Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_01s0010g00730.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:1:15898381:15900732:-1 gene:VIT_01s0010g00730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGTCATCATCCTCCAACTACTACGCTTCTTTACTCAAACTCTGCTGTGAATCCCAGAAC CAAACCCAAGCCAAGAAACTCCACTGCCTCATACTCAAAACCATTAAACAACCTGAAACC TTTTTATCAAACAATCTCATCACTGCTTACTATAAACTAGGCAATTTAGCATATGCCCAC CACGTGTTCGATCATATTCCTCAACCAAATCTCTTCTCATGGAACACAATCCTCTCCGTT TATTCAAAACTGGGACTTCTTTCTCAGATGCAACAAATCTTTAATCTAATGCCATTTCGA GATGGGGTCTCTTGGAATTTGGCTATTTCGGGTTATGCTAATTATGGCTCTTGTAGTGAT GCGGTTAGAGTTTATAAGTTGATGTTGAAGGATGCAGCCATGAATTTGAATCGGATTACA TTTTCAACAATGCTTATATTGTGTTCAAAATTTCGGTGTGTAGATTTGGGTAGGCAAATT AATGGGCAAATACTGAAATTTGGTTTTGGGTCTGATGTATTTGTGGGTAGTCCTTTGGTG GACATGTATACGAAATTGGGGTTGATCTATGATGCAAAGCGGTACTTTGATGAAATGCCG GAGAGGAATGTAGTTATGTGTAATACAATGATCACTGGGCTTATGCGGTGTGGGATGATT GAAGAGTCTCAGCGTTTGTTTTGTGGCCTAAAAGAGAGAGATTCGATTTCTTGGACGATC ATGATTACAGGGCTAATGCAGAATGGGTTGGAGAGAGAAGCACTTGATATGTTCAGAGAG ATGCGATTGGCAGGGTTTGCAATGGATCAGTTTACATTTGGAAGTGTCTTGACTGCTTGT GGGAGTCTTTTGGCCTTAGGAGAAGGGAAACAGATTCATGCGTATGTAATAAGGACTGAC CATAAGGATAATGTGTTTGTGGGAAGTGCTCTTGTTGACATGTATTCCAAGTGTAGAAGC ATAAAATCTGCAGAAACAGTATTCAAGAGAATGCCCCAAAAGAATGTCATTTCATGGACT GCGATGCTGGTGGGTTATGGCCAGAATGGTTTCAGTGAAGAAGCTGTTAAGATTTTCTTT GAGATGCAGAGAAATGGGGTTGAGCCAGATGATTTTACTCTAGGAAGTGTTATTAGCTCA TGTGCTAATCTGGCAAGCTTAGAAGAGGGTGCCCAATTTCATTGTCGAGCCTTGGTTTCT GGCTTGATTTCTTTTATTACCGTATCTAATGCGCTTATTACCTTGTATGGTAAATGTGGA AGCACAGAAAATTCCCATCGGTTGTTCACTGAAATGAACATCAGAGATGAAGTTTCTTGG ACTGCATTGCTTGCAGGGTATGCCCAGTTTGGGAAAGCCAATGAGACAATTGGTTTGTTT GAAAGAATGTTGGCACATGGCTTGAAACCAGATGGAGTTACATTTATTGGGGTCCTTTCA GCTTGCAGTAGGGCAGGACTAGTGGAGAAAGGACTTCAGTATTTTGAATCAATGATAAAA GAACATGGTATTATGCCAATTGTTGATCACTGCACTTGCATCATTGATCTGCTTGGCCGA GCTGGAAGGTTAGAAGAAGCAAGAAATTTTATAAATAATATGCCTTGCCATCCTGATGTG GTTGGATGGGCTACCTTGCTGAGCTCATGTAGAGTTCATGGTGACATGGAAATTGGGAAA TGGGCAGCTGATTCTCTAATTGCATTAGAGCCTCAGAACCCTGCAAGCTATGTCTTGCTT TCAAGTCTCTATGCTTCCAAAGGGAAGTGGGACAAAGTGGCTCAGTTAAGAAGAGGAATG