Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_02s0087g00080.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:2:17196376:17198281:-1 gene:VIT_02s0087g00080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGCAAGACTTGAAGCAACTCCATGCCCAGATGATCAAGACCGCCCAAATTCGAGACCCA CTCGCCGCTGCCGAACTCCTCCGCTTCTCCGCCGTCTCCGACCACCGTGATCTCGACTAC GCCCGCAAGATTTTCCGAAGCATGCACCGACCCAACTGCTTCTCCTACAACACCCTCATA AGAGCTCTGTCCGAGAGCAACGACCCATGTGATGCCTTGCTGGTGTTCATTGAAATGGTT GAAGATTGCAGTGTGGAGCCCAATTGCTTCACATTTCCTTCTGTTTTTAAGGCTTGTGGT AGAGCTGAGAGGCTCCGAGAAGGGAGGCAGGTTCATGGGTTGGCGGTGAAATTTGGACTT GATAGTGATGAATTTGTGGTTAGTAATGTTGTTAGGATGTATTTGAGTTGTGGGGTTATG GAGGATGCTCATAGGTTGTTCTACAGAAGGGTTTTTGTTGATGGGTGTGATGGAATTAGA GATAAGAAGAGGAGGGTTGATGGGGATGTTGTTTTGTGGAATGTCATGATTGATGGGTAT GTGAGAATTGGGGAGCTTGAGGTTGCTAGGAATTTGTTTGATGAAATGCCTCAAAGAAGT GTAGTCTCTTGGAATGTGATGATAGCGGGGTATGCACAAAGCGGGCATTTCAAAGAGGCG GTGGAGGTGTTTCGCGAGATGCAGATGGCTGAGGTGCCCCCGAATTATGTGACTTTGGTT AGTGTTCTCCCCGCCATGTCCCGGCTTGGGGCGCTTGAGTTGGGGAAGTGGGTGCATTTG TATGCTGTGAGGAACAACATTGGGGTTGATGATGTGCTTGGGTCTGCGCTAATTGATATG TATGCCAAGTGTGGGAGCATTGAGAAGGCACTGCAGGTCTTTGAGGGGTTACCAAAAAGG AATGTGGTCACATGGAGTACTATTATTGCAGGGCTTGCGATGCATGGTCGAGCAAAAGAT ACACTCGATCACTTTGAGGATATGGAACGGGCTGGAGTTATGCCCAGCGATGTCACATAT ATCGGTCTCTTGAGTGCATGTAGCCATGCAGGTTTAGTCAATGAGGGTAGATGGTTTTTT GACCACATGGTTAGGGTATCTGGCTTAGAACCAAGGATTGAACATTACGGTTGCATGGTT GATCTATTAGGTCGAGCTGGTCTTTTAGAAGAGTCTGAAGAGCTTATACTGAACATGCCG ATTAAACCTGATGATGTGATATGGAAGGCCTTGCTTGGTGCTTGTAAGATGCATGGAAAT GTTGAGATGGGTAAACGTGTTGCAGAGCATCTGATGGAGTTGGCTCCTCATGACAGTGGC TCCTATGTGGCCCTGTCAAATATATATGCCTCTTTGGGAAATTGGGAAGGGGTTGCTAAA GTGAGGTTGATGATGAAGGAGATGGACGTAAGGAAAGACCCAGGGTGTAGTTGGATTGAG CTTGATGGAGTGATTCATGAGTTCCTTGTGGAAGATGATTCCCATCCCAAATCCAAAAAG ATCCATTCAATGTTGCAGGAGATGTCAAGAAATTTGATATTGGTAGGCTATAGGCCAAAC ACTACACAAGTCTTGACCAACATGGATGAAGAAGACAAAGAAAGCTCCTTAAACTATCAT AGTGAAAAGATTGCGATTGCTTTTGGCTTAATCAGCACACAGCCACAAACACCACTTCGG ATTACTAAGAACCTTCGCATATGTGAAGATTGTCACTCTTCAATAAAACTAATCTCAAAA ATATATAAACGGAAGATCATTGTAAGGGACCGAAAGCGCTTTCATCATTTTGTGAATGGC TCATGTTCTTGTATGGATTATTGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_02s0087g00080.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:2:17196376:17198281:-1 gene:VIT_02s0087g00080 transcript:VIT_02s0087g00080.