Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_01s0011g03450.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:1:3127812:3132261:1 gene:VIT_01s0011g03450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCTTCCTCTTATCTTCTACTTGTGGTTTCGATTCTATGCATCTATGGAGGATGCGGC GCGTTGGCGGCAATTCCTGCAAAGATTGGCAAAGGGTATCGTCTGATATCCATTGAAGAG ACTGCTAATGGAGGTCTTCTGGGCCATCTTCAAGTCAAGCAAAAGAACAACATCTACGGT GCCGATATCCCACATTTGCAGCTCCATGTCAAGCATGAGACGCAAGATCGTTTGAGGGTG CACATCACCGACGCAGAGAAGCAGAGATGGGAAGTTCCGTACGATCTGTTGCCCAGAGAG AAGCCTCTACCATTGAGACAGGCCATTGGAAGATCAAGGAAAACTCTATCAACACCTACT GACTACCCGGGTTCTGAGCTCATATTCAGCTACACTACAGACCCATTTGGGTTTGCAGTG AGAAGAAAATCCACCGGCGAAACCCTTTTCAATACGACTTCCGATGACTCAGACCGGTAT GGTAATATGGTGTTTAAGGACCAGTACCTCGAAATTTCCACCAAATTGCCTAAAGATGCC TCACTGTACGGGTTGGGGGAGAACACTCAACCCCATGGAATCAAACTGTATCCAAATGAT CCCTATACTCTGTATACAACAGATATATCGGCCATTAATCTAAATGCAGATCTGTACGGG TCTCATCCAGTGTACATGGATCTCAGGAACACCGGTGGGAAAGCTTATGCACACTCAGTC TTGTTGCTGAACAGCAACGGGATGGATGTGTTCTACAAGGGAAGTTCATTGACATACAAG GTGATTGGGGGTGTCTTTGATTTCTACTTCTTTGGTGGTCCAACGCCACTATCTGTTGTT GATCAGTACACTAGCTTGGTGGGTAGGCCTGCTCCAATGCCCTACTGGTCTCTAGGATTC CACCAATGTAGATGGGGTTACCATAATCTATCTGTAGTTGAAGATGTGGTTGAGAACTAC AAAAAGGCTCAAATCCCGCTTGATGTGATATGGAATGATGATGATCATATGGATGGGCAC AAGGACTTCACTCTCAACCCTGTCAACTACCCTCGCCCAAAGCTGTTGGAGTTCCTAAAC AAAATACATGATCGGGGCATGAAGTACATTGTTATCATTGACCCTGGAATTGGTGTGAAT TCAACCTATGGTGTGTATCAAAGAGGTATGGCCAATGATGTTTTTATCAAGTATGATGGT GAACCCTTCTTAGCTCAAGTCTGGCCTGGGCCTGTTTACTTCCCTGACTTCCTTAACCCA AAAACTGTTTCATGGTGGGGTGATGAAATTCGGCGGTTCCATGAACTTGTTCCTGTTGAT GGTCTTTGGATTGATATGAATGAGGCTTCGAATTTCTGTACTGGGAAGTGCACAATCCCA AAGGGTAAGGTGTGCCCCAGTGGAACTGGACCTGGGTGGATATGTTGCTTGGATTGCAAG AACATAACAAAAACAAGATGGGACGACCCACCTTATAAGATCAATGCTTCAGGATTGGAG GTTCCAATTGGGTACAAAACCATAGCCACCAGTGCAGTTCACTACAATGGGGTTTTGGAG TATGATGCACATAGTCTCTATGGTTTCTCTCAATCCATTGCGACCCATAAGGGCCTCCAA GGGCTTGAGGGCAAACGCCCCTTCATATTATCCCGCTCTACTTATGTTGGGTCAGGCAAA TATGCTGCCCATTGGACGGGTGACAATAAGGGCACTTGGGATGATATAAAGTATTCGATT TCTACTATGCTGAACTTTGGTATATTTGGGGTGCCAATGGTTGGTTCAGACATCTGTGGA TTCTATCCAGCACCCACAGAGGAGCTTTGCAACAGATGGATTGAGCTAGGTGCTTTCTAC CCTTTCTCAAGGGATCATGCAAACTACTATTCCCCAAGACAGGAGCTTTATCAATGGGAC TCGGTGGCTAAGTCTGCTCGAAATGCTCTGGGAATGAGGTACAAGCTCCTTCCATATCTG TACACATTGAACTATGAGGCACATATCAGTGGTGCCCCAATTGCCAGGCCGCTTTTCTTC ACATTCCCAACTTTCTCCAAGTGTTATGAGGTGAGCACCCAGTTCTTGCTAGGTAGCGGT GTCTTGGTGTCTCCAGTGCTTGACAAGGGGAAAACCAAGGTCAATGCTCTCTTTCCTCCT GGTACCTGGTACAGTTTATTTGATTTGAAGGAGACCATTGTATCAGAGGGTGACTACCGT TCTCTAGATGCACCATTACATGTGATCAATGTTCATGTGTACCAAAATACCATACTCCCA