Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_00s0215g00040.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:Un:13536489:13543310:1 gene:VIT_00s0215g00040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGCGACGAAGGTGAGCTCCGCCGGTGGCCTTTTAGCGATGCTGAACGAGAGCCATCCC
ATGCTCAAGTTTCACGCACTCTCCAATCTCAACGCTTTCGTTGACTATTTCTGGCCTGAG
ATCTCCACCAGCGTACCCATCATAGAAAGTTTATATGAAGATGAAGAGTTTGATCAAAGA
CAAAGGCAACTTGCTGCATTGCTAGTTTCAAAGGTTTTCTATTACCTAGGCGAGCTCAAT
GACTCGTTGTCGTACGCACTTGGAGCTGGTCCCTTATTTGATGTTTCAGAGGATTCTGAT
TATGTACACACTCTTCTTGCTAAAGCTATAGATGAATATGCCAGTCTTAAGTCTAAGGCA
GCAGAATCAAATAATGAAGCGCTGGTGGATCCTCGGTTGGAGGCAATTGTGGAGAGAATG
TTGGATAAGTGTATTGTGGATGGAAGATACCAACAAGCTATGGGAATGGCAGTTGAATGC
AGAAGATTGGATAAACTTGAGGAAGCAATCTCTAGGAGTGATAATGTTCATGGAACTCTG
TCATATTGCATTAACATCTCTCATTCCTTTGTTAATCGTAGAGAATATCGCCATGAGGTT
CTTCGTCGTCTTGTTAAAGTGTATCAAAAGCTTCCATCTCCTGATTATTTGAGTATTTGC
CAGTGTCTGATGTTCTTGGATGAACCTGAAGGTGTTGCAAGCATATTAGAAAAGCTCCTT
CGTTCTGAAAATAAAGATGATGCTCTGCTGGCATTTCAAATAGCCTTTGATCTTGTAGAG
AATGAGCACCAAGCTTTTCTCTTGAATGTGAGAGATCGCCTTTCTAATCCCAGGTCTCAA
CCTTCTGAATCAGTGCAGCCAGGAAACAATGATACTGATTCTACTCAAAATGGAAATCCT
GGTGCCTCAGAGGATGTTGAGATGGCAGATGGATCTCATGCTTCTAATGGGAGTCAGCAT
GAAATGGATCCTATTGAAGCATCATATGCTGAGAGACTGACAAAAATCAAGGGAGTTTTG
TCTGGAGAGACATTGATACAATTGACTCTACAGTTTTTATATAGTCATAACAAATCGGAT
CTTCTAATTCTAAAGACAATAAAGCAATCTGTTGAGATGAGAAATAGTGTCTGCCACAGT
GCAACAATTTATGCTAATGCAATTATGCATGCTGGGACAACAGTGGATACATTTCTCAGG
GAGAATCTGGACTGGCTGAGCAGAGCCACAAATTGGGCTAAGTTCAGTGCAACAGCAGGG
CTAGGTGTGATTCATAGAGGCCACCTGCAACAGGGAAGGTCACTGATGGCGCCTTACTTG
CCTCAGAGTGGGGCTGGTGGTGGTGGCAGTCCATACTCAGAAGGTGGAGCCCTCTATGCT
CTTGGTCTGATTCATGCTAACCATGGAGAGGGAATCAAGCAATTCCTTCGTGATAGCTTG
CGCAGTAGCAATGTTGAGGTTATACAGCATGGTGCATGCTTGGGTCTTGGTTTAGCTGCT
CTTGGGACTGCTGATGAAGATGTCTATGACGATATAAAAAATGTGCTCTATACTGACAGT
GCTGTTGCTGGTGAAGCAGCTGGCATCAGTATGGGTTTACTAATGGTTGGTACTGCAAGT
GAGAