Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_01s0011g00660.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:1:590563:592859:1 gene:VIT_01s0011g00660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGCGTTGGCATCCTTTTCACCTTCACTTGTCATGCCACCCCCAACCCTCCATTTCCAA
CCCACTTCAGATCCTCCATACAAACTTCTCCAAAACCACCCGTCTCTCACTCTTCTCTCC
ACTTGCAAGAGCTTTCAAAACCTCAAGCAAATCCACTCCCAAATCATTAAGACTGGTCTC
CACAATACCCAATTCGCCTTAAGCAAGCTCATTGAGTTTTGTGCCATTTCTCCATTTGGC
AACCTTTCCTATGCTCTGTTACTATTTGAGTCCATTGAGCAGCCCAATCAATTCATTTGG
AACACCATGATTCGTGGGAACTCATTGAGCTCCTCCCCAGTGGGTGCCATAGATTTCTAT
GTTCGTATGCTTTTGTGTGGGGTTGAACCCAATTCTTATACTTTTCCTTTCCTGTTGAAG
TCTTGTGCAAAAGTTGGAGCTACCCAAGAAGGGAAACAGATCCATGGCCATGTTTTGAAG
CTTGGACTTGAGTCTGATCCCTTTGTGCATACTTCACTCATTAATATGTATGCCCAGAAT
GGTGAATTGGGCTATGCTGAATTGGTATTCAGTAAGAGTTCTCTTCGAGATGCGGTTTCT
TTTACTGCCCTGATCACGGGTTATACTTTGCGGGGTTGTTTGGATGATGCAAGACGGCTT
TTTGAAGAAATTCCAGTGAGAGATGCAGTGTCTTGGAATGCTATGATTGCTGGGTATGCC
CAAAGTGGTCGATTTGAAGAGGCATTGGCGTTCTTTCAAGAGATGAAAAGAGCCAATGTT
GCACCAAATGAGAGCACAATGGTAACTGTCCTTTCAGCTTGTGCTCAGTCTGGTTCTCTT
GAATTGGGCAATTGGGTTCGGTCTTGGATTGAAGACCATGGACTTGGTTCGAATCTTCGT
CTTGTTAACGCTCTTATTGACATGTACTCAAAGTGTGGTGATTTGGACAAAGCTAGGGAT
TTGTTTGAGGGGATATGTGAAAAGGATATAATCTCCTGGAATGTTATGATAGGTGGTTAT
TCTCATATGAACAGCTATAAAGAGGCCTTGGCTCTCTTTCGGAAAATGCAGCAATCAAAT
GTAGAGCCTAATGATGTCACTTTCGTAAGCATTCTTCCTGCTTGTGCTTACTTGGGTGCT
CTTGATCTTGGTAAATGGATTCATGCTTATATAGACAAAAAATTTCTAGGTTTAACCAAT
ACCTCCCTTTGGACGAGTCTCATCGATATGTATGCAAAATGTGGAAATATAGAGGCTGCA
AAACAAGTCTTTGCTGGTATGAAACCTAAAAGCTTGGGTTCTTGGAATGCAATGATATCA
GGACTAGCTATGCATGGGCATGCAAATATGGCCCTTGAGCTTTTCAGACAAATGAGAGAT
GAAGGATTCGAACCAGATGATATCACTTTTGTTGGTGTTTTATCAGCTTGCAGCCATGCT
GGTTTGGTAGAACTCGGTCGTCAATGTTTTAGCTCAATGGTTGAAGATTATGACATTTCA
CCAAAACTGCAACACTATGGCTGTATGATAGATCTACTAGGCCGAGCAGGGCTATTTGAT
GAAGCAGAAGCCCTGATGAAGAACATGGAGATGAAGCCAGATGGTGCTATATGGGGTTCT
CTACTTGGAGCTTGCAGGGTCCATGGAAATGTAGAGTTGGGGGAATTTGCTGCTAAACAC
CTTTTTGAATTAGAGCCTGAAAACCCTGGGGCGTATGTGCTTTTATCAAACATTTATGCA
