Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_01s0011g01910.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:1:1646100:1648239:-1 gene:VIT_01s0011g01910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGTGTTACGTCTTCTTCTTCATCGGTTTCATGTACTGCCTCAGAAATTGCCAGCATCG TCAATCTTGAGTAGCGTCTTCCTCTCCCAGCTACACCCTACATTCAGTCTCAGACCACAC TGTTACATTCACGATGAACCCTCTACTTCTTCATCATCTCAATCCCAATCACACTCACAA TCCGTTGTGAGAACAATCTGTTCCTTGGTCTGTCAATCTTATTACCAGCAAACCCATGTC AGATTCACCCCTCCAAAGCTGCACCTCCCATTAGACTCCGAGTCTCTGACCCATGACCAG GCGATTACGGTCGTTGCTTCGCTGGCTGATGAAGCTGGTTCCATGGTGGCCTTGAGTTTC TTGTACTGGGCAATTGGGTTTCCTAAATTCCGGCATTTCATGCGCCTTTACATAGTTTCA GCCACCGCTTTGATTGGTAACAAGAATTTGGAGAGAGCCAATGAGGTGATGCAGTGTATG GTGATGAATTTTGCTGAAAATGGAAAATTGAAGGAGGCTGTTAACATGGTGGTGGAGATG CAAAATCAGGGCTTGGTTCCAAGTACCCAAACACTTAATTGTGTTCTGGATGTTGCAGTG GGAATGGGGTTGGTTGAAATTGCAGAGAATATGTTCGTTGAAATGTGTCAAAGAGGGGTG TCTCCTGATTGTGTAAGTTTCAAGTTAATGGTTGTTGCTTGCTGTAACATGGGTAGGGTT TTAGAGGCAGAGAGGTGGTTGAATGCGATGGTTGAAAGAGGGTTTATAGTCGATAACGCG ACTTGTACCTTGATCATTGATGCATTCTGCCAAAAGGGTTATGTGAATAGAGTTGTTGGG TACTTTTGGAAGATGGTTGAGATGGGTTTGGCTCCGAATGTGATAAATTTCACTGCTCTG ATTAATGGGTTGTGCAAGCAAGGAAGCATCAAGCAGGCGTTTGAGTTGTTGGAGGAGATG GTTCGGAGAGGCTGGAAGCCTAATGTGTATACCCACACAACATTGATTGATGGGTTGTGC AAGAAGGGGTGGACCGAAAAGGCATTTAGGCTGTTTCTTAAGCTCGTTAGGAGCGACGGT TACAAGCCAAATGTGCATACCTACACTGCTATGATCAATGGATATTGCAAGGAGGACAAG TTGAATCGGGCAGAGATGCTGCTGAGTAGAATGCAGGAACAGGGATTGGTTCCCAACACG AACACATACACTACTCTCATTGATGGGCATTGTAAAGTGGGCAATTTCGTTCGAGCATAT GAATTGATGGATCTAATGGGCAAGGAAGGTTTCTCTCCCAATATCTATACATATAATGCA ATCATTGATGGCCTTTGTAAGAAGGGAAGTCTTGATGAGGCTTATAGGCTGCTTAATAAG GTCTCTGTTCATGGCCTCCAAGCTGATGGAGTCACATATACCATTCTCATGTCTGTACAT TGCAGGCAGGCTGATACCAACCGATCTCTGGTGTTTTTCAATAAGATGCTCAAAGTTGGC TTCACGCCTGACATACATTCCTATACAACATTGATTTCCACCTTCTGTAGGCAAAAACAG ATGAAAGAAAGCGAGAGACTCTTTGAGGAAGCTGTCAGTCTTGGCTTGATCCCCACCAAG AAAACATACACATCCATGATATGTGGATACTGCAGATATGGGAATACAAGCTTGGCAGTG AAGCTGTTCCAAAGAATGAGTAACCATGGCTGTGCTCCTGATAGTATAACTTATGGTGCT CTGATCAGTGGACTCTGCAAAGAGTCCAAGCTTGATGATGCTCGAAACCTCTACGATGCC ATGATGGACAAGGGCCTGTCGCCATGTGAAGTTACACGACTGACGCTAGCTTATGAGTAC TGCAAGAAGGATGATTCCTCTACTGCCATCAATGTCTTGGACCGGTTAGAGAAGAGGCAG TGGATAAGAACGGTGAACACCTTGGTCAGGAAGCTTTGCAGTGAGGGGAAATTAGACATG GCAGCATTGTTCTTTCACAAGTTACTGGACAAAGAGCCAAATGTGAATCGAGTAACCCTG TTAGGGTTCATGAACAAATGCTATGAAAGCAACAAATATGGTCTTGTCTCCGAGTTGTCT GAGAGGATTTGTGAGGGAATTGGTTAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_01s0011g01910.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:1:1646100:1648239:-1 gene:VIT_01s0011g01910 transcript:VIT_01s0011g01910.