Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_01s0011g03220.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:1:2928959:2935184:-1 gene:VIT_01s0011g03220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAGCGACTCTCTGAGCCCTTCCTCAGATGATTCGGCGTCGATCGCTTCCGCAGATCAG AATGTAGGGAGAAGTCGAAGAAGCGGCGATGGTAGTCACGGTCTCGGTCGCAGTCATACA GTGACTACCGAGCCGTTGAGGCATTGGAGGGATGTGTTCTGGTTGACTGTATTTATTGTG CATTTGATCGGTTTGGGGTTGATTCTGGCGGTTCTTGGACTCAATAGGTTTAGGAAAACG GATAGGCTTAAAATTGATAGGTTCACCACCAGACTTTCTGAGAATAGTAAGGGCTTGACG GAGAATTATTGGCCGCTCTATGCTGTTGCTGGCGGAGTTGGGACGTTTCTTGGATGGGCA TGGTTATTGCTGCTCGGTTCTCGTGCCAATCAAATGATGAAGGTTTCTGTCCACATTTTG ACCACTTATCTTGCGGTTATTAGCGTCCTGTGTTTCTGGGGTGAACAGTTTTTCTGGGGG GTTGCTTTTGCTATTGGCGCTGCTCTGCAATTCTTGTATGTCATATCGGTTATGGATAGA CTTCCATTTAGCATGCTGGTGCTCCAAAAAGCTGTGAAGTTGGTATGGAATCTCCCAGAA GTTATGAGAGTGGCATATGCATTCATGCTGGTCATGCTTTTATGGATGGCAATATGGTCT TTTGGAGCATCAGGTGTTGTGGCTTCAAGTATAGGTGATAGTGGACGCTGGTGGCTTCTT GTGGTGTTCTCGGTGAGCTTATTTTGGACAGGTGCAGTCCTTTGTAATACTGTACATGTT ATTGTGTCTGGAATAGTGTTTCTTGTTCTCATCCATGGTGGTCCAGAGGCTGCACCAATG CCTCCCAATTCATTGATGAAGTCTCTACGATATGCTGTGACAACATCTTTTGGCAGCATC TGCTATGGATCATTGTTTACAGCTGCAATAAGGGCATTGCGATGGGAGATTAGGGGATTC CGGTCTAAGATTGGCAACAATGAGTGTTTGCTTTGTTGTGTTGATTTCCTGTTCCATCTT GTGGAGACCCTTGTCCGGTTTTTCAACAAGTATGCCTATGTTCAGATAGCTGTTTATGGA AAAAGCTTTAATCACTCAGCGAGGGATGCTTGGGAATTATTCCAATCAACTGGTGTTGAA GCACTCATAGCCTATGATTGTTCAGGTGCTGTGCTACTGATGGGCACCGTTCTGGGTGGG CTTATTACAGGAACTTGCTCAGGAGTCTGGACATGGTTTAGGAATAGCGACAGAGTGATT ATGGTGGGATCTACTGCTATGTTGATGGGAATGATCTTGGTGGGACTGGCAATGGTTGTG GTGGAAAGTGCTGTTACATCCATATACATTTGCTATGCAGAAGACCCCTTATTGATCCAT AGATGGGATGCTGAGTTCTTCAACCAGATGTCAGAGACGCTGCACCAGCGTCTCCAGTAT AGGAGCGCCCGGGTCAGGGAAGTATTATCTCAAAATCAGCTCGACGGCCACATCCAAGAA TCAATTCCTGTGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_01s0011g03220.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:1:2928959:2935184:-1 gene:VIT_01s0011g03220 transcript:VIT_01s0011g03220.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MSDSLSPSSDDSASIASADQNVGRSRRSGDGSHGLGRSHTVTTEPLRHWRDVFWLTVFIV HLIGLGLILAVLGLNRFRKTDRLKIDRFTTRLSENSKGLTENYWPLYAVAGGVGTFLGWA WLLLLGSRANQMMKVSVHILTTYLAVISVLCFWGEQFFWGVAFAIGAALQFLYVISVMDR LPFSMLVLQKAVKLVWNLPEVMRVAYAFMLVMLLWMAIWSFGASGVVASSIGDSGRWWLL VVFSVSLFWTGAVLCNTVHVIVSGIVFLVLIHGGPEAAPMPPNSLMKSLRYAVTTSFGSI CYGSLFTAAIRALRWEIRGFRSKIGNNECLLCCVDFLFHLVETLVRFFNKYAYVQIAVYG KSFNHSARDAWELFQSTGVEALIAYDCSGAVLLMGTVLGGLITGTCSGVWTWFRNSDRVI MVGSTAMLMGMILVGLAMVVVESAVTSIYICYAEDPLLIHRWDAEFFNQMSETLHQRLQY RSARVREVLSQNQLDGHIQESIPV

