Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_01s0011g00900.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:1:763141:765817:-1 gene:VIT_01s0011g00900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAAACGTATCTCCCTCTTACACAGACACCTCCAATGGAGAAATCTCACCGTAACTGCC CTTCAACGGACTCCTGAAATTGATCGTACTATAGCTTCGATTCAGTCCATATCTTCAAAC CCATGTTTTTCTCTTCTGGGTATCTGCAAAACCGTATCGTCTCTCAGGAAAATCCACGCT TTGCTCGTCGTCCACGGCCTGTCGGAGGACCTTTTATGCGAAACCAAATTGGTTAGCTTG TATGGTTCGTTTGGCCACGTTGAGTGTGCCCGATTAATGTTTGATAGAATTCGCAACCCG GATCTTTATTCGTGGAAGGTGATGATCAGATGGTATTTTTTGAACGATTCGTATTCGGAG ATTGTTCAGTTTTACAACACCCGTTTGAGGAAATGCCTCAACGAGTATGACAATGTTGTT TTTTCGATTGTGTTGAAGGCGTGCAGTGAATTGCGTGAGACTGATGAAGGGAGGAAACTG CATTGCCAGATTGTTAAGGTGGGGAGTCCTGATAGTTTTGTGTTGACGGGTCTTGTGGAT ATGTATGCTAAATGTAGAGAGGTCGAGGATTCACGTCGAGTGTTTGATGAAATTCTTGAT AGAAATGTGGTGTGTTGGACTTCCATGATTGTGGGGTATGTACAGAATGATTGCTTGAAA GAAGGGTTGGTGTTGTTTAATAGGATGAGGGAGGGGCTGGTGGAAGGTAACCAATATACT TTGGGGAGCTTAGTCACAGCCTGTACCAAGTTGGGAGCTTTACATCAGGGAAAGTGGGTT CATGGGTATGTGATTAAGAGTGGTTTTGATCTCAATTCTTTCTTGGTAACACCTCTTCTA GACTTGTATTTCAAGTGTGGGGACATTAGAGATGCTTTTTCTGTATTTGATGAGCTTTCT ACTATTGATCTAGTTTCATGGACAGCCATGATTGTTGGGTATGCTCAGAGGGGCTACCCC CGAGAGGCTTTGAAGCTTTTTACAGATGAAAGATGGAAAGATCTCTTGCCAAATACTGTT ACCACTTCGAGTGTGCTTTCTGCATGTGCACAAACTGGGTCTTTGAATATGGGTAGATCA GTTCATTGTCTTGGGATAAAACTTGGATCGGAAGATGCAACTTTTGAAAATGCTCTTGTG GACATGTATGCAAAATGCCACATGATTGGAGATGCTCGGTATGTATTCGAAACAGTTTTT GATAAGGATGTAATTGCTTGGAATTCAATCATTTCAGGGTACACTCAAAATGGGTATGCA TATGAAGCCCTTGAACTTTTTGATCAAATGAGATCAGACTCTGTCTACCCAGATGCAATC ACACTGGTCAGCGTCCTCTCAGCCTGTGCTTCTGTTGGTGCTTACAGAGTGGGTTCTTCT CTTCATGGATACGCTATAAAGGCTGGCCTATTATCAGGCAGTGTCTATGTTGGCACTGCA CTTCTAAACTTCTACGCCAAATGTGGAGATGCAGAGTCTGCTCGAGTAATTTTTGATGAG ATGGGAGAGAAGAACACGATCACATGGAGTGCAATGATTGGCGGTTATGGAATTCAAGGG GATTGTAGCAGGTCCCTTGAACTTTTTGGTGATATGCTGAAGGAAAAGTTGGAGCCCAAT GAAGTAATCTTCACCACTATATTATCGGCTTGTAGCCATTCAGGGATGCTTGGAGAAGGG TGGAGGTATTTCAATACAATGTGTCAGGTCTATAACTTTGTGCCTTCCATGAAGCATTAT GCATGTATGGTTGATCTCTTGGCTCGTGCAGGAAGGCTTGAAGAAGCCTTGGATTTCATT GAGAAAATCCCAATTCAACCGGATGTTAGTTTGTTGGGAGCTTTTCTCCATGGATGCAGA