Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_02s0025g01850.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:2:1711749:1714927:1 gene:VIT_02s0025g01850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCTGATGCAGTGCTGGCTTTCATGTGGGCAACCTCACAGGCCTTTCGCATGTGTCCA GTGGGTCGTCGGGTTTTCATTGAACACCTTGAACATTATGCCAAGGAAAGTGATTATCCG AGGTTGGACGTGTTTGTATGCACTTCTGATCCATATAAGGAGCCACCTATGTGTGCGGTG AACACTGCTCTATCTGTGATGTCTTATGATTATCCAACAGAGAAGTTGTCGGTCTATGTA TCAGATGACGGAGGTTCCAAGCTGACCCTCTTTGCTTTCATGGAGGCTGCTAGGTTTGCT GCCCTCTGGCTGCCTTACTGCAAGAAGAACAAGATTGTAGAGAGGTGTCCAGAGGCATAT TTTAGATCTAATCTCTCATGGTTTCCCGAGACTGATCAAATTAAGATGATGTATGAGAAT ATGAGAGATAGGGTGGAGAAAGCTGTCCAGAAAGGGAGCATTTGCTATGATTATCTCACT AATGAAGGAGAAGGTGAAGCTTTCAGCAGATGGACAGATGGATTTACACCTCAGAATCAT CCTCCAGTAATTCAGGTTTTGTTAGAGAGCAGTAAGGATAAGGACAACGCTAGCCATACC ATGCCCAACCTTGTGTATATCTCCAGAGGGAAAAGCACGACTTTGCCCCACCATTTCAAA GCTGGTGCACTTAATGTCCTTCTACGAGTATCAGGCACCATGAGCAACGCACCAGTAATC CTAACACTAGATACTGATATGTACTCCAATGATCCTCAAACACCGCTTCGTGTGCTGTGT TATCTCTTGGACCCTGCTATGGATCCCAAACTGGGGTACATTCAGTTTCCTCAGATCTTC CATGGAATCAATGAGAATGATATTTATGGAGGTCAACTCAAATTAGAGTTCCAAATTGAA GCCAGTGGAATGGATGGATTGGTTGGCTCTACATATACAGGTACTGGATGCTTTTTCAGG CGTGGAGTCTTCTTTGGTGGTCCATTAGAAACCCCAGAACTGAACCAGGATCATCTAGTG AACAAGTCAATCAATTCCAAAGAAGTTTTAGCAATGGCACACCATGTTGCAGACTGCAAT TTTGAGAAGCAAACCAAATGGGGCACTGAAATTGGCTTCAGATATGGAACATTGGTTGAG GACTTCTATACCGACTATCTGCTAAAATGTAAGGGTTGGAAGTCCATTTTCTGCAACCCT AAAAGGCCTGCATTTCTGGGAAATTCACCTATCAATCTCCACAGCACACTGAATCAACTT ATGCGATGGTCTGTTGGCCTCCTCGAAGTGGCCTTCTGCAGATATAGTCCCATCACCTTC GGAGTCAAGTCCATAAACCCTCTCACAGGGCTATGTTATGCTCACTACGCCTTCTGGCCA ATATGGTCCATTCCAATTACCATCTATGCCTTTGTCCCCCAGATAGCTCTGCTCAATTGT GCCTCAATCTTCCCAAAGGCCTCAGACCCTTGGTTTTTATTGTACATATTCCTTTTCCTT GGTGCCTATGGGCAAGAGTGTCTCGAGTTTATGTTAGCTGGAGAAACAATCCAAAGATGG TGGAACAATCAAAGGATGTGGACAATTAGGGGACTCTCAAGCTTCATTTTTGGATTGGTT GAATGCTTACTGAAGTTCATTGGCATTTCCACATTTGGATTTAATGTCACAAGCAAGGTA ATTGAAGAAGAACAAAGAAAGCGATATAACCAAGGGATTTTCGAGTTTGGAGTCCCATCA CCCTTGTTCTTGCCCATGACAACAGCTGCAGTAATCAACTTGGTCTCATTCCTATGGGGC ATAGTACAAGTTTTCAAGCAAAGAGAGCTTGAAGGTCTATTTACGCAGATGCTCTTAGCC GGTTTTGCAATAGTGAATTGCTGGCCCCTATATGAAGCCATGGTCTTGAGGACTGATGAA GGAAAGATGCCTGTGAAGATCACATTGATCTCAATTACACTTGCATGGGCTCTTTACTTG GTATCCTCCATTGCATTTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_02s0025g01850.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:2:1711749:1714927:1 gene:VIT_02s0025g01850 transcript:VIT_02s0025g01850.