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_01s0011g03220.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:1:2928959:2935184:-1 gene:VIT_01s0011g03220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	TATCGCTTAGCCGTTGAGTTTCAGTTTCCGCTCCATATCGGAATTCTACATGTTCTAGTG AAAAAACCCTAGAATCTTCGACTGACCTCTCTCTTCACAGAGCCGATCGACTCAATCGCG CCATGAGCGACTCTCTGAGCCCTTCCTCAGATGATTCGGCGTCGATCGCTTCCGCAGATC AGAATGTAGGGAGAAGTCGAAGAAGCGGCGATGGTAGTCACGGTCTCGGTCGCAGTCATA CAGTGACTACCGAGCCGTTGAGGCATTGGAGGGATGTGTTCTGGTTGACTGTATTTATTG TGCATTTGATCGGTTTGGGGTTGATTCTGGCGGTTCTTGGACTCAATAGGTTTAGGAAAA CGGATAGGCTTAAAATTGATAGGTTCACCACCAGACTTTCTGAGAATAGTAAGGGCTTGA CGGAGAATTATTGGCCGCTCTATGCTGTTGCTGGCGGAGTTGGGACGTTTCTTGGATGGG CATGGTTATTGCTGCTCGGTTCTCGTGCCAATCAAATGATGAAGGTTTCTGTCCACATTT TGACCACTTATCTTGCGGTTATTAGCGTCCTGTGTTTCTGGGGTGAACAGTTTTTCTGGG GGGTTGCTTTTGCTATTGGCGCTGCTCTGCAATTCTTGTATGTCATATCGGTTATGGATA GACTTCCATTTAGCATGCTGGTGCTCCAAAAAGCTGTGAAGTTGGTATGGAATCTCCCAG AAGTTATGAGAGTGGCATATGCATTCATGCTGGTCATGCTTTTATGGATGGCAATATGGT CTTTTGGAGCATCAGGTGTTGTGGCTTCAAGTATAGGTGATAGTGGACGCTGGTGGCTTC TTGTGGTGTTCTCGGTGAGCTTATTTTGGACAGGTGCAGTCCTTTGTAATACTGTACATG TTATTGTGTCTGGAATAGTGTTTCTTGTTCTCATCCATGGTGGTCCAGAGGCTGCACCAA TGCCTCCCAATTCATTGATGAAGTCTCTACGATATGCTGTGACAACATCTTTTGGCAGCA TCTGCTATGGATCATTGTTTACAGCTGCAATAAGGGCATTGCGATGGGAGATTAGGGGAT TCCGGTCTAAGATTGGCAACAATGAGTGTTTGCTTTGTTGTGTTGATTTCCTGTTCCATC TTGTGGAGACCCTTGTCCGGTTTTTCAACAAGTATGCCTATGTTCAGATAGCTGTTTATG GAAAAAGCTTTAATCACTCAGCGAGGGATGCTTGGGAATTATTCCAATCAACTGGTGTTG AAGCACTCATAGCCTATGATTGTTCAGGTGCTGTGCTACTGATGGGCACCGTTCTGGGTG GGCTTATTACAGGAACTTGCTCAGGAGTCTGGACATGGTTTAGGAATAGCGACAGAGTGA TTATGGTGGGATCTACTGCTATGTTGATGGGAATGATCTTGGTGGGACTGGCAATGGTTG TGGTGGAAAGTGCTGTTACATCCATATACATTTGCTATGCAGAAGACCCCTTATTGATCC ATAGATGGGATGCTGAGTTCTTCAACCAGATGTCAGAGACGCTGCACCAGCGTCTCCAGT ATAGGAGCGCCCGGGTCAGGGAAGTATTATCTCAAAATCAGCTCGACGGCCACATCCAAG AATCAATTCCTGTGTGAATAATTATACTCTTGTTTAGAAAACGCATAATGTTTTCAATCT TAATCTATTCATCCAAAATATATGAAGAAGAGCGTTTGTCCGTTCCAGTTTTGTTTGAAC