Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_01s0026g01960.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:1:11312739:11322744:-1 gene:VIT_01s0026g01960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGACGCACCCTCGATCCGAGTTCCATACAAGAATCTGAAGCAGGCTGAGGTTGAATTG GTTGCCGCCGACGAACCTCGCCATGGAGCCGACTTGAATTCTAGGGTTCCCAATGGGACA TCTGATCCCTCATCTAGCCCTTCATCCATTACTCATCCACCCAAACACGGTGGTTTGAGG ACTTTGATTCTCAGTTGTATGATTGCCGCCGGTGTTCAATTTGGTTGGGCCTTGCAGCTT TCCCTATTGACTCCTTATATTCAGACACTTGGAATAGAGCATGCCTTTTCTTCATTTATC TGGCTTTGTGGCCCTATTACAGGCCTTGTGGTTCAGCCTTGTGTTGGGATATGGAGTGAC AAGTGCTCTTCAAAATATGGAAGAAGACGACCATTTATTCTTGCTGGGTCTCTAATGATC TCAGTTGCTGTGACAATTATTGGGTTTTCTGCAGACATTGGATATTTATTAGGAGATACC AATATGGATTGCAGAAAATTTAAAGGTACTCGAACATGGGCAGCTATTATTTTTGTCCTT GGATTTTGGATGCTAGATCTTGCAAACAATACGGTGCAGGGCCCAGCTCGTGCTCTTCTA GCTGATCTATCAGGTCCTGATCAGCGAAATTCAGCAAATGCCATCTTTTGCTCATGGATG GCTGTGGGAAACATTCTAGGATTTTCTGCTGGTGCTAGTGGACACTGGCATAGATGGTTT CCTTTTCTGTTAAATAAAGCTTGCTGTGAAGCCTGTGGGAATCTTAAAGCAGCATTTCTA ATCGCAGTGGTCTTCCTGACTTTGTGTACCCTTGTGACTTTATATTTTGCTGAGGAGGTT CCATTGATGGCATACCAGCCTCACCATTTATCAGACTCTGCGCCTTTATTGGATAATCCT CAACAAATTGGGTTTGATAATTCAAAATCAAAGCTTGATATGTCAGCTGTTGATAATGCC ACTGGTAACAACCCTGAGAGCAGTTATGAAATCAATAAAAATGCAAAACATCTCACTCCG ATCGTTCAAGAACAAAATGAAAGTTTCAGTGATGGACCTGGAGCAGTATTGGTCAATCTG TTGACAAGCCTAAGGCATTTGCCACCTGCAATGCATTCAGTGCTTCTTGTCATGGCTCTT AGTTGGCTGTCCTGGTTTCCCTTCTTTCTTTTTGATACGGATTGGATGGGTAGAGAAGTT TATCATGGGGATCCTAAAGGGGATGAGTCTGCAGTTAAAGCATATGATGCTGGTGTTAGA GAAGGTGCATTTGGTTTGCTATTGAATTCAGTTGTTCTTGGCATTAGCTCTTTCCTTATT GAACCCATGTGTCAGCGGATGGGGGCAAGGCTGGTTTGGGCCATGAGCAATTTTATTGTG TTTGCCTGCATGGCTGGCACTGCTATTATTAGTCTGGTTTCTGTCAACAAATATATTACT GAAGGGATTCAACATGCAATTGGAGAGAATAGAGCAATCAAGATCGCTTCATTGGTTGTG TTTGCTCTTCTTGGCTTTCCTCTTTCTATTACCTATAGTGTTCCTTTTTCTATCACAGCA GAGTTGACTGCTGATACAGGTGGTGGCCAAGGATTGGCTATTGGAGTTTTGAATCTTGCA ATTGTCATTCCTCAGATGATTGTTTCCCTTGGTGCGGGTCCATGGGATGCTTTATTTGGT GGAGGAAACATACCTGCCTTTGTGCTAGCTGCATTGTTTGCCCTAGCAGCTGGTGTTATT GCAATTCTCAAGCTGCCAAACCTTTCGAGTAGTTCGTACAAATCATCTGGTTTTCATTTT GGATAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_01s0026g01960.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:1:11312739:11322744:-1 gene:VIT_01s0026g01960 transcript:VIT_01s0026g01960.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MDAPSIRVPYKNLKQAEVELVAADEPRHGADLNSRVPNGTSDPSSSPSSITHPPKHGGLR TLILSCMIAAGVQFGWALQLSLLTPYIQTLGIEHAFSSFIWLCGPITGLVVQPCVGIWSD KCSSKYGRRRPFILAGSLMISVAVTIIGFSADIGYLLGDTNMDCRKFKGTRTWAAIIFVL GFWMLDLANNTVQGPARALLADLSGPDQRNSANAIFCSWMAVGNILGFSAGASGHWHRWF PFLLNKACCEACGNLKAAFLIAVVFLTLCTLVTLYFAEEVPLMAYQPHHLSDSAPLLDNP QQIGFDNSKSKLDMSAVDNATGNNPESSYEINKNAKHLTPIVQEQNESFSDGPGAVLVNL LTSLRHLPPAMHSVLLVMALSWLSWFPFFLFDTDWMGREVYHGDPKGDESAVKAYDAGVR EGAFGLLLNSVVLGISSFLIEPMCQRMGARLVWAMSNFIVFACMAGTAIISLVSVNKYIT EGIQHAIGENRAIKIASLVVFALLGFPLSITYSVPFSITAELTADTGGGQGLAIGVLNLA IVIPQMIVSLGAGPWDALFGGGNIPAFVLAALFALAAGVIAILKLPNLSSSSYKSSGFHF G

