTCTCAGAGAAGGCAAAAGG GTCCACCTCCATTTGAAGCTTACGGGTCTGAAGAGGCCCGGTACATTTTTATCTAATCAT TTAATTAATATGTATGCGAAATGTGGCAAAGAGGTTGAAGCTCGTAAAGTGTTTGATAAA ATGTCTGCTAGAAATCTGTATTCTTGGAACAATATGCTTTCTGGGTATGCTAAATTGGGA ATGATAAAGCCAGCTAGGAAGTTGTTTGACAAAATGCCTGAGAAGGATGTTGTGTCATGG AATACTATGGTAATCGCCCATGCTCAGTGTGGTTATTGGGATGAAGCATTGAGGTTTTAC AGTGAGTTTCGGCAGTTGGGTATTCAGTGTAACGGGTTTAGTTTCGCTGGCGTCTTGACT GTTTGTGTAAAGTTGAAGGAAGTAGGGCTTACTAGGCAGGTTCATGGGCAGATTCTGGTA GCTGGGTTTTTGTCTAATGTTGTGCTTTCAAGCTCAGTTCTCGATGCTTATGTGAAATGC GGGTTGATGGGTGATGCGAGGAAGTTGTTTGATGAGATGTCTGCTAGAGACGTTCTTGCA TGGACTACCATGGTTTCAGGATATGCCAAATGGGGTGATATGAAATCAGCTAATGAATTA TTTGTTGAGATGCCTGAGAAGAATCCAGTCTCATGGACTGCTTTGATTTCTGGGTATGCC AGAAATGGTATGGGGCACAAGGCCCTTGAATTGTTCACAAAGATGATGCTGTTTCATGTT AGACCTGATCAATTCACGTTCAGTAGTTGCCTTTGTGCTTGTGCTAGTATAGCTTCACTT AAGCATGGTAAACAAATTCATGCCTATTTGTTACGAATTAATTTCCAACCTAATACCATA GTTGTTAGCGCACTCATCGACATGTACTCAAAATGTGGAAGCTTGGGAATTGGAAGGAAG GTTTTTGATCTTATGGGTAATAAGCTAGATGTTGTATTGTGGAACACGATTATATCTGCT TTGGCACAGCATGGTTGTGGAGAAGAGGCAATACAGATGCTTGATGACATGGTAAGATCA GGAGCAAAGCCAGATAAAATTACCTTTGTCGTCATTCTTAATGCATGTAGTCATTCAGGC CTTGTGCAGCAAGGGCTTAATTTCTTTGAGTCCATGTCTTGTGATTATGGCATTGTTCCC AGTCAGGAACATTATGCATGCTTAATTGATCTGTTGGGTCGAGCTGGATGTTTTGAGGAG GTAATGGACCAGCTTGAGAAGATGCCTTATAAGCCTGATGATCGTGTTTGGAATGCCTTA CTAGGTGTTTGTAGGATTCATGGACATATAGAGTTGGGAAGAAAAGCAGCTGAACGCCTT ATTGAGTTGGAACCTCAATCCTCCACAGCCTATGTATTACTTTCAAGTATATATGCTGTA CTTGGGAGGTGGGAGTCAGTACAGAAGGTTAGACAGCTTATGAATGAGAGACAGGTCAAG AAAGAGCGAGCCATTAGTTGGCTTGAAATTGAAAATAAGGTGCATAGTTTTAGTGTATCA GATAGTTCACACCCTCTGAAAGAACAAATATACTCGGTTTTGGAACAGTTAGCTGGCCAG ATGGAAGAAGATGCTTCATTATTTATCGCTCAAAGGTAAAGATTTGTCATTTTTTCTCCT TGCCAGGTTATATCAAGGGAAGCCTGAAAGAATAATGTCTCTATTCAATTTCAGCAGCTT GTAACATTTTTCTTTCCCTTTTTTATCATCGTGTATATTCTGTAGAACCAGATCTTCACG ATGAACATGGAGGATGTTTTTAAG