Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_02s0025g01940.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:2:1794323:1797246:1 gene:VIT_02s0025g01940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGAAGAGACAAGAGCGAAAGGCCTTCCTCTTCACACAAGGGTGCTCATGCCCCGGACC TGGGCGAACCGAGTCTTTGCATGTGTATACTTGTGTGCCATCTTAGCTCTGCTATATCAC CATCTCATTGCTGTGCTGCACTCCACCTCCATGGTCCCCCTCTTCATTCTTCTAGCTGAT GCAGTGCTGGCTTTCATGTGGGCAACTTCACAGGCCTTCCGCATGTGTCCAACTGAGCGT CGGGTTTTCATCGAACACCTTCAACATTATGTCAAGCAGAGTGATTATCCAGGGTTGGAT GTCTTTATATGCACTGCCGATCCATACAAGGAGCCACCTATGTGTGTGGTGAACACAGCT TTATCGGTAATGGCTTATGATTATCCCCCGGAGAAGCTGTCAGTGTATGTCTCTGATGAT GGAGGTTCTCAGCTGACTCTCTTTGCCTTCATAGAGGCTGCTAGGTTTGCCACCCACTGG TTACCCTATTGTAGAAAGAATAAGATTTTAGAAAGGTGTCCCGAGGCCTATTTTAGATCC AGTCCCTCATGGTCTCCTGAGACCGCTCAAATTAAGATGATGTATGAGAGAATGAGAGCT AGGGTGGAGAATGTGGTCAAGAGGGGGAGCATTTTGCCTGATTATATCACAAATGAAGCA GAATCTGAAGCCTTCAGCAGATGGGCTGATGGATTTACGCCTCGAGATCATCCTGCTGTT GTTCAGGTTTTGTTAGAGGCCGACAGAGATAAAGACATAACCGGCCTTACAATGCCCAAC CTTGTCTATGCGTCCAGAGAGAAAAACATGAATTTGCCCCATCATTTCAAGGCCGGTGCT CTTAATGTCCTGCTTCGAGTATCAGCAACCATGACCAATGCACCAATACTCCTGACCCTA GACAGCGACATGTACTCAAATGATTCGCAAACGCCTCTTTGTGCACTGTGTTTTCTCTTA GACCCTTGTATAGATTCAAAACTCGGATTTGTTCAGTTCCCTCAGATGTTCTATGGGATC AACAAGAATGATACTTATGGTGCTGAATCTAGACAGAGTGAAATTGTTCTAATTGGGATG GATGGATTGGTAGGGCCTACATATATAGGTACAGGATGTTTTTTCCGCAGACAGGTCTTC CTTGGTGGCTCCTCCCCACAACTGAACCCTGATCTTCTAGTTAGCAAGTCAATCAAGTCC GAAGAAGTTTTAGCACTAGCACACCATGTTGCGGGCTGCAATTATGAAAATCAAACCAGT TGGGGCTCCAAGATGGGATTTAGGTATGGATCATTGGTTGAGGACTTATACACAGGCTAT CGACTTCATTGTGAAGGATGGAAGTCCATTTTCTGCAATCCCAAAAGGCCTGCATTTCTG GGAAAGGCGCCTATCAATCTCAATGACATGTTGAATCAAACCGTAAGATGGTGTGTGGGA CTCCTTGAAGTGGCATTTTGCGAGCATAGCCCTATCACCTTTGGAGCCCGTTCCATAAAC CTTCTCACAGGATTATGTTATGGGCACATGGCATTATGGCCTATTTCGTCCATTCCAGTT ACCATCTATGCCTTTCTACCTCAGCTAGCTCTCCTCAAGTGTGTCTCAATCTTCCCAGAG GCCTCAGACCCTTGGTTATTCTTGCGTCTATTTCTTTTCCTTGGAGCCTATGGACAAAAT TGTCTCGAGTTTATGTTGTCTGGAGGATCAATCCAAAGGTGGTGGAATGATCAGAGGGTG TGGATGATGAGAGGGCTCTCAAGCATGATGTTTGGATTGGTGGAATACTTACTGAAGACC ATTGGCATTTCCACATTTGGATTTAGTGTCACAAACAAGACTGTTGGAGAGGAACAAAGC AAGCGATACGACCAAGGGCTGTTCGAGTTTGGAGTCTCATCACCCTTGTTATTGCCAATG ACAACAGCCGCCATAATCAACTGCATCTCTTTCCTATGGGGCATTGCCCAAGTCTTCACA CAAGGAAGGCTTGAAGGTATACTTCTACAGATGTTCTTAGCAGGTTTTGCGACGGTAAAT TGCTGGCCAATATATGAAGCCATTCTGATGAGGACCGACGGAGGAAAGATCCCAGTGAAG CTCACATTGATCTCAATTATTCTAGCATGGGCTCTTTACTTAACATCTTCGATAGCATTC TAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_02s0025g01940.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:2:1794323:1797246:1 gene:VIT_02s0025g01940 transcript:VIT_02s0025g01940.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MEETRAKGLPLHTRVLMPRTWANRVFACVYLCAILALLYHHLIAVLHSTSMVPLFILLAD AVLAFMWATSQAFRMCPTERRVFIEHLQHYVKQSDYPGLDVFICTADPYKEPPMCVVNTA LSVMAYDYPPEKLSVYVSDDGGSQLTLFAFIEAARFATHWLPYCRKNKILERCPEAYFRS SPSWSPETAQIKMMYERMRARVENVVKRGSILPDYITNEAESEAFSRWADGFTPRDHPAV VQVLLEADRDKDITGLTMPNLVYASREKNMNLPHHFKAGALNVLLRVSATMTNAPILLTL DSDMYSNDSQTPLCALCFLLDPCIDSKLGFVQFPQMFYGINKNDTYGAESRQSEIVLIGM DGLVGPTYIGTGCFFRRQVFLGGSSPQLNPDLLVSKSIKSEEVLALAHHVAGCNYENQTS WGSKMGFRYGSLVEDLYTGYRLHCEGWKSIFCNPKRPAFLGKAPINLNDMLNQTVRWCVG LLEVAFCEHSPITFGARSINLLTGLCYGHMALWPISSIPVTIYAFLPQLALLKCVSIFPE ASDPWLFLRLFLFLGAYGQNCLEFMLSGGSIQRWWNDQRVWMMRGLSSMMFGLVEYLLKT IGISTFGFSVTNKTVGEEQSKRYDQGLFEFGVSSPLLLPMTTAAIINCISFLWGIAQVFT QGRLEGILLQMFLAGFATVNCWPIYEAILMRTDGGKIPVKLTLISIILAWALYLTSSIAF

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_02s0025g01940.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:2:1794323:1797246:1 gene:VIT_02s0025g01940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGAAGAGACAAGAGCGAAAGGCCTTCCTCTTCACACAAGGGTGCTCATGCCCCGGACC TGGGCGAACCGAGTCTTTGCATGTGTATACTTGTGTGCCATCTTAGCTCTGCTATATCAC CATCTCATTGCTGTGCTGCACTCCACCTCCATGGTCCCCCTCTTCATTCTTCTAGCTGAT GCAGTGCTGGCTTTCATGTGGGCAACTTCACAGGCCTTCCGCATGTGTCCAACTGAGCGT CGGGTTTTCATCGAACACCTTCAACATTATGTCAAGCAGAGTGATTATCCAGGGTTGGAT GTCTTTATATGCACTGCCGATCCATACAAGGAGCCACCTATGTGTGTGGTGAACACAGCT TTATCGGTAATGGCTTATGATTATCCCCCGGAGAAGCTGTCAGTGTATGTCTCTGATGAT GGAGGTTCTCAGCTGACTCTCTTTGCCTTCATAGAGGCTGCTAGGTTTGCCACCCACTGG TTACCCTATTGTAGAAAGAATAAGATTTTAGAAAGGTGTCCCGAGGCCTATTTTAGATCC AGTCCCTCATGGTCTCCTGAGACCGCTCAAATTAAGATGATGTATGAGAGAATGAGAGCT AGGGTGGAGAATGTGGTCAAGAGGGGGAGCATTTTGCCTGATTATATCACAAATGAAGCA GAATCTGAAGCCTTCAGCAGATGGGCTGATGGATTTACGCCTCGAGATCATCCTGCTGTT GTTCAGGTTTTGTTAGAGGCCGACAGAGATAAAGACATAACCGGCCTTACAATGCCCAAC CTTGTCTATGCGTCCAGAGAGAAAAACATGAATTTGCCCCATCATTTCAAGGCCGGTGCT CTTAATGTCCTGCTTCGAGTATCAGCAACCATGACCAATGCACCAATACTCCTGACCCTA GACAGCGACATGTACTCAAATGATTCGCAAACGCCTCTTTGTGCACTGTGTTTTCTCTTA GACCCTTGTATAGATTCAAAACTCGGATTTGTTCAGTTCCCTCAGATGTTCTATGGGATC AACAAGAATGATACTTATGGTGCTGAATCTAGACAGAGTGAAATTGTTCTAATTGGGATG GATGGATTGGTAGGGCCTACATATATAGGTACAGGATGTTTTTTCCGCAGACAGGTCTTC CTTGGTGGCTCCTCCCCACAACTGAACCCTGATCTTCTAGTTAGCAAGTCAATCAAGTCC GAAGAAGTTTTAGCACTAGCACACCATGTTGCGGGCTGCAATTATGAAAATCAAACCAGT TGGGGCTCCAAGATGGGATTTAGGTATGGATCATTGGTTGAGGACTTATACACAGGCTAT CGACTTCATTGTGAAGGATGGAAGTCCATTTTCTGCAATCCCAAAAGGCCTGCATTTCTG GGAAAGGCGCCTATCAATCTCAATGACATGTTGAATCAAACCGTAAGATGGTGTGTGGGA CTCCTTGAAGTGGCATTTTGCGAGCATAGCCCTATCACCTTTGGAGCCCGTTCCATAAAC CTTCTCACAGGATTATGTTATGGGCACATGGCATTATGGCCTATTTCGTCCATTCCAGTT ACCATCTATGCCTTTCTACCTCAGCTAGCTCTCCTCAAGTGTGTCTCAATCTTCCCAGAG GCCTCAGACCCTTGGTTATTCTTGCGTCTATTTCTTTTCCTTGGAGCCTATGGACAAAAT TGTCTCGAGTTTATGTTGTCTGGAGGATCAATCCAAAGGTGGTGGAATGATCAGAGGGTG TGGATGATGAGAGGGCTCTCAAGCATGATGTTTGGATTGGTGGAATACTTACTGAAGACC ATTGGCATTTCCACATTTGGATTTAGTGTCACAAACAAGACTGTTGGAGAGGAACAAAGC AAGCGATACGACCAAGGGCTGTTCGAGTTTGGAGTCTCATCACCCTTGTTATTGCCAATG ACAACAGCCGCCATAATCAACTGCATCTCTTTCCTATGGGGCATTGCCCAAGTCTTCACA CAAGGAAGGCTTGAAGGTATACTTCTACAGATGTTCTTAGCAGGTTTTGCGACGGTAAAT TGCTGGCCAATATATGAAGCCATTCTGATGAGGACCGACGGAGGAAAGATCCCAGTGAAG CTCACATTGATCTCAATTATTCTAGCATGGGCTCTTTACTTAACATCTTCGATAGCATTC TAA