Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_01s0026g02130.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:1:11539990:11541783:1 gene:VIT_01s0026g02130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGATCTTTGGTAGTGCTTCATGGGTGAGGCAAAAGTTCCAATCTTGGTCATTGCATCAC TTCCCTAAGTACTACTCCACAGCCCCAGAAGATCAAAGCCTCATTTCCCTACTGGAATCT TGCACTCAGACCTCTGAAATCTGTCAAGTCCATGGCTCCATGGTCAAAACTGGCCTTGTC AATGTCCCCTTCACTTTGAGCAAGCTTCTTGCATCTTCCATACAAGACACTGACTATGCA GCCTCAATTTTCAACCAGATTCCAAGTCCAAATCTCTTTATGTTCAATACTATGCTTAGA GGCTATTCAATTAGTCACCATCCAAAACAAGCTTTTGTTGTCTTCAAGGGTTTGAGGGCT CAACAAATGATACTCGACCAGTTTTCCTTCATCCCAACCCTCAAAGCTTGTGCTCGCGAA TTGGCTTACGAAACTGGCCAAGGGATTCATGGGGTTGTTGTGAGGTCTGGGCATGGACTG TTTACCAACGTGAAGAATGCACTTTTGCATTTTTATTGTGTTTGTGGGAGAATTGGAGAT GCCCATCAGTTGTTTGATGAGATTCCTCCGAAAATTGATTTGGTTTCATGGAACACTTTG TTGGGTGGATATCTCCAGGTGCCCCACCCCACTATGGTCACTTGCTTGTTCGGAGAAATG TGTAGGAAAGGTCTAAAATTTAGCACCACAACAATTTCCAGTGTGTTGTGTGCTGTGGGT GATTTGGGAAACATTCTTGGTGGAGTATCTCTTCATGGGCATTGCATTAAGGTTGGCTTT TGTTCAGATTTAAATGTGGCTACTGCTTTGATTGATATGTACGCAAATGCTGGGTTTATT GATTTAGGGCATAAAATTTTTTATCAAGTCCCCAAAAAGGATGTTGTCTTATGGAATTGT TTGATAGATGGGTATGCAAAAAGTGACCTGTTACAAGAATCATTGTCTCTACTGCAACTA ATGAAACGTGAACAAGTGAAACCCAATTCATCTACATTGGTAGGGTTGCTTTCGGCTTGC GCTGCTGCCGGAGCATCGAGTGTAGGCCTATGTATCAGCAACTATGTGGAGGAGGAGCAA ATAGCATTGGATGCAGTTCTTGGCACCGCTCTGGTTGATATGTACTGTAAATGTGGGTTC CTCGAGAAGGCTATTGATGTTTTTGAAAGGATGGAAATCAAAGACGTGAAATCTTGGACA GCCATGATTTCAGGTTATGGGGTGCACGGGCAGGCAAAAAATGCCATTATGATCTTTCAT AGAATGGAGGTGGAGGGCTATAGGCCTAATGAAGTCACTTTCTTAGCAGTTTTGAATGCT TGTAGCCATGGAGGTATGGTTGTAGAGGGGATAAGTTTCTTAGAGAAAATGGTTCGAGAA TATGGCTTTTCCCCAAAGGTTGAACACTATGGATGTATGATTGATCTCTTGGGCCGTGCA GGGTTGCTGGAAGAAGCACATAACCTAATCAAGAGTTTGCCCATTGAGGGCGATGCTACC GGGTGGCGTGCATTGCTTGCAGCTTGCAGGGTGTATGGAAATGTTGACTTGGGAGAATGC GTGAAGAGAGTGCTGTTGGAAATCTTTGATGAGCACCCCACTGATTCCATCCTTCTTTCT AGCACATACGCTATTGCAGGAAGGTTGCCTGATTATACAAGAATGCAGGAGATTAAGGAA GAAAAGATGATGAAGGAAGCTGGATGTAGTGTAATTGAGATGGATAGCCATGGGTGGGAG CATATTAGGGAATATGGGAGCTCAAGCAAGGGACCCCCTCATGCGAATGCTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_01s0026g02130.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:1:11539990:11541783:1 gene:VIT_01s0026g02130 transcript:VIT_01s0026g02130.