Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_01s0011g01050.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:1:924701:929880:1 gene:VIT_01s0011g01050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCGGGTCTCAGACATCAGCTGGGTCTGTTCCTGGTGGTGGGTATGGTGGTGATGAGG TGTGCGTGGGGGAGGTTCGTGGTGGAGAAGAACAGCATCAGTGTTCTGGCTCCCCTTGAT ATGCGTTCAAAGCATGATGGGGCGATTGGGAACTTTGGTATTCCTGAATATGGAGGATCC ATGGTGGGGTCTGTTGTTTATCCTCAAAAGGGCTCTTTTGGGTGTGTGCCTTTTGAGGGT GACAAGCCCTTCAAGTCTCGCTCCTCTCCCACCACTATTCTTCTTCTTGACCGTGGAGAG TGCTACTTTGCCTTGAAGGCATGGAATGCTCAACAGGCAGGAGCTGCAGCAGTTCTAGTG GCTGATAGCATAGATGAGCCTCTCATAACCATGGATTCTCCAGAGGAGAGCACTGATTCA GACGGCTATGTGGAGAAGCTTAGGATCCCATCAGCCTTAATAGACCGAGCTTTTGGTGAA AATTTGAAGCAGGCCTTGAAGAAAGGTCAAGATGTTTTGGTAAAATTAGACTGGACAGAG TCAATGCCCCACCCAGATGAGAGGGTCGAGTATGAGCTCTGGACTAACAGCAATGATGAG TGTGGGACTCGTTGTGATGAGCAGATGAACTTTGTGCAGAACTTCAAGGGCCACGCCCAG ATTCTCGAGAAGCTGGGCTACACTCAATTCACACCACATTATATAACTTGGTACTGTCCT CAAGCTTTTGTCCTTAGCAACCAATGCAAGTCTCAATGCATCAACCATGGAAGGTACTGT GCACCTGATCCAGAGCAAAATTTTGGAGAAGGGTACCAAGGAAAAGATGTGGTGTTTGAG AACTTGAGACAGCTTTGTGTGCATAGGGTTGCCAATGAGAGCAACCGGTCTTGGGTTTGG TGGGACTATGTCACTGATTTTCATATCAGATGTTCAATGAAGGAGAAGAGGTATAGCAAA GAATGCGCTGAGGATGTCATGAAATCACTTGATCTGCCTATTGACAAGATCAAAAAATGC ATGGGCAATCCTGAAGCTGATGTGGATAATGAGGTATTGAAAACCGAGCAAGAACTCCAG GTTGGCCGAGGATCTCGTGGTGATGTTACCATCTTGCCAACACTGGTTGTTAATAACATC CAATACCGAGGAAAACTGGAGAGAACTGCTGTGCTGAAGGCCATTTGCGCTGGATTTAAG GAGACCACTGAACCTCAAGTATGTTTAAGTGGAGATCTTGAGACCAATGAGTGCCTTGAA AGGCATGGTGGCTGTTGGCACGATTCACGTTCTAACATAACTGCCTGCAAGGACACATAT CGGGGAAGAGTTTGCAAATGCCCAGTTGTGGATGGTGTTCAGTACAGAGGAGATGGTTAC GTCTCTTGTGAAGCTTTCGGGCCTGCAAGGTGCGCGATGAACAATGGAGGTTGCTGGTCA GACACCAAAAATGGAAAAACTTTCTCAGCTTGCTCAGATTCTGAGGTAACTGGCTGTCAG TGCCCACATGGCTTCCAAGGAGATGGCCATAAATGTGAAGATGTTAATGAATGCAAGGAA CGTCTCGCTTGTCAATGTGACGGTTGCACTTGTAAGAACACATGGGGTGGATATGACTGC AAGTGTAAGGGCAACCTTCTGTACATAATGGAGCAAGATACTTGTATTGAAAGAAGTGGT TCTAAATTCGGATGGTCCCTCGGCTTCTTGGTCCTAGCTGCTCTGGTGGGTGCTGGTATA GCTGGTTATATATTCTACAAATACAGGCTCCGGTCTTACATGGACTCAGAGATCATGGCC ATCATGTCACAGTACATGCCTCTTGACAACCACAACAACAACAACGAAGTCCCAACCGAG GCCCAGGCTCTGCGACCAGGCTCATCAGTATGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_01s0011g01050.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:1:924701:929880:1 gene:VIT_01s0011g01050 transcript:VIT_01s0011g01050.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MAGLRHQLGLFLVVGMVVMRCAWGRFVVEKNSISVLAPLDMRSKHDGAIGNFGIPEYGGS MVGSVVYPQKGSFGCVPFEGDKPFKSRSSPTTILLLDRGECYFALKAWNAQQAGAAAVLV ADSIDEPLITMDSPEESTDSDGYVEKLRIPSALIDRAFGENLKQALKKGQDVLVKLDWTE SMPHPDERVEYELWTNSNDECGTRCDEQMNFVQNFKGHAQILEKLGYTQFTPHYITWYCP QAFVLSNQCKSQCINHGRYCAPDPEQNFGEGYQGKDVVFENLRQLCVHRVANESNRSWVW WDYVTDFHIRCSMKEKRYSKECAEDVMKSLDLPIDKIKKCMGNPEADVDNEVLKTEQELQ VGRGSRGDVTILPTLVVNNIQYRGKLERTAVLKAICAGFKETTEPQVCLSGDLETNECLE RHGGCWHDSRSNITACKDTYRGRVCKCPVVDGVQYRGDGYVSCEAFGPARCAMNNGGCWS DTKNGKTFSACSDSEVTGCQCPHGFQGDGHKCEDVNECKERLACQCDGCTCKNTWGGYDC KCKGNLLYIMEQDTCIERSGSKFGWSLGFLVLAALVGAGIAGYIFYKYRLRSYMDSEIMA IMSQYMPLDNHNNNNEVPTEAQALRPGSSV