AGAGATAAGCGAGTAAGAAAGGAACCGGGATATAGTTGGATTAAATATAAAGGCAAAGTG CATGTTTTCTCAGCTGATGACCAGTCAAGTCCATTTTTAGGTCAGATATATGCTGAGTTG GAAAAACTGAATTATAAAATGATAGAAGAGGGATATGTTCCTGATATGAGTTCTGTTCTT CATGATGTTGAGGAATCTGAGAAGATAAAAATGCTTAACCACCATAGCGAAAAACTTGCT ATTGCTTTTGGGTTGATTTTTGTTCCTCCTGGCCTGCCCATACGGGTAATTAAGAACCTG AGAGTCTGTGGTGATTGCCACAATGCAACTAAATTCATTTCCAAGATAACACAGAGAGAG ATACTTGTAAGGGATGCAGTTCGTTTCCATTTGTTTAAAGATGGGACATGTTCATGTGGG GATTTTTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_01s0010g00730.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:1:15898381:15900732:-1 gene:VIT_01s0010g00730 transcript:VIT_01s0010g00730.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MSSSSNYYASLLKLCCESQNQTQAKKLHCLILKTIKQPETFLSNNLITAYYKLGNLAYAH HVFDHIPQPNLFSWNTILSVYSKLGLLSQMQQIFNLMPFRDGVSWNLAISGYANYGSCSD AVRVYKLMLKDAAMNLNRITFSTMLILCSKFRCVDLGRQINGQILKFGFGSDVFVGSPLV DMYTKLGLIYDAKRYFDEMPERNVVMCNTMITGLMRCGMIEESQRLFCGLKERDSISWTI MITGLMQNGLEREALDMFREMRLAGFAMDQFTFGSVLTACGSLLALGEGKQIHAYVIRTD HKDNVFVGSALVDMYSKCRSIKSAETVFKRMPQKNVISWTAMLVGYGQNGFSEEAVKIFF EMQRNGVEPDDFTLGSVISSCANLASLEEGAQFHCRALVSGLISFITVSNALITLYGKCG STENSHRLFTEMNIRDEVSWTALLAGYAQFGKANETIGLFERMLAHGLKPDGVTFIGVLS ACSRAGLVEKGLQYFESMIKEHGIMPIVDHCTCIIDLLGRAGRLEEARNFINNMPCHPDV VGWATLLSSCRVHGDMEIGKWAADSLIALEPQNPASYVLLSSLYASKGKWDKVAQLRRGM RDKRVRKEPGYSWIKYKGKVHVFSADDQSSPFLGQIYAELEKLNYKMIEEGYVPDMSSVL HDVEESEKIKMLNHHSEKLAIAFGLIFVPPGLPIRVIKNLRVCGDCHNATKFISKITQRE ILVRDAVRFHLFKDGTCSCGDFW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_01s0010g00730.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:1:15898381:15900732:-1 gene:VIT_01s0010g00730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGTCATCATCCTCCAACTACTACGCTTCTTTACTCAAACTCTGCTGTGAATCCCAGAAC CAAACCCAAGCCAAGAAACTCCACTGCCTCATACTCAAAACCATTAAACAACCTGAAACC TTTTTATCAAACAATCTCATCACTGCTTACTATAAACTAGGCAATTTAGCATATGCCCAC CACGTGTTCGATCATATTCCTCAACCAAATCTCTTCTCATGGAACACAATCCTCTCCGTT TATTCAAAACTGGGACTTCTTTCTCAGATGCAACAAATCTTTAATCTAATGCCATTTCGA GATGGGGTCTCTTGGAATTTGGCTATTTCGGGTTATGCTAATTATGGCTCTTGTAGTGAT