CTCCACTCGAGGTTTGATCTTGGAGAGGTGGCAGTTAGGAGGATGCTAGAGTTGCACCCT GATAAAGCTTGTTACTATGTTCTCATGTCAAATTTGTATGCATCAGAAGGAAGATGGAGC CAGGCTAATCAGGTGATGGAGTTGATGAAACAAAGAGGATTAGCAAAATTACCTGGGTGG AGCCTAGTGGATATTGAGACCAGTAATGATTTTTCTCCATTGATAGTGGCATCTCATCCT TAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_01s0011g00900.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:1:763141:765817:-1 gene:VIT_01s0011g00900 transcript:VIT_01s0011g00900.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MKRISLLHRHLQWRNLTVTALQRTPEIDRTIASIQSISSNPCFSLLGICKTVSSLRKIHA LLVVHGLSEDLLCETKLVSLYGSFGHVECARLMFDRIRNPDLYSWKVMIRWYFLNDSYSE IVQFYNTRLRKCLNEYDNVVFSIVLKACSELRETDEGRKLHCQIVKVGSPDSFVLTGLVD MYAKCREVEDSRRVFDEILDRNVVCWTSMIVGYVQNDCLKEGLVLFNRMREGLVEGNQYT LGSLVTACTKLGALHQGKWVHGYVIKSGFDLNSFLVTPLLDLYFKCGDIRDAFSVFDELS TIDLVSWTAMIVGYAQRGYPREALKLFTDERWKDLLPNTVTTSSVLSACAQTGSLNMGRS VHCLGIKLGSEDATFENALVDMYAKCHMIGDARYVFETVFDKDVIAWNSIISGYTQNGYA YEALELFDQMRSDSVYPDAITLVSVLSACASVGAYRVGSSLHGYAIKAGLLSGSVYVGTA LLNFYAKCGDAESARVIFDEMGEKNTITWSAMIGGYGIQGDCSRSLELFGDMLKEKLEPN EVIFTTILSACSHSGMLGEGWRYFNTMCQVYNFVPSMKHYACMVDLLARAGRLEEALDFI EKIPIQPDVSLLGAFLHGCRLHSRFDLGEVAVRRMLELHPDKACYYVLMSNLYASEGRWS QANQVMELMKQRGLAKLPGWSLVDIETSNDFSPLIVASHP

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_01s0011g00900.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:1:763141:765817:-1 gene:VIT_01s0011g00900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAAACGTATCTCCCTCTTACACAGACACCTCCAATGGAGAAATCTCACCGTAACTGCC CTTCAACGGACTCCTGAAATTGATCGTACTATAGCTTCGATTCAGTCCATATCTTCAAAC CCATGTTTTTCTCTTCTGGGTATCTGCAAAACCGTATCGTCTCTCAGGAAAATCCACGCT TTGCTCGTCGTCCACGGCCTGTCGGAGGACCTTTTATGCGAAACCAAATTGGTTAGCTTG TATGGTTCGTTTGGCCACGTTGAGTGTGCCCGATTAATGTTTGATAGAATTCGCAACCCG GATCTTTATTCGTGGAAGGTGATGATCAGATGGTATTTTTTGAACGATTCGTATTCGGAG ATTGTTCAGTTTTACAACACCCGTTTGAGGAAATGCCTCAACGAGTATGACAATGTTGTT TTTTCGATTGTGTTGAAGGCGTGCAGTGAATTGCGTGAGACTGATGAAGGGAGGAAACTG CATTGCCAGATTGTTAAGGTGGGGAGTCCTGATAGTTTTGTGTTGACGGGTCTTGTGGAT ATGTATGCTAAATGTAGAGAGGTCGAGGATTCACGTCGAGTGTTTGATGAAATTCTTGAT