Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_00s0220g00060.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:Un:14149971:14151329:1 gene:VIT_00s0220g00060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGATTACACTGGATGTGTAGCCATGATTAGGAATTTATGTTTGGAAGGTAAGTTACGT GCAGCTCTATGGCTTCGAAACAAAATGATACAGAAAGGTGTTATCCCTGATGTGCTGACA CACAATTATCTTGTAAATGGACTTTGCAAAGCTGGTGACTTGGAGAAAGCAGACAATCTT GTCAGAGAAATGTTAGAAATAGGTCCCTCTCCAAACTGTGCTACATTCAACACTTTTATC AAGGGTTATTGCCTTAATAATAATGTAGACAAAGCTCTGTATCTTTTCTCCACAATGGCC AATAGTGGTATTGGGCCAAATAAAGTTACTTATAATATACTTATACATGCACTGTGCAAG AAAGGCCTTTTGAAAGATGCTAGAAAGCTTCTTGAAAAGATATTAGATGATGATTGTGGT AAGGAAACATCCGATATAATCACCTCAACTATATTTATGGATGGTTGTTTGAAGAAGGGT GATATGGTCCAGGCTCTTGTTCATTGGGATGAAATGTTGCAAAGGGGTACCCAAATAGAT GTTGTTGCATACAATGTCCTTATCCATGGATTTTGTTTGATTCAAGATATGAACTCTGCA TATAGATATTTCTGTGAAATGTTTAAAAGAGGTTTGCTTCCTGATATTTTTACTTATAAT ACCCTTATAAGTGGTTTTTGCAAAATAGGAAATTTGGATGAAGCTTGTTATATCCATGGT GTTATGTCAAAAATGGGTGCTGCTCCTGATCTGATCTCATACAAAATGATTATTCAAGGC TTATGCATTCATGGAGATGTTATCAGAGCTAATCAGTTTCTTGTTTGTATGCTGGAGAAT TTAATGGTGCCTGAGCCTCTTATATGGAATGTCGTAATTGATGGTCATGGGAGACATGGA GATCTTAGCAACGCTTTGTCCATTAGAGATCAGATGGTGTCTTTTGGTATTCCGCCAAAT GTATTTACTTATAATGCATTGATTCATGCACAAATAAAAGGAGGAAACATTGTTGATGCT CATTCTATAAAGAAGGAGATGCTTTTAAATGGTATTTACCCTGATGTGGTCACCTATAAT TTGTTGATAGGTGCTGCTTGTAATTTTGGGCGCATTCATTTCGCACTTCGGTTATATGAT GAAATGCTGAGAAGAGGGTATGAACCCGATATAATAACTTACACTGAGCTAATCAGAGGT TTTTGTATTAGAGGTCATGTGATGGAGGCAGAAGAACTTTTGGCTAAGTTACAAAGATCT GGTTTATCCATTGATCATGCTCCATTTCAAATACTCATTCAGAAGTACTGCAGAACAAGA GTGCCTGGACGGGCATATGACCTTACCAAACTTGGTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_00s0220g00060.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:Un:14149971:14151329:1 gene:VIT_00s0220g00060 transcript:VIT_00s0220g00060.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MDYTGCVAMIRNLCLEGKLRAALWLRNKMIQKGVIPDVLTHNYLVNGLCKAGDLEKADNL VREMLEIGPSPNCATFNTFIKGYCLNNNVDKALYLFSTMANSGIGPNKVTYNILIHALCK KGLLKDARKLLEKILDDDCGKETSDIITSTIFMDGCLKKGDMVQALVHWDEMLQRGTQID VVAYNVLIHGFCLIQDMNSAYRYFCEMFKRGLLPDIFTYNTLISGFCKIGNLDEACYIHG VMSKMGAAPDLISYKMIIQGLCIHGDVIRANQFLVCMLENLMVPEPLIWNVVIDGHGRHG DLSNALSIRDQMVSFGIPPNVFTYNALIHAQIKGGNIVDAHSIKKEMLLNGIYPDVVTYN LLIGAACNFGRIHFALRLYDEMLRRGYEPDIITYTELIRGFCIRGHVMEAEELLAKLQRS GLSIDHAPFQILIQKYCRTRVPGRAYDLTKLG

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_00s0220g00060.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:Un:14149971:14151329:1 gene:VIT_00s0220g00060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGATTACACTGGATGTGTAGCCATGATTAGGAATTTATGTTTGGAAGGTAAGTTACGT GCAGCTCTATGGCTTCGAAACAAAATGATACAGAAAGGTGTTATCCCTGATGTGCTGACA CACAATTATCTTGTAAATGGACTTTGCAAAGCTGGTGACTTGGAGAAAGCAGACAATCTT GTCAGAGAAATGTTAGAAATAGGTCCCTCTCCAAACTGTGCTACATTCAACACTTTTATC AAGGGTTATTGCCTTAATAATAATGTAGACAAAGCTCTGTATCTTTTCTCCACAATGGCC AATAGTGGTATTGGGCCAAATAAAGTTACTTATAATATACTTATACATGCACTGTGCAAG AAAGGCCTTTTGAAAGATGCTAGAAAGCTTCTTGAAAAGATATTAGATGATGATTGTGGT AAGGAAACATCCGATATAATCACCTCAACTATATTTATGGATGGTTGTTTGAAGAAGGGT GATATGGTCCAGGCTCTTGTTCATTGGGATGAAATGTTGCAAAGGGGTACCCAAATAGAT GTTGTTGCATACAATGTCCTTATCCATGGATTTTGTTTGATTCAAGATATGAACTCTGCA TATAGATATTTCTGTGAAATGTTTAAAAGAGGTTTGCTTCCTGATATTTTTACTTATAAT ACCCTTATAAGTGGTTTTTGCAAAATAGGAAATTTGGATGAAGCTTGTTATATCCATGGT GTTATGTCAAAAATGGGTGCTGCTCCTGATCTGATCTCATACAAAATGATTATTCAAGGC TTATGCATTCATGGAGATGTTATCAGAGCTAATCAGTTTCTTGTTTGTATGCTGGAGAAT TTAATGGTGCCTGAGCCTCTTATATGGAATGTCGTAATTGATGGTCATGGGAGACATGGA GATCTTAGCAACGCTTTGTCCATTAGAGATCAGATGGTGTCTTTTGGTATTCCGCCAAAT GTATTTACTTATAATGCATTGATTCATGCACAAATAAAAGGAGGAAACATTGTTGATGCT CATTCTATAAAGAAGGAGATGCTTTTAAATGGTATTTACCCTGATGTGGTCACCTATAAT TTGTTGATAGGTGCTGCTTGTAATTTTGGGCGCATTCATTTCGCACTTCGGTTATATGAT GAAATGCTGAGAAGAGGGTATGAACCCGATATAATAACTTACACTGAGCTAATCAGAGGT TTTTGTATTAGAGGTCATGTGATGGAGGCAGAAGAACTTTTGGCTAAGTTACAAAGATCT GGTTTATCCATTGATCATGCTCCATTTCAAATACTCATTCAGAAGTACTGCAGAACAAGA GTGCCTGGACGGGCATATGACCTTACCAAACTTGGTTAA