Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_01s0127g00690.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:1:8016688:8021125:-1 gene:VIT_01s0127g00690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGAATATTTATCAAACAAGAAATTTCCCATCAATTCAAAAGATTACAAGTTATATGAG
GAAGTTGGTGAAGGTGTTAGTGCCACAGTGTACAGAGCTCTCTGCATTCCATTTAATGAG
ATAGTCGCTGTCAAGGTTATGGATCTGGAGAGGTGCAACGATAACTTGGATGGTATTCGA
CATGAAGTACAAACTATGAGCCTGATTGATCATCCAAATGTACTCAGGGCACATTGCTCT
TTCTCAGTGGGAAGCTGCCTCTGGATTGTGATGCCTTATATGGCTAGTGGATCTTGTCTT
CACATAATGAAATCTTCTTATCCAGAGGGTTTTGAACAGGCTGTTATTGCAACACTATTA
CGTGAAGTTCTTAAAGCTCTTGTTTATCTTCATTCCAATGGACACATCCACAGAGATGTT
AAGGCTGGGAATATCTTGGTTGATTCCAAAGGTGCAATTAAGTTGGCTGACTTTGGAGTT
TCGGCATGTATGTTTGATGCTGGAGATAGACAACGTTCAAGGAACACATTTGTGGGAACT
CCATGCTGGATGGCTCCTGAAGTTATGCAGCAATTAAATGGATATGACTTTAAAGCAGAC
ATCTGGTCTTTTGGAATAACCGCTCTGGAACTTGCTCATGGTCATGCCCCATTTTCCAAG
TATCCACCAATGAAGGTGTTGCTGATGACATTACAAAATGCACCACCTGGTCTTGACTAT
GAAAGGGATCGAAGATTTTCAAAGTCGTTTAAAGAGATGGTAGGTGCTTGCTTAGTGAAG
GATCCAAAGAAGCGTCCCACATCAGAGAAGCTTTTAAAGCACCGTTTCTTTAAACATGCA
TGCTCAAAAGAGTTTTTGGCCTGGGCTATTCTTAATGGCCTTGCTCCACTCGGTGACCGG
TTTAGGATGCTGAAGGCTGACTTTCTTGTACAAAAGAGGGGTATGGATGGGAATAAAGAG
CAACTATCACAAGTAACTATAAGTAAGATTAGGGATTCTCGAGTGGGTTTGCTACCCATA
CCTCTAGGAAAGCTGCCCATACACAAAGATCTAGTTAATGGTAGAGCCTTAGATGAAAAT
GATGATTTTCATGAGGATGAGGTTTTTGGTGCCATAATGCCTATTAATGAAGATAGGAAA
GAGTCTTCTAGGTCACAATTTGTCAATGAAGGTCCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_01s0127g00690.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:1:8016688:8021125:-1 gene:VIT_01s0127g00690 transcript:VIT_01s0127g00690.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MEYLSNKKFPINSKDYKLYEEVGEGVSATVYRALCIPFNEIVAVKVMDLERCNDNLDGIR
HEVQTMSLIDHPNVLRAHCSFSVGSCLWIVMPYMASGSCLHIMKSSYPEGFEQAVIATLL
REVLKALVYLHSNGHIHRDVKAGNILVDSKGAIKLADFGVSACMFDAGDRQRSRNTFVGT
PCWMAPEVMQQLNGYDFKADIWSFGITALELAHGHAPFSKYPPMKVLLMTLQNAPPGLDY
ERDRRFSKSFKEMVGACLVKDPKKRPTSEKLLKHRFFKHACSKEFLAWAILNGLAPLGDR
FRMLKADFLVQKRGMDGNKEQLSQVTISKIRDSRVGLLPIPLGKLPIHKDLVNGRALDEN
DDFHEDEVFGAIMPINEDRKESSRSQFVNEGP

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_01s0127g00690.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:1:8016688:8021125:-1 gene:VIT_01s0127g00690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

AAGAAGCCATGGAATATTTATCAAACAAGAAATTTCCCATCAATTCAAAAGATTACAAGT
TATATGAGGAAGTTGGTGAAGGTGTTAGTGCCACAGTGTACAGAGCTCTCTGCATTCCAT
TTAATGAGATAGTCGCTGTCAAGGTTATGGATCTGGAGAGGTGCAACGATAACTTGGATG
GTATTCGACATGAAGTACAAACTATGAGCCTGATTGATCATCCAAATGTACTCAGGGCAC
ATTGCTCTTTCTCAGTGGGAAGCTGCCTCTGGATTGTGATGCCTTATATGGCTAGTGGAT
CTTGTCTTCACATAATGAAATCTTCTTATCCAGAGGGTTTTGAACAGGCTGTTATTGCAA
CACTATTACGTGAAGTTCTTAAAGCTCTTGTTTATCTTCATTCCAATGGACACATCCACA
GAGATGTTAAGGCTGGGAATATCTTGGTTGATTCCAAAGGTGCAATTAAGTTGGCTGACT
TTGGAGTTTCGGCATGTATGTTTGATGCTGGAGATAGACAACGTTCAAGGAACACATTTG
TGGGAACTCCATGCTGGATGGCTCCTGAAGTTATGCAGCAATTAAATGGATATGACTTTA
AAGCAGACATCTGGTCTTTTGGAATAACCGCTCTGGAACTTGCTCATGGTCATGCCCCAT
TTTCCAAGTATCCACCAATGAAGGTGTTGCTGATGACATTACAAAATGCACCACCTGGTC
TTGACTATGAAAGGGATCGAAGATTTTCAAAGTCGTTTAAAGAGATGGTAGGTGCTTGCT
TAGTGAAGGATCCAAAGAAGCGTCCCACATCAGAGAAGCTTTTAAAGCACCGTTTCTTTA
AACATGCATGCTCAAAAGAGTTTTTGGCCTGGGCTATTCTTAATGGCCTTGCTCCACTCG
GTGACCGGTTTAGGATGCTGAAGGCTGACTTTCTTGTACAAAAGAGGGGTATGGATGGGA
ATAAAGAGCAACTATCACAAGTAACTATAAGTAAGATTAGGGATTCTCGAGTGGGTTTGC
TACCCATACCTCTAGGAAAGCTGCCCATACACAAAGATCTAGTTAATGGTAGAGCCTTAG
ATGAAAATGATGATTTTCATGAGGATGAGGTTTTTGGTGCCATAATGCCTATTAATGAAG
ATAGGAAAGAGTCTTCTAGGTCACAATTTGTCAATGAAGGTCCTTGA