Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_03s0017g01340.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:3:17294038:17305033:-1 gene:VIT_03s0017g01340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGCCGCCGCGAGCCGCCGTGAGACGACCTTCGACAGCGTCTGCTCTCAAGAAGAAGCCT CCAAGAGAGGAAAAGGAGGAGAAGGAGTTTGTTGTGGGAGACATGGATAGATCAGAAAGG TTGGAGCTTGAAGATAATGACCCACAGTCTGATGCAGAAGACGATATGGGGCATTATATG GGAACAGAAGAGGAATGTCGGGAACAGAGAATTGATGGAGATGATGACCTGATGGGAGAT ATGATGGAAGGCGAGGATGAGGAAGAGGAGGATATGGGTGAGGATGATGTGGGAGGTGAA CATGAGGAGATGATGGATGGGTATGAAGACGAGCATCATGATTTAGTTAAAGAGCGTCGA AAGCGTAAGGAGTTTGAGGTCTTTGTTGGTGGATTGGACCGAGATGTCACAGAAGATGAT CTCTTTCACTTTTTCAGACAGGTGGGTGATATCACTGAAGTGAGACTTATGAAGAATGCC CTTACTCAGAAGAACAAGGGCTTTGCTTTCATACGGTTTGCAACTGTTGAGCAGGCTAGG CGTGCTGTCAATGAACTTAAGCATCCAGTGATTAATGGAAAGCAATGTGGGGTAGCTCCA AGTCAGGACAGTGACACACTCTTTGTTGGTAACATATGCAAGACATGGACAAAAGTAGCT GTGAAGGATAAGCTTGCATACTACGGTGTTGACAAGTATGAAGACTTGACATTGGTTGAA GATACCAAAAATGAGGGCATGAATCGGGGATTTGCTTTTTTGGATTTCTCTTCCAGGGCA GATGCCTTGGAAGCTTGCAAACGCTTGCAAAAGAGGGATGTTGTGTTCGGTACAGATCGA ACAGCAAGAGTTGCATTTGCAGACACTTTCATAGAACCTGATGACGAAATCATGTCACAG GTCAGGACGATATTCCTTGATGGGTTGCCTGCTACTTGGGATGAGGATCGTGTCAGGGAT TATCTTAAAAAGTTTGGGAGGATTGAAAAGATTGAACTTGCAAGAAATATGCCAGCTGCT AAAAGAACTGATTTTGGTTTTGTGACATTTGACACTCATGATTCTGCTGTGGCTTGTGTT GACAGTATTAATAATTCTGAGCTTGTTGATGGAGAAAGGCTGGTGAAAGTTAGAGCAAGG CTGTCTAGGCCACGCCAGAGAGGTAAGTCTGCTAAGCATGCTCGAGGTGGTTATCTAGTT GCACAGGGCAGCGGTCGAGGTTTCAAGGCTCCATGGGGATCTAGTTCATCCCGCATGGAT TCTTGGAAGTTTACAGGTCGTGGAGGGAGAAGTATGCAAACGCGTGGAGCATATGATGGT GGTCTTAAGCGGCCAGTTGGTCCTAGGGATAGACACTCAATGATGGAGATGGTTCCTACT AGAGTTGGGAGCAGGAGACGATTTCCTTCCCCAGAGAGTTCCTTCGGTCGAAGGTCACCT GTTTATGAAAAGAGCAGCACGAAGAGGGAGTACATTCAACGTGATGAATCCTTTTCTAGG CCAGCTGTTTTTGCTAGAGACCCCACAGAGAGGCGTTATTATAAAGATAATTACTCTTCA CGTGGATCTGAGTATTTGGACAGTCCTCCTAGAAATGTTTCTCGTGCTGCTGGTCATAGA GCTCCTCTTTATGAAGATGATGACTATGACCGATATTTGGAACGACCCACAAACTATCAT GATGGTCATAGGCATGATTATGGTTCTATTTCCAGTTCAAAACGTTCCCATTCAGCAATG GAGGAAGTTCATTCTCGTTATGCTGAGCCTCCAATTAGGCACTCGAGGGCCCGTTTTGAT TATGGGGGGAGCAATTCAGGATTGCCCTATGACGACCATTATGGAAGTGAATCTACAAGT GAACGCAGGATGGGCCGTGGTTCTCGTCTAGGGTATGATGGAGGTATGCGAAGTTCTTCA