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_01s0026g01960.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:1:11312739:11322744:-1 gene:VIT_01s0026g01960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	CTTCAAACCCTGGAATTAGAAATAGATCTCTTGGAACTTATATGCGTATATGACAAGATC AGACTTGTGATCATCTCCGACTGGAACATTCCGCGTCATGCCGGAGACGATGGACGCACC CTCGATCCGAGTTCCATACAAGAATCTGAAGCAGGCTGAGGTTGAATTGGTTGCCGCCGA CGAACCTCGCCATGGAGCCGACTTGAATTCTAGGGTTCCCAATGGGACATCTGATCCCTC ATCTAGCCCTTCATCCATTACTCATCCACCCAAACACGGTGGTTTGAGGACTTTGATTCT CAGTTGTATGATTGCCGCCGGTGTTCAATTTGGTTGGGCCTTGCAGCTTTCCCTATTGAC TCCTTATATTCAGACACTTGGAATAGAGCATGCCTTTTCTTCATTTATCTGGCTTTGTGG CCCTATTACAGGCCTTGTGGTTCAGCCTTGTGTTGGGATATGGAGTGACAAGTGCTCTTC AAAATATGGAAGAAGACGACCATTTATTCTTGCTGGGTCTCTAATGATCTCAGTTGCTGT GACAATTATTGGGTTTTCTGCAGACATTGGATATTTATTAGGAGATACCAATATGGATTG CAGAAAATTTAAAGGTACTCGAACATGGGCAGCTATTATTTTTGTCCTTGGATTTTGGAT GCTAGATCTTGCAAACAATACGGTGCAGGGCCCAGCTCGTGCTCTTCTAGCTGATCTATC AGGTCCTGATCAGCGAAATTCAGCAAATGCCATCTTTTGCTCATGGATGGCTGTGGGAAA CATTCTAGGATTTTCTGCTGGTGCTAGTGGACACTGGCATAGATGGTTTCCTTTTCTGTT AAATAAAGCTTGCTGTGAAGCCTGTGGGAATCTTAAAGCAGCATTTCTAATCGCAGTGGT CTTCCTGACTTTGTGTACCCTTGTGACTTTATATTTTGCTGAGGAGGTTCCATTGATGGC ATACCAGCCTCACCATTTATCAGACTCTGCGCCTTTATTGGATAATCCTCAACAAATTGG GTTTGATAATTCAAAATCAAAGCTTGATATGTCAGCTGTTGATAATGCCACTGGTAACAA CCCTGAGAGCAGTTATGAAATCAATAAAAATGCAAAACATCTCACTCCGATCGTTCAAGA ACAAAATGAAAGTTTCAGTGATGGACCTGGAGCAGTATTGGTCAATCTGTTGACAAGCCT AAGGCATTTGCCACCTGCAATGCATTCAGTGCTTCTTGTCATGGCTCTTAGTTGGCTGTC CTGGTTTCCCTTCTTTCTTTTTGATACGGATTGGATGGGTAGAGAAGTTTATCATGGGGA TCCTAAAGGGGATGAGTCTGCAGTTAAAGCATATGATGCTGGTGTTAGAGAAGGTGCATT TGGTTTGCTATTGAATTCAGTTGTTCTTGGCATTAGCTCTTTCCTTATTGAACCCATGTG TCAGCGGATGGGGGCAAGGCTGGTTTGGGCCATGAGCAATTTTATTGTGTTTGCCTGCAT GGCTGGCACTGCTATTATTAGTCTGGTTTCTGTCAACAAATATATTACTGAAGGGATTCA ACATGCAATTGGAGAGAATAGAGCAATCAAGATCGCTTCATTGGTTGTGTTTGCTCTTCT TGGCTTTCCTCTTTCTATTACCTATAGTGTTCCTTTTTCTATCACAGCAGAGTTGACTGC TGATACAGGTGGTGGCCAAGGATTGGCTATTGGAGTTTTGAATCTTGCAATTGTCATTCC TCAGATGATTGTTTCCCTTGGTGCGGGTCCATGGGATGCTTTATTTGGTGGAGGAAACAT ACCTGCCTTTGTGCTAGCTGCATTGTTTGCCCTAGCAGCTGGTGTTATTGCAATTCTCAA GCTGCCAAACCTTTCGAGTAGTTCGTACAAATCATCTGGTTTTCATTTTGGATAACTTCC CTGCCTCAATGAGGTGACAGCAAACCTGTATATGATCCTCTCAGCTGCTACAAGAACAGA CCTAGTCAAGTGGTTCTACTATCATCCGTACGTATTATAATTTCATACAAAAAAATTCAT GCATTACATATTCAAATTCATTCATTTTTTGCCACTTCTTTGTGGCATCTGTAACTTATT TAGAGTGTAAATCATCCTTAATATTGCAAGGCATATACAT