Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_01s0011g02250.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:1:1973859:1978367:1 gene:VIT_01s0011g02250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGTTACCCATAACGCTGAGAGAGGCTTCCACGGCGACAGCCATGAGAACGCCACCTTC GCCGTCGAGGAAACTCGGTCGAGCGGGACTATGATGATAGAGAACGAACGTTATGGCAAT GGTGAAGGTGGTGGTGATTCAGATGATAAGTCGCTGTCGGTGGAGATGCTGTTTAAGGGG AAGGTGGTGCCTTCCTGGAGGGAGCAGCTGACCATTAGGGCTTTTGTTGTGAGCTTCGTG TTGGGTGTGCTCTTGACTTTTATAGTGATGAAGCTCAATTTGACCACTGGGATTATTCCT TCTCTGAATGTTTCCGCTGGGCTGTTGGGGTTCTTCTTCGTGAAGTCATGGGCCAAGTTC ATGGAGAAGTCTGGGATGTTGAAGCAGCCCTTCACCAGACAGGAGAACACCGTTATTCAG ACTTGTGTCGTCGCCACCTCCGGCATCGCCTTCAGCGGAGGCTTTGGGAGCTACCTCTTT GGAATGAGCTCCATTGTGGCAGGTCAGTCAGCAAAGTCCATCGATGCCCAGAACACCAAG GATCCAAGATTGCCTTGGATAATTGGGTTTCTGTTTGCCGTTAGTTTCCTTGGTCTCTTC TCCGTTTTGCCTCTTCGAAAGATCATGGTTATAGACTACAAATTGACATACCCTAGTGGC ACTGCAACTGCCCACCTTATCAACAGCTTCCATACTCCTCAAGGAGCCAAGCTAGCCAAG CAACAAGTAAGAACTCTGGGCAAGTTCTTCTCCTTCAGCTTTCTGTGGGGTTTCTTTCAA TGGTTCTTTACTGGTGGGGATGGATGTGGATTTTCTAACTTCCCCACATTTGGCCTAGAA GCCTATGAGAACAGGTTTTACTTCGACTTCTCAGGTACATTTGTTGGAGTAGGGATGATC TGTCCTTACTTAATCAACGTATCTGTGTTAGTTGGAGCAATTCTGTCATGGGGCCTAATG TGGCCTCTCATAAAAAACAGAAAGGGGGATTGGTACTCAGCCATGCTTAGTGACAGCAAT CTCATGGGCGTCCAAGGTTATCGGGTCTTCCTTTCTATTGCAATGATCCTTGGGGATGGC CTCTACAACTTCGTCAAGGTTCTTGGCCTAACTATTCGGGGCTTCATCAAACAATATAAA AAGATGGAAGTTATACCTGTTACTGAACGAGGCTCTCCTGAGAAAGTATCCAACTCTTAC GATGACGAGGTCCGGACCAAACTCTTCCTCAAGGACGGAATTCCATTATGGGTATCAATC GTTGGCTATGTTGCTATTGCTGCCGTTTCCATAGGAGTAATTCCTAAAATTTTCCATCAG ATGAAATGGTATTATGTCCTGGTCATATACATCTTTGCCCCAGTTCTAGCCTTCTGTAAT GCATATGGGTGTGGGCTGACTGACTGGTCACTTGCCTCCACTTATGGAAAGCTTGCCATC TTCGCCATTGGAGCATGGGCAGGAGAATCTCATGGAGGTGTCCTTGCAGGTCTTGCTGCA TGTGGGGTTATGATGAATATTGTGTCAACAGCTTCTGACCTAATGCAGGACTTCAAGACT GGGTACATGACTCTAGCCTCCCCCAGGTCCATGTTTGTGAGCCAAGTGATTGGAACTGCA ATGGGCTGCATCATCTCTCCATGTGTCTTTTGGCTCTTCTACAAGGCTTTCGTTGATATA