Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_01s0010g00550.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:1:15443313:15464465:1 gene:VIT_01s0010g00550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGACACTGTATGACAAAAAAATACTAGGAAAAAGAAAACCATCACCCTTCTCAGCTCCA AGAGACGCCCCTCCAGTCCCAAAGAAAGTTCCCTTCACAGTCTCAGCTCATGGCACATCG TGGCAAGATCCCTACCATTGGATGTCCAACACCGCTGACCCCGACCTCTCCGCATACCTT CGCCACGAAAACTCATATGCTGAAGCTTTCATGGCTGACACCCTTAACCTCCAGCGGACA CTCTTTTCTGAGATGAATTCTAGAATGCCCACTAATATTTCCACTCCCACTGAACGCTGG GGGCCATGGTTATACTACCAATACATTCCGGAGGGGAAGGAATACCCTGTACTTTGTCGG AAATTAGCAACTCAGACAAATGGTTGGGCAAAGTCTTTTCTTAATAACGTGATAGGAGAA TTTGGAAGGGAGAAAGTTCTCCTGGACTGGAATGAAATTGCAGAAGAATATGGTTATGTT CATGTTGGTACATGTCGAGTTTCTCCAGATCACAACTTTCTTGCATACACACTTGATATA ACTGGGAGTGAACGGTTCATGCTTCAAATTAAGGATCTCCATAGTGGCTGTATTCTTCCA GACTTGAGGGTTGATGGGGTTGTTAGCTTGGCATGGGCTCAAGATGGTTGTACTTTATTC TATACAACAACAGATGAAAACCAACGGCCTTACAGGGTGCAATGCATTAAACTGGGATCA GATGCTGTGAATGATGTCCCAGTATTTACAGAAAGTGATCCCAGCTTCTGTGTGGACATC ACGAGTACAAAGGATGGCAAGTTTATAACCGTTTTCGTGATAAATGCAACCAATCCAGAA GAGGGCTTGCGAAGAATGAATAAGCGTGTCCCTGGTGTACAGTATTTTTTGGAACATCAC CATGGTTTTTTCTATATTCTCACAAATGCTCCTTTAACCGATAAGGAATTGTCTGTTGGA GATTATTATTTGGCCAGATGCCAGGTTGACGATGTACAGTTGGCTAATTGGCAGAACATC ATCCTCCCAGGTGAAGATATTAGCATACAAGATATGGACATTTTTCATGGACATTTGGTG CTTTTCCTCAATAGCAAAGGTTGCTCTATGATATGCTCCATCAATATGCCAATTGATGTT AATTATAAGCAGCAAATGGAGATTGGTGATCTTAGTCCATGGTTCTTCCCTCTGCCTTCG GGTTTATGTAAAGTTGTTCCATGTTCAAATCATGACTTCATGAACTTCGTCTATCGTGTG GTTGTTTCATCTCCAGTGATGCCTGATATGATCATTGATTATGACATGCGGCAACGGGTA TTCTCCATAGTGCAGCAAGAGGAGGTACTAGGTGTTTTTGGTAATAGTGGATCGTTCTCA CAGACTCATGACCTAAATACTAACAAACTGTTGGATGCCCAAAATGGTGAGAACAAACAT GCCCAGATTACTGAAGTTCAGAGATGGAAGGACTTTTCTGATGCATACTGTTGTGAAAGA AAGGAGGTTATTTCCCATGATGGTGTTGAGGTTCCTCTGACTATTTTGTACTCACGAGAA GCATGGAAGAAGGGTCTGTCTCCTGGCCTTCTACAAGGCTATGGAGCATATGGGGAAGTT CTAGATAAAGCCTGGTGTTCAGATCGTCTGAGTTTGCTTGATCGTGGCTGGGTGGTGGCA TTCGCTGATGTGAGGGGTGGTGGAGGTCCGGATTCTTCATGGCACAAATGTGGCAGTGGA TTGAACAAGCTAAACTCTATTTATGACTTTGTTTTATGCGGCAAATACCTGGTTAATGAG GGCTATGTTCATGAAGACCAGCTTGGTGCTATTGGATTTAGTGCAGGAGGTCTTCTTGTA