Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_02s0033g01410.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:2:16907202:16934203:-1 gene:VIT_02s0033g01410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCAGGAGCATTGACATTCAGCAGTGACGGAGTGGGAGCATTGGGATTTTGGAAAACC CACCAATATGGGTTTATTTCTGGGGGTTTCAACAGGCCATTGTTGAAGAATTGTGTTCCT CGGCACCCATCTTCTCCATCTCGCCCCTTCAGAAAGAGGGTTAAGAAGAGGCTGATTGGT GAAAGATTAGTGATCAAGATGGCAGAATATGAAGGAAAGGTGGTCCCTGCAGATTTCACT TCTGGAAATATGCTTTTTGAACCTATCCTGGAGGAAGGGGTTTTCCGGTTTGATTGTTCT TCAGATGATAGAGATGCAGCATTTCCCAGTCTTTCATTTACTAATCAGAAAAATAGAGAT ATGCCAATCATGAATCACAAGGTTCCTATGTATACCCCTACATTTGAATGTGTTTTGGGG CAACAGATTGTTACAATTGAGCTTCCCACTGGTACCTCCTTTTATGGAACAGGAGAAGTT AGTGGACAGCTTGAGCGGACAGGGAAGAGAGTTTTTACGTGGAACACAGATGCATGGGGT TATGGTTCTGGAACAACATCCTTGTACCAGTCACATCCTTGGGTTCTAGCTGTTCTTCCA AATGGGGAGGCACTTGGGATTCTTGCTGATACAACACGGCGCTGCGAGATTGATTTGCAG AAAGAATCAATAGTAAAGTTTAGTGCTTCATCCTCTTATCCCATCATCACATTTGGTCCA TTTGCTTCACCAACTGCAGTTTTGACATCTTTATCACATGCAATTGGAACTGTATTTATG CCCCCAAAGTGGTCCTTAGGCTATCAGCAATGCCGATGGAGCTATGATTCTGCTGTGAGA GTTCTTGAGGTTGCCCGAACATTCCGTGAGAAGGGAATACCTTGTGATGTCATATGGATG GATATTGATTACATGGATGGTTTTCGCTGTTTCACTTTTGATCAGGAGCGTTTCTCAGAT CCAAAATCTTTGGGTAAGGATCTTCATCTTAATGGTTTCAAAGCAATCTGGATGCTTGAC CCAGGGATCAAACAAGAAGATGGTTACTTTGTTTATGATAGTGGTTCTGCAAATGATGTC TGGATTCATAAAGCAGATGGAACACCTTTTGTTGGGAAAGTATGGCCCGGTCCTTGTGTT TTCCCTGACTTTACCCAGTCAAAAGCTCGTTCATGGTGGGCCTGTTTAGTCAAAGATTTT ATTTCTAATGGTGTTGATGGTATATGGAATGATATGAATGAACCAGCTGTTTTTAAGACT GTAACAAAGACAATGCCTGAGGACAATGTTCATAGAGGAGATGCTGAGCTTGGAGGTTGT CAGAATCACTCACACTATCACAATGTCTATGGCATGCTGATGGCAAGATCAACATATGAA GGAATGAAATTAGCTAATGAAAATAAGCGTCCTTTTGTTCTCACTAGAGCTGGGTATATC GGTAGCCAGAGATATGCAGCAACATGGACAGGAGATAACCTTTCAAACTGGGATCACCTC CATATGAGTATCTCTATGGTGCTTCAATTGGGGCTTAGTGGTCAACCACTATCAGGACCA GACATTGGTGGATTTGCTGGAAATGCAACACCCAGGCTATTTGGAAGGTGGATGGGTGTG GGTGCTATGTTTCCTTTTTGTCGCGGGCATTCTGAAACTGGCACAGTTGACCATGAACCC TGGTCTTTTGGGGAAGAGTGTGAAGAAGTTTGCCGTTTGGCATTGAAAAGGCGGTACCGC TTGATACCACACATATATACTCTGTTTTATATGGCACATACAACTGGTACTCCAGTGGCA ACTCCCACCTTTTTTGCAGATCCAAAGGATCCCAGCTTGAGGACAGTTGAGAACTCCTTT CTCATGGGACCCCTTCTAATATATGCAAGCACTATACCTGACCAGGGATTGGATGAATTA CAGCACAAATTACCCAAAGGCATTTGGCTGAGCTTTGATTTTGATGATTCACATCCGGAT TTACCAGCTCTATATTTGCAAGGTGGATCGATCATTCCTTTGGGTCCTCCCCATCAGCAT GTTGGTGAAGCTGATCCAACAGATGACTTAATACTCCTTGTCGCTCTAGATGAACATGGG AAAGCTGAAGGTGTTCTCTTTGAAGATGATGGTGATGGGTATGAATTCACAACAGGTGGA TATCTATTGACATACTATGTTGCTGAACTTCAATCTTCAGTTGTTTCTGTTAGAGTTTCC AAAACTGAAGGATCATGGAAAAGGCCAAAGCGTGGTCTTCATGTCCAATTATTGCTTGGT GGAGGTGCAAAGATTGATGCACAAGGCACTGATGGAGAGGTTTTACAAATTACGATGCCT TCAGAACATGAAGTGTCTGACCTGGTATCTACAAGCAAGGAACAATACAGGAATCGTCTA GAAAGTGCTAAGCATATTCCAGATGTACAAGAGGTTTCTGGCCATAAGGGAATAGAACTT TCAAGTACTCCTATTGAACTGAAAAGTGGTGATTGGGCTCTCAAAGTGGTCCCTTGGATT GGGGGTAGAATTATTTCCATGATGCATCTTCCTTCTGGAACTCAGTGGCTTCATAGCAGG ATTGAAGCTAATGGATATGAAGAATACAGTGGTGTTGAGTACCGGTCAGCTGGATGGTCT GAGGAATATACCATTGTTGAGCGTAATCTTGAGCAGGCAGGAGAGGAGGAATCACTTAAG TTAGAAGGTGAAATTGGTGGAGGATTAGTTATTGAGCGGCAAATATCCCTGCCAAAAGAT AATTCCAAGGTTTTCCGAGTAGATTCTGGCATTATAGCCCATAATGTTGGTGCTGGCTCT GGTGGATATTCAAGGCTGGTTTGCCTCCGTGTGCACCCAATGTTCAATCTCTTGCACCCA ACAGAATCTTTTGTCTCGTTTGTCTCCATTGATGGATCTAAGCATGAAGTTTGGCCTGAA GCTGGTGAGCAGTCTTATGAAGGGAATCTTCGGCCTAATGGTGAATGGATGCTGGTTGAT AAATGTCTCGGGCTGGCTCTAGTGAACCGGTTCGACATCACTGAAGTCCACAAGTGTCTC GTTCACTGGGGAACCGGAACAGTTAACTTAGAGCTGTGGTCAGAACAGAGACCGGTTTCC AAGCAATCACCTCTTACGATCTCCCATGAATATGAGGTGAGAGTGATCCCTTAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_02s0033g01410.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:2:16907202:16934203:-1 gene:VIT_02s0033g01410 transcript:VIT_02s0033g01410.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MAGALTFSSDGVGALGFWKTHQYGFISGGFNRPLLKNCVPRHPSSPSRPFRKRVKKRLIG ERLVIKMAEYEGKVVPADFTSGNMLFEPILEEGVFRFDCSSDDRDAAFPSLSFTNQKNRD MPIMNHKVPMYTPTFECVLGQQIVTIELPTGTSFYGTGEVSGQLERTGKRVFTWNTDAWG YGSGTTSLYQSHPWVLAVLPNGEALGILADTTRRCEIDLQKESIVKFSASSSYPIITFGP FASPTAVLTSLSHAIGTVFMPPKWSLGYQQCRWSYDSAVRVLEVARTFREKGIPCDVIWM DIDYMDGFRCFTFDQERFSDPKSLGKDLHLNGFKAIWMLDPGIKQEDGYFVYDSGSANDV WIHKADGTPFVGKVWPGPCVFPDFTQSKARSWWACLVKDFISNGVDGIWNDMNEPAVFKT VTKTMPEDNVHRGDAELGGCQNHSHYHNVYGMLMARSTYEGMKLANENKRPFVLTRAGYI GSQRYAATWTGDNLSNWDHLHMSISMVLQLGLSGQPLSGPDIGGFAGNATPRLFGRWMGV GAMFPFCRGHSETGTVDHEPWSFGEECEEVCRLALKRRYRLIPHIYTLFYMAHTTGTPVA TPTFFADPKDPSLRTVENSFLMGPLLIYASTIPDQGLDELQHKLPKGIWLSFDFDDSHPD LPALYLQGGSIIPLGPPHQHVGEADPTDDLILLVALDEHGKAEGVLFEDDGDGYEFTTGG YLLTYYVAELQSSVVSVRVSKTEGSWKRPKRGLHVQLLLGGGAKIDAQGTDGEVLQITMP SEHEVSDLVSTSKEQYRNRLESAKHIPDVQEVSGHKGIELSSTPIELKSGDWALKVVPWI GGRIISMMHLPSGTQWLHSRIEANGYEEYSGVEYRSAGWSEEYTIVERNLEQAGEEESLK LEGEIGGGLVIERQISLPKDNSKVFRVDSGIIAHNVGAGSGGYSRLVCLRVHPMFNLLHP TESFVSFVSIDGSKHEVWPEAGEQSYEGNLRPNGEWMLVDKCLGLALVNRFDITEVHKCL VHWGTGTVNLELWSEQRPVSKQSPLTISHEYEVRVIP

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_02s0033g01410.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:2:16907202:16934203:-1 gene:VIT_02s0033g01410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCAGGAGCATTGACATTCAGCAGTGACGGAGTGGGAGCATTGGGATTTTGGAAAACC CACCAATATGGGTTTATTTCTGGGGGTTTCAACAGGCCATTGTTGAAGAATTGTGTTCCT CGGCACCCATCTTCTCCATCTCGCCCCTTCAGAAAGAGGGTTAAGAAGAGGCTGATTGGT GAAAGATTAGTGATCAAGATGGCAGAATATGAAGGAAAGGTGGTCCCTGCAGATTTCACT TCTGGAAATATGCTTTTTGAACCTATCCTGGAGGAAGGGGTTTTCCGGTTTGATTGTTCT TCAGATGATAGAGATGCAGCATTTCCCAGTCTTTCATTTACTAATCAGAAAAATAGAGAT ATGCCAATCATGAATCACAAGGTTCCTATGTATACCCCTACATTTGAATGTGTTTTGGGG CAACAGATTGTTACAATTGAGCTTCCCACTGGTACCTCCTTTTATGGAACAGGAGAAGTT AGTGGACAGCTTGAGCGGACAGGGAAGAGAGTTTTTACGTGGAACACAGATGCATGGGGT TATGGTTCTGGAACAACATCCTTGTACCAGTCACATCCTTGGGTTCTAGCTGTTCTTCCA AATGGGGAGGCACTTGGGATTCTTGCTGATACAACACGGCGCTGCGAGATTGATTTGCAG AAAGAATCAATAGTAAAGTTTAGTGCTTCATCCTCTTATCCCATCATCACATTTGGTCCA TTTGCTTCACCAACTGCAGTTTTGACATCTTTATCACATGCAATTGGAACTGTATTTATG CCCCCAAAGTGGTCCTTAGGCTATCAGCAATGCCGATGGAGCTATGATTCTGCTGTGAGA GTTCTTGAGGTTGCCCGAACATTCCGTGAGAAGGGAATACCTTGTGATGTCATATGGATG GATATTGATTACATGGATGGTTTTCGCTGTTTCACTTTTGATCAGGAGCGTTTCTCAGAT CCAAAATCTTTGGGTAAGGATCTTCATCTTAATGGTTTCAAAGCAATCTGGATGCTTGAC CCAGGGATCAAACAAGAAGATGGTTACTTTGTTTATGATAGTGGTTCTGCAAATGATGTC TGGATTCATAAAGCAGATGGAACACCTTTTGTTGGGAAAGTATGGCCCGGTCCTTGTGTT TTCCCTGACTTTACCCAGTCAAAAGCTCGTTCATGGTGGGCCTGTTTAGTCAAAGATTTT ATTTCTAATGGTGTTGATGGTATATGGAATGATATGAATGAACCAGCTGTTTTTAAGACT GTAACAAAGACAATGCCTGAGGACAATGTTCATAGAGGAGATGCTGAGCTTGGAGGTTGT CAGAATCACTCACACTATCACAATGTCTATGGCATGCTGATGGCAAGATCAACATATGAA GGAATGAAATTAGCTAATGAAAATAAGCGTCCTTTTGTTCTCACTAGAGCTGGGTATATC GGTAGCCAGAGATATGCAGCAACATGGACAGGAGATAACCTTTCAAACTGGGATCACCTC CATATGAGTATCTCTATGGTGCTTCAATTGGGGCTTAGTGGTCAACCACTATCAGGACCA GACATTGGTGGATTTGCTGGAAATGCAACACCCAGGCTATTTGGAAGGTGGATGGGTGTG GGTGCTATGTTTCCTTTTTGTCGCGGGCATTCTGAAACTGGCACAGTTGACCATGAACCC TGGTCTTTTGGGGAAGAGTGTGAAGAAGTTTGCCGTTTGGCATTGAAAAGGCGGTACCGC TTGATACCACACATATATACTCTGTTTTATATGGCACATACAACTGGTACTCCAGTGGCA ACTCCCACCTTTTTTGCAGATCCAAAGGATCCCAGCTTGAGGACAGTTGAGAACTCCTTT CTCATGGGACCCCTTCTAATATATGCAAGCACTATACCTGACCAGGGATTGGATGAATTA CAGCACAAATTACCCAAAGGCATTTGGCTGAGCTTTGATTTTGATGATTCACATCCGGAT TTACCAGCTCTATATTTGCAAGGTGGATCGATCATTCCTTTGGGTCCTCCCCATCAGCAT GTTGGTGAAGCTGATCCAACAGATGACTTAATACTCCTTGTCGCTCTAGATGAACATGGG AAAGCTGAAGGTGTTCTCTTTGAAGATGATGGTGATGGGTATGAATTCACAACAGGTGGA TATCTATTGACATACTATGTTGCTGAACTTCAATCTTCAGTTGTTTCTGTTAGAGTTTCC AAAACTGAAGGATCATGGAAAAGGCCAAAGCGTGGTCTTCATGTCCAATTATTGCTTGGT GGAGGTGCAAAGATTGATGCACAAGGCACTGATGGAGAGGTTTTACAAATTACGATGCCT TCAGAACATGAAGTGTCTGACCTGGTATCTACAAGCAAGGAACAATACAGGAATCGTCTA GAAAGTGCTAAGCATATTCCAGATGTACAAGAGGTTTCTGGCCATAAGGGAATAGAACTT TCAAGTACTCCTATTGAACTGAAAAGTGGTGATTGGGCTCTCAAAGTGGTCCCTTGGATT GGGGGTAGAATTATTTCCATGATGCATCTTCCTTCTGGAACTCAGTGGCTTCATAGCAGG ATTGAAGCTAATGGATATGAAGAATACAGTGGTGTTGAGTACCGGTCAGCTGGATGGTCT GAGGAATATACCATTGTTGAGCGTAATCTTGAGCAGGCAGGAGAGGAGGAATCACTTAAG TTAGAAGGTGAAATTGGTGGAGGATTAGTTATTGAGCGGCAAATATCCCTGCCAAAAGAT AATTCCAAGGTTTTCCGAGTAGATTCTGGCATTATAGCCCATAATGTTGGTGCTGGCTCT GGTGGATATTCAAGGCTGGTTTGCCTCCGTGTGCACCCAATGTTCAATCTCTTGCACCCA ACAGAATCTTTTGTCTCGTTTGTCTCCATTGATGGATCTAAGCATGAAGTTTGGCCTGAA GCTGGTGAGCAGTCTTATGAAGGGAATCTTCGGCCTAATGGTGAATGGATGCTGGTTGAT AAATGTCTCGGGCTGGCTCTAGTGAACCGGTTCGACATCACTGAAGTCCACAAGTGTCTC GTTCACTGGGGAACCGGAACAGTTAACTTAGAGCTGTGGTCAGAACAGAGACCGGTTTCC AAGCAATCACCTCTTACGATCTCCCATGAATATGAGGTGAGAGTGATCCCTTAGTTTGTT ATCTTCAACATAAACCTGGAATTTAAGTCAGAAGACTTCAAAACTTGGAACTGCAAGCTT ACATACTACTTAAGAATGTTCTTCAGTTATTACCTAAATGCTTTTCGTGATCATGGAATA TGCTTTGAGCTTCTAGGCTCTATGAGAATTTCGTCTGAACTCGCAGTTCGAAATTGATAT GTTAGTAGTAAACCACAAAGA