Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_02s0025g00220.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:2:349466:351910:1 gene:VIT_02s0025g00220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAAGGGGCTCGCCACCCACAGCGACGCTCTCCAATCCATCAAAACCCTTGTGCTGAAA CGCCTATATCCGCAAGCCCTTAGAGCCTCAGCATCGCTCCTCCATCCTCCTCTCACTGAT CAATCCTATGCCCTCTTCCTTAAATCAGGCTTCGCACTCGATGCCTTCCTCTCCAGCTTC ATTGTCAACCGCTTTGCCATCTCAGGCGACTTCGCTCGCGCCCGCAGGTTCCTACTCGAC ACCCCATACCCCGACACAGTCTCCTGGAATTCTCTCATCTCTGGGTATGCTCGGTTTCGG CAACCCGGGCCCGTGTTCGACTTGTTCAATGGGTTGAGGCGATCCGGTCTGAGTCCTGAT GAGTTCAGTTTGAGTTCTTTGGTCAAGGGGTGTGGTGTTCTTGAGCAAAATGAGGTTGCA CATGGGGTTTGTTTGAAGATGGGGTTATTGAACGGTTTTGTGGTGAGTGGACTGCTGGAT GGCTATGCGAAATTGGGTGATGTTGATTCAGCTGAGAAGTGTTTCAAAGAGTTTTATATT GCGGATTCTGTGGTTTGGACGGCTATGGTTTGTGGATTTGTTTGGAACGGAGAATTCGAG AAGGGGCGTGAGGTTTTTGTAGAGATGAGGGGTTTGGGTTTGGGTTTGGAGTTGAACGAG TTTAGCCTGACTAGTGTTCTTGGGGCACTGTCTGATGTTAGAGAGGGTGAACAGGTTTTT GGTTTAAGTGTTAAGATGGGTCTGTTATGCGGATGCTCAATTCATCTGAACAATGCATTG ATGAATATGTATTCTAGGTGTGGGAGTAAATCCGATGCTATTAAAATGTTTGATGAAATG ACTGAGCCGGATGTTGTTTCATGGACTGAGCGGATTGGTGCTGCTTATGACGCTATAGAA GCTTTTGAATTGTTTAGACTTGTGCTTTCAGGAAACATGGAAGTGAATGAGTATATGTTG ATTAATGTTTTGTCTGCCATGAGGGAGCCAAAGTTGTTGAAATCTGGGAGGCAAATCCAA GGGCTTTGTCAAAAGGCTGGGTATTTGCTAGTGGCTTCTGTTAATAATGCATTGATTTTT ATGTATGGGAAGTGTGGAGAGATGGTCGCTGCTAGGCACATTTTTGATGAAATGCTTTGT GGAGATTCCGTTTCATGGAATTCTCTGATTGCAGGGTATGCTGAGAATGGACTCATGAAA CAGGCTCTTAAGGTGTTCTCTCAAATGCGTGATTATTTGCTACAACCCAATAAATATACT TTGGCTAGCATTCTAGAAGTAGCAGCAAACTCAAATTTTCCAGAGCAGGCAATGCAAATT CATTCATATATAGTCAAACTGGGATTCATAGTAGATGATTCAATGTTGTCTTGTCTAATA ACAGCATATGGTAAATGCAATATGATTTGTGAATCAAAGAGGGTATACAGTGATATTAGT CAAATAAATGTGTTGCATCTTAATGCAATGGCAGCCACACTTGTCCATGCTGGTTGCCAT GCTGATGCCCTCAAATTGTTCCAAACAGGATGGCGCTTGCATCAGGAAGTGGACTGCATA ACATTAAGTATAGTACTTAAAGCATGTGGTGCTTTGACAGATTTGGAATATGGTAGAAAT ATACATTCTATGGCCCTTAAATCTGGAATGAGTCAGGATAACTTTGTTGAAAGTGCTGTT ATCGATGTGTACTGTAAGTGTGGAACTGTGGATGAAGCTGCAAAAACTTTTATGAATGTA TCTAAAAACAATTTAGTTGCTTGGAATGCCATGGTGATGGGATATGCTCAGCATGGTTGT TATCATGAAGTTTTCGAGCTATTTAATAAGATGCTTGAATTGGGGATACAACCTGATGAG ATAACTTATCTTGGAGTGCTTAACTCATGTTGTCATGCAGGGCTAGTGAATGAAGCGCAT