AGAAATGTGGTGTGTTGGACTTCCATGATTGTGGGGTATGTACAGAATGATTGCTTGAAA GAAGGGTTGGTGTTGTTTAATAGGATGAGGGAGGGGCTGGTGGAAGGTAACCAATATACT TTGGGGAGCTTAGTCACAGCCTGTACCAAGTTGGGAGCTTTACATCAGGGAAAGTGGGTT CATGGGTATGTGATTAAGAGTGGTTTTGATCTCAATTCTTTCTTGGTAACACCTCTTCTA GACTTGTATTTCAAGTGTGGGGACATTAGAGATGCTTTTTCTGTATTTGATGAGCTTTCT ACTATTGATCTAGTTTCATGGACAGCCATGATTGTTGGGTATGCTCAGAGGGGCTACCCC CGAGAGGCTTTGAAGCTTTTTACAGATGAAAGATGGAAAGATCTCTTGCCAAATACTGTT ACCACTTCGAGTGTGCTTTCTGCATGTGCACAAACTGGGTCTTTGAATATGGGTAGATCA GTTCATTGTCTTGGGATAAAACTTGGATCGGAAGATGCAACTTTTGAAAATGCTCTTGTG GACATGTATGCAAAATGCCACATGATTGGAGATGCTCGGTATGTATTCGAAACAGTTTTT GATAAGGATGTAATTGCTTGGAATTCAATCATTTCAGGGTACACTCAAAATGGGTATGCA TATGAAGCCCTTGAACTTTTTGATCAAATGAGATCAGACTCTGTCTACCCAGATGCAATC ACACTGGTCAGCGTCCTCTCAGCCTGTGCTTCTGTTGGTGCTTACAGAGTGGGTTCTTCT CTTCATGGATACGCTATAAAGGCTGGCCTATTATCAGGCAGTGTCTATGTTGGCACTGCA CTTCTAAACTTCTACGCCAAATGTGGAGATGCAGAGTCTGCTCGAGTAATTTTTGATGAG ATGGGAGAGAAGAACACGATCACATGGAGTGCAATGATTGGCGGTTATGGAATTCAAGGG GATTGTAGCAGGTCCCTTGAACTTTTTGGTGATATGCTGAAGGAAAAGTTGGAGCCCAAT GAAGTAATCTTCACCACTATATTATCGGCTTGTAGCCATTCAGGGATGCTTGGAGAAGGG TGGAGGTATTTCAATACAATGTGTCAGGTCTATAACTTTGTGCCTTCCATGAAGCATTAT GCATGTATGGTTGATCTCTTGGCTCGTGCAGGAAGGCTTGAAGAAGCCTTGGATTTCATT GAGAAAATCCCAATTCAACCGGATGTTAGTTTGTTGGGAGCTTTTCTCCATGGATGCAGA CTCCACTCGAGGTTTGATCTTGGAGAGGTGGCAGTTAGGAGGATGCTAGAGTTGCACCCT GATAAAGCTTGTTACTATGTTCTCATGTCAAATTTGTATGCATCAGAAGGAAGATGGAGC CAGGCTAATCAGGTGATGGAGTTGATGAAACAAAGAGGATTAGCAAAATTACCTGGGTGG AGCCTAGTGGATATTGAGACCAGTAATGATTTTTCTCCATTGATAGTGGCATCTCATCCT TAGTTATGCACTTCACCGCGCATGAATTCTGGAGTCCAGGAGTCAGGGTATCTCTTAACC TATTCGATATGGATCTTGGTAAATGATTTTTCTCCACAGGAAGTAACATCTCTTGCCCCA TCCTATTCCTCATCATGCATGAATTCTGGAGTCAGTGAGGTACTTAGAGAACACTCAATC AAATACTTTTCTGGGTCTGGCTATGTATGAACTTGTGTTGGACTGGTCCTGAGGTCCTGT TGAAACGGTTTGAGCATAGCTGGGAGAATGTGGTTTGAATTGCTCTGGATTTTTTAATGG CAGAGTTGCAGTAAAATTTTGATGTGAAGATTCCTGGCAGCAAACTCACTGAATCATCTT CCTGAATATAACGGTTTGAAGTTCTCATGCATCTTCAAACCTGACTACGATGAAGAACCA TGGTGTATCATTGCAGTGCAAGAGGGAAGCTTTCAATACAAGGTTACCGACTCCAAATCC CTTTGGATCACGAGTGATATCTTCTTTAATACAATGTTCATGAGATTAGCCCACTAGGTT TTCTGTCCTGGTGGTTTTGCTGGTGTAAAATGACCTA