ATGCAGCAGGGTGGACTGATTTCGAAGGAAGCCAGGATGACACCCTTCACTCTCATTGTA ACCTTCCCAGCAGGAGCAACTGAGGGACATGCTGAAGGGAAACTCTACCTTGATGATGAT GAGCTCCCTGAAATGACTCTTGGAAATGGATTTTCCACATATGTTGATTTACATGCAACT GTGGAGAATAAAATGGTGAAGGTATGGTCAGATGTTGCGGAGGGCAAATATGCTTTGGAG AAGGGTTGGACCATAGAGAAGATAACAGTGTTGGGATTGAGTGGAAGCGGAGAGTCATTT GCTCTCGAGGTTGATGGAAGTTCAGTGTCAGATGTCTCCCATGTACAGCTTACTGCATCT GAACAGCATGTAGCCACTGATAAGTTAGAAGATGAAGGAGATACGAGGAAGAGCATGATG ATAGAAATTCAGGGATTGGACCTGCCAGTAGGGAAAAACTTTGCCATGTCCTGGAAAATG GGCGTCCATGGTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_01s0011g03450.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:1:3127812:3132261:1 gene:VIT_01s0011g03450 transcript:VIT_01s0011g03450.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MASSYLLLVVSILCIYGGCGALAAIPAKIGKGYRLISIEETANGGLLGHLQVKQKNNIYG ADIPHLQLHVKHETQDRLRVHITDAEKQRWEVPYDLLPREKPLPLRQAIGRSRKTLSTPT DYPGSELIFSYTTDPFGFAVRRKSTGETLFNTTSDDSDRYGNMVFKDQYLEISTKLPKDA SLYGLGENTQPHGIKLYPNDPYTLYTTDISAINLNADLYGSHPVYMDLRNTGGKAYAHSV LLLNSNGMDVFYKGSSLTYKVIGGVFDFYFFGGPTPLSVVDQYTSLVGRPAPMPYWSLGF HQCRWGYHNLSVVEDVVENYKKAQIPLDVIWNDDDHMDGHKDFTLNPVNYPRPKLLEFLN KIHDRGMKYIVIIDPGIGVNSTYGVYQRGMANDVFIKYDGEPFLAQVWPGPVYFPDFLNP KTVSWWGDEIRRFHELVPVDGLWIDMNEASNFCTGKCTIPKGKVCPSGTGPGWICCLDCK NITKTRWDDPPYKINASGLEVPIGYKTIATSAVHYNGVLEYDAHSLYGFSQSIATHKGLQ GLEGKRPFILSRSTYVGSGKYAAHWTGDNKGTWDDIKYSISTMLNFGIFGVPMVGSDICG FYPAPTEELCNRWIELGAFYPFSRDHANYYSPRQELYQWDSVAKSARNALGMRYKLLPYL YTLNYEAHISGAPIARPLFFTFPTFSKCYEVSTQFLLGSGVLVSPVLDKGKTKVNALFPP GTWYSLFDLKETIVSEGDYRSLDAPLHVINVHVYQNTILPMQQGGLISKEARMTPFTLIV TFPAGATEGHAEGKLYLDDDELPEMTLGNGFSTYVDLHATVENKMVKVWSDVAEGKYALE KGWTIEKITVLGLSGSGESFALEVDGSSVSDVSHVQLTASEQHVATDKLEDEGDTRKSMM IEIQGLDLPVGKNFAMSWKMGVHG

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_01s0011g03450.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:1:3127812:3132261:1 gene:VIT_01s0011g03450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	GTTTTTCCAGGCATGGCTTCCTCTTATCTTCTACTTGTGGTTTCGATTCTATGCATCTAT GGAGGATGCGGCGCGTTGGCGGCAATTCCTGCAAAGATTGGCAAAGGGTATCGTCTGATA TCCATTGAAGAGACTGCTAATGGAGGTCTTCTGGGCCATCTTCAAGTCAAGCAAAAGAAC AACATCTACGGTGCCGATATCCCACATTTGCAGCTCCATGTCAAGCATGAGACGCAAGAT CGTTTGAGGGTGCACATCACCGACGCAGAGAAGCAGAGATGGGAAGTTCCGTACGATCTG TTGCCCAGAGAGAAGCCTCTACCATTGAGACAGGCCATTGGAAGATCAAGGAAAACTCTA TCAACACCTACTGACTACCCGGGTTCTGAGCTCATATTCAGCTACACTACAGACCCATTT GGGTTTGCAGTGAGAAGAAAATCCACCGGCGAAACCCTTTTCAATACGACTTCCGATGAC TCAGACCGGTATGGTAATATGGTGTTTAAGGACCAGTACCTCGAAATTTCCACCAAATTG CCTAAAGATGCCTCACTGTACGGGTTGGGGGAGAACACTCAACCCCATGGAATCAAACTG