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_01s0011g01050.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:1:924701:929880:1 gene:VIT_01s0011g01050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	AGTTGGTTGTGAGCATTGGGCAGTGAGTAGTTTCTTCTCTTGTTTCTCTCTCTCTTCAAT CTGCATGGTTTCTTCCATGGCGGGTCTCAGACATCAGCTGGGTCTGTTCCTGGTGGTGGG TATGGTGGTGATGAGGTGTGCGTGGGGGAGGTTCGTGGTGGAGAAGAACAGCATCAGTGT TCTGGCTCCCCTTGATATGCGTTCAAAGCATGATGGGGCGATTGGGAACTTTGGTATTCC TGAATATGGAGGATCCATGGTGGGGTCTGTTGTTTATCCTCAAAAGGGCTCTTTTGGGTG TGTGCCTTTTGAGGGTGACAAGCCCTTCAAGTCTCGCTCCTCTCCCACCACTATTCTTCT TCTTGACCGTGGAGAGTGCTACTTTGCCTTGAAGGCATGGAATGCTCAACAGGCAGGAGC TGCAGCAGTTCTAGTGGCTGATAGCATAGATGAGCCTCTCATAACCATGGATTCTCCAGA GGAGAGCACTGATTCAGACGGCTATGTGGAGAAGCTTAGGATCCCATCAGCCTTAATAGA CCGAGCTTTTGGTGAAAATTTGAAGCAGGCCTTGAAGAAAGGTCAAGATGTTTTGGTAAA ATTAGACTGGACAGAGTCAATGCCCCACCCAGATGAGAGGGTCGAGTATGAGCTCTGGAC TAACAGCAATGATGAGTGTGGGACTCGTTGTGATGAGCAGATGAACTTTGTGCAGAACTT CAAGGGCCACGCCCAGATTCTCGAGAAGCTGGGCTACACTCAATTCACACCACATTATAT AACTTGGTACTGTCCTCAAGCTTTTGTCCTTAGCAACCAATGCAAGTCTCAATGCATCAA CCATGGAAGGTACTGTGCACCTGATCCAGAGCAAAATTTTGGAGAAGGGTACCAAGGAAA AGATGTGGTGTTTGAGAACTTGAGACAGCTTTGTGTGCATAGGGTTGCCAATGAGAGCAA CCGGTCTTGGGTTTGGTGGGACTATGTCACTGATTTTCATATCAGATGTTCAATGAAGGA GAAGAGGTATAGCAAAGAATGCGCTGAGGATGTCATGAAATCACTTGATCTGCCTATTGA CAAGATCAAAAAATGCATGGGCAATCCTGAAGCTGATGTGGATAATGAGGTATTGAAAAC CGAGCAAGAACTCCAGGTTGGCCGAGGATCTCGTGGTGATGTTACCATCTTGCCAACACT GGTTGTTAATAACATCCAATACCGAGGAAAACTGGAGAGAACTGCTGTGCTGAAGGCCAT TTGCGCTGGATTTAAGGAGACCACTGAACCTCAAGTATGTTTAAGTGGAGATCTTGAGAC CAATGAGTGCCTTGAAAGGCATGGTGGCTGTTGGCACGATTCACGTTCTAACATAACTGC CTGCAAGGACACATATCGGGGAAGAGTTTGCAAATGCCCAGTTGTGGATGGTGTTCAGTA CAGAGGAGATGGTTACGTCTCTTGTGAAGCTTTCGGGCCTGCAAGGTGCGCGATGAACAA TGGAGGTTGCTGGTCAGACACCAAAAATGGAAAAACTTTCTCAGCTTGCTCAGATTCTGA GGTAACTGGCTGTCAGTGCCCACATGGCTTCCAAGGAGATGGCCATAAATGTGAAGATGT TAATGAATGCAAGGAACGTCTCGCTTGTCAATGTGACGGTTGCACTTGTAAGAACACATG GGGTGGATATGACTGCAAGTGTAAGGGCAACCTTCTGTACATAATGGAGCAAGATACTTG TATTGAAAGAAGTGGTTCTAAATTCGGATGGTCCCTCGGCTTCTTGGTCCTAGCTGCTCT GGTGGGTGCTGGTATAGCTGGTTATATATTCTACAAATACAGGCTCCGGTCTTACATGGA CTCAGAGATCATGGCCATCATGTCACAGTACATGCCTCTTGACAACCACAACAACAACAA CGAAGTCCCAACCGAGGCCCAGGCTCTGCGACCAGGCTCATCAGTATGAGGAAGCATTTG CAGAAAAGAAAGTAGAAGCAAATGGGATACCGCGAAAGCTTCCACGAGAGGAATGAAGTG TGCTGCCTGTAAATTTTCAGATCAATCTTACAACTCCTGTATGCAGCTGGAAATGGCCAA GTTCTCCTTCTCCCATACCACCTTAGGACTTTGTGTCATCCATATACACAGAATTACTTT ACAGAATCCTTCTCCCTCGTGTAGATAAATTGTTGAGATGCAAATCTAGTGTAGCGAATA ATAAGGTTTTATATGACAATCCATACGAACAGACAAAGTGAAAGAATAAAAAATATATAT ATAAAATGAGAAGCTGCATGCATGCATGCGCGTCCAAATCTTCAAGTTTGGAGTC