Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_02s0012g00840.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:2:6708452:6711471:-1 gene:VIT_02s0012g00840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGGCGTTAGGTTCAAACCCTCCCACCCAACTGTCCGCTTATCTTCACTCTCTCTTGAA AAATTCCTCAAATCCCGCAAAAACCTCTTTAAAGCCCCTCCAAGACTCTGGTCCGACCAT GGCCATGGGCTTCCAGAAGAAGACGACCAACCACTCCCTATCCTAAAGCTAAGCCACCCC ATTTTGCGCACCTTAGAATCATGCTGCGGTTCAACGAAAGAGTTCAACCAAATCCACACC CAACTCATTGTCTCCGGCCTCCTTCAACAACCTCTAGCAGCGGGCCGAGCTGTCAAGACG CTTTGTTCTTTTCCGGATTCTGTCCAACATGCGGTTTCGCTGTTTGAAGGTCTGGAAGAG CCGGATGCGTTTATATGTAACACCATTATGAGAACCTATGTGAATGTGAATGATCCATAT ACTGCTCTTGGGTTTTACTATGAGCAAATGGTTCGTAAATGTGTTGCTCCCAATCATTAC ACCTTCCCACTTTTGGTGAAGGTTTGCTGGGAGATTGGGTCGATTGGAGACGGGGAAAAG ATCCATGCCCGCATATTGAAGTTTGGGTTTGAATTGGATTTGTTTGTTCGAAACTCCTTG ATCCATATGTATTCAGTTTGTGGGAGAATTGGGGATGCAAGAGCAATGTTTGAGGTGTGT TCTATATCGGATTTGGTGACTTGGAATTCCATGATTGATGGGTATGTAAAGAATGGGGAG ATCGGTGCTGCTCGTGAACTTTTTGAGGAAATGCCTGAGAGAGACCTATTTAGTTGGAAT TCGATGATTGCAGGGTATGTTGGAAATGGAGACATGACGGCTGCGGAAGACTTGTTCAAC AAGATGCCATTTAGAGATATTGTTTCCTGGAACTGTATGATTGACGGATATGCTCAGGTT CAGAATATGGAAATTGCTTGTGAGCTTTTTAATTGGATGCCATATCGAAATGTAGTTTCT TGGAATATCATGTTGGCTCTTTATGTGCGGATCAAAGACTATGATGAGTGTTTGCGCATG TTTGATAAGATGATGGGGGAGACTATGCCAAACGAGGCTACCCTTGTGAGTGTCTTGACT GCTTGTGCACACTTAGGGAGGCTTGATAGGGGCAAATGGATTCATTCTTACATTAAAAAT AATAGGGTGATTGAACCTGATGTGTTACTTTCAACTGCGCTCTTGACAATGTATGCAAAG TGTGGAGCCATGGATTTGGCTAGAGATGTGTTTGACAAGATGTCCAACAGAAGTGTTGTA TCTTGGAATTCGATGATTATGGGATATGGCATGCATGGCCAGGCAGATAAAGCCCTAGAA ATGTTCTTGGATATGGAAAAGAGAGGTCCAATGCCAAATGATGCTACTTTTATATGTGTT TTAAGTGCATGTGCACACTCTGGAATGATTTTGGAGGGTTGGTGGTACTTTGATCTAATG AGGCGGGCTTATAAGATCGAACCGAAGGTTGAGCACTATGGTTGCATGGTTGATCTTCTT GGGCGGGCAGGTTTGATGAAAGATTTGGAAGAGCTTATAAGGAAGATGCCGATGGAGGGG GGAACTGCCTTATGGGGAGCACTACTTTCTGCTTGTAGGACTCACTCAAATTCAGAGCTT GCAGAGATCGTGGCCAAAAGGCTAATTGAGTTGGAACCAAGGGATATTGGGCCCTACTTG CTGTTATCAAATATATATGCTGCAGAAGGAAAATGGGACGATGTAGAAATTGTCAGAAAG ATGATGAAGGAAAGGGGTTTAACAAAAACAACAGGGTCAAAGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_02s0012g00840.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:2:6708452:6711471:-1 gene:VIT_02s0012g00840 transcript:VIT_02s0012g00840.