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MVLRLLLHRFHVLPQKLPASSILSSVFLSQLHPTFSLRPHCYIHDEPSTSSSSQSQSHSQ SVVRTICSLVCQSYYQQTHVRFTPPKLHLPLDSESLTHDQAITVVASLADEAGSMVALSF LYWAIGFPKFRHFMRLYIVSATALIGNKNLERANEVMQCMVMNFAENGKLKEAVNMVVEM QNQGLVPSTQTLNCVLDVAVGMGLVEIAENMFVEMCQRGVSPDCVSFKLMVVACCNMGRV LEAERWLNAMVERGFIVDNATCTLIIDAFCQKGYVNRVVGYFWKMVEMGLAPNVINFTAL INGLCKQGSIKQAFELLEEMVRRGWKPNVYTHTTLIDGLCKKGWTEKAFRLFLKLVRSDG YKPNVHTYTAMINGYCKEDKLNRAEMLLSRMQEQGLVPNTNTYTTLIDGHCKVGNFVRAY ELMDLMGKEGFSPNIYTYNAIIDGLCKKGSLDEAYRLLNKVSVHGLQADGVTYTILMSVH CRQADTNRSLVFFNKMLKVGFTPDIHSYTTLISTFCRQKQMKESERLFEEAVSLGLIPTK KTYTSMICGYCRYGNTSLAVKLFQRMSNHGCAPDSITYGALISGLCKESKLDDARNLYDA MMDKGLSPCEVTRLTLAYEYCKKDDSSTAINVLDRLEKRQWIRTVNTLVRKLCSEGKLDM AALFFHKLLDKEPNVNRVTLLGFMNKCYESNKYGLVSELSERICEGIG

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_01s0011g01910.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:1:1646100:1648239:-1 gene:VIT_01s0011g01910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGTGTTACGTCTTCTTCTTCATCGGTTTCATGTACTGCCTCAGAAATTGCCAGCATCG TCAATCTTGAGTAGCGTCTTCCTCTCCCAGCTACACCCTACATTCAGTCTCAGACCACAC TGTTACATTCACGATGAACCCTCTACTTCTTCATCATCTCAATCCCAATCACACTCACAA TCCGTTGTGAGAACAATCTGTTCCTTGGTCTGTCAATCTTATTACCAGCAAACCCATGTC AGATTCACCCCTCCAAAGCTGCACCTCCCATTAGACTCCGAGTCTCTGACCCATGACCAG GCGATTACGGTCGTTGCTTCGCTGGCTGATGAAGCTGGTTCCATGGTGGCCTTGAGTTTC TTGTACTGGGCAATTGGGTTTCCTAAATTCCGGCATTTCATGCGCCTTTACATAGTTTCA GCCACCGCTTTGATTGGTAACAAGAATTTGGAGAGAGCCAATGAGGTGATGCAGTGTATG GTGATGAATTTTGCTGAAAATGGAAAATTGAAGGAGGCTGTTAACATGGTGGTGGAGATG CAAAATCAGGGCTTGGTTCCAAGTACCCAAACACTTAATTGTGTTCTGGATGTTGCAGTG GGAATGGGGTTGGTTGAAATTGCAGAGAATATGTTCGTTGAAATGTGTCAAAGAGGGGTG TCTCCTGATTGTGTAAGTTTCAAGTTAATGGTTGTTGCTTGCTGTAACATGGGTAGGGTT TTAGAGGCAGAGAGGTGGTTGAATGCGATGGTTGAAAGAGGGTTTATAGTCGATAACGCG ACTTGTACCTTGATCATTGATGCATTCTGCCAAAAGGGTTATGTGAATAGAGTTGTTGGG TACTTTTGGAAGATGGTTGAGATGGGTTTGGCTCCGAATGTGATAAATTTCACTGCTCTG ATTAATGGGTTGTGCAAGCAAGGAAGCATCAAGCAGGCGTTTGAGTTGTTGGAGGAGATG GTTCGGAGAGGCTGGAAGCCTAATGTGTATACCCACACAACATTGATTGATGGGTTGTGC AAGAAGGGGTGGACCGAAAAGGCATTTAGGCTGTTTCTTAAGCTCGTTAGGAGCGACGGT TACAAGCCAAATGTGCATACCTACACTGCTATGATCAATGGATATTGCAAGGAGGACAAG TTGAATCGGGCAGAGATGCTGCTGAGTAGAATGCAGGAACAGGGATTGGTTCCCAACACG AACACATACACTACTCTCATTGATGGGCATTGTAAAGTGGGCAATTTCGTTCGAGCATAT GAATTGATGGATCTAATGGGCAAGGAAGGTTTCTCTCCCAATATCTATACATATAATGCA ATCATTGATGGCCTTTGTAAGAAGGGAAGTCTTGATGAGGCTTATAGGCTGCTTAATAAG GTCTCTGTTCATGGCCTCCAAGCTGATGGAGTCACATATACCATTCTCATGTCTGTACAT TGCAGGCAGGCTGATACCAACCGATCTCTGGTGTTTTTCAATAAGATGCTCAAAGTTGGC TTCACGCCTGACATACATTCCTATACAACATTGATTTCCACCTTCTGTAGGCAAAAACAG ATGAAAGAAAGCGAGAGACTCTTTGAGGAAGCTGTCAGTCTTGGCTTGATCCCCACCAAG AAAACATACACATCCATGATATGTGGATACTGCAGATATGGGAATACAAGCTTGGCAGTG AAGCTGTTCCAAAGAATGAGTAACCATGGCTGTGCTCCTGATAGTATAACTTATGGTGCT CTGATCAGTGGACTCTGCAAAGAGTCCAAGCTTGATGATGCTCGAAACCTCTACGATGCC ATGATGGACAAGGGCCTGTCGCCATGTGAAGTTACACGACTGACGCTAGCTTATGAGTAC TGCAAGAAGGATGATTCCTCTACTGCCATCAATGTCTTGGACCGGTTAGAGAAGAGGCAG TGGATAAGAACGGTGAACACCTTGGTCAGGAAGCTTTGCAGTGAGGGGAAATTAGACATG GCAGCATTGTTCTTTCACAAGTTACTGGACAAAGAGCCAAATGTGAATCGAGTAACCCTG TTAGGGTTCATGAACAAATGCTATGAAAGCAACAAATATGGTCTTGTCTCCGAGTTGTCT GAGAGGATTTGTGAGGGAATTGGTTAGCATATGCAGTGTA