ACCGCTGGTAGATGGGATGATGTAGCAAGAATAAGAACCAAGCTGAACGATAAGGGGATG
AAGAAGGTCCCTGGATGTAGCTCAATTGAGGTGGATAGTGTTGTTCACGAGTTTCTTGTT
GGTGACAAAGTACATGAACAGAGCCAAGACATATATAAGATGTTGGATGAAATAGATCAG
CTTTTGGAGAAAGCCGGGCATGTGCCTGATACATCTGAGGTGCTCTATGACATGGATGAG
GAGTGGAAAGAAGGGTCCTTGAGTCATCATAGTGAGAAGTTGGCCATTGCCTTTGGGCTG
ATTAGTACAAAGCCAGAGACTACTATCAGGATAGTGAAGAATCTTCGTGTATGTGGAAAT
TGTCATTCAGCAATAAAGCTGATAAGCAAGATATTCAACAGAGAGATTATTGCTAGAGAT
CGGAACCGTTTTCACCATTTCAAAGATGGTTCTTGTTCATGTATGGACTATTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_01s0011g00660.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:1:590563:592859:1 gene:VIT_01s0011g00660 transcript:VIT_01s0011g00660.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MALASFSPSLVMPPPTLHFQPTSDPPYKLLQNHPSLTLLSTCKSFQNLKQIHSQIIKTGL
HNTQFALSKLIEFCAISPFGNLSYALLLFESIEQPNQFIWNTMIRGNSLSSSPVGAIDFY
VRMLLCGVEPNSYTFPFLLKSCAKVGATQEGKQIHGHVLKLGLESDPFVHTSLINMYAQN
GELGYAELVFSKSSLRDAVSFTALITGYTLRGCLDDARRLFEEIPVRDAVSWNAMIAGYA
QSGRFEEALAFFQEMKRANVAPNESTMVTVLSACAQSGSLELGNWVRSWIEDHGLGSNLR
LVNALIDMYSKCGDLDKARDLFEGICEKDIISWNVMIGGYSHMNSYKEALALFRKMQQSN
VEPNDVTFVSILPACAYLGALDLGKWIHAYIDKKFLGLTNTSLWTSLIDMYAKCGNIEAA
KQVFAGMKPKSLGSWNAMISGLAMHGHANMALELFRQMRDEGFEPDDITFVGVLSACSHA
GLVELGRQCFSSMVEDYDISPKLQHYGCMIDLLGRAGLFDEAEALMKNMEMKPDGAIWGS
LLGACRVHGNVELGEFAAKHLFELEPENPGAYVLLSNIYATAGRWDDVARIRTKLNDKGM
KKVPGCSSIEVDSVVHEFLVGDKVHEQSQDIYKMLDEIDQLLEKAGHVPDTSEVLYDMDE
EWKEGSLSHHSEKLAIAFGLISTKPETTIRIVKNLRVCGNCHSAIKLISKIFNREIIARD
RNRFHHFKDGSCSCMDYW

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_01s0011g00660.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:1:590563:592859:1 gene:VIT_01s0011g00660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGCGTTGGCATCCTTTTCACCTTCACTTGTCATGCCACCCCCAACCCTCCATTTCCAA
CCCACTTCAGATCCTCCATACAAACTTCTCCAAAACCACCCGTCTCTCACTCTTCTCTCC
ACTTGCAAGAGCTTTCAAAACCTCAAGCAAATCCACTCCCAAATCATTAAGACTGGTCTC
CACAATACCCAATTCGCCTTAAGCAAGCTCATTGAGTTTTGTGCCATTTCTCCATTTGGC
AACCTTTCCTATGCTCTGTTACTATTTGAGTCCATTGAGCAGCCCAATCAATTCATTTGG