GGGGCAGCTATCAATATGTGTCCTGATATGTTTCGTGCTGCTATTTTGAAGGTTCCATTT CTTGACATTTGCAACACATTGTTAGATCCCAATTTGCCTCTCACTTTATTGGACTACGAA GAATTTGGAAATCCTCGAGTACAATCCCAATTTGAGTCCATTTTAAGTTATTCTCCATAT GATAATATTTCTCAAGGAAGCTGTCATCCTTCAGTGCTTGTTACGGCATCATTCTATGAC TCAAGGGTGGGAGTTTGGGAAGCTGCCAAATGGGTAGCCAAAGTACGTGATAGCACTTGT TCAAGTTGTTCCAGTGGGGTCATCCTGAAGACGAATATGAATGGAGGCCATTTTGGTGAA GGAGGCCGTCATGGTCACTGTGAGGAAACAGCGTATGAATATGCTTTTCTAATGAAAGTT ATGGGGATTTCATGCGATACCACATGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_01s0010g00550.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:1:15443313:15464465:1 gene:VIT_01s0010g00550 transcript:VIT_01s0010g00550.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MTLYDKKILGKRKPSPFSAPRDAPPVPKKVPFTVSAHGTSWQDPYHWMSNTADPDLSAYL RHENSYAEAFMADTLNLQRTLFSEMNSRMPTNISTPTERWGPWLYYQYIPEGKEYPVLCR KLATQTNGWAKSFLNNVIGEFGREKVLLDWNEIAEEYGYVHVGTCRVSPDHNFLAYTLDI TGSERFMLQIKDLHSGCILPDLRVDGVVSLAWAQDGCTLFYTTTDENQRPYRVQCIKLGS DAVNDVPVFTESDPSFCVDITSTKDGKFITVFVINATNPEEGLRRMNKRVPGVQYFLEHH HGFFYILTNAPLTDKELSVGDYYLARCQVDDVQLANWQNIILPGEDISIQDMDIFHGHLV LFLNSKGCSMICSINMPIDVNYKQQMEIGDLSPWFFPLPSGLCKVVPCSNHDFMNFVYRV VVSSPVMPDMIIDYDMRQRVFSIVQQEEVLGVFGNSGSFSQTHDLNTNKLLDAQNGENKH AQITEVQRWKDFSDAYCCERKEVISHDGVEVPLTILYSREAWKKGLSPGLLQGYGAYGEV LDKAWCSDRLSLLDRGWVVAFADVRGGGGPDSSWHKCGSGLNKLNSIYDFVLCGKYLVNE GYVHEDQLGAIGFSAGGLLVGAAINMCPDMFRAAILKVPFLDICNTLLDPNLPLTLLDYE EFGNPRVQSQFESILSYSPYDNISQGSCHPSVLVTASFYDSRVGVWEAAKWVAKVRDSTC SSCSSGVILKTNMNGGHFGEGGRHGHCEETAYEYAFLMKVMGISCDTT

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_01s0010g00550.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:1:15443313:15464465:1 gene:VIT_01s0010g00550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGACACTGTATGACAAAAAAATACTAGGAAAAAGAAAACCATCACCCTTCTCAGCTCCA AGAGACGCCCCTCCAGTCCCAAAGAAAGTTCCCTTCACAGTCTCAGCTCATGGCACATCG TGGCAAGATCCCTACCATTGGATGTCCAACACCGCTGACCCCGACCTCTCCGCATACCTT CGCCACGAAAACTCATATGCTGAAGCTTTCATGGCTGACACCCTTAACCTCCAGCGGACA CTCTTTTCTGAGATGAATTCTAGAATGCCCACTAATATTTCCACTCCCACTGAACGCTGG GGGCCATGGTTATACTACCAATACATTCCGGAGGGGAAGGAATACCCTGTACTTTGTCGG AAATTAGCAACTCAGACAAATGGTTGGGCAAAGTCTTTTCTTAATAACGTGATAGGAGAA