Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_00s0324g00090.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:Un:23455414:23464065:-1 gene:VIT_00s0324g00090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAGTTCATTGAAGAGTGATAGGAGAAAAAGATTTAAAAAAGTGGCGACAAAGCAAAAA TGGCAATTGCGAACAGAAGAAAAAAGTGAAGTAGAAGAAAGTGAAGCAAAGGAAAGCGAA GCTACTGAGCAAAAATCCCTATTACCAACAGAAGAGGCAAGTGATTTTGCTAAACCGATG AGTGTAGTCTTCACATTTGATAAATTATTGAAATTTTTGGAGATGTATTCGACATGTGGA GCGATGGAGCTTGCTCGCCAAGTGTTCAACGAAAGCTCGAACAGAAATATAGTTTGTTGG ACAGGCCTCATTAGTGGGTATTGTAGTAACGGATTCGTTGATGAAGCTCGTTGTGTGTTT GATGCCATGCCGGAGAGAAACGATGTTTCTTATAGTGCAATGGCATCTGGGTATGTTAGA AATGATCGTTTCAACGAGGCGATTGAGTTATTTCGTGAATTGAAAAGTTGTGCTGCCGTG AAGCCGAATATTTCTCTTTTGGTGAGTGTTCTTGATGCTTGTGCAGCTGTTGGTGCATTT GAGGAAGGAAAATGGATTCATTCCTATATAGATGAGAATGGTTTGGACTATGATCTTAAA ATGGGCACTGCACTAATAGATTTTTATGCAAAATGTGGGTGCATAAAGACTGCTGAGGAA ATATTTAACAAGATGCCATTGAAAGATGTAACAGCCTGGAGTTCCATGATCTTGGGATTA GCCATCAATGGCAATAATGAGATGGGGCTTGAGCTTTTCCATGAGATGGAAACGAGGGGG CCTAGACCGAATGCTATTACTTTTATTGGTGTTTTTACTGCTTGTAATCACAAAACCTTA GTGAATGAAGCCTTGCGGTTGCTTGGACGCATGAGCAAAGTTTATGGTATGTTTCCCTTG ATTGAGCACTACGGGTGCATGGTTGATCTCTTGTCTCGGACTGGACAAGTGAAAGAGGCA GAGATATTAATAAATACCATGCCAATGGAACCAGATGGAGCCATTTGGGGATCTTTGCTT AATGGGTGTCTGATGCATGGTCATATGAAGTTGGGGGAGAGGGTGGGGAAGCTTCTAATC CAATTAGAGCCTCAACATAGCGGAAGGTATGTCCTCCTAGCAAACATGTATGCCACTATG GGTAGCTGGGAAGGTGTTATGAGGCTTAGGAAAATGATGAAAGAGAGGGGGGTACTTACA GTTCCTGCTTGGAGTTTTATCGAAATTAATGGAGTTGTTCATAAATTTCTAGTTGACGAT AAGTGCCATCCTCAATGGAGATATATCTATAGTGTTTTAAATCAACTTGGAAGAGAACTC GACACTTTTAATGTTATGAATGATGCACGCTCATGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_00s0324g00090.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:Un:23455414:23464065:-1 gene:VIT_00s0324g00090 transcript:VIT_00s0324g00090.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MSSLKSDRRKRFKKVATKQKWQLRTEEKSEVEESEAKESEATEQKSLLPTEEASDFAKPM SVVFTFDKLLKFLEMYSTCGAMELARQVFNESSNRNIVCWTGLISGYCSNGFVDEARCVF DAMPERNDVSYSAMASGYVRNDRFNEAIELFRELKSCAAVKPNISLLVSVLDACAAVGAF EEGKWIHSYIDENGLDYDLKMGTALIDFYAKCGCIKTAEEIFNKMPLKDVTAWSSMILGL AINGNNEMGLELFHEMETRGPRPNAITFIGVFTACNHKTLVNEALRLLGRMSKVYGMFPL IEHYGCMVDLLSRTGQVKEAEILINTMPMEPDGAIWGSLLNGCLMHGHMKLGERVGKLLI QLEPQHSGRYVLLANMYATMGSWEGVMRLRKMMKERGVLTVPAWSFIEINGVVHKFLVDD KCHPQWRYIYSVLNQLGRELDTFNVMNDARS

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_00s0324g00090.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:Un:23455414:23464065:-1 gene:VIT_00s0324g00090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAGTTCATTGAAGAGTGATAGGAGAAAAAGATTTAAAAAAGTGGCGACAAAGCAAAAA TGGCAATTGCGAACAGAAGAAAAAAGTGAAGTAGAAGAAAGTGAAGCAAAGGAAAGCGAA GCTACTGAGCAAAAATCCCTATTACCAACAGAAGAGGCAAGTGATTTTGCTAAACCGATG AGTGTAGTCTTCACATTTGATAAATTATTGAAATTTTTGGAGATGTATTCGACATGTGGA GCGATGGAGCTTGCTCGCCAAGTGTTCAACGAAAGCTCGAACAGAAATATAGTTTGTTGG ACAGGCCTCATTAGTGGGTATTGTAGTAACGGATTCGTTGATGAAGCTCGTTGTGTGTTT GATGCCATGCCGGAGAGAAACGATGTTTCTTATAGTGCAATGGCATCTGGGTATGTTAGA AATGATCGTTTCAACGAGGCGATTGAGTTATTTCGTGAATTGAAAAGTTGTGCTGCCGTG AAGCCGAATATTTCTCTTTTGGTGAGTGTTCTTGATGCTTGTGCAGCTGTTGGTGCATTT GAGGAAGGAAAATGGATTCATTCCTATATAGATGAGAATGGTTTGGACTATGATCTTAAA ATGGGCACTGCACTAATAGATTTTTATGCAAAATGTGGGTGCATAAAGACTGCTGAGGAA ATATTTAACAAGATGCCATTGAAAGATGTAACAGCCTGGAGTTCCATGATCTTGGGATTA GCCATCAATGGCAATAATGAGATGGGGCTTGAGCTTTTCCATGAGATGGAAACGAGGGGG CCTAGACCGAATGCTATTACTTTTATTGGTGTTTTTACTGCTTGTAATCACAAAACCTTA GTGAATGAAGCCTTGCGGTTGCTTGGACGCATGAGCAAAGTTTATGGTATGTTTCCCTTG ATTGAGCACTACGGGTGCATGGTTGATCTCTTGTCTCGGACTGGACAAGTGAAAGAGGCA GAGATATTAATAAATACCATGCCAATGGAACCAGATGGAGCCATTTGGGGATCTTTGCTT AATGGGTGTCTGATGCATGGTCATATGAAGTTGGGGGAGAGGGTGGGGAAGCTTCTAATC CAATTAGAGCCTCAACATAGCGGAAGGTATGTCCTCCTAGCAAACATGTATGCCACTATG GGTAGCTGGGAAGGTGTTATGAGGCTTAGGAAAATGATGAAAGAGAGGGGGGTACTTACA GTTCCTGCTTGGAGTTTTATCGAAATTAATGGAGTTGTTCATAAATTTCTAGTTGACGAT AAGTGCCATCCTCAATGGAGATATATCTATAGTGTTTTAAATCAACTTGGAAGAGAACTC GACACTTTTAATGTTATGAATGATGCACGCTCATGA