Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_00s0250g00030.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:Un:17268660:17281352:1 gene:VIT_00s0250g00030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAGGATCGGCGTTCGGAGGCCTACACTTGCTCTTATCTTGGGAAACATGAAGAAGAAT CCGCCATCGTTGATGCTGTTTACTGTGATTAAAAATCTCCAAGGACTTGGCTATTTGTTT AAGATTTATGCTGTACATGATGATAACTCTCGCTCCATATGGGAGCAACTGGGTGGTCAA ATTTCAATTCTAAGTCCTGAGATATACAGCCATAATGATTGGACAACTTTTGAAGGCATC ATTGTAGACTCTCTTGAAGCAAAAGAAGCCATTTTAAGCCTTATGCAAGAGCCTTTCTGT TTCATACCACTTATTTGGATAATTCAAGAGGATACACTTGCAAAGCGACTTCCATTCTAT GAGAAACTGGGCTGGGAACATCTTGTTTCTTATTGGAGAAGTGCTTTTAGCAGAGCTGAT GTTGTCGTCTTTCCAGATTTTTCTTTGCCGATGTTATATAGTGTGCTTGACACTGGAAAC TTCTTTGTGATTCCTGCATCGCCAGTAGATGTGTGGGCTGCAGAAAGCTACAGTAAAACC CACTCGAAATATCAGTTAAGAGAGGACCTTGGATTCAATAAAGATGATATGTTGGTTCTA GTTGTTGGAAGTTCTTTCTTCTACGATGAGCTATCATGGGACTATGCTGTAGCAATGAAT GACATAGGACCGCTACTAAGCAAATATGCAAGGAGTAAGAATGCTGGGGCCATGTTTAGA TTTGTCTTTTTATGTGGTAACTCTACTGATGGATATAATGATCATTTGAAGGTATATGGA TATAATGATCATTTGAAGGAGGTTGCTTCACATCTAAAACTTCTTCCTGGTTCTGTAAGG CAATATGGCATGAATAGTGATGTCAATGGTCTCATATTAATGGCTGATGTTGTTATTTAT GCATCATCCCAAGTTGAGCAGGGTTTTCCACCTTTACTTACTCGGGCCATGTCATTTGGA ATCCCTGTTATAGCACCCGATCTTCCTGACATAAGAAAATATGTTGTTGATGGAGTCCAT GTGGTAATTTTTCCAAAAAACAATCCCGATGCCTTGATGAGAGCTTTCTCCCTTTTGATA TCAAATGGAAAACTCTCTAAATTTGCTAAGGCAGTTGCACTCTCTGGAAGGCTACTTGCT AAGAACATGCTGGCATCAGAATGTGTGAATAGTTATGCAAAGCTTCTGGAGAATGTCCTT AGTTTCCCATCGGATGTATTGCTACCAGGTCATATTTCTCAGTCTCAACATGATGCATGG GAGTGGAATTCATTCAGAACTGCAGATATGCCGCTCATTGAGAATGGGAGTGCTTCCATG AGAAAATCTAGTGTTGTTGATGTCCTTGAAGAAACTTTGTCCAACCAGCTTGACTCAGGG AACATTTCCAACAGTGAAACTGAGAATGATGTGCTGACACAGCTAGATTGGGATGTTTTA AGGGAAATAGAAAGCATTGAAGAAATGGAAAGACTAGAAATGGAGGAGCTTGAAGAAAGA ATGGAGAAAAACCCAGGTATATGGGATGAAATATATCGGAATGCTCGAAAAGTTGAAAGG GTTAAGTTTGAAACAAATGAAAGGGATGAAGGAGAGCTAGAAAGGACAGGCCAGCCACTA TGCATTTATGAGATTTATAATGGAGCTGGAGCCTGGCCATTTCTACATCATGGTTCTATG TATCGTGGGTTAAGTCTGACTACAAGTGCAAGGAGATTAAGATCAGATGATGTGGATGCT GTTGATCGGCTTCCTGTCTTGAATGACACATATTATCGGGATATCTTCTGTGATATTGGA GGCATGTTTTCTATTGCATTTAGGGTGGATAAAATTCACAAAAGACCTTGGATTGGGTTT CAATCATGGCATGCTGTTGGAAGTAAGGTTTCATTGTCTTCTAGAGCTGAAAAGGTTCTG GAAGAAACAATACAAGAAGAAACAAAGGGAGATGTATTATACTTCTGGGCTCACCTGAAC GTGGATGATGGACCCACACAAAAAAACCGCATCCCTACATTTTGGTCCATGTGCGACATT TTAAATGGCGGAAACTGCAGAACTGCTTTTGAAGATGCTTTCCGCCAGATGTATGCTATG CCATCATACATAGAAGCACTTCCACCTATGCCTGAAGATGGTGGTTACTGGTCTGCGTTG CATAGCTGGGTGATGCCAACCCCTTCCTTTCTAGAGTTCATAATGTTTTCCAGGATGTTT