GGGCATTCTCGAGGAATGTATGAGACAAGAACATCAACTACTGGGTACAGAAGAGTCCTT GCAGATGATATTAGCCGGGGGAATGAAGAAGGGATGTATTCCAGCTATGACCGTGAGTAT ATGTCCAGGGACTACATGCCTTCTCGATCAGATCTAGGGACAGGTTCTTACCCTTCTGAC TACCCTAGTCGTCGCATGAATGATGGATACTTGAGTGGCCGAGGTTCAGGTTCAGGTTCA TATTATTAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_03s0017g01340.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:3:17294038:17305033:-1 gene:VIT_03s0017g01340 transcript:VIT_03s0017g01340.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MPPRAAVRRPSTASALKKKPPREEKEEKEFVVGDMDRSERLELEDNDPQSDAEDDMGHYM GTEEECREQRIDGDDDLMGDMMEGEDEEEEDMGEDDVGGEHEEMMDGYEDEHHDLVKERR KRKEFEVFVGGLDRDVTEDDLFHFFRQVGDITEVRLMKNALTQKNKGFAFIRFATVEQAR RAVNELKHPVINGKQCGVAPSQDSDTLFVGNICKTWTKVAVKDKLAYYGVDKYEDLTLVE DTKNEGMNRGFAFLDFSSRADALEACKRLQKRDVVFGTDRTARVAFADTFIEPDDEIMSQ VRTIFLDGLPATWDEDRVRDYLKKFGRIEKIELARNMPAAKRTDFGFVTFDTHDSAVACV DSINNSELVDGERLVKVRARLSRPRQRGKSAKHARGGYLVAQGSGRGFKAPWGSSSSRMD SWKFTGRGGRSMQTRGAYDGGLKRPVGPRDRHSMMEMVPTRVGSRRRFPSPESSFGRRSP VYEKSSTKREYIQRDESFSRPAVFARDPTERRYYKDNYSSRGSEYLDSPPRNVSRAAGHR APLYEDDDYDRYLERPTNYHDGHRHDYGSISSSKRSHSAMEEVHSRYAEPPIRHSRARFD YGGSNSGLPYDDHYGSESTSERRMGRGSRLGYDGGMRSSSGHSRGMYETRTSTTGYRRVL ADDISRGNEEGMYSSYDREYMSRDYMPSRSDLGTGSYPSDYPSRRMNDGYLSGRGSGSGS YY

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_03s0017g01340.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:3:17294038:17305033:-1 gene:VIT_03s0017g01340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	CTCCCAAAACGCTGCGTTTTGCCTCTCGACACTCTCAAAACGCTGCGCTTTGACTCTACC AGTCTCCGTAAATCGACCGCCGATGCCGCCGCGAGCCGCCGTGAGACGACCTTCGACAGC GTCTGCTCTCAAGAAGAAGCCTCCAAGAGAGGAAAAGGAGGAGAAGGAGTTTGTTGTGGG AGACATGGATAGATCAGAAAGGTTGGAGCTTGAAGATAATGACCCACAGTCTGATGCAGA AGACGATATGGGGCATTATATGGGAACAGAAGAGGAATGTCGGGAACAGAGAATTGATGG AGATGATGACCTGATGGGAGATATGATGGAAGGCGAGGATGAGGAAGAGGAGGATATGGG TGAGGATGATGTGGGAGGTGAACATGAGGAGATGATGGATGGGTATGAAGACGAGCATCA TGATTTAGTTAAAGAGCGTCGAAAGCGTAAGGAGTTTGAGGTCTTTGTTGGTGGATTGGA CCGAGATGTCACAGAAGATGATCTCTTTCACTTTTTCAGACAGGTGGGTGATATCACTGA AGTGAGACTTATGAAGAATGCCCTTACTCAGAAGAACAAGGGCTTTGCTTTCATACGGTT TGCAACTGTTGAGCAGGCTAGGCGTGCTGTCAATGAACTTAAGCATCCAGTGATTAATGG