Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_01s0137g00590.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:1:7079708:7086909:-1 gene:VIT_01s0137g00590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGTATAGAAGTCTTGGCCGACATCGGCTTGCATATCGTGCACAAATATCCAGCTATGTT AAAGCAGGTTTGATCGATCAAGCTCTCAAAACTTTTGATGAGATGACTAAATCCAATTGC CGTGTGTTTAGTATTGACTACAATAGATTTATTGGAGTGTTGGTTCGTCAATCTCGATTT GATTTGGCAGAGCAGTATTACGATAGAATGATACCACAAGGCTTTTCTTTGAATTCATTT ACATATTCAAGGTTCATTTCTGGTTTGTGTAAGGTGAAGAATTTTGTCCTTATTGAGAAA CTTCTAGAGGACATGGATAGGCTTGGATATGTGCCTGATATCTGGGCTTATAATATATAT CTGAATCTTTTGTGCTGTGAGAACCAGCTAGATGTGGCTCTAGGGGTAGTGCAGACCATG GTTGAAAAGGGAAGAGAGCCTGATATTGTAACCTATACCATAGTCATCAATGGGCTGTGT AGAGCAGGAAGGTTTGATTCTGCTGTTGAAATTTGGCGTAATATGGTTAGAAAGGGGTTT AGTCCTGATGAAAAAGCTTGCAGGGCACTTGTCCTTGGTTTGTGTCATGATGGGAAGGTT GATTTAGCTTATGAGCTCACGGTGGGTGCAATGAGGGGACGAATTAAGTTTAGTAAGTCA ATTTACAATTCTCTTATCAATGGGTTTTGTCAGGCTGGTTGGATTGACAAAGCACAATCG ATTATATCCTTCATGAGAAGGAATGGATGTGAGCCAGATTTGGTTACATACAATGTGCTG CTAAACTACTGTTGTGATGAGCTCCTGCTGGAGGAGGCCGAGAATTTGATGAAGAAGATG GAAAGGAGCGGGGTGGAACCCGATGTATATAGTTACAATGAACTTCTTAAGGGCCTTTGT AAAGCTAACCGGTTAGACAAGGCTTATATGATGATGGTGAACAAGATGGAGGCCAAAGGA TTGTGTGATGTTGTATCCTACAATACCATCATTAAAGCGCTTTGCACGGCGTCCCATACT AAAAGGGCATACAAGTTATTTGAGGAGATGGGTGGAAAGGGGATTACTCCTGATGTGGTG ACCTTTACCATACTTATAAAAGCTTTTCTTAGAGAAGGTAGTTCAAACATAGCCAAGAAG CTTCTTGATCAGATGACAGGATTGGGTTTGTTACCAGATCGTGTACTGTACACTACAATT GTTGATCACCTGTGTAAGACTGGGAAAATGGGGATGGCTCACAGTGTTTTTTGTGACATG GTAGAGAGTGGGATAACTCCTGATGTAGTTTCATACAATGCCCTCATAAATGGGCTTTGC AGGGCTTCCAGAGTAAGTGAAGCCATGCATCTATATGAGGATATGCATACTGGAGGACCT TGTCCTGATGAGGTGACTTTTAAATTGATCATAGGGGGGCTCATATGGGAAAAGAAGCTC TCAGTGGCCTGTAGGGTGTGGGATCAGATGATGGAGAAGGGCTTTACTCTTGATGGAGCT GTTTCTGAGACTCTAGTTAATGCCATCCATTCAAATGATGCATCCTGCATGAATATCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_01s0137g00590.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:1:7079708:7086909:-1 gene:VIT_01s0137g00590 transcript:VIT_01s0137g00590.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MYRSLGRHRLAYRAQISSYVKAGLIDQALKTFDEMTKSNCRVFSIDYNRFIGVLVRQSRF DLAEQYYDRMIPQGFSLNSFTYSRFISGLCKVKNFVLIEKLLEDMDRLGYVPDIWAYNIY LNLLCCENQLDVALGVVQTMVEKGREPDIVTYTIVINGLCRAGRFDSAVEIWRNMVRKGF SPDEKACRALVLGLCHDGKVDLAYELTVGAMRGRIKFSKSIYNSLINGFCQAGWIDKAQS IISFMRRNGCEPDLVTYNVLLNYCCDELLLEEAENLMKKMERSGVEPDVYSYNELLKGLC KANRLDKAYMMMVNKMEAKGLCDVVSYNTIIKALCTASHTKRAYKLFEEMGGKGITPDVV TFTILIKAFLREGSSNIAKKLLDQMTGLGLLPDRVLYTTIVDHLCKTGKMGMAHSVFCDM VESGITPDVVSYNALINGLCRASRVSEAMHLYEDMHTGGPCPDEVTFKLIIGGLIWEKKL SVACRVWDQMMEKGFTLDGAVSETLVNAIHSNDASCMNI