TATCCAAATGATCCCTATACTCTGTATACAACAGATATATCGGCCATTAATCTAAATGCA GATCTGTACGGGTCTCATCCAGTGTACATGGATCTCAGGAACACCGGTGGGAAAGCTTAT GCACACTCAGTCTTGTTGCTGAACAGCAACGGGATGGATGTGTTCTACAAGGGAAGTTCA TTGACATACAAGGTGATTGGGGGTGTCTTTGATTTCTACTTCTTTGGTGGTCCAACGCCA CTATCTGTTGTTGATCAGTACACTAGCTTGGTGGGTAGGCCTGCTCCAATGCCCTACTGG TCTCTAGGATTCCACCAATGTAGATGGGGTTACCATAATCTATCTGTAGTTGAAGATGTG GTTGAGAACTACAAAAAGGCTCAAATCCCGCTTGATGTGATATGGAATGATGATGATCAT ATGGATGGGCACAAGGACTTCACTCTCAACCCTGTCAACTACCCTCGCCCAAAGCTGTTG GAGTTCCTAAACAAAATACATGATCGGGGCATGAAGTACATTGTTATCATTGACCCTGGA ATTGGTGTGAATTCAACCTATGGTGTGTATCAAAGAGGTATGGCCAATGATGTTTTTATC AAGTATGATGGTGAACCCTTCTTAGCTCAAGTCTGGCCTGGGCCTGTTTACTTCCCTGAC TTCCTTAACCCAAAAACTGTTTCATGGTGGGGTGATGAAATTCGGCGGTTCCATGAACTT GTTCCTGTTGATGGTCTTTGGATTGATATGAATGAGGCTTCGAATTTCTGTACTGGGAAG TGCACAATCCCAAAGGGTAAGGTGTGCCCCAGTGGAACTGGACCTGGGTGGATATGTTGC TTGGATTGCAAGAACATAACAAAAACAAGATGGGACGACCCACCTTATAAGATCAATGCT TCAGGATTGGAGGTTCCAATTGGGTACAAAACCATAGCCACCAGTGCAGTTCACTACAAT GGGGTTTTGGAGTATGATGCACATAGTCTCTATGGTTTCTCTCAATCCATTGCGACCCAT AAGGGCCTCCAAGGGCTTGAGGGCAAACGCCCCTTCATATTATCCCGCTCTACTTATGTT GGGTCAGGCAAATATGCTGCCCATTGGACGGGTGACAATAAGGGCACTTGGGATGATATA AAGTATTCGATTTCTACTATGCTGAACTTTGGTATATTTGGGGTGCCAATGGTTGGTTCA GACATCTGTGGATTCTATCCAGCACCCACAGAGGAGCTTTGCAACAGATGGATTGAGCTA GGTGCTTTCTACCCTTTCTCAAGGGATCATGCAAACTACTATTCCCCAAGACAGGAGCTT TATCAATGGGACTCGGTGGCTAAGTCTGCTCGAAATGCTCTGGGAATGAGGTACAAGCTC CTTCCATATCTGTACACATTGAACTATGAGGCACATATCAGTGGTGCCCCAATTGCCAGG CCGCTTTTCTTCACATTCCCAACTTTCTCCAAGTGTTATGAGGTGAGCACCCAGTTCTTG CTAGGTAGCGGTGTCTTGGTGTCTCCAGTGCTTGACAAGGGGAAAACCAAGGTCAATGCT CTCTTTCCTCCTGGTACCTGGTACAGTTTATTTGATTTGAAGGAGACCATTGTATCAGAG GGTGACTACCGTTCTCTAGATGCACCATTACATGTGATCAATGTTCATGTGTACCAAAAT ACCATACTCCCAATGCAGCAGGGTGGACTGATTTCGAAGGAAGCCAGGATGACACCCTTC ACTCTCATTGTAACCTTCCCAGCAGGAGCAACTGAGGGACATGCTGAAGGGAAACTCTAC CTTGATGATGATGAGCTCCCTGAAATGACTCTTGGAAATGGATTTTCCACATATGTTGAT TTACATGCAACTGTGGAGAATAAAATGGTGAAGGTATGGTCAGATGTTGCGGAGGGCAAA TATGCTTTGGAGAAGGGTTGGACCATAGAGAAGATAACAGTGTTGGGATTGAGTGGAAGC GGAGAGTCATTTGCTCTCGAGGTTGATGGAAGTTCAGTGTCAGATGTCTCCCATGTACAG CTTACTGCATCTGAACAGCATGTAGCCACTGATAAGTTAGAAGATGAAGGAGATACGAGG AAGAGCATGATGATAGAAATTCAGGGATTGGACCTGCCAGTAGGGAAAAACTTTGCCATG TCCTGGAAAATGGGCGTCCATGGTTAAGGTCCCTGCCTTTTTAGATTTGCTTGTTTAGTA TTTTTCCTTTTTTTTTTTTTGTTTTCAAATTTTCTTTCTTCAATTGTTGATGCTTTTGGT GCTTCACATTTGTGTTGCTGGAGATGAGATGGGCGAAGAATGCTCTCCATTTCCCATGCA CACAAGCAGGGATGATGAGGACTTGACTCTCTTGCTTTGCTTTAGGCTTTCTTTGAATCT CTAGGCTTGTAGCTTCAATTGGCTTCAATGCAGTTTTATAATGTTATGAATCTTTGAGAT CTA