Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_01s0011g03630.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:1:3281798:3283951:1 gene:VIT_01s0011g03630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGACTTACGCTCGCCAGTTGTTCGATCAAATTCCCGACCCCAATATTGCACTATGGAAC TCGATGTTTCGTGGGTATGCCCAGAGCGAGTCGTACAGAGAAGTGGTATTTTTGTTTTTT CAGATGAAGGGTATGGACATACGGCCCAATTGCTTCACCTTCCCTGTTGTTCTGAAATCA TGTGGGAAGATCAATGCATTGATTGAAGGAGAACAAGTGCATTGTTTCTTGATCAAGTGT GGTTTTAGGGGAAACCCGTTTGTGGGCACTACATTGATTGATATGTATTCGGCTGGTGGA ACGGTTGGGGATGCTTACAAGATTTTCTGTGAAATGTTTGAGAGGAATGTAGTTGCATGG ACTTCGATGATTAATGGGTATATTTTGTCTGCTGATCTGGTTTCCGCACGTCGCCTTTTT GACTTGGCGCCAGAGCGTGATGTTGTGCTGTGGAACATTATGGTTTCAGGGTACATTGAA GGTGGGGACATGGTTGAGGCGCGCAAGCTCTTCCATGAGATGCCAAATCGAGATGTGATG TTTTGGAACACTGTATTGAAGGGTTATGCTACCAATGGGAATGTTGAAGCTCTTGAGGGG CTGTTTGAAGAGATGCCGGAGAGAAACATTTTTTCTTGGAACGCATTGATTGGAGGGTAT GCTCATAATGGCCTTTTCTTTGAAGTTTTAGGTTCCTTTAAAAGGATGTTGAGTGAGTCT GATGTGCCTCCTAATGATGCCACTCTTGTGACAGTGTTGTCTGCTTGTGCAAGATTAGGA GCTCTTGATTTGGGCAAGTGGGTACATGTATATGCAGAGAGTAGTGGGTTGAAGGGCAAT GTTTATGTTGGGAATGCTTTGATGGATATGTATGCAAAATGTGGGATCATAGAAAATGCA ATTTCAGTGTTCCGGGGCATGGACACAAAAGATTTGATCTCCTGGAACACCTTAATTGGA GGCTTAGCGATGCATAGCCGTGGGGCTGATGCCTTAAATTTGTTTTTTCAGATGAAGAAT GCTGGACAAAAGCCAGATGGTATCACCTTCATAGGCATCTTGTGTGCTTGTACGCATATG GGTCTAGTTGAAGATGGGTTTGCATATTTTCAATCAATGGCCGATGATTATTTAATCATG CCTCAAATTGAGCATTATGGTTGTATGGTTGATATGCTAGCACGAGCAGGTCGTTTAGAA CAGGCTATGGCTTTTGTCAGGAAGATGCCTGTGGAAGCTGATGGTGTCATATGGGCTGGT TTACTTGGGGCCTGTAGGATTTACAAGAATGTTGAGTTGGCCGAACTGGCTCTTCAACGG CTGATTGAACTCGAACCAAAAAACCCTGCAAATTATGTCATGTTGTCCAATATATATGGG GATGCTGGCAGATGGGAAGATGTGGCCCGGCTAAAAGTTGCAATGAGAGATACAGGGTTT AAAAAATTACCAGGGTGTAGTTTGATTGAGGTGAATGATGCTGTAGTTGAGTTCTATTCG TTAGATGAGCGGCATCCCCAGATAGAGGAAATATATGGAGTATTGAGGGGATTAGTGAAG GTTTTAAGATCCTTTGGGTATGTACCCGACCTTACAGGAGCTGGGCGAGGAACTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_01s0011g03630.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:1:3281798:3283951:1 gene:VIT_01s0011g03630 transcript:VIT_01s0011g03630.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MTYARQLFDQIPDPNIALWNSMFRGYAQSESYREVVFLFFQMKGMDIRPNCFTFPVVLKS CGKINALIEGEQVHCFLIKCGFRGNPFVGTTLIDMYSAGGTVGDAYKIFCEMFERNVVAW TSMINGYILSADLVSARRLFDLAPERDVVLWNIMVSGYIEGGDMVEARKLFHEMPNRDVM FWNTVLKGYATNGNVEALEGLFEEMPERNIFSWNALIGGYAHNGLFFEVLGSFKRMLSES DVPPNDATLVTVLSACARLGALDLGKWVHVYAESSGLKGNVYVGNALMDMYAKCGIIENA ISVFRGMDTKDLISWNTLIGGLAMHSRGADALNLFFQMKNAGQKPDGITFIGILCACTHM GLVEDGFAYFQSMADDYLIMPQIEHYGCMVDMLARAGRLEQAMAFVRKMPVEADGVIWAG LLGACRIYKNVELAELALQRLIELEPKNPANYVMLSNIYGDAGRWEDVARLKVAMRDTGF KKLPGCSLIEVNDAVVEFYSLDERHPQIEEIYGVLRGLVKVLRSFGYVPDLTGAGRGT