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MADAVLAFMWATSQAFRMCPVGRRVFIEHLEHYAKESDYPRLDVFVCTSDPYKEPPMCAV NTALSVMSYDYPTEKLSVYVSDDGGSKLTLFAFMEAARFAALWLPYCKKNKIVERCPEAY FRSNLSWFPETDQIKMMYENMRDRVEKAVQKGSICYDYLTNEGEGEAFSRWTDGFTPQNH PPVIQVLLESSKDKDNASHTMPNLVYISRGKSTTLPHHFKAGALNVLLRVSGTMSNAPVI LTLDTDMYSNDPQTPLRVLCYLLDPAMDPKLGYIQFPQIFHGINENDIYGGQLKLEFQIE ASGMDGLVGSTYTGTGCFFRRGVFFGGPLETPELNQDHLVNKSINSKEVLAMAHHVADCN FEKQTKWGTEIGFRYGTLVEDFYTDYLLKCKGWKSIFCNPKRPAFLGNSPINLHSTLNQL MRWSVGLLEVAFCRYSPITFGVKSINPLTGLCYAHYAFWPIWSIPITIYAFVPQIALLNC ASIFPKASDPWFLLYIFLFLGAYGQECLEFMLAGETIQRWWNNQRMWTIRGLSSFIFGLV ECLLKFIGISTFGFNVTSKVIEEEQRKRYNQGIFEFGVPSPLFLPMTTAAVINLVSFLWG IVQVFKQRELEGLFTQMLLAGFAIVNCWPLYEAMVLRTDEGKMPVKITLISITLAWALYL VSSIAF

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_02s0025g01850.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:2:1711749:1714927:1 gene:VIT_02s0025g01850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCTGATGCAGTGCTGGCTTTCATGTGGGCAACCTCACAGGCCTTTCGCATGTGTCCA GTGGGTCGTCGGGTTTTCATTGAACACCTTGAACATTATGCCAAGGAAAGTGATTATCCG AGGTTGGACGTGTTTGTATGCACTTCTGATCCATATAAGGAGCCACCTATGTGTGCGGTG AACACTGCTCTATCTGTGATGTCTTATGATTATCCAACAGAGAAGTTGTCGGTCTATGTA TCAGATGACGGAGGTTCCAAGCTGACCCTCTTTGCTTTCATGGAGGCTGCTAGGTTTGCT GCCCTCTGGCTGCCTTACTGCAAGAAGAACAAGATTGTAGAGAGGTGTCCAGAGGCATAT TTTAGATCTAATCTCTCATGGTTTCCCGAGACTGATCAAATTAAGATGATGTATGAGAAT ATGAGAGATAGGGTGGAGAAAGCTGTCCAGAAAGGGAGCATTTGCTATGATTATCTCACT AATGAAGGAGAAGGTGAAGCTTTCAGCAGATGGACAGATGGATTTACACCTCAGAATCAT CCTCCAGTAATTCAGGTTTTGTTAGAGAGCAGTAAGGATAAGGACAACGCTAGCCATACC ATGCCCAACCTTGTGTATATCTCCAGAGGGAAAAGCACGACTTTGCCCCACCATTTCAAA GCTGGTGCACTTAATGTCCTTCTACGAGTATCAGGCACCATGAGCAACGCACCAGTAATC CTAACACTAGATACTGATATGTACTCCAATGATCCTCAAACACCGCTTCGTGTGCTGTGT TATCTCTTGGACCCTGCTATGGATCCCAAACTGGGGTACATTCAGTTTCCTCAGATCTTC CATGGAATCAATGAGAATGATATTTATGGAGGTCAACTCAAATTAGAGTTCCAAATTGAA GCCAGTGGAATGGATGGATTGGTTGGCTCTACATATACAGGTACTGGATGCTTTTTCAGG CGTGGAGTCTTCTTTGGTGGTCCATTAGAAACCCCAGAACTGAACCAGGATCATCTAGTG AACAAGTCAATCAATTCCAAAGAAGTTTTAGCAATGGCACACCATGTTGCAGACTGCAAT TTTGAGAAGCAAACCAAATGGGGCACTGAAATTGGCTTCAGATATGGAACATTGGTTGAG GACTTCTATACCGACTATCTGCTAAAATGTAAGGGTTGGAAGTCCATTTTCTGCAACCCT AAAAGGCCTGCATTTCTGGGAAATTCACCTATCAATCTCCACAGCACACTGAATCAACTT ATGCGATGGTCTGTTGGCCTCCTCGAAGTGGCCTTCTGCAGATATAGTCCCATCACCTTC GGAGTCAAGTCCATAAACCCTCTCACAGGGCTATGTTATGCTCACTACGCCTTCTGGCCA ATATGGTCCATTCCAATTACCATCTATGCCTTTGTCCCCCAGATAGCTCTGCTCAATTGT GCCTCAATCTTCCCAAAGGCCTCAGACCCTTGGTTTTTATTGTACATATTCCTTTTCCTT GGTGCCTATGGGCAAGAGTGTCTCGAGTTTATGTTAGCTGGAGAAACAATCCAAAGATGG TGGAACAATCAAAGGATGTGGACAATTAGGGGACTCTCAAGCTTCATTTTTGGATTGGTT GAATGCTTACTGAAGTTCATTGGCATTTCCACATTTGGATTTAATGTCACAAGCAAGGTA ATTGAAGAAGAACAAAGAAAGCGATATAACCAAGGGATTTTCGAGTTTGGAGTCCCATCA CCCTTGTTCTTGCCCATGACAACAGCTGCAGTAATCAACTTGGTCTCATTCCTATGGGGC ATAGTACAAGTTTTCAAGCAAAGAGAGCTTGAAGGTCTATTTACGCAGATGCTCTTAGCC GGTTTTGCAATAGTGAATTGCTGGCCCCTATATGAAGCCATGGTCTTGAGGACTGATGAA GGAAAGATGCCTGTGAAGATCACATTGATCTCAATTACACTTGCATGGGCTCTTTACTTG GTATCCTCCATTGCATTTTAA