AAAGCAATGTGGGGTAGCTCCAAGTCAGGACAGTGACACACTCTTTGTTGGTAACATATG CAAGACATGGACAAAAGTAGCTGTGAAGGATAAGCTTGCATACTACGGTGTTGACAAGTA TGAAGACTTGACATTGGTTGAAGATACCAAAAATGAGGGCATGAATCGGGGATTTGCTTT TTTGGATTTCTCTTCCAGGGCAGATGCCTTGGAAGCTTGCAAACGCTTGCAAAAGAGGGA TGTTGTGTTCGGTACAGATCGAACAGCAAGAGTTGCATTTGCAGACACTTTCATAGAACC TGATGACGAAATCATGTCACAGGTCAGGACGATATTCCTTGATGGGTTGCCTGCTACTTG GGATGAGGATCGTGTCAGGGATTATCTTAAAAAGTTTGGGAGGATTGAAAAGATTGAACT TGCAAGAAATATGCCAGCTGCTAAAAGAACTGATTTTGGTTTTGTGACATTTGACACTCA TGATTCTGCTGTGGCTTGTGTTGACAGTATTAATAATTCTGAGCTTGTTGATGGAGAAAG GCTGGTGAAAGTTAGAGCAAGGCTGTCTAGGCCACGCCAGAGAGGTAAGTCTGCTAAGCA TGCTCGAGGTGGTTATCTAGTTGCACAGGGCAGCGGTCGAGGTTTCAAGGCTCCATGGGG ATCTAGTTCATCCCGCATGGATTCTTGGAAGTTTACAGGTCGTGGAGGGAGAAGTATGCA AACGCGTGGAGCATATGATGGTGGTCTTAAGCGGCCAGTTGGTCCTAGGGATAGACACTC AATGATGGAGATGGTTCCTACTAGAGTTGGGAGCAGGAGACGATTTCCTTCCCCAGAGAG TTCCTTCGGTCGAAGGTCACCTGTTTATGAAAAGAGCAGCACGAAGAGGGAGTACATTCA ACGTGATGAATCCTTTTCTAGGCCAGCTGTTTTTGCTAGAGACCCCACAGAGAGGCGTTA TTATAAAGATAATTACTCTTCACGTGGATCTGAGTATTTGGACAGTCCTCCTAGAAATGT TTCTCGTGCTGCTGGTCATAGAGCTCCTCTTTATGAAGATGATGACTATGACCGATATTT GGAACGACCCACAAACTATCATGATGGTCATAGGCATGATTATGGTTCTATTTCCAGTTC AAAACGTTCCCATTCAGCAATGGAGGAAGTTCATTCTCGTTATGCTGAGCCTCCAATTAG GCACTCGAGGGCCCGTTTTGATTATGGGGGGAGCAATTCAGGATTGCCCTATGACGACCA TTATGGAAGTGAATCTACAAGTGAACGCAGGATGGGCCGTGGTTCTCGTCTAGGGTATGA TGGAGGTATGCGAAGTTCTTCAGGGCATTCTCGAGGAATGTATGAGACAAGAACATCAAC TACTGGGTACAGAAGAGTCCTTGCAGATGATATTAGCCGGGGGAATGAAGAAGGGATGTA TTCCAGCTATGACCGTGAGTATATGTCCAGGGACTACATGCCTTCTCGATCAGATCTAGG GACAGGTTCTTACCCTTCTGACTACCCTAGTCGTCGCATGAATGATGGATACTTGAGTGG CCGAGGTTCAGGTTCAGGTTCATATTATTAAGGTGAGTTTGCTTGTGGTTTCTCTGGAGT ATTTTCTATGCATGTGCATCAAAAAGCACATCTCAGATACATAAGGAGGTTCCTGAAGTT AGAAAACAACTCCTTTGGAGGCTGACTTAGTGGTGCTTACCTTGATGGCCTCCCCATAGC GTTAACATGAATGAATTTTAGTGTGTGGGAGTAGTTTCTGATTACTTGAAGACTTTCAGA AAGTAGTTTGTGGACTCATTCAATTCATCTACTGTACTGAAATTGGTTATTGGATTGGTA ATTTTAGGATATTTATCCAGGATGAGGTTCTGTATTGGTAAAGTTAAAAGAGGAACCAAG ATGCGCTTGTTGCTTGGTTGAGTGTTTGAGAACGAAAAGTTCTTGGAGTCACTATGTACA AAAATGCTGTTTCTCCTGATGGTTCTGTCTATCTGGTTAGGTGGATAGTTTGAAGTGCTA CTGAACATGCACTTTTTCTTGCTCTATTATTGAATGTTCTGTGAAACTCCCATAATAAGC TATTTGGGATGTGCTTTTATGATGGGTATTGAAG