AACACCATGATTCGTGGGAACTCATTGAGCTCCTCCCCAGTGGGTGCCATAGATTTCTAT
GTTCGTATGCTTTTGTGTGGGGTTGAACCCAATTCTTATACTTTTCCTTTCCTGTTGAAG
TCTTGTGCAAAAGTTGGAGCTACCCAAGAAGGGAAACAGATCCATGGCCATGTTTTGAAG
CTTGGACTTGAGTCTGATCCCTTTGTGCATACTTCACTCATTAATATGTATGCCCAGAAT
GGTGAATTGGGCTATGCTGAATTGGTATTCAGTAAGAGTTCTCTTCGAGATGCGGTTTCT
TTTACTGCCCTGATCACGGGTTATACTTTGCGGGGTTGTTTGGATGATGCAAGACGGCTT
TTTGAAGAAATTCCAGTGAGAGATGCAGTGTCTTGGAATGCTATGATTGCTGGGTATGCC
CAAAGTGGTCGATTTGAAGAGGCATTGGCGTTCTTTCAAGAGATGAAAAGAGCCAATGTT
GCACCAAATGAGAGCACAATGGTAACTGTCCTTTCAGCTTGTGCTCAGTCTGGTTCTCTT
GAATTGGGCAATTGGGTTCGGTCTTGGATTGAAGACCATGGACTTGGTTCGAATCTTCGT
CTTGTTAACGCTCTTATTGACATGTACTCAAAGTGTGGTGATTTGGACAAAGCTAGGGAT
TTGTTTGAGGGGATATGTGAAAAGGATATAATCTCCTGGAATGTTATGATAGGTGGTTAT
TCTCATATGAACAGCTATAAAGAGGCCTTGGCTCTCTTTCGGAAAATGCAGCAATCAAAT
GTAGAGCCTAATGATGTCACTTTCGTAAGCATTCTTCCTGCTTGTGCTTACTTGGGTGCT
CTTGATCTTGGTAAATGGATTCATGCTTATATAGACAAAAAATTTCTAGGTTTAACCAAT
ACCTCCCTTTGGACGAGTCTCATCGATATGTATGCAAAATGTGGAAATATAGAGGCTGCA
AAACAAGTCTTTGCTGGTATGAAACCTAAAAGCTTGGGTTCTTGGAATGCAATGATATCA
GGACTAGCTATGCATGGGCATGCAAATATGGCCCTTGAGCTTTTCAGACAAATGAGAGAT
GAAGGATTCGAACCAGATGATATCACTTTTGTTGGTGTTTTATCAGCTTGCAGCCATGCT
GGTTTGGTAGAACTCGGTCGTCAATGTTTTAGCTCAATGGTTGAAGATTATGACATTTCA
CCAAAACTGCAACACTATGGCTGTATGATAGATCTACTAGGCCGAGCAGGGCTATTTGAT
GAAGCAGAAGCCCTGATGAAGAACATGGAGATGAAGCCAGATGGTGCTATATGGGGTTCT
CTACTTGGAGCTTGCAGGGTCCATGGAAATGTAGAGTTGGGGGAATTTGCTGCTAAACAC
CTTTTTGAATTAGAGCCTGAAAACCCTGGGGCGTATGTGCTTTTATCAAACATTTATGCA
ACCGCTGGTAGATGGGATGATGTAGCAAGAATAAGAACCAAGCTGAACGATAAGGGGATG
AAGAAGGTCCCTGGATGTAGCTCAATTGAGGTGGATAGTGTTGTTCACGAGTTTCTTGTT
GGTGACAAAGTACATGAACAGAGCCAAGACATATATAAGATGTTGGATGAAATAGATCAG
CTTTTGGAGAAAGCCGGGCATGTGCCTGATACATCTGAGGTGCTCTATGACATGGATGAG
GAGTGGAAAGAAGGGTCCTTGAGTCATCATAGTGAGAAGTTGGCCATTGCCTTTGGGCTG
ATTAGTACAAAGCCAGAGACTACTATCAGGATAGTGAAGAATCTTCGTGTATGTGGAAAT
TGTCATTCAGCAATAAAGCTGATAAGCAAGATATTCAACAGAGAGATTATTGCTAGAGAT
CGGAACCGTTTTCACCATTTCAAAGATGGTTCTTGTTCATGTATGGACTATTGGTGAAAC
TTGGTTGCTTACAGAAGGAATAATAACTTCCCAGACTATTTTCTAGAGAAATCCAATCAT
ATGGATTGATCAAGAAA