Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_01s0146g00240.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:1:22058282:22060381:1 gene:VIT_01s0146g00240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCAAAGCATGGGTTGGTTAGAGACCTCTATCTGCCTAATTCATCTCCATTTGCAAAG CTCTTGGACTCCTGCCTCCGTTCAAGGTCGGCCAGGGGCACTCGTCTGGTTCACGCCCGC ATTCTCATGACTCAGTTTTCAATGGAAATCTTCATTCAGAACAGGTTGATTGATGTTTAT GGGAAATGTGACTGTTTGGATGATGCCCGCAAGTTGTTTGATAGAATGCCCCAAAGGAAC ACTTTCACTTGGAATTCCCTTATAAGTGTGTTGACTAAATCGGGATTTCTTGATGAGGCA GCAAGGCTCTTTGGTTCAATGCCTGAGCCTGATCAGTGCTCGTGGAATTCGATGGTGTCG GGTTTCGCTCAACATGATCGATTCGAAGAATCTTTAGAATATTTTGTTAAGATGCATAGG GAGGACTTTTTGCTTAATGAGTACTCGTTTGGTAGTGCTCTGAGTGCCTGTGCAGGGTTG ATGGATTTAAATATGGGTACCCAAGTCCATGCTTTGGTATCAAAATCTAGGTATTCAACC GATGTTTATATGGGGTCTGCCCTTATTGATATGTACTCTAAGTGTGGGAGTGTGGCTTGC GCTGAGGAAGTTTTTTCAGGAATGATCGAGCGGAACTTAGTCACATGGAATAGCTTGATT ACCTGTTACGAGCAAAATGGTCCAGCAAGTGAAGCTCTAGAGGTATTTGTGAGGATGATG GACTCTGGACTAGAACCAGATGAGGTCACGCTAGCTAGCGTAGTCAGTGCCTGTGCAAGC TTGTGTGCACTCAAAGAAGGCCTGCAAATTCATGCCCGTGTCGTGAAAACTAACAAATTT AGGGATGATCTTGTTTTGGGCAATGCTTTGGTTGATATGTATGCAAAATGCAGTAAAGTT AATGAAGCCAGAAGGGTTTTTGATAGGATGTCTATTAGGAATGTCGTGTCTGAAACCTCC ATGGTAAGCGGGTATGCAAGGGCAGCAAGCGTAAAAGCTGCAAGATTTATGTTTTCGAAG ATGACACAAAGGAATGTAGTATCTTGGAATGCACTTATTGCAGGTTATACACAGAATGGG GAGAATGAAGAGGCTCTCAGACTCTTCCGCCTCCTAAAGAGGGAATCCATTTGGCCAACC CATTATACCTTTGGGAATCTCCTTAGTGCTTGTGCCAATCTCGCTGATCTGCTGCTCGGT CGTCAGGCTCATACCCATGTCTTGAAGCAAGGTTTTGAGTTCCAGTCTGGAGCAGAGTCT GATATTTTTGTGGGAAACTCTCTCATAGACATGTACATGAAATGCGGTTCAATTGAAGAT GGGAGCCGGGTGTTTGAGAAAATGAAGGAAAGAGATTGTGTTTCATGGAATGCCATAATA GTAGGGTATGCACAAAATGGTTATGGGGCAGAAGCTCTTCAAATTTTCAGAAAAATGTTG GTATGTGGAGAGAAACCCGACCATGTTACTATGATAGGAGTTCTATGTGCTTGTAGCCAT GCAGGCTTGGTTGAAGAGGGCCGTCACTATTTCTTTTCAATGGAGGAGCATGGTTTAATA CCACTGAAGGACCATTATACATGTATGGTCGATTTACTAGGACGAGCTGGTTGCCTCAAT GAAGCAAAGAATTTAATTGAAGCAATGCCAGTGAATCCTGATGCTGTCGTGTGGGGGTCT TTGCTTGCTGCTTGTAAAGTTCATGGCAACATCGAAATGGGGAAGCATGCAGCAGAGAAG CTTTTGGAGATCGATCCTTGGAACTCTGGACCTTATGTTCTTCTCTCAAACATGTATGCT GAGCTTGGAAGATGGGGAGATGTTGTAAGAGTAAGGAAACTTATGAGGCAACAGGGGGTC ACTAAGCAGCCAGGTTGCAGTTGGATTGAAGTAGAGAGCCGAGTGCATGTTTTCCTGGTT AAAGATAAAAGCCATCCTCATAGGAAGCAAATCTATTCAGTTCTCAAAATGCTCACAGAG CAAATGAAGCGGGTTGGATATATCCCAGATGCCAATGATTTCGAGGCTTATGATGAGCAG AGCAAATCTGAATAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_01s0146g00240.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:1:22058282:22060381:1 gene:VIT_01s0146g00240 transcript:VIT_01s0146g00240.