Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_00s0291g00100.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:Un:21868441:21885323:-1 gene:VIT_00s0291g00100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGCTATGGCTATGGCTATGGCTCTGGGTAATCCATCCATGGCTCTGCCCCTTCGCTCT
CCTTTTCACCGCAAACACGCCTTCAACAATACTATCCACGGCATTTCCCGTTTCACCACC
AATACCAAGCTCCCTTTCTTTCAATGCACTTCTCCCCCTAACTGCCGCCTCAATTCCTTT
TCTACTCCCAAATCGGCGTCTGTCAATGGATTCTCCGTGCATAATAGCAATCCGGAAGGG
TCTGAGAATGACCAGGTTGAGTTCCCCAAGAGGTTCCGAGAATTGGTCCATTTTATTCGA
TCAATTTGGCCCGGTGGAAGTTGGTGGAGCTTATCCGATCATGCGGACTTCATAATGACG
GCAAAGCCGGTGACTGTGTTGCGTGCACTTCAACGGATGTGGGGCTTGGTTGCTAAAGAT
CGATGGATCATCTTTGCTGCCTTTTCCGCCTTAGTTCTCGCTGCGGTTTCAGAGATCTCC
ATACCTCATTTCTTGACAGCATCAATCTTCTCTGCACAGAGTGGTGAAATTGTGGTGTTC
CACCGGAATGTTGGTCTCTTGGTTTTTCTATGTTTTGCTTCAGGAATATGCAGTGGTCTT
CGAGGTTGCTGCTTTGGCATAGCAAACATGATCCTTGTCAAGCGAATGAGGGAAACCTTA
TATTCTGCTCTACTTTTTCAGGACATATCCTTTTTCGACAATGAAACTGTTGGTGATTTG
ACCAGTAGGCTTGGGGCAGATTGTCAGCAAGTGTCACGTGTTATTGGAAATGATCTTAAT
CTTATTCTGCGCAATGTTCTTCAGGGGACAGGCGCGTTGATATACTTGCTAGTCTTGTCA
TGGCCGCTTGGTTTATGTACAATGATGATATGTTCTACTCTGTTAATAATTATGCTATTA
TATGGCAGGTACCAGAAGAAAGCAGCAAAATTAATCCAAGAGTTCACTGCTTCTGCTAAT
GAGGTTGCCCAGGAAACATTCTCTTTGATGAGAACTGTTCGTGTTTATGGAACAGAGGAA
CAAGAAGTTGGAAGGTACAAGCAGTGGCTGGGAAAAATAGCTGACATAAGCTTGCGGCAA
AGTGCTGCATATGGATTGTGGAACCTGAGCTTCAACACTCTTTATCACTCAACACAGGTT
ATTGCTGTGCTGATAGGAGGAATGTCTATTCTGGCTGGTCATATAACAGCAGAGCAACTT
ACAAAGTTTATATTATACAGTGAGTGGCTGATTTATTCAACATGGTGGGTGGGGGACAAT
TTGTCATCATTGATGCAATCTGTTGGGGCAAGTGAAAAAGTCTTCCAATTGATGGATCTC
TTGCCTAGTGACCAGTTCATATCTAAAGGATTAAAGTTACAAAGACTGTTAGGACATATT
GAGTTTGTGAATGTATCCTTTTATTATGCTTCAAGGGCAATGGTACCTGTACTGCAACAT
GTAAACATTTCTGTGCATCCTAATGAAGTGCTTGCAATCGTTGGTCTTAGTGGTAGTGGA
AAAAGCACAATAGTGAATCTTTTGCTCCGTCTTTATGAGCCAACGGATGGTCAGGTTTTG
ATTGATGGCTTCCCCCTTCAAGAGTTGGATGTCAAGTGGTTGAGGGAGAGAATTGGATTT
GTGGGACAGGAACCCCGACTTTTCCGTATGGATATCAGTTCAAACATACGCTATGGATGT
ACCCGGGATATTAAGCAGAAGGATGTGGAATGGGCTGCCAAGCAGGCATATGCCCATGAT
TTCATCTTGTCACTCCCTAATGGTTACAAGACACTTGTTGACAATGATTTACTGAGTGGG
GGACAAAAGCAGCGAATTGCTATTGCTCGAGCCCTTCTTAGGGATCCCACCATTTTGGTC
CTTGATGAAGCCACTAGTGCACTGGATGCAGAGAGTGAACACAATGTCAAGAATGTTCTT
CGTGCTCTCAGAAGTGACTTGAAGACAAAGAGAACGGTCATAGTAATTGCACACAGACTC
TCTACGATACAAGCTGCTGATAGAATAGTGGTTATGGATGGTGGCCGAATTGTTGAGATG
GGGAGTCACATGGAGCTTCTCCTTAAAGACGGTATATATGCCCGATTGACTAGAAGGCAG
GCTGATGCTGTAGCATGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_00s0291g00100.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:Un:21868441:21885323:-1 gene:VIT_00s0291g00100 transcript:VIT_00s0291g00100.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MAMAMAMALGNPSMALPLRSPFHRKHAFNNTIHGISRFTTNTKLPFFQCTSPPNCRLNSF
STPKSASVNGFSVHNSNPEGSENDQVEFPKRFRELVHFIRSIWPGGSWWSLSDHADFIMT
AKPVTVLRALQRMWGLVAKDRWIIFAAFSALVLAAVSEISIPHFLTASIFSAQSGEIVVF
HRNVGLLVFLCFASGICSGLRGCCFGIANMILVKRMRETLYSALLFQDISFFDNETVGDL
TSRLGADCQQVSRVIGNDLNLILRNVLQGTGALIYLLVLSWPLGLCTMMICSTLLIIMLL
YGRYQKKAAKLIQEFTASANEVAQETFSLMRTVRVYGTEEQEVGRYKQWLGKIADISLRQ
SAAYGLWNLSFNTLYHSTQVIAVLIGGMSILAGHITAEQLTKFILYSEWLIYSTWWVGDN
LSSLMQSVGASEKVFQLMDLLPSDQFISKGLKLQRLLGHIEFVNVSFYYASRAMVPVLQH
VNISVHPNEVLAIVGLSGSGKSTIVNLLLRLYEPTDGQVLIDGFPLQELDVKWLRERIGF
VGQEPRLFRMDISSNIRYGCTRDIKQKDVEWAAKQAYAHDFILSLPNGYKTLVDNDLLSG
GQKQRIAIARALLRDPTILVLDEATSALDAESEHNVKNVLRALRSDLKTKRTVIVIAHRL
STIQAADRIVVMDGGRIVEMGSHMELLLKDGIYARLTRRQADAVA

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_00s0291g00100.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:Un:21868441:21885323:-1 gene:VIT_00s0291g00100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

TTAGCTTTATCCGTTGAACCCTCTGCTTATTGCTATTGCAATGGCTATGGCTATGGCTAT
GGCTCTGGGTAATCCATCCATGGCTCTGCCCCTTCGCTCTCCTTTTCACCGCAAACACGC
CTTCAACAATACTATCCACGGCATTTCCCGTTTCACCACCAATACCAAGCTCCCTTTCTT
TCAATGCACTTCTCCCCCTAACTGCCGCCTCAATTCCTTTTCTACTCCCAAATCGGCGTC
TGTCAATGGATTCTCCGTGCATAATAGCAATCCGGAAGGGTCTGAGAATGACCAGGTTGA
GTTCCCCAAGAGGTTCCGAGAATTGGTCCATTTTATTCGATCAATTTGGCCCGGTGGAAG
TTGGTGGAGCTTATCCGATCATGCGGACTTCATAATGACGGCAAAGCCGGTGACTGTGTT
GCGTGCACTTCAACGGATGTGGGGCTTGGTTGCTAAAGATCGATGGATCATCTTTGCTGC
CTTTTCCGCCTTAGTTCTCGCTGCGGTTTCAGAGATCTCCATACCTCATTTCTTGACAGC
ATCAATCTTCTCTGCACAGAGTGGTGAAATTGTGGTGTTCCACCGGAATGTTGGTCTCTT
GGTTTTTCTATGTTTTGCTTCAGGAATATGCAGTGGTCTTCGAGGTTGCTGCTTTGGCAT
AGCAAACATGATCCTTGTCAAGCGAATGAGGGAAACCTTATATTCTGCTCTACTTTTTCA
GGACATATCCTTTTTCGACAATGAAACTGTTGGTGATTTGACCAGTAGGCTTGGGGCAGA
TTGTCAGCAAGTGTCACGTGTTATTGGAAATGATCTTAATCTTATTCTGCGCAATGTTCT
TCAGGGGACAGGCGCGTTGATATACTTGCTAGTCTTGTCATGGCCGCTTGGTTTATGTAC
AATGATGATATGTTCTACTCTGTTAATAATTATGCTATTATATGGCAGGTACCAGAAGAA
AGCAGCAAAATTAATCCAAGAGTTCACTGCTTCTGCTAATGAGGTTGCCCAGGAAACATT
CTCTTTGATGAGAACTGTTCGTGTTTATGGAACAGAGGAACAAGAAGTTGGAAGGTACAA
GCAGTGGCTGGGAAAAATAGCTGACATAAGCTTGCGGCAAAGTGCTGCATATGGATTGTG
GAACCTGAGCTTCAACACTCTTTATCACTCAACACAGGTTATTGCTGTGCTGATAGGAGG
AATGTCTATTCTGGCTGGTCATATAACAGCAGAGCAACTTACAAAGTTTATATTATACAG
TGAGTGGCTGATTTATTCAACATGGTGGGTGGGGGACAATTTGTCATCATTGATGCAATC
TGTTGGGGCAAGTGAAAAAGTCTTCCAATTGATGGATCTCTTGCCTAGTGACCAGTTCAT
ATCTAAAGGATTAAAGTTACAAAGACTGTTAGGACATATTGAGTTTGTGAATGTATCCTT
TTATTATGCTTCAAGGGCAATGGTACCTGTACTGCAACATGTAAACATTTCTGTGCATCC
TAATGAAGTGCTTGCAATCGTTGGTCTTAGTGGTAGTGGAAAAAGCACAATAGTGAATCT
TTTGCTCCGTCTTTATGAGCCAACGGATGGTCAGGTTTTGATTGATGGCTTCCCCCTTCA
AGAGTTGGATGTCAAGTGGTTGAGGGAGAGAATTGGATTTGTGGGACAGGAACCCCGACT
TTTCCGTATGGATATCAGTTCAAACATACGCTATGGATGTACCCGGGATATTAAGCAGAA
GGATGTGGAATGGGCTGCCAAGCAGGCATATGCCCATGATTTCATCTTGTCACTCCCTAA
TGGTTACAAGACACTTGTTGACAATGATTTACTGAGTGGGGGACAAAAGCAGCGAATTGC
TATTGCTCGAGCCCTTCTTAGGGATCCCACCATTTTGGTCCTTGATGAAGCCACTAGTGC
ACTGGATGCAGAGAGTGAACACAATGTCAAGAATGTTCTTCGTGCTCTCAGAAGTGACTT
GAAGACAAAGAGAACGGTCATAGTAATTGCACACAGACTCTCTACGATACAAGCTGCTGA
TAGAATAGTGGTTATGGATGGTGGCCGAATTGTTGAGATGGGGAGTCACATGGAGCTTCT
CCTTAAAGACGGTATATATGCCCGATTGACTAGAAGGCAGGCTGATGCTGTAGCATGACA
TAGGGGCTAGTGGATGCAGAAGATATTGCCTTCTACTTTTTCCTCTGGTTTCTTGCTGAT
CAGCTCCAGTATAGAGGTTTAAGCAATTCTTTTTAGTGCTGACCCATATATTTCTACAGG
TAAAAATTTGGAAACAGAAAGATAAAGGTATCATTGAAGTGGTTGGGATGCTGCCGACTC
AACCCCTGTAAAGTATGCAATGCTGCTCCAAAAGGAATTTGCTGCACCAAAATATCTCAT
TTCTTTTGTTTCTATTTTGTAATTCTTTTATTGGTGGATGATCCTAAACTGTTATCCAAG
AAGCATGGGGTGCATATAGATAGCAATAGCAGAGAATGAAATGCTACTTGGATCTTATAC
CAGTTGCTGATACATGTAATTCACT