TTTGGAAGGGAGAAAGTTCTCCTGGACTGGAATGAAATTGCAGAAGAATATGGTTATGTT CATGTTGGTACATGTCGAGTTTCTCCAGATCACAACTTTCTTGCATACACACTTGATATA ACTGGGAGTGAACGGTTCATGCTTCAAATTAAGGATCTCCATAGTGGCTGTATTCTTCCA GACTTGAGGGTTGATGGGGTTGTTAGCTTGGCATGGGCTCAAGATGGTTGTACTTTATTC TATACAACAACAGATGAAAACCAACGGCCTTACAGGGTGCAATGCATTAAACTGGGATCA GATGCTGTGAATGATGTCCCAGTATTTACAGAAAGTGATCCCAGCTTCTGTGTGGACATC ACGAGTACAAAGGATGGCAAGTTTATAACCGTTTTCGTGATAAATGCAACCAATCCAGAA GAGGGCTTGCGAAGAATGAATAAGCGTGTCCCTGGTGTACAGTATTTTTTGGAACATCAC CATGGTTTTTTCTATATTCTCACAAATGCTCCTTTAACCGATAAGGAATTGTCTGTTGGA GATTATTATTTGGCCAGATGCCAGGTTGACGATGTACAGTTGGCTAATTGGCAGAACATC ATCCTCCCAGGTGAAGATATTAGCATACAAGATATGGACATTTTTCATGGACATTTGGTG CTTTTCCTCAATAGCAAAGGTTGCTCTATGATATGCTCCATCAATATGCCAATTGATGTT AATTATAAGCAGCAAATGGAGATTGGTGATCTTAGTCCATGGTTCTTCCCTCTGCCTTCG GGTTTATGTAAAGTTGTTCCATGTTCAAATCATGACTTCATGAACTTCGTCTATCGTGTG GTTGTTTCATCTCCAGTGATGCCTGATATGATCATTGATTATGACATGCGGCAACGGGTA TTCTCCATAGTGCAGCAAGAGGAGGTACTAGGTGTTTTTGGTAATAGTGGATCGTTCTCA CAGACTCATGACCTAAATACTAACAAACTGTTGGATGCCCAAAATGGTGAGAACAAACAT GCCCAGATTACTGAAGTTCAGAGATGGAAGGACTTTTCTGATGCATACTGTTGTGAAAGA AAGGAGGTTATTTCCCATGATGGTGTTGAGGTTCCTCTGACTATTTTGTACTCACGAGAA GCATGGAAGAAGGGTCTGTCTCCTGGCCTTCTACAAGGCTATGGAGCATATGGGGAAGTT CTAGATAAAGCCTGGTGTTCAGATCGTCTGAGTTTGCTTGATCGTGGCTGGGTGGTGGCA TTCGCTGATGTGAGGGGTGGTGGAGGTCCGGATTCTTCATGGCACAAATGTGGCAGTGGA TTGAACAAGCTAAACTCTATTTATGACTTTGTTTTATGCGGCAAATACCTGGTTAATGAG GGCTATGTTCATGAAGACCAGCTTGGTGCTATTGGATTTAGTGCAGGAGGTCTTCTTGTA GGGGCAGCTATCAATATGTGTCCTGATATGTTTCGTGCTGCTATTTTGAAGGTTCCATTT CTTGACATTTGCAACACATTGTTAGATCCCAATTTGCCTCTCACTTTATTGGACTACGAA GAATTTGGAAATCCTCGAGTACAATCCCAATTTGAGTCCATTTTAAGTTATTCTCCATAT GATAATATTTCTCAAGGAAGCTGTCATCCTTCAGTGCTTGTTACGGCATCATTCTATGAC TCAAGGGTGGGAGTTTGGGAAGCTGCCAAATGGGTAGCCAAAGTACGTGATAGCACTTGT TCAAGTTGTTCCAGTGGGGTCATCCTGAAGACGAATATGAATGGAGGCCATTTTGGTGAA GGAGGCCGTCATGGTCACTGTGAGGAAACAGCGTATGAATATGCTTTTCTAATGAAAGTT ATGGGGATTTCATGCGATACCACATGATAAGTGTTCTTTTGAATCAACACAAGTGACGAT ATGAGGAAAGTTTGTATTCAAAATCTTTGGTGAGTGTGATCTAGTATTTGTCTCTTAAAA GGATTTATGATTTCCCATTGGCTCTTTGTTATTTGTGAAGGCGACCTGAAGCAGTTGGGG CACTCAAGCTCTGAATGCTTTTTAAGATACAGAATTACTTATTTTTTCACTCAATACATG GGG