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MIFGSASWVRQKFQSWSLHHFPKYYSTAPEDQSLISLLESCTQTSEICQVHGSMVKTGLV NVPFTLSKLLASSIQDTDYAASIFNQIPSPNLFMFNTMLRGYSISHHPKQAFVVFKGLRA QQMILDQFSFIPTLKACARELAYETGQGIHGVVVRSGHGLFTNVKNALLHFYCVCGRIGD AHQLFDEIPPKIDLVSWNTLLGGYLQVPHPTMVTCLFGEMCRKGLKFSTTTISSVLCAVG DLGNILGGVSLHGHCIKVGFCSDLNVATALIDMYANAGFIDLGHKIFYQVPKKDVVLWNC LIDGYAKSDLLQESLSLLQLMKREQVKPNSSTLVGLLSACAAAGASSVGLCISNYVEEEQ IALDAVLGTALVDMYCKCGFLEKAIDVFERMEIKDVKSWTAMISGYGVHGQAKNAIMIFH RMEVEGYRPNEVTFLAVLNACSHGGMVVEGISFLEKMVREYGFSPKVEHYGCMIDLLGRA GLLEEAHNLIKSLPIEGDATGWRALLAACRVYGNVDLGECVKRVLLEIFDEHPTDSILLS STYAIAGRLPDYTRMQEIKEEKMMKEAGCSVIEMDSHGWEHIREYGSSSKGPPHANA

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_01s0026g02130.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:1:11539990:11541783:1 gene:VIT_01s0026g02130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGATCTTTGGTAGTGCTTCATGGGTGAGGCAAAAGTTCCAATCTTGGTCATTGCATCAC TTCCCTAAGTACTACTCCACAGCCCCAGAAGATCAAAGCCTCATTTCCCTACTGGAATCT TGCACTCAGACCTCTGAAATCTGTCAAGTCCATGGCTCCATGGTCAAAACTGGCCTTGTC AATGTCCCCTTCACTTTGAGCAAGCTTCTTGCATCTTCCATACAAGACACTGACTATGCA GCCTCAATTTTCAACCAGATTCCAAGTCCAAATCTCTTTATGTTCAATACTATGCTTAGA GGCTATTCAATTAGTCACCATCCAAAACAAGCTTTTGTTGTCTTCAAGGGTTTGAGGGCT CAACAAATGATACTCGACCAGTTTTCCTTCATCCCAACCCTCAAAGCTTGTGCTCGCGAA TTGGCTTACGAAACTGGCCAAGGGATTCATGGGGTTGTTGTGAGGTCTGGGCATGGACTG TTTACCAACGTGAAGAATGCACTTTTGCATTTTTATTGTGTTTGTGGGAGAATTGGAGAT GCCCATCAGTTGTTTGATGAGATTCCTCCGAAAATTGATTTGGTTTCATGGAACACTTTG TTGGGTGGATATCTCCAGGTGCCCCACCCCACTATGGTCACTTGCTTGTTCGGAGAAATG TGTAGGAAAGGTCTAAAATTTAGCACCACAACAATTTCCAGTGTGTTGTGTGCTGTGGGT GATTTGGGAAACATTCTTGGTGGAGTATCTCTTCATGGGCATTGCATTAAGGTTGGCTTT TGTTCAGATTTAAATGTGGCTACTGCTTTGATTGATATGTACGCAAATGCTGGGTTTATT GATTTAGGGCATAAAATTTTTTATCAAGTCCCCAAAAAGGATGTTGTCTTATGGAATTGT TTGATAGATGGGTATGCAAAAAGTGACCTGTTACAAGAATCATTGTCTCTACTGCAACTA ATGAAACGTGAACAAGTGAAACCCAATTCATCTACATTGGTAGGGTTGCTTTCGGCTTGC GCTGCTGCCGGAGCATCGAGTGTAGGCCTATGTATCAGCAACTATGTGGAGGAGGAGCAA ATAGCATTGGATGCAGTTCTTGGCACCGCTCTGGTTGATATGTACTGTAAATGTGGGTTC CTCGAGAAGGCTATTGATGTTTTTGAAAGGATGGAAATCAAAGACGTGAAATCTTGGACA GCCATGATTTCAGGTTATGGGGTGCACGGGCAGGCAAAAAATGCCATTATGATCTTTCAT AGAATGGAGGTGGAGGGCTATAGGCCTAATGAAGTCACTTTCTTAGCAGTTTTGAATGCT TGTAGCCATGGAGGTATGGTTGTAGAGGGGATAAGTTTCTTAGAGAAAATGGTTCGAGAA TATGGCTTTTCCCCAAAGGTTGAACACTATGGATGTATGATTGATCTCTTGGGCCGTGCA GGGTTGCTGGAAGAAGCACATAACCTAATCAAGAGTTTGCCCATTGAGGGCGATGCTACC GGGTGGCGTGCATTGCTTGCAGCTTGCAGGGTGTATGGAAATGTTGACTTGGGAGAATGC GTGAAGAGAGTGCTGTTGGAAATCTTTGATGAGCACCCCACTGATTCCATCCTTCTTTCT AGCACATACGCTATTGCAGGAAGGTTGCCTGATTATACAAGAATGCAGGAGATTAAGGAA GAAAAGATGATGAAGGAAGCTGGATGTAGTGTAATTGAGATGGATAGCCATGGGTGGGAG CATATTAGGGAATATGGGAGCTCAAGCAAGGGACCCCCTCATGCGAATGCTTAA