GCTGATTCACTTGATGCGTTGCATATGAATTCAAGGCAGTCCATGAATTTAAGCCAGTCA ATGAATTCAAGCCAGCCCACAGTATGTTTGTTGGGTTCCTCAAAGCTCGAGAAAAAGCAT TGTTACTGTCGGGTTTTGGAACTCCTGGTCAATGTTTGGGCTTATCATAGTGCCCGAAAG ATGGTTTATATCAATCCATACTCGGGTCAGCTAGAAGAGCAGCATCCTGTTGAACAGAGA AGGGGATTCATGTGGGCAAAGTACTTTAACAGCACATTGTTGAAAAGTATGGATGAAGAT CTAGCAGAGGCAGCTGATGATGGTGACCATCCCAGGGAGAGGTGGTTATGGCCTTTAACA GGAGAAGTGCATTGGCAAGGAATTTATGAGAGGGAGAGGGAAGAGAGATATAGGTCAAAG ATGGATAAGAAGAGAAAAGCAAAGGAGAAACTTGTTGAAAGGATGAAACATGGATACAAG CAGAAGCCAATTGGACGATAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_00s0250g00030.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:Un:17268660:17281352:1 gene:VIT_00s0250g00030 transcript:VIT_00s0250g00030.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MRIGVRRPTLALILGNMKKNPPSLMLFTVIKNLQGLGYLFKIYAVHDDNSRSIWEQLGGQ ISILSPEIYSHNDWTTFEGIIVDSLEAKEAILSLMQEPFCFIPLIWIIQEDTLAKRLPFY EKLGWEHLVSYWRSAFSRADVVVFPDFSLPMLYSVLDTGNFFVIPASPVDVWAAESYSKT HSKYQLREDLGFNKDDMLVLVVGSSFFYDELSWDYAVAMNDIGPLLSKYARSKNAGAMFR FVFLCGNSTDGYNDHLKVYGYNDHLKEVASHLKLLPGSVRQYGMNSDVNGLILMADVVIY ASSQVEQGFPPLLTRAMSFGIPVIAPDLPDIRKYVVDGVHVVIFPKNNPDALMRAFSLLI SNGKLSKFAKAVALSGRLLAKNMLASECVNSYAKLLENVLSFPSDVLLPGHISQSQHDAW EWNSFRTADMPLIENGSASMRKSSVVDVLEETLSNQLDSGNISNSETENDVLTQLDWDVL REIESIEEMERLEMEELEERMEKNPGIWDEIYRNARKVERVKFETNERDEGELERTGQPL CIYEIYNGAGAWPFLHHGSMYRGLSLTTSARRLRSDDVDAVDRLPVLNDTYYRDIFCDIG GMFSIAFRVDKIHKRPWIGFQSWHAVGSKVSLSSRAEKVLEETIQEETKGDVLYFWAHLN VDDGPTQKNRIPTFWSMCDILNGGNCRTAFEDAFRQMYAMPSYIEALPPMPEDGGYWSAL HSWVMPTPSFLEFIMFSRMFADSLDALHMNSRQSMNLSQSMNSSQPTVCLLGSSKLEKKH CYCRVLELLVNVWAYHSARKMVYINPYSGQLEEQHPVEQRRGFMWAKYFNSTLLKSMDED LAEAADDGDHPRERWLWPLTGEVHWQGIYEREREERYRSKMDKKRKAKEKLVERMKHGYK QKPIGR

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_00s0250g00030.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:Un:17268660:17281352:1 gene:VIT_00s0250g00030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAGGATCGGCGTTCGGAGGCCTACACTTGCTCTTATCTTGGGAAACATGAAGAAGAAT CCGCCATCGTTGATGCTGTTTACTGTGATTAAAAATCTCCAAGGACTTGGCTATTTGTTT AAGATTTATGCTGTACATGATGATAACTCTCGCTCCATATGGGAGCAACTGGGTGGTCAA ATTTCAATTCTAAGTCCTGAGATATACAGCCATAATGATTGGACAACTTTTGAAGGCATC ATTGTAGACTCTCTTGAAGCAAAAGAAGCCATTTTAAGCCTTATGCAAGAGCCTTTCTGT TTCATACCACTTATTTGGATAATTCAAGAGGATACACTTGCAAAGCGACTTCCATTCTAT GAGAAACTGGGCTGGGAACATCTTGTTTCTTATTGGAGAAGTGCTTTTAGCAGAGCTGAT GTTGTCGTCTTTCCAGATTTTTCTTTGCCGATGTTATATAGTGTGCTTGACACTGGAAAC TTCTTTGTGATTCCTGCATCGCCAGTAGATGTGTGGGCTGCAGAAAGCTACAGTAAAACC CACTCGAAATATCAGTTAAGAGAGGACCTTGGATTCAATAAAGATGATATGTTGGTTCTA