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_01s0137g00590.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:1:7079708:7086909:-1 gene:VIT_01s0137g00590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGTATAGAAGTCTTGGCCGACATCGGCTTGCATATCGTGCACAAATATCCAGCTATGTT AAAGCAGGTTTGATCGATCAAGCTCTCAAAACTTTTGATGAGATGACTAAATCCAATTGC CGTGTGTTTAGTATTGACTACAATAGATTTATTGGAGTGTTGGTTCGTCAATCTCGATTT GATTTGGCAGAGCAGTATTACGATAGAATGATACCACAAGGCTTTTCTTTGAATTCATTT ACATATTCAAGGTTCATTTCTGGTTTGTGTAAGGTGAAGAATTTTGTCCTTATTGAGAAA CTTCTAGAGGACATGGATAGGCTTGGATATGTGCCTGATATCTGGGCTTATAATATATAT CTGAATCTTTTGTGCTGTGAGAACCAGCTAGATGTGGCTCTAGGGGTAGTGCAGACCATG GTTGAAAAGGGAAGAGAGCCTGATATTGTAACCTATACCATAGTCATCAATGGGCTGTGT AGAGCAGGAAGGTTTGATTCTGCTGTTGAAATTTGGCGTAATATGGTTAGAAAGGGGTTT AGTCCTGATGAAAAAGCTTGCAGGGCACTTGTCCTTGGTTTGTGTCATGATGGGAAGGTT GATTTAGCTTATGAGCTCACGGTGGGTGCAATGAGGGGACGAATTAAGTTTAGTAAGTCA ATTTACAATTCTCTTATCAATGGGTTTTGTCAGGCTGGTTGGATTGACAAAGCACAATCG ATTATATCCTTCATGAGAAGGAATGGATGTGAGCCAGATTTGGTTACATACAATGTGCTG CTAAACTACTGTTGTGATGAGCTCCTGCTGGAGGAGGCCGAGAATTTGATGAAGAAGATG GAAAGGAGCGGGGTGGAACCCGATGTATATAGTTACAATGAACTTCTTAAGGGCCTTTGT AAAGCTAACCGGTTAGACAAGGCTTATATGATGATGGTGAACAAGATGGAGGCCAAAGGA TTGTGTGATGTTGTATCCTACAATACCATCATTAAAGCGCTTTGCACGGCGTCCCATACT AAAAGGGCATACAAGTTATTTGAGGAGATGGGTGGAAAGGGGATTACTCCTGATGTGGTG ACCTTTACCATACTTATAAAAGCTTTTCTTAGAGAAGGTAGTTCAAACATAGCCAAGAAG CTTCTTGATCAGATGACAGGATTGGGTTTGTTACCAGATCGTGTACTGTACACTACAATT GTTGATCACCTGTGTAAGACTGGGAAAATGGGGATGGCTCACAGTGTTTTTTGTGACATG GTAGAGAGTGGGATAACTCCTGATGTAGTTTCATACAATGCCCTCATAAATGGGCTTTGC AGGGCTTCCAGAGTAAGTGAAGCCATGCATCTATATGAGGATATGCATACTGGAGGACCT TGTCCTGATGAGGTGACTTTTAAATTGATCATAGGGGGGCTCATATGGGAAAAGAAGCTC TCAGTGGCCTGTAGGGTGTGGGATCAGATGATGGAGAAGGGCTTTACTCTTGATGGAGCT GTTTCTGAGACTCTAGTTAATGCCATCCATTCAAATGATGCATCCTGCATGAATATCTGA AATGGTTTGACTGGCTTCATTCATTTGGAACATGCATATGACTAAGGAATCCCTTGAAAA AGTAACCCACAAAAGTTCTACTGAGTTGGAGAGTGTTCCCTTCTACCCTTATCAGACAAG TTCGCAGGATTTGGATTTTGAAGTAATGTATCAGACACATCCCATACATTACCCATGCTG