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_01s0011g03630.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:1:3281798:3283951:1 gene:VIT_01s0011g03630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	GCACCAAAGCCACCCCACAGGCTTCTTGAGGAGAGATTCATCTCACTTTTGCAGTCATGT AAGACCTCAAAACAAGTTCACCAAATTCAAGCCCAGATAATCGCCAACGGTTTCCAATAC AACGAATACATCACCCCTAAATTGGTCACGATATGTGCGACACTGAAGAGAATGACTTAC GCTCGCCAGTTGTTCGATCAAATTCCCGACCCCAATATTGCACTATGGAACTCGATGTTT CGTGGGTATGCCCAGAGCGAGTCGTACAGAGAAGTGGTATTTTTGTTTTTTCAGATGAAG GGTATGGACATACGGCCCAATTGCTTCACCTTCCCTGTTGTTCTGAAATCATGTGGGAAG ATCAATGCATTGATTGAAGGAGAACAAGTGCATTGTTTCTTGATCAAGTGTGGTTTTAGG GGAAACCCGTTTGTGGGCACTACATTGATTGATATGTATTCGGCTGGTGGAACGGTTGGG GATGCTTACAAGATTTTCTGTGAAATGTTTGAGAGGAATGTAGTTGCATGGACTTCGATG ATTAATGGGTATATTTTGTCTGCTGATCTGGTTTCCGCACGTCGCCTTTTTGACTTGGCG CCAGAGCGTGATGTTGTGCTGTGGAACATTATGGTTTCAGGGTACATTGAAGGTGGGGAC ATGGTTGAGGCGCGCAAGCTCTTCCATGAGATGCCAAATCGAGATGTGATGTTTTGGAAC ACTGTATTGAAGGGTTATGCTACCAATGGGAATGTTGAAGCTCTTGAGGGGCTGTTTGAA GAGATGCCGGAGAGAAACATTTTTTCTTGGAACGCATTGATTGGAGGGTATGCTCATAAT GGCCTTTTCTTTGAAGTTTTAGGTTCCTTTAAAAGGATGTTGAGTGAGTCTGATGTGCCT CCTAATGATGCCACTCTTGTGACAGTGTTGTCTGCTTGTGCAAGATTAGGAGCTCTTGAT TTGGGCAAGTGGGTACATGTATATGCAGAGAGTAGTGGGTTGAAGGGCAATGTTTATGTT GGGAATGCTTTGATGGATATGTATGCAAAATGTGGGATCATAGAAAATGCAATTTCAGTG TTCCGGGGCATGGACACAAAAGATTTGATCTCCTGGAACACCTTAATTGGAGGCTTAGCG ATGCATAGCCGTGGGGCTGATGCCTTAAATTTGTTTTTTCAGATGAAGAATGCTGGACAA AAGCCAGATGGTATCACCTTCATAGGCATCTTGTGTGCTTGTACGCATATGGGTCTAGTT GAAGATGGGTTTGCATATTTTCAATCAATGGCCGATGATTATTTAATCATGCCTCAAATT GAGCATTATGGTTGTATGGTTGATATGCTAGCACGAGCAGGTCGTTTAGAACAGGCTATG GCTTTTGTCAGGAAGATGCCTGTGGAAGCTGATGGTGTCATATGGGCTGGTTTACTTGGG GCCTGTAGGATTTACAAGAATGTTGAGTTGGCCGAACTGGCTCTTCAACGGCTGATTGAA CTCGAACCAAAAAACCCTGCAAATTATGTCATGTTGTCCAATATATATGGGGATGCTGGC AGATGGGAAGATGTGGCCCGGCTAAAAGTTGCAATGAGAGATACAGGGTTTAAAAAATTA CCAGGGTGTAGTTTGATTGAGGTGAATGATGCTGTAGTTGAGTTCTATTCGTTAGATGAG CGGCATCCCCAGATAGAGGAAATATATGGAGTATTGAGGGGATTAGTGAAGGTTTTAAGA TCCTTTGGGTATGTACCCGACCTTACAGGAGCTGGGCGAGGAACTTAAAGAAAGAGATCT TAACATTGTTGAGGCTTCATTTGGTGGTCGCATTTTGGTTCTGGGGTGTCCAAGAACACT ATCAGGATTTGGGCTGCAACTCAAAGCAAGTTGAAGGAGGCTTCCCCAGCAAAAAGATCC ATAACGTGTGCCAAAAAGTTCTTCTCCAGTATTGAAGATTGATAAAAAACAGTCAAGGAT CTTACGGCACTGCCTAAATATTAGGCATCGGCAGCACGTACCCCGTATGCCATGAAAATG ACGTAGATTTGCATACATTCATCTTCTTGACAGAAGTAGTTGTTCAGGAATATCGCATTT AGATAACATGCATCTTTTTGTTCATTAATCAAATATTTTATTGTTTGGATTATC