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MAKHGLVRDLYLPNSSPFAKLLDSCLRSRSARGTRLVHARILMTQFSMEIFIQNRLIDVY GKCDCLDDARKLFDRMPQRNTFTWNSLISVLTKSGFLDEAARLFGSMPEPDQCSWNSMVS GFAQHDRFEESLEYFVKMHREDFLLNEYSFGSALSACAGLMDLNMGTQVHALVSKSRYST DVYMGSALIDMYSKCGSVACAEEVFSGMIERNLVTWNSLITCYEQNGPASEALEVFVRMM DSGLEPDEVTLASVVSACASLCALKEGLQIHARVVKTNKFRDDLVLGNALVDMYAKCSKV NEARRVFDRMSIRNVVSETSMVSGYARAASVKAARFMFSKMTQRNVVSWNALIAGYTQNG ENEEALRLFRLLKRESIWPTHYTFGNLLSACANLADLLLGRQAHTHVLKQGFEFQSGAES DIFVGNSLIDMYMKCGSIEDGSRVFEKMKERDCVSWNAIIVGYAQNGYGAEALQIFRKML VCGEKPDHVTMIGVLCACSHAGLVEEGRHYFFSMEEHGLIPLKDHYTCMVDLLGRAGCLN EAKNLIEAMPVNPDAVVWGSLLAACKVHGNIEMGKHAAEKLLEIDPWNSGPYVLLSNMYA ELGRWGDVVRVRKLMRQQGVTKQPGCSWIEVESRVHVFLVKDKSHPHRKQIYSVLKMLTE QMKRVGYIPDANDFEAYDEQSKSE

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_01s0146g00240.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:1:22058282:22060381:1 gene:VIT_01s0146g00240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCAAAGCATGGGTTGGTTAGAGACCTCTATCTGCCTAATTCATCTCCATTTGCAAAG CTCTTGGACTCCTGCCTCCGTTCAAGGTCGGCCAGGGGCACTCGTCTGGTTCACGCCCGC ATTCTCATGACTCAGTTTTCAATGGAAATCTTCATTCAGAACAGGTTGATTGATGTTTAT GGGAAATGTGACTGTTTGGATGATGCCCGCAAGTTGTTTGATAGAATGCCCCAAAGGAAC ACTTTCACTTGGAATTCCCTTATAAGTGTGTTGACTAAATCGGGATTTCTTGATGAGGCA GCAAGGCTCTTTGGTTCAATGCCTGAGCCTGATCAGTGCTCGTGGAATTCGATGGTGTCG GGTTTCGCTCAACATGATCGATTCGAAGAATCTTTAGAATATTTTGTTAAGATGCATAGG GAGGACTTTTTGCTTAATGAGTACTCGTTTGGTAGTGCTCTGAGTGCCTGTGCAGGGTTG ATGGATTTAAATATGGGTACCCAAGTCCATGCTTTGGTATCAAAATCTAGGTATTCAACC GATGTTTATATGGGGTCTGCCCTTATTGATATGTACTCTAAGTGTGGGAGTGTGGCTTGC GCTGAGGAAGTTTTTTCAGGAATGATCGAGCGGAACTTAGTCACATGGAATAGCTTGATT ACCTGTTACGAGCAAAATGGTCCAGCAAGTGAAGCTCTAGAGGTATTTGTGAGGATGATG GACTCTGGACTAGAACCAGATGAGGTCACGCTAGCTAGCGTAGTCAGTGCCTGTGCAAGC TTGTGTGCACTCAAAGAAGGCCTGCAAATTCATGCCCGTGTCGTGAAAACTAACAAATTT AGGGATGATCTTGTTTTGGGCAATGCTTTGGTTGATATGTATGCAAAATGCAGTAAAGTT AATGAAGCCAGAAGGGTTTTTGATAGGATGTCTATTAGGAATGTCGTGTCTGAAACCTCC ATGGTAAGCGGGTATGCAAGGGCAGCAAGCGTAAAAGCTGCAAGATTTATGTTTTCGAAG ATGACACAAAGGAATGTAGTATCTTGGAATGCACTTATTGCAGGTTATACACAGAATGGG GAGAATGAAGAGGCTCTCAGACTCTTCCGCCTCCTAAAGAGGGAATCCATTTGGCCAACC CATTATACCTTTGGGAATCTCCTTAGTGCTTGTGCCAATCTCGCTGATCTGCTGCTCGGT CGTCAGGCTCATACCCATGTCTTGAAGCAAGGTTTTGAGTTCCAGTCTGGAGCAGAGTCT GATATTTTTGTGGGAAACTCTCTCATAGACATGTACATGAAATGCGGTTCAATTGAAGAT GGGAGCCGGGTGTTTGAGAAAATGAAGGAAAGAGATTGTGTTTCATGGAATGCCATAATA GTAGGGTATGCACAAAATGGTTATGGGGCAGAAGCTCTTCAAATTTTCAGAAAAATGTTG GTATGTGGAGAGAAACCCGACCATGTTACTATGATAGGAGTTCTATGTGCTTGTAGCCAT GCAGGCTTGGTTGAAGAGGGCCGTCACTATTTCTTTTCAATGGAGGAGCATGGTTTAATA CCACTGAAGGACCATTATACATGTATGGTCGATTTACTAGGACGAGCTGGTTGCCTCAAT GAAGCAAAGAATTTAATTGAAGCAATGCCAGTGAATCCTGATGCTGTCGTGTGGGGGTCT TTGCTTGCTGCTTGTAAAGTTCATGGCAACATCGAAATGGGGAAGCATGCAGCAGAGAAG CTTTTGGAGATCGATCCTTGGAACTCTGGACCTTATGTTCTTCTCTCAAACATGTATGCT GAGCTTGGAAGATGGGGAGATGTTGTAAGAGTAAGGAAACTTATGAGGCAACAGGGGGTC ACTAAGCAGCCAGGTTGCAGTTGGATTGAAGTAGAGAGCCGAGTGCATGTTTTCCTGGTT AAAGATAAAAGCCATCCTCATAGGAAGCAAATCTATTCAGTTCTCAAAATGCTCACAGAG CAAATGAAGCGGGTTGGATATATCCCAGATGCCAATGATTTCGAGGCTTATGATGAGCAG AGCAAATCTGAATAAACCTCTTGTTACCACATGGAACTGCCAGTGGATGCTGCTGTGGGA