GCGGTTAGAGTTTATAAGTTGATGTTGAAGGATGCAGCCATGAATTTGAATCGGATTACA TTTTCAACAATGCTTATATTGTGTTCAAAATTTCGGTGTGTAGATTTGGGTAGGCAAATT AATGGGCAAATACTGAAATTTGGTTTTGGGTCTGATGTATTTGTGGGTAGTCCTTTGGTG GACATGTATACGAAATTGGGGTTGATCTATGATGCAAAGCGGTACTTTGATGAAATGCCG GAGAGGAATGTAGTTATGTGTAATACAATGATCACTGGGCTTATGCGGTGTGGGATGATT GAAGAGTCTCAGCGTTTGTTTTGTGGCCTAAAAGAGAGAGATTCGATTTCTTGGACGATC ATGATTACAGGGCTAATGCAGAATGGGTTGGAGAGAGAAGCACTTGATATGTTCAGAGAG ATGCGATTGGCAGGGTTTGCAATGGATCAGTTTACATTTGGAAGTGTCTTGACTGCTTGT GGGAGTCTTTTGGCCTTAGGAGAAGGGAAACAGATTCATGCGTATGTAATAAGGACTGAC CATAAGGATAATGTGTTTGTGGGAAGTGCTCTTGTTGACATGTATTCCAAGTGTAGAAGC ATAAAATCTGCAGAAACAGTATTCAAGAGAATGCCCCAAAAGAATGTCATTTCATGGACT GCGATGCTGGTGGGTTATGGCCAGAATGGTTTCAGTGAAGAAGCTGTTAAGATTTTCTTT GAGATGCAGAGAAATGGGGTTGAGCCAGATGATTTTACTCTAGGAAGTGTTATTAGCTCA TGTGCTAATCTGGCAAGCTTAGAAGAGGGTGCCCAATTTCATTGTCGAGCCTTGGTTTCT GGCTTGATTTCTTTTATTACCGTATCTAATGCGCTTATTACCTTGTATGGTAAATGTGGA AGCACAGAAAATTCCCATCGGTTGTTCACTGAAATGAACATCAGAGATGAAGTTTCTTGG ACTGCATTGCTTGCAGGGTATGCCCAGTTTGGGAAAGCCAATGAGACAATTGGTTTGTTT GAAAGAATGTTGGCACATGGCTTGAAACCAGATGGAGTTACATTTATTGGGGTCCTTTCA GCTTGCAGTAGGGCAGGACTAGTGGAGAAAGGACTTCAGTATTTTGAATCAATGATAAAA GAACATGGTATTATGCCAATTGTTGATCACTGCACTTGCATCATTGATCTGCTTGGCCGA GCTGGAAGGTTAGAAGAAGCAAGAAATTTTATAAATAATATGCCTTGCCATCCTGATGTG GTTGGATGGGCTACCTTGCTGAGCTCATGTAGAGTTCATGGTGACATGGAAATTGGGAAA TGGGCAGCTGATTCTCTAATTGCATTAGAGCCTCAGAACCCTGCAAGCTATGTCTTGCTT TCAAGTCTCTATGCTTCCAAAGGGAAGTGGGACAAAGTGGCTCAGTTAAGAAGAGGAATG AGAGATAAGCGAGTAAGAAAGGAACCGGGATATAGTTGGATTAAATATAAAGGCAAAGTG CATGTTTTCTCAGCTGATGACCAGTCAAGTCCATTTTTAGGTCAGATATATGCTGAGTTG GAAAAACTGAATTATAAAATGATAGAAGAGGGATATGTTCCTGATATGAGTTCTGTTCTT CATGATGTTGAGGAATCTGAGAAGATAAAAATGCTTAACCACCATAGCGAAAAACTTGCT ATTGCTTTTGGGTTGATTTTTGTTCCTCCTGGCCTGCCCATACGGGTAATTAAGAACCTG AGAGTCTGTGGTGATTGCCACAATGCAACTAAATTCATTTCCAAGATAACACAGAGAGAG ATACTTGTAAGGGATGCAGTTCGTTTCCATTTGTTTAAAGATGGGACATGTTCATGTGGG GATTTTTGGTGATAGGGTTCTCCTAGCATTTGTGTAGAATATTAAAACCTTCAAAATTTT CAGGTGAGTTACTGAAACACAGGGCAGAGCATCAGAAAACTGAATAGGTCTCTTCATTAA AGCAACCTGTTA