GGCTCACCGGATTCAGATTACCCTGCACCTAATGCTCTTGTCTACAGAAACATGTCAGTC CTGGGTGTTGAAGGCTTTGGGTCCCTGCCCGATCACTGCCTCACCCTTTGCTATATCTTA TTCGCCGGCTCCATCGTTATCAACCTCATCAGGGATACTGTTGCAAAGAAGTGGGCAAAG TACATCCCCCTTCCAATGGCCATGGCTATACCATTCTATCTCGGTCCCTACTTTGCCATT GACATGTGCGTTGGAAGTTTGATCCTCTTTATCTGGGGCAAGTTGGACAAAGCCAAGGCA GACGCTTTTGGACCAGCTGTAGCGTCTGGTTTAATATGCGGCGATGGAATATGGAGTTTG CCCAGTTCGATCCTAGCTTTGGCTGGGGTGCAACCACCCATCTGCATGAAGTTTTTATCA AGAGGAACAAATGCCAGGGTGGATCAATTCTTAAGTCCTTAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_01s0011g02250.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:1:1973859:1978367:1 gene:VIT_01s0011g02250 transcript:VIT_01s0011g02250.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MVTHNAERGFHGDSHENATFAVEETRSSGTMMIENERYGNGEGGGDSDDKSLSVEMLFKG KVVPSWREQLTIRAFVVSFVLGVLLTFIVMKLNLTTGIIPSLNVSAGLLGFFFVKSWAKF MEKSGMLKQPFTRQENTVIQTCVVATSGIAFSGGFGSYLFGMSSIVAGQSAKSIDAQNTK DPRLPWIIGFLFAVSFLGLFSVLPLRKIMVIDYKLTYPSGTATAHLINSFHTPQGAKLAK QQVRTLGKFFSFSFLWGFFQWFFTGGDGCGFSNFPTFGLEAYENRFYFDFSGTFVGVGMI CPYLINVSVLVGAILSWGLMWPLIKNRKGDWYSAMLSDSNLMGVQGYRVFLSIAMILGDG LYNFVKVLGLTIRGFIKQYKKMEVIPVTERGSPEKVSNSYDDEVRTKLFLKDGIPLWVSI VGYVAIAAVSIGVIPKIFHQMKWYYVLVIYIFAPVLAFCNAYGCGLTDWSLASTYGKLAI FAIGAWAGESHGGVLAGLAACGVMMNIVSTASDLMQDFKTGYMTLASPRSMFVSQVIGTA MGCIISPCVFWLFYKAFVDIGSPDSDYPAPNALVYRNMSVLGVEGFGSLPDHCLTLCYIL FAGSIVINLIRDTVAKKWAKYIPLPMAMAIPFYLGPYFAIDMCVGSLILFIWGKLDKAKA DAFGPAVASGLICGDGIWSLPSSILALAGVQPPICMKFLSRGTNARVDQFLSP

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_01s0011g02250.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:1:1973859:1978367:1 gene:VIT_01s0011g02250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGTTACCCATAACGCTGAGAGAGGCTTCCACGGCGACAGCCATGAGAACGCCACCTTC GCCGTCGAGGAAACTCGGTCGAGCGGGACTATGATGATAGAGAACGAACGTTATGGCAAT GGTGAAGGTGGTGGTGATTCAGATGATAAGTCGCTGTCGGTGGAGATGCTGTTTAAGGGG AAGGTGGTGCCTTCCTGGAGGGAGCAGCTGACCATTAGGGCTTTTGTTGTGAGCTTCGTG