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MQDLKQLHAQMIKTAQIRDPLAAAELLRFSAVSDHRDLDYARKIFRSMHRPNCFSYNTLI RALSESNDPCDALLVFIEMVEDCSVEPNCFTFPSVFKACGRAERLREGRQVHGLAVKFGL DSDEFVVSNVVRMYLSCGVMEDAHRLFYRRVFVDGCDGIRDKKRRVDGDVVLWNVMIDGY VRIGELEVARNLFDEMPQRSVVSWNVMIAGYAQSGHFKEAVEVFREMQMAEVPPNYVTLV SVLPAMSRLGALELGKWVHLYAVRNNIGVDDVLGSALIDMYAKCGSIEKALQVFEGLPKR NVVTWSTIIAGLAMHGRAKDTLDHFEDMERAGVMPSDVTYIGLLSACSHAGLVNEGRWFF DHMVRVSGLEPRIEHYGCMVDLLGRAGLLEESEELILNMPIKPDDVIWKALLGACKMHGN VEMGKRVAEHLMELAPHDSGSYVALSNIYASLGNWEGVAKVRLMMKEMDVRKDPGCSWIE LDGVIHEFLVEDDSHPKSKKIHSMLQEMSRNLILVGYRPNTTQVLTNMDEEDKESSLNYH SEKIAIAFGLISTQPQTPLRITKNLRICEDCHSSIKLISKIYKRKIIVRDRKRFHHFVNG SCSCMDYW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_02s0087g00080.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:2:17196376:17198281:-1 gene:VIT_02s0087g00080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATCCATGAATTCAACAATCTTCACATCCACAACCTCACTATGGCCTCCATCTTCTTTCTT CCCATGCAAAACCATGCAAGACTTGAAGCAACTCCATGCCCAGATGATCAAGACCGCCCA AATTCGAGACCCACTCGCCGCTGCCGAACTCCTCCGCTTCTCCGCCGTCTCCGACCACCG TGATCTCGACTACGCCCGCAAGATTTTCCGAAGCATGCACCGACCCAACTGCTTCTCCTA CAACACCCTCATAAGAGCTCTGTCCGAGAGCAACGACCCATGTGATGCCTTGCTGGTGTT CATTGAAATGGTTGAAGATTGCAGTGTGGAGCCCAATTGCTTCACATTTCCTTCTGTTTT TAAGGCTTGTGGTAGAGCTGAGAGGCTCCGAGAAGGGAGGCAGGTTCATGGGTTGGCGGT GAAATTTGGACTTGATAGTGATGAATTTGTGGTTAGTAATGTTGTTAGGATGTATTTGAG TTGTGGGGTTATGGAGGATGCTCATAGGTTGTTCTACAGAAGGGTTTTTGTTGATGGGTG TGATGGAATTAGAGATAAGAAGAGGAGGGTTGATGGGGATGTTGTTTTGTGGAATGTCAT GATTGATGGGTATGTGAGAATTGGGGAGCTTGAGGTTGCTAGGAATTTGTTTGATGAAAT GCCTCAAAGAAGTGTAGTCTCTTGGAATGTGATGATAGCGGGGTATGCACAAAGCGGGCA TTTCAAAGAGGCGGTGGAGGTGTTTCGCGAGATGCAGATGGCTGAGGTGCCCCCGAATTA TGTGACTTTGGTTAGTGTTCTCCCCGCCATGTCCCGGCTTGGGGCGCTTGAGTTGGGGAA GTGGGTGCATTTGTATGCTGTGAGGAACAACATTGGGGTTGATGATGTGCTTGGGTCTGC GCTAATTGATATGTATGCCAAGTGTGGGAGCATTGAGAAGGCACTGCAGGTCTTTGAGGG GTTACCAAAAAGGAATGTGGTCACATGGAGTACTATTATTGCAGGGCTTGCGATGCATGG TCGAGCAAAAGATACACTCGATCACTTTGAGGATATGGAACGGGCTGGAGTTATGCCCAG CGATGTCACATATATCGGTCTCTTGAGTGCATGTAGCCATGCAGGTTTAGTCAATGAGGG TAGATGGTTTTTTGACCACATGGTTAGGGTATCTGGCTTAGAACCAAGGATTGAACATTA CGGTTGCATGGTTGATCTATTAGGTCGAGCTGGTCTTTTAGAAGAGTCTGAAGAGCTTAT ACTGAACATGCCGATTAAACCTGATGATGTGATATGGAAGGCCTTGCTTGGTGCTTGTAA GATGCATGGAAATGTTGAGATGGGTAAACGTGTTGCAGAGCATCTGATGGAGTTGGCTCC TCATGACAGTGGCTCCTATGTGGCCCTGTCAAATATATATGCCTCTTTGGGAAATTGGGA AGGGGTTGCTAAAGTGAGGTTGATGATGAAGGAGATGGACGTAAGGAAAGACCCAGGGTG TAGTTGGATTGAGCTTGATGGAGTGATTCATGAGTTCCTTGTGGAAGATGATTCCCATCC CAAATCCAAAAAGATCCATTCAATGTTGCAGGAGATGTCAAGAAATTTGATATTGGTAGG CTATAGGCCAAACACTACACAAGTCTTGACCAACATGGATGAAGAAGACAAAGAAAGCTC CTTAAACTATCATAGTGAAAAGATTGCGATTGCTTTTGGCTTAATCAGCACACAGCCACA AACACCACTTCGGATTACTAAGAACCTTCGCATATGTGAAGATTGTCACTCTTCAATAAA ACTAATCTCAAAAATATATAAACGGAAGATCATTGTAAGGGACCGAAAGCGCTTTCATCA TTTTGTGAATGGCTCATGTTCTTGTATGGATTATTGGTAATTTCTT