GTTGTTGGAAGTTCTTTCTTCTACGATGAGCTATCATGGGACTATGCTGTAGCAATGAAT GACATAGGACCGCTACTAAGCAAATATGCAAGGAGTAAGAATGCTGGGGCCATGTTTAGA TTTGTCTTTTTATGTGGTAACTCTACTGATGGATATAATGATCATTTGAAGGTATATGGA TATAATGATCATTTGAAGGAGGTTGCTTCACATCTAAAACTTCTTCCTGGTTCTGTAAGG CAATATGGCATGAATAGTGATGTCAATGGTCTCATATTAATGGCTGATGTTGTTATTTAT GCATCATCCCAAGTTGAGCAGGGTTTTCCACCTTTACTTACTCGGGCCATGTCATTTGGA ATCCCTGTTATAGCACCCGATCTTCCTGACATAAGAAAATATGTTGTTGATGGAGTCCAT GTGGTAATTTTTCCAAAAAACAATCCCGATGCCTTGATGAGAGCTTTCTCCCTTTTGATA TCAAATGGAAAACTCTCTAAATTTGCTAAGGCAGTTGCACTCTCTGGAAGGCTACTTGCT AAGAACATGCTGGCATCAGAATGTGTGAATAGTTATGCAAAGCTTCTGGAGAATGTCCTT AGTTTCCCATCGGATGTATTGCTACCAGGTCATATTTCTCAGTCTCAACATGATGCATGG GAGTGGAATTCATTCAGAACTGCAGATATGCCGCTCATTGAGAATGGGAGTGCTTCCATG AGAAAATCTAGTGTTGTTGATGTCCTTGAAGAAACTTTGTCCAACCAGCTTGACTCAGGG AACATTTCCAACAGTGAAACTGAGAATGATGTGCTGACACAGCTAGATTGGGATGTTTTA AGGGAAATAGAAAGCATTGAAGAAATGGAAAGACTAGAAATGGAGGAGCTTGAAGAAAGA ATGGAGAAAAACCCAGGTATATGGGATGAAATATATCGGAATGCTCGAAAAGTTGAAAGG GTTAAGTTTGAAACAAATGAAAGGGATGAAGGAGAGCTAGAAAGGACAGGCCAGCCACTA TGCATTTATGAGATTTATAATGGAGCTGGAGCCTGGCCATTTCTACATCATGGTTCTATG TATCGTGGGTTAAGTCTGACTACAAGTGCAAGGAGATTAAGATCAGATGATGTGGATGCT GTTGATCGGCTTCCTGTCTTGAATGACACATATTATCGGGATATCTTCTGTGATATTGGA GGCATGTTTTCTATTGCATTTAGGGTGGATAAAATTCACAAAAGACCTTGGATTGGGTTT CAATCATGGCATGCTGTTGGAAGTAAGGTTTCATTGTCTTCTAGAGCTGAAAAGGTTCTG GAAGAAACAATACAAGAAGAAACAAAGGGAGATGTATTATACTTCTGGGCTCACCTGAAC GTGGATGATGGACCCACACAAAAAAACCGCATCCCTACATTTTGGTCCATGTGCGACATT TTAAATGGCGGAAACTGCAGAACTGCTTTTGAAGATGCTTTCCGCCAGATGTATGCTATG CCATCATACATAGAAGCACTTCCACCTATGCCTGAAGATGGTGGTTACTGGTCTGCGTTG CATAGCTGGGTGATGCCAACCCCTTCCTTTCTAGAGTTCATAATGTTTTCCAGGATGTTT GCTGATTCACTTGATGCGTTGCATATGAATTCAAGGCAGTCCATGAATTTAAGCCAGTCA ATGAATTCAAGCCAGCCCACAGTATGTTTGTTGGGTTCCTCAAAGCTCGAGAAAAAGCAT TGTTACTGTCGGGTTTTGGAACTCCTGGTCAATGTTTGGGCTTATCATAGTGCCCGAAAG ATGGTTTATATCAATCCATACTCGGGTCAGCTAGAAGAGCAGCATCCTGTTGAACAGAGA AGGGGATTCATGTGGGCAAAGTACTTTAACAGCACATTGTTGAAAAGTATGGATGAAGAT CTAGCAGAGGCAGCTGATGATGGTGACCATCCCAGGGAGAGGTGGTTATGGCCTTTAACA GGAGAAGTGCATTGGCAAGGAATTTATGAGAGGGAGAGGGAAGAGAGATATAGGTCAAAG ATGGATAAGAAGAGAAAAGCAAAGGAGAAACTTGTTGAAAGGATGAAACATGGATACAAG CAGAAGCCAATTGGACGATAAGGACGTTTATTGGTTCTGATAGTGGAATTCTCAACTCCT GATATGGCTACACAGACATACATTTCTTTGACTCAGTGAATGGAGAAGGGTCATGGTGAG GGAGAAACATTTCTTTTCGTATTACTGGAATATATAGTCCAATGACACGAAAGAGAGAGG CAAAAAAAGAGCTTCCTGTCAAAATTATGGCTACTACAGAAATCTTCTAACGAGGTTACT TGAAGCGGCACTAGGGAAATACCACATTCCAGAGGGACCTAACCCATTCTTTTTCACTAT CCAAACACACAAAATGTGTAGTGAAGAGTAA