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MGVRFKPSHPTVRLSSLSLEKFLKSRKNLFKAPPRLWSDHGHGLPEEDDQPLPILKLSHP ILRTLESCCGSTKEFNQIHTQLIVSGLLQQPLAAGRAVKTLCSFPDSVQHAVSLFEGLEE PDAFICNTIMRTYVNVNDPYTALGFYYEQMVRKCVAPNHYTFPLLVKVCWEIGSIGDGEK IHARILKFGFELDLFVRNSLIHMYSVCGRIGDARAMFEVCSISDLVTWNSMIDGYVKNGE IGAARELFEEMPERDLFSWNSMIAGYVGNGDMTAAEDLFNKMPFRDIVSWNCMIDGYAQV QNMEIACELFNWMPYRNVVSWNIMLALYVRIKDYDECLRMFDKMMGETMPNEATLVSVLT ACAHLGRLDRGKWIHSYIKNNRVIEPDVLLSTALLTMYAKCGAMDLARDVFDKMSNRSVV SWNSMIMGYGMHGQADKALEMFLDMEKRGPMPNDATFICVLSACAHSGMILEGWWYFDLM RRAYKIEPKVEHYGCMVDLLGRAGLMKDLEELIRKMPMEGGTALWGALLSACRTHSNSEL AEIVAKRLIELEPRDIGPYLLLSNIYAAEGKWDDVEIVRKMMKERGLTKTTGSK

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_02s0012g00840.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:2:6708452:6711471:-1 gene:VIT_02s0012g00840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGGCGTTAGGTTCAAACCCTCCCACCCAACTGTCCGCTTATCTTCACTCTCTCTTGAA AAATTCCTCAAATCCCGCAAAAACCTCTTTAAAGCCCCTCCAAGACTCTGGTCCGACCAT GGCCATGGGCTTCCAGAAGAAGACGACCAACCACTCCCTATCCTAAAGCTAAGCCACCCC ATTTTGCGCACCTTAGAATCATGCTGCGGTTCAACGAAAGAGTTCAACCAAATCCACACC CAACTCATTGTCTCCGGCCTCCTTCAACAACCTCTAGCAGCGGGCCGAGCTGTCAAGACG CTTTGTTCTTTTCCGGATTCTGTCCAACATGCGGTTTCGCTGTTTGAAGGTCTGGAAGAG CCGGATGCGTTTATATGTAACACCATTATGAGAACCTATGTGAATGTGAATGATCCATAT ACTGCTCTTGGGTTTTACTATGAGCAAATGGTTCGTAAATGTGTTGCTCCCAATCATTAC ACCTTCCCACTTTTGGTGAAGGTTTGCTGGGAGATTGGGTCGATTGGAGACGGGGAAAAG ATCCATGCCCGCATATTGAAGTTTGGGTTTGAATTGGATTTGTTTGTTCGAAACTCCTTG ATCCATATGTATTCAGTTTGTGGGAGAATTGGGGATGCAAGAGCAATGTTTGAGGTGTGT TCTATATCGGATTTGGTGACTTGGAATTCCATGATTGATGGGTATGTAAAGAATGGGGAG ATCGGTGCTGCTCGTGAACTTTTTGAGGAAATGCCTGAGAGAGACCTATTTAGTTGGAAT TCGATGATTGCAGGGTATGTTGGAAATGGAGACATGACGGCTGCGGAAGACTTGTTCAAC AAGATGCCATTTAGAGATATTGTTTCCTGGAACTGTATGATTGACGGATATGCTCAGGTT CAGAATATGGAAATTGCTTGTGAGCTTTTTAATTGGATGCCATATCGAAATGTAGTTTCT TGGAATATCATGTTGGCTCTTTATGTGCGGATCAAAGACTATGATGAGTGTTTGCGCATG TTTGATAAGATGATGGGGGAGACTATGCCAAACGAGGCTACCCTTGTGAGTGTCTTGACT GCTTGTGCACACTTAGGGAGGCTTGATAGGGGCAAATGGATTCATTCTTACATTAAAAAT AATAGGGTGATTGAACCTGATGTGTTACTTTCAACTGCGCTCTTGACAATGTATGCAAAG TGTGGAGCCATGGATTTGGCTAGAGATGTGTTTGACAAGATGTCCAACAGAAGTGTTGTA TCTTGGAATTCGATGATTATGGGATATGGCATGCATGGCCAGGCAGATAAAGCCCTAGAA ATGTTCTTGGATATGGAAAAGAGAGGTCCAATGCCAAATGATGCTACTTTTATATGTGTT TTAAGTGCATGTGCACACTCTGGAATGATTTTGGAGGGTTGGTGGTACTTTGATCTAATG AGGCGGGCTTATAAGATCGAACCGAAGGTTGAGCACTATGGTTGCATGGTTGATCTTCTT GGGCGGGCAGGTTTGATGAAAGATTTGGAAGAGCTTATAAGGAAGATGCCGATGGAGGGG GGAACTGCCTTATGGGGAGCACTACTTTCTGCTTGTAGGACTCACTCAAATTCAGAGCTT GCAGAGATCGTGGCCAAAAGGCTAATTGAGTTGGAACCAAGGGATATTGGGCCCTACTTG CTGTTATCAAATATATATGCTGCAGAAGGAAAATGGGACGATGTAGAAATTGTCAGAAAG ATGATGAAGGAAAGGGGTTTAACAAAAACAACAGGGTCAAAGTAG