Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_03s0017g02180.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:3:18931865:18933652:-1 gene:VIT_03s0017g02180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAGTGATTATGATAATGCTAATGTTCTTTACGGTTTGGTCGTTAAACTGGGTAGTGAT TTTGTGGATGATTTTTTTGTTGTGAGTTCAGCTATTTTCATGTATGCCGAGCTTGGTTGT GTTGATTTTGCTAGGGAGATTTTTGACTGTTGTTTAGAGAGGAATACAGAGGTTTGGAAC ACTATGATTGGCGGGTATGTGCAGAATAATTGCCCCATTGAAGCAATTGATCTTTTTGTT CAAGTTATGGAGTCAGAGCAGTTTGTTCTTGATGATGTAACTTTTCTCTCTGCTTTAACT GCAATTTCACAATTGCAGTGGTTGGAATTGGGCCGACAGCTACATGCATATATACTCAAG AGTTCAACAATATTACAAGTTGTTATACTGAATGCAATCATTGTCATGTACTCAAGGTGC GGTTCTATCGGGACATCGTTCAAGGTTTTCAGTAACATGTTGGAAAGAGATGTCGTTACA TGGAATACCATGGTTTCTGCATTTGTGCAGAATGGGCTGGATGATGAAGGGTTAATGCTT GTGTTTGCGATGCAGAAGCAAGGATTTATGGTTGATTCTGTAACATTAACTGCTTTGCTT TCATTAGCGTCAAACCTTAGAAGCCAGGAAATAGGCAAGCAAGCCCATGCTTACCTCATT CGACATGGAATTCAATTCGAGGGAATGGACAGTTACCTTATAGACATGTATGCAAAATCA GGTTTAATTACTACCGCCCAGCAACTTTTTGAGAAAAACAGTGATTATGATAGAGACGAA GCCACATGGAATGCCATGATTGCTGGTTACACTCAAAATGGGCTGAGTGAAGAGGGTTTT GCTGTATTCAGGAAGATGATAGAGCAAAATGTAAGACCCAATGCTGTGACCTTAGCATCA ATTCTCCCAGCCTGCAATCCAATGGGAACTATTGGTTTGGGTAAGCAAATCCATGGCTTT GCCATTCGCTGCTTCCTCAACCGAAATGTCTTTGTGGGAACTGCTCTACTAGACATGTAC TCAAAATCAGGTGCAATCACCTATGCAGAAAATGTGTTTGCTGAAACCCTTGAAAAAAAT TCAGTCACTTACACCACCATGATATCGAGTTATGGTCAACATGGAATGGGTGAGAGAGCT CTCTCTCTCTTTCACGCAATGCTGGGATCTGGTATTAAACCTGATTCTGTTACCTTTGTT GCAATCTTGTCTGCTTGTAGTTATGCTGGGTTGGTAGATGAAGGTCTTAGAATATTTCAG TCAATGGAAAGAGAATATAAAATTCAGCCTTCTGCTGAGCATTACTGTTGTGTTGCAGAC ATGTTAGGGAGGGTTGGGCGGGTGGTGGAAGCCTACGAATTTGTTAAAGGACTGGGGGAA GAGGGTAATACATTCGGAATTTGGGGATCACTTCTTGGGGCCTGCCGAATTCATGGAGAA TTTGAATTGGGTAAAGTTGTTGCCAACAAATTGCTTGAAATGGAGAAAGGAAGCAGTTTG ACTGGCTATCATGTTTTGTTGTCAAATATATATGCAGCAGAAGGAAACTGGGACAATGTT GATCGGGTGAGAAAAGAGATGCGGCAAAAAGGTTTGATGAAGGAGGCTGGCTGCAGTTGG GTTGAGGTTGCAGGGCATGTGAACTGCTTTATGTCTAGGGATCATAAGCACCCTCAGTGT GCTGAAATATATCAAATGTTAGAAAAATTGGCCATGGAGATGAAAGATGCTGGTTATAAG CCTTGTCTCAATTTACAAACAGGGGGGATCTCTGCATCTGAGGAGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_03s0017g02180.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:3:18931865:18933652:-1 gene:VIT_03s0017g02180 transcript:VIT_03s0017g02180.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MSDYDNANVLYGLVVKLGSDFVDDFFVVSSAIFMYAELGCVDFAREIFDCCLERNTEVWN TMIGGYVQNNCPIEAIDLFVQVMESEQFVLDDVTFLSALTAISQLQWLELGRQLHAYILK SSTILQVVILNAIIVMYSRCGSIGTSFKVFSNMLERDVVTWNTMVSAFVQNGLDDEGLML VFAMQKQGFMVDSVTLTALLSLASNLRSQEIGKQAHAYLIRHGIQFEGMDSYLIDMYAKS GLITTAQQLFEKNSDYDRDEATWNAMIAGYTQNGLSEEGFAVFRKMIEQNVRPNAVTLAS ILPACNPMGTIGLGKQIHGFAIRCFLNRNVFVGTALLDMYSKSGAITYAENVFAETLEKN SVTYTTMISSYGQHGMGERALSLFHAMLGSGIKPDSVTFVAILSACSYAGLVDEGLRIFQ SMEREYKIQPSAEHYCCVADMLGRVGRVVEAYEFVKGLGEEGNTFGIWGSLLGACRIHGE FELGKVVANKLLEMEKGSSLTGYHVLLSNIYAAEGNWDNVDRVRKEMRQKGLMKEAGCSW VEVAGHVNCFMSRDHKHPQCAEIYQMLEKLAMEMKDAGYKPCLNLQTGGISASEE

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_03s0017g02180.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:3:18931865:18933652:-1 gene:VIT_03s0017g02180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAGTGATTATGATAATGCTAATGTTCTTTACGGTTTGGTCGTTAAACTGGGTAGTGAT TTTGTGGATGATTTTTTTGTTGTGAGTTCAGCTATTTTCATGTATGCCGAGCTTGGTTGT GTTGATTTTGCTAGGGAGATTTTTGACTGTTGTTTAGAGAGGAATACAGAGGTTTGGAAC ACTATGATTGGCGGGTATGTGCAGAATAATTGCCCCATTGAAGCAATTGATCTTTTTGTT CAAGTTATGGAGTCAGAGCAGTTTGTTCTTGATGATGTAACTTTTCTCTCTGCTTTAACT GCAATTTCACAATTGCAGTGGTTGGAATTGGGCCGACAGCTACATGCATATATACTCAAG AGTTCAACAATATTACAAGTTGTTATACTGAATGCAATCATTGTCATGTACTCAAGGTGC GGTTCTATCGGGACATCGTTCAAGGTTTTCAGTAACATGTTGGAAAGAGATGTCGTTACA TGGAATACCATGGTTTCTGCATTTGTGCAGAATGGGCTGGATGATGAAGGGTTAATGCTT GTGTTTGCGATGCAGAAGCAAGGATTTATGGTTGATTCTGTAACATTAACTGCTTTGCTT TCATTAGCGTCAAACCTTAGAAGCCAGGAAATAGGCAAGCAAGCCCATGCTTACCTCATT CGACATGGAATTCAATTCGAGGGAATGGACAGTTACCTTATAGACATGTATGCAAAATCA GGTTTAATTACTACCGCCCAGCAACTTTTTGAGAAAAACAGTGATTATGATAGAGACGAA GCCACATGGAATGCCATGATTGCTGGTTACACTCAAAATGGGCTGAGTGAAGAGGGTTTT GCTGTATTCAGGAAGATGATAGAGCAAAATGTAAGACCCAATGCTGTGACCTTAGCATCA ATTCTCCCAGCCTGCAATCCAATGGGAACTATTGGTTTGGGTAAGCAAATCCATGGCTTT GCCATTCGCTGCTTCCTCAACCGAAATGTCTTTGTGGGAACTGCTCTACTAGACATGTAC TCAAAATCAGGTGCAATCACCTATGCAGAAAATGTGTTTGCTGAAACCCTTGAAAAAAAT TCAGTCACTTACACCACCATGATATCGAGTTATGGTCAACATGGAATGGGTGAGAGAGCT CTCTCTCTCTTTCACGCAATGCTGGGATCTGGTATTAAACCTGATTCTGTTACCTTTGTT GCAATCTTGTCTGCTTGTAGTTATGCTGGGTTGGTAGATGAAGGTCTTAGAATATTTCAG TCAATGGAAAGAGAATATAAAATTCAGCCTTCTGCTGAGCATTACTGTTGTGTTGCAGAC ATGTTAGGGAGGGTTGGGCGGGTGGTGGAAGCCTACGAATTTGTTAAAGGACTGGGGGAA GAGGGTAATACATTCGGAATTTGGGGATCACTTCTTGGGGCCTGCCGAATTCATGGAGAA TTTGAATTGGGTAAAGTTGTTGCCAACAAATTGCTTGAAATGGAGAAAGGAAGCAGTTTG ACTGGCTATCATGTTTTGTTGTCAAATATATATGCAGCAGAAGGAAACTGGGACAATGTT GATCGGGTGAGAAAAGAGATGCGGCAAAAAGGTTTGATGAAGGAGGCTGGCTGCAGTTGG GTTGAGGTTGCAGGGCATGTGAACTGCTTTATGTCTAGGGATCATAAGCACCCTCAGTGT GCTGAAATATATCAAATGTTAGAAAAATTGGCCATGGAGATGAAAGATGCTGGTTATAAG CCTTGTCTCAATTTACAAACAGGGGGGATCTCTGCATCTGAGGAGTGA