TTGGGTGTGCTCTTGACTTTTATAGTGATGAAGCTCAATTTGACCACTGGGATTATTCCT TCTCTGAATGTTTCCGCTGGGCTGTTGGGGTTCTTCTTCGTGAAGTCATGGGCCAAGTTC ATGGAGAAGTCTGGGATGTTGAAGCAGCCCTTCACCAGACAGGAGAACACCGTTATTCAG ACTTGTGTCGTCGCCACCTCCGGCATCGCCTTCAGCGGAGGCTTTGGGAGCTACCTCTTT GGAATGAGCTCCATTGTGGCAGGTCAGTCAGCAAAGTCCATCGATGCCCAGAACACCAAG GATCCAAGATTGCCTTGGATAATTGGGTTTCTGTTTGCCGTTAGTTTCCTTGGTCTCTTC TCCGTTTTGCCTCTTCGAAAGATCATGGTTATAGACTACAAATTGACATACCCTAGTGGC ACTGCAACTGCCCACCTTATCAACAGCTTCCATACTCCTCAAGGAGCCAAGCTAGCCAAG CAACAAGTAAGAACTCTGGGCAAGTTCTTCTCCTTCAGCTTTCTGTGGGGTTTCTTTCAA TGGTTCTTTACTGGTGGGGATGGATGTGGATTTTCTAACTTCCCCACATTTGGCCTAGAA GCCTATGAGAACAGGTTTTACTTCGACTTCTCAGGTACATTTGTTGGAGTAGGGATGATC TGTCCTTACTTAATCAACGTATCTGTGTTAGTTGGAGCAATTCTGTCATGGGGCCTAATG TGGCCTCTCATAAAAAACAGAAAGGGGGATTGGTACTCAGCCATGCTTAGTGACAGCAAT CTCATGGGCGTCCAAGGTTATCGGGTCTTCCTTTCTATTGCAATGATCCTTGGGGATGGC CTCTACAACTTCGTCAAGGTTCTTGGCCTAACTATTCGGGGCTTCATCAAACAATATAAA AAGATGGAAGTTATACCTGTTACTGAACGAGGCTCTCCTGAGAAAGTATCCAACTCTTAC GATGACGAGGTCCGGACCAAACTCTTCCTCAAGGACGGAATTCCATTATGGGTATCAATC GTTGGCTATGTTGCTATTGCTGCCGTTTCCATAGGAGTAATTCCTAAAATTTTCCATCAG ATGAAATGGTATTATGTCCTGGTCATATACATCTTTGCCCCAGTTCTAGCCTTCTGTAAT GCATATGGGTGTGGGCTGACTGACTGGTCACTTGCCTCCACTTATGGAAAGCTTGCCATC TTCGCCATTGGAGCATGGGCAGGAGAATCTCATGGAGGTGTCCTTGCAGGTCTTGCTGCA TGTGGGGTTATGATGAATATTGTGTCAACAGCTTCTGACCTAATGCAGGACTTCAAGACT GGGTACATGACTCTAGCCTCCCCCAGGTCCATGTTTGTGAGCCAAGTGATTGGAACTGCA ATGGGCTGCATCATCTCTCCATGTGTCTTTTGGCTCTTCTACAAGGCTTTCGTTGATATA GGCTCACCGGATTCAGATTACCCTGCACCTAATGCTCTTGTCTACAGAAACATGTCAGTC CTGGGTGTTGAAGGCTTTGGGTCCCTGCCCGATCACTGCCTCACCCTTTGCTATATCTTA TTCGCCGGCTCCATCGTTATCAACCTCATCAGGGATACTGTTGCAAAGAAGTGGGCAAAG TACATCCCCCTTCCAATGGCCATGGCTATACCATTCTATCTCGGTCCCTACTTTGCCATT GACATGTGCGTTGGAAGTTTGATCCTCTTTATCTGGGGCAAGTTGGACAAAGCCAAGGCA GACGCTTTTGGACCAGCTGTAGCGTCTGGTTTAATATGCGGCGATGGAATATGGAGTTTG CCCAGTTCGATCCTAGCTTTGGCTGGGGTGCAACCACCCATCTGCATGAAGTTTTTATCA AGAGGAACAAATGCCAGGGTGGATCAATTCTTAAGTCCTTAG