Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_03s0017g02180.t01

CDS Infomation

cds chromosome:12X:3:18931865:18933652:-1 gene:VIT_03s0017g02180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGAGTGATTATGATAATGCTAATGTTCTTTACGGTTTGGTCGTTAAACTGGGTAGTGAT
TTTGTGGATGATTTTTTTGTTGTGAGTTCAGCTATTTTCATGTATGCCGAGCTTGGTTGT
GTTGATTTTGCTAGGGAGATTTTTGACTGTTGTTTAGAGAGGAATACAGAGGTTTGGAAC
ACTATGATTGGCGGGTATGTGCAGAATAATTGCCCCATTGAAGCAATTGATCTTTTTGTT
CAAGTTATGGAGTCAGAGCAGTTTGTTCTTGATGATGTAACTTTTCTCTCTGCTTTAACT
GCAATTTCACAATTGCAGTGGTTGGAATTGGGCCGACAGCTACATGCATATATACTCAAG
AGTTCAACAATATTACAAGTTGTTATACTGAATGCAATCATTGTCATGTACTCAAGGTGC
GGTTCTATCGGGACATCGTTCAAGGTTTTCAGTAACATGTTGGAAAGAGATGTCGTTACA
TGGAATACCATGGTTTCTGCATTTGTGCAGAATGGGCTGGATGATGAAGGGTTAATGCTT
GTGTTTGCGATGCAGAAGCAAGGATTTATGGTTGATTCTGTAACATTAACTGCTTTGCTT
TCATTAGCGTCAAACCTTAGAAGCCAGGAAATAGGCAAGCAAGCCCATGCTTACCTCATT
CGACATGGAATTCAATTCGAGGGAATGGACAGTTACCTTATAGACATGTATGCAAAATCA
GGTTTAATTACTACCGCCCAGCAACTTTTTGAGAAAAACAGTGATTATGATAGAGACGAA
GCCACATGGAATGCCATGATTGCTGGTTACACTCAAAATGGGCTGAGTGAAGAGGGTTTT
GCTGTATTCAGGAAGATGATAGAGCAAAATGTAAGACCCAATGCTGTGACCTTAGCATCA
ATTCTCCCAGCCTGCAATCCAATGGGAACTATTGGTTTGGGTAAGCAAATCCATGGCTTT
GCCATTCGCTGCTTCCTCAACCGAAATGTCTTTGTGGGAACTGCTCTACTAGACATGTAC
TCAAAATCAGGTGCAATCACCTATGCAGAAAATGTGTTTGCTGAAACCCTTGAAAAAAAT
TCAGTCACTTACACCACCATGATATCGAGTTATGGTCAACATGGAATGGGTGAGAGAGCT
CTCTCTCTCTTTCACGCAATGCTGGGATCTGGTATTAAACCTGATTCTGTTACCTTTGTT
GCAATCTTGTCTGCTTGTAGTTATGCTGGGTTGGTAGATGAAGGTCTTAGAATATTTCAG
TCAATGGAAAGAGAATATAAAATTCAGCCTTCTGCTGAGCATTACTGTTGTGTTGCAGAC
ATGTTAGGGAGGGTTGGGCGGGTGGTGGAAGCCTACGAATTTGTTAAAGGACTGGGGGAA
GAGGGTAATACATTCGGAATTTGGGGATCACTTCTTGGGGCCTGCCGAATTCATGGAGAA
TTTGAATTGGGTAAAGTTGTTGCCAACAAATTGCTTGAAATGGAGAAAGGAAGCAGTTTG
ACTGGCTATCATGTTTTGTTGTCAAATATATATGCAGCAGAAGGAAACTGGGACAATGTT
GATCGGGTGAGAAAAGAGATGCGGCAAAAAGGTTTGATGAAGGAGGCTGGCTGCAGTTGG
GTTGAGGTTGCAGGGCATGTGAACTGCTTTATGTCTAGGGATCATAAGCACCCTCAGTGT
GCTGAAATATATCAAATGTTAGAAAAATTGGCCATGGAGATGAAAGATGCTGGTTATAAG
CCTTGTCTCAATTTACAAACAGGGGGGATCTCTGCATCTGAGGAGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_03s0017g02180.t01

PEP Infomation

pep chromosome:12X:3:18931865:18933652:-1 gene:VIT_03s0017g02180 transcript:VIT_03s0017g02180.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

MSDYDNANVLYGLVVKLGSDFVDDFFVVSSAIFMYAELGCVDFAREIFDCCLERNTEVWN
TMIGGYVQNNCPIEAIDLFVQVMESEQFVLDDVTFLSALTAISQLQWLELGRQLHAYILK
SSTILQVVILNAIIVMYSRCGSIGTSFKVFSNMLERDVVTWNTMVSAFVQNGLDDEGLML
VFAMQKQGFMVDSVTLTALLSLASNLRSQEIGKQAHAYLIRHGIQFEGMDSYLIDMYAKS
GLITTAQQLFEKNSDYDRDEATWNAMIAGYTQNGLSEEGFAVFRKMIEQNVRPNAVTLAS
ILPACNPMGTIGLGKQIHGFAIRCFLNRNVFVGTALLDMYSKSGAITYAENVFAETLEKN
SVTYTTMISSYGQHGMGERALSLFHAMLGSGIKPDSVTFVAILSACSYAGLVDEGLRIFQ
SMEREYKIQPSAEHYCCVADMLGRVGRVVEAYEFVKGLGEEGNTFGIWGSLLGACRIHGE
FELGKVVANKLLEMEKGSSLTGYHVLLSNIYAAEGNWDNVDRVRKEMRQKGLMKEAGCSW
VEVAGHVNCFMSRDHKHPQCAEIYQMLEKLAMEMKDAGYKPCLNLQTGGISASEE

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_03s0017g02180.t01

Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:3:18931865:18933652:-1 gene:VIT_03s0017g02180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGAGTGATTATGATAATGCTAATGTTCTTTACGGTTTGGTCGTTAAACTGGGTAGTGAT
TTTGTGGATGATTTTTTTGTTGTGAGTTCAGCTATTTTCATGTATGCCGAGCTTGGTTGT
GTTGATTTTGCTAGGGAGATTTTTGACTGTTGTTTAGAGAGGAATACAGAGGTTTGGAAC
ACTATGATTGGCGGGTATGTGCAGAATAATTGCCCCATTGAAGCAATTGATCTTTTTGTT
CAAGTTATGGAGTCAGAGCAGTTTGTTCTTGATGATGTAACTTTTCTCTCTGCTTTAACT
GCAATTTCACAATTGCAGTGGTTGGAATTGGGCCGACAGCTACATGCATATATACTCAAG
AGTTCAACAATATTACAAGTTGTTATACTGAATGCAATCATTGTCATGTACTCAAGGTGC
GGTTCTATCGGGACATCGTTCAAGGTTTTCAGTAACATGTTGGAAAGAGATGTCGTTACA
TGGAATACCATGGTTTCTGCATTTGTGCAGAATGGGCTGGATGATGAAGGGTTAATGCTT
GTGTTTGCGATGCAGAAGCAAGGATTTATGGTTGATTCTGTAACATTAACTGCTTTGCTT
TCATTAGCGTCAAACCTTAGAAGCCAGGAAATAGGCAAGCAAGCCCATGCTTACCTCATT
CGACATGGAATTCAATTCGAGGGAATGGACAGTTACCTTATAGACATGTATGCAAAATCA
GGTTTAATTACTACCGCCCAGCAACTTTTTGAGAAAAACAGTGATTATGATAGAGACGAA
GCCACATGGAATGCCATGATTGCTGGTTACACTCAAAATGGGCTGAGTGAAGAGGGTTTT
GCTGTATTCAGGAAGATGATAGAGCAAAATGTAAGACCCAATGCTGTGACCTTAGCATCA
ATTCTCCCAGCCTGCAATCCAATGGGAACTATTGGTTTGGGTAAGCAAATCCATGGCTTT
GCCATTCGCTGCTTCCTCAACCGAAATGTCTTTGTGGGAACTGCTCTACTAGACATGTAC
TCAAAATCAGGTGCAATCACCTATGCAGAAAATGTGTTTGCTGAAACCCTTGAAAAAAAT
TCAGTCACTTACACCACCATGATATCGAGTTATGGTCAACATGGAATGGGTGAGAGAGCT
CTCTCTCTCTTTCACGCAATGCTGGGATCTGGTATTAAACCTGATTCTGTTACCTTTGTT
GCAATCTTGTCTGCTTGTAGTTATGCTGGGTTGGTAGATGAAGGTCTTAGAATATTTCAG
TCAATGGAAAGAGAATATAAAATTCAGCCTTCTGCTGAGCATTACTGTTGTGTTGCAGAC
ATGTTAGGGAGGGTTGGGCGGGTGGTGGAAGCCTACGAATTTGTTAAAGGACTGGGGGAA
GAGGGTAATACATTCGGAATTTGGGGATCACTTCTTGGGGCCTGCCGAATTCATGGAGAA
TTTGAATTGGGTAAAGTTGTTGCCAACAAATTGCTTGAAATGGAGAAAGGAAGCAGTTTG
ACTGGCTATCATGTTTTGTTGTCAAATATATATGCAGCAGAAGGAAACTGGGACAATGTT
GATCGGGTGAGAAAAGAGATGCGGCAAAAAGGTTTGATGAAGGAGGCTGGCTGCAGTTGG
GTTGAGGTTGCAGGGCATGTGAACTGCTTTATGTCTAGGGATCATAAGCACCCTCAGTGT
GCTGAAATATATCAAATGTTAGAAAAATTGGCCATGGAGATGAAAGATGCTGGTTATAAG
CCTTGTCTCAATTTACAAACAGGGGGGATCTCTGCATCTGAGGAGTGA