ACTTACCTAAGCTCGATGTTAGAACTTCATGGAGTGGTCCCATGTTTAGAACACTATGCC TGCATGATAGACTTATTTGGACGAGTAGGACTCCTAGAAGATGCAAAGAGGACCATTGAT CAAATGCCTATTATGCCTGATGCTCAAATATGGCAGATTCTTCTCTCAGGCTGCAACATC CATGGAAATGTTGATTTGGGGGAAGTTGCAGCAAAGAAGCTTATCGAGCTGCAACCTGAA AATGATTCCGCTTATGTTCTTCTCTCAAATCTCTATGCTTCAGCTGGTAGGTGGAATGCT GTTGGAAAATTGAGAAGGGTAATGAAAAAAAAAATAATCTGCAAGGAACCTGGTTCTAGT TGGATTCAGGTGAGAGGATCTGTGCATTACTTTTTTGCTAGCGATACATCACATCCTGAG AGTAAAGAAATTTATATGAAGCTCCAGAGGTTGTATGAGGAAATGTTTGCTTCACCATAT TTGGAACAAGATAGACCTGTAAACTATGATCCAATTCAATTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_02s0025g00220.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:2:349466:351910:1 gene:VIT_02s0025g00220 transcript:VIT_02s0025g00220.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MKGLATHSDALQSIKTLVLKRLYPQALRASASLLHPPLTDQSYALFLKSGFALDAFLSSF IVNRFAISGDFARARRFLLDTPYPDTVSWNSLISGYARFRQPGPVFDLFNGLRRSGLSPD EFSLSSLVKGCGVLEQNEVAHGVCLKMGLLNGFVVSGLLDGYAKLGDVDSAEKCFKEFYI ADSVVWTAMVCGFVWNGEFEKGREVFVEMRGLGLGLELNEFSLTSVLGALSDVREGEQVF GLSVKMGLLCGCSIHLNNALMNMYSRCGSKSDAIKMFDEMTEPDVVSWTERIGAAYDAIE AFELFRLVLSGNMEVNEYMLINVLSAMREPKLLKSGRQIQGLCQKAGYLLVASVNNALIF MYGKCGEMVAARHIFDEMLCGDSVSWNSLIAGYAENGLMKQALKVFSQMRDYLLQPNKYT LASILEVAANSNFPEQAMQIHSYIVKLGFIVDDSMLSCLITAYGKCNMICESKRVYSDIS QINVLHLNAMAATLVHAGCHADALKLFQTGWRLHQEVDCITLSIVLKACGALTDLEYGRN IHSMALKSGMSQDNFVESAVIDVYCKCGTVDEAAKTFMNVSKNNLVAWNAMVMGYAQHGC YHEVFELFNKMLELGIQPDEITYLGVLNSCCHAGLVNEAHTYLSSMLELHGVVPCLEHYA CMIDLFGRVGLLEDAKRTIDQMPIMPDAQIWQILLSGCNIHGNVDLGEVAAKKLIELQPE NDSAYVLLSNLYASAGRWNAVGKLRRVMKKKIICKEPGSSWIQVRGSVHYFFASDTSHPE SKEIYMKLQRLYEEMFASPYLEQDRPVNYDPIQF

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_02s0025g00220.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:2:349466:351910:1 gene:VIT_02s0025g00220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAAGGGGCTCGCCACCCACAGCGACGCTCTCCAATCCATCAAAACCCTTGTGCTGAAA CGCCTATATCCGCAAGCCCTTAGAGCCTCAGCATCGCTCCTCCATCCTCCTCTCACTGAT CAATCCTATGCCCTCTTCCTTAAATCAGGCTTCGCACTCGATGCCTTCCTCTCCAGCTTC ATTGTCAACCGCTTTGCCATCTCAGGCGACTTCGCTCGCGCCCGCAGGTTCCTACTCGAC ACCCCATACCCCGACACAGTCTCCTGGAATTCTCTCATCTCTGGGTATGCTCGGTTTCGG CAACCCGGGCCCGTGTTCGACTTGTTCAATGGGTTGAGGCGATCCGGTCTGAGTCCTGAT GAGTTCAGTTTGAGTTCTTTGGTCAAGGGGTGTGGTGTTCTTGAGCAAAATGAGGTTGCA CATGGGGTTTGTTTGAAGATGGGGTTATTGAACGGTTTTGTGGTGAGTGGACTGCTGGAT GGCTATGCGAAATTGGGTGATGTTGATTCAGCTGAGAAGTGTTTCAAAGAGTTTTATATT GCGGATTCTGTGGTTTGGACGGCTATGGTTTGTGGATTTGTTTGGAACGGAGAATTCGAG AAGGGGCGTGAGGTTTTTGTAGAGATGAGGGGTTTGGGTTTGGGTTTGGAGTTGAACGAG TTTAGCCTGACTAGTGTTCTTGGGGCACTGTCTGATGTTAGAGAGGGTGAACAGGTTTTT GGTTTAAGTGTTAAGATGGGTCTGTTATGCGGATGCTCAATTCATCTGAACAATGCATTG ATGAATATGTATTCTAGGTGTGGGAGTAAATCCGATGCTATTAAAATGTTTGATGAAATG ACTGAGCCGGATGTTGTTTCATGGACTGAGCGGATTGGTGCTGCTTATGACGCTATAGAA GCTTTTGAATTGTTTAGACTTGTGCTTTCAGGAAACATGGAAGTGAATGAGTATATGTTG ATTAATGTTTTGTCTGCCATGAGGGAGCCAAAGTTGTTGAAATCTGGGAGGCAAATCCAA GGGCTTTGTCAAAAGGCTGGGTATTTGCTAGTGGCTTCTGTTAATAATGCATTGATTTTT ATGTATGGGAAGTGTGGAGAGATGGTCGCTGCTAGGCACATTTTTGATGAAATGCTTTGT GGAGATTCCGTTTCATGGAATTCTCTGATTGCAGGGTATGCTGAGAATGGACTCATGAAA CAGGCTCTTAAGGTGTTCTCTCAAATGCGTGATTATTTGCTACAACCCAATAAATATACT TTGGCTAGCATTCTAGAAGTAGCAGCAAACTCAAATTTTCCAGAGCAGGCAATGCAAATT CATTCATATATAGTCAAACTGGGATTCATAGTAGATGATTCAATGTTGTCTTGTCTAATA ACAGCATATGGTAAATGCAATATGATTTGTGAATCAAAGAGGGTATACAGTGATATTAGT CAAATAAATGTGTTGCATCTTAATGCAATGGCAGCCACACTTGTCCATGCTGGTTGCCAT GCTGATGCCCTCAAATTGTTCCAAACAGGATGGCGCTTGCATCAGGAAGTGGACTGCATA ACATTAAGTATAGTACTTAAAGCATGTGGTGCTTTGACAGATTTGGAATATGGTAGAAAT ATACATTCTATGGCCCTTAAATCTGGAATGAGTCAGGATAACTTTGTTGAAAGTGCTGTT ATCGATGTGTACTGTAAGTGTGGAACTGTGGATGAAGCTGCAAAAACTTTTATGAATGTA TCTAAAAACAATTTAGTTGCTTGGAATGCCATGGTGATGGGATATGCTCAGCATGGTTGT TATCATGAAGTTTTCGAGCTATTTAATAAGATGCTTGAATTGGGGATACAACCTGATGAG ATAACTTATCTTGGAGTGCTTAACTCATGTTGTCATGCAGGGCTAGTGAATGAAGCGCAT ACTTACCTAAGCTCGATGTTAGAACTTCATGGAGTGGTCCCATGTTTAGAACACTATGCC TGCATGATAGACTTATTTGGACGAGTAGGACTCCTAGAAGATGCAAAGAGGACCATTGAT CAAATGCCTATTATGCCTGATGCTCAAATATGGCAGATTCTTCTCTCAGGCTGCAACATC CATGGAAATGTTGATTTGGGGGAAGTTGCAGCAAAGAAGCTTATCGAGCTGCAACCTGAA AATGATTCCGCTTATGTTCTTCTCTCAAATCTCTATGCTTCAGCTGGTAGGTGGAATGCT GTTGGAAAATTGAGAAGGGTAATGAAAAAAAAAATAATCTGCAAGGAACCTGGTTCTAGT TGGATTCAGGTGAGAGGATCTGTGCATTACTTTTTTGCTAGCGATACATCACATCCTGAG AGTAAAGAAATTTATATGAAGCTCCAGAGGTTGTATGAGGAAATGTTTGCTTCACCATAT TTGGAACAAGATAGACCTGTAAACTATGATCCAATTCAATTTTGA