Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_00s0270g00090.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:Un:19962893:19964599:-1 gene:VIT_00s0270g00090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGCTCACATCAAACAGATTCAGTCCCATCTCACCGTTTCCGGCACCCTCTTCGACCCC
TTCGCAGCAGGCAGAATCATCTCATTCTGCGCCGTCTCCGCCCAAGGCGACATCTCTCAC
GCCTACCTCCTCTTTCTCTCTCTCCCTCGACGTACCTCCTTCATTTGGAACACCATGCTA
CGAGCTTTCACCGACAAAAAGGAACCCGCCACTGTGCTCTCTCTTTACAAATACATGCTT
AGTACTGGCTTCTTACCCAATAACTACACTTTCTCTTTTCTTCTTCAAGCCTGTGCTCAG
CTCTCTGACCTCTCTTTTGGGATCCTACTCCACGCTCAGGCGGTCAGATTGGGTTGGGAA
GCCTATGATTTCGTGCAAAACGGATTGCTCCATTTGTACGCGTCTTGTAATTGCATGGAC
TCGGCTCGAAGGTTGTTTGATGGGAGTGTGAACCGAGACGTTGTTACGTGGACTGCTGTG
ATAAATGGGTATGCCAAGTCTGGGCAGGTCGTGGTGGCGAGGCAACTGTTTGATGAAATG
CCTGAGAAGAATGCGGTTTCTTGGAGTGCGATGATCACTGGGTATGCGCAAATTGGGTTG
TTTAGGGAGGCTTTAGAGCTTTTCAATGATATGCAGATTGCTGGATTTCGGCCTAATCAT
GGGGCAATAGTGGGTGCACTCACTGCTTGTGCTTTTCTTGGGGCATTGGATCAGGGAAGG
TGGATTCATGCATATGTGGATAGAAACCGTATGGTATTGGATAGAATATTGGGGACAGCG
CTTATAGACATGTATGCAAAGTGCGGCTGTGTAGAAACAGCTTGTCGTGTGTTTGATGAA
ATGCTAGATCGGGACGTCTTTGCTTTTACTTCTTTAATTTCAGGCTTAGCCAATCATGGT
CACAGTGCCACAGCTATTGAGATGTTTACAAGAATGCAGAATGAAGGGGTTTGTCCAAAT
GAAGTTACTTTTATATGTCTCTTAAGTGCTTGTAGTCGAGTTGGATTGGTGGAAGAAGGA
TTGAGAATCTTCAAAAGTATGACAAATATTTATGGAATTGAACCAGTCGTCCAGCACTAT
GGCTGTTTGGTAGATCTTTTGGGCAGAGCTGGGATGCTAGAGGATGCTAAGAGGGTGGTC
AGGGAGATGCCCCTGGAGCCAGATTCTTATGTATTGGGTGCATTACTCAATGCTTGTAGG
GTTCATGGCGACGTTGAGTTAGGTAAAGAAACAGTTGAGTGCTTGGCAGAGCGGAGTCTT
GACCATGGAGGTGTTCATGTCCTTCTTTCAAATATGTATGCCTCAGCTAACCAATGGGAG
GATGTAGCTAAGGTAAGGAAGGGAATGGAAGAAAAAAAGGTGAAAAAGGTTCCAGGGTGT
AGCTTGATTGAAGTGGATGGTGCGGTTTTCGAATTTGTTGCTGGAGATATGTCTCATGTT
TTTATGGATGAGATTGTGTTGTTGCTTCTTGGTATTGACAAGCACTTGAAATCACTTTGG
TCTGAAGATGATGACAATGATGACATGAAATTTGAGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_00s0270g00090.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:Un:19962893:19964599:-1 gene:VIT_00s0270g00090 transcript:VIT_00s0270g00090.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MAHIKQIQSHLTVSGTLFDPFAAGRIISFCAVSAQGDISHAYLLFLSLPRRTSFIWNTML
RAFTDKKEPATVLSLYKYMLSTGFLPNNYTFSFLLQACAQLSDLSFGILLHAQAVRLGWE
AYDFVQNGLLHLYASCNCMDSARRLFDGSVNRDVVTWTAVINGYAKSGQVVVARQLFDEM
PEKNAVSWSAMITGYAQIGLFREALELFNDMQIAGFRPNHGAIVGALTACAFLGALDQGR
WIHAYVDRNRMVLDRILGTALIDMYAKCGCVETACRVFDEMLDRDVFAFTSLISGLANHG
HSATAIEMFTRMQNEGVCPNEVTFICLLSACSRVGLVEEGLRIFKSMTNIYGIEPVVQHY
GCLVDLLGRAGMLEDAKRVVREMPLEPDSYVLGALLNACRVHGDVELGKETVECLAERSL
DHGGVHVLLSNMYASANQWEDVAKVRKGMEEKKVKKVPGCSLIEVDGAVFEFVAGDMSHV
FMDEIVLLLLGIDKHLKSLWSEDDDNDDMKFE

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_00s0270g00090.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:Un:19962893:19964599:-1 gene:VIT_00s0270g00090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGCTCACATCAAACAGATTCAGTCCCATCTCACCGTTTCCGGCACCCTCTTCGACCCC
TTCGCAGCAGGCAGAATCATCTCATTCTGCGCCGTCTCCGCCCAAGGCGACATCTCTCAC
GCCTACCTCCTCTTTCTCTCTCTCCCTCGACGTACCTCCTTCATTTGGAACACCATGCTA
CGAGCTTTCACCGACAAAAAGGAACCCGCCACTGTGCTCTCTCTTTACAAATACATGCTT
AGTACTGGCTTCTTACCCAATAACTACACTTTCTCTTTTCTTCTTCAAGCCTGTGCTCAG
CTCTCTGACCTCTCTTTTGGGATCCTACTCCACGCTCAGGCGGTCAGATTGGGTTGGGAA
GCCTATGATTTCGTGCAAAACGGATTGCTCCATTTGTACGCGTCTTGTAATTGCATGGAC
TCGGCTCGAAGGTTGTTTGATGGGAGTGTGAACCGAGACGTTGTTACGTGGACTGCTGTG
ATAAATGGGTATGCCAAGTCTGGGCAGGTCGTGGTGGCGAGGCAACTGTTTGATGAAATG
CCTGAGAAGAATGCGGTTTCTTGGAGTGCGATGATCACTGGGTATGCGCAAATTGGGTTG
TTTAGGGAGGCTTTAGAGCTTTTCAATGATATGCAGATTGCTGGATTTCGGCCTAATCAT
GGGGCAATAGTGGGTGCACTCACTGCTTGTGCTTTTCTTGGGGCATTGGATCAGGGAAGG
TGGATTCATGCATATGTGGATAGAAACCGTATGGTATTGGATAGAATATTGGGGACAGCG
CTTATAGACATGTATGCAAAGTGCGGCTGTGTAGAAACAGCTTGTCGTGTGTTTGATGAA
ATGCTAGATCGGGACGTCTTTGCTTTTACTTCTTTAATTTCAGGCTTAGCCAATCATGGT
CACAGTGCCACAGCTATTGAGATGTTTACAAGAATGCAGAATGAAGGGGTTTGTCCAAAT
GAAGTTACTTTTATATGTCTCTTAAGTGCTTGTAGTCGAGTTGGATTGGTGGAAGAAGGA
TTGAGAATCTTCAAAAGTATGACAAATATTTATGGAATTGAACCAGTCGTCCAGCACTAT
GGCTGTTTGGTAGATCTTTTGGGCAGAGCTGGGATGCTAGAGGATGCTAAGAGGGTGGTC
AGGGAGATGCCCCTGGAGCCAGATTCTTATGTATTGGGTGCATTACTCAATGCTTGTAGG
GTTCATGGCGACGTTGAGTTAGGTAAAGAAACAGTTGAGTGCTTGGCAGAGCGGAGTCTT
GACCATGGAGGTGTTCATGTCCTTCTTTCAAATATGTATGCCTCAGCTAACCAATGGGAG
GATGTAGCTAAGGTAAGGAAGGGAATGGAAGAAAAAAAGGTGAAAAAGGTTCCAGGGTGT
AGCTTGATTGAAGTGGATGGTGCGGTTTTCGAATTTGTTGCTGGAGATATGTCTCATGTT
TTTATGGATGAGATTGTGTTGTTGCTTCTTGGTATTGACAAGCACTTGAAATCACTTTGG
TCTGAAGATGATGACAATGATGACATGAAATTTGAGTAAAACTACTTGTAGCTGGGATTG
GATGCATACTGAGCTGGTGGTGTAGGAAATTCATAAGGGGAAAAGATAGCGCTATTCATG
AGTTTTAATTGCCAAATTCAACTAAGCACACTTTTGAGGTAATGCTCTTTTACTTCTCTT
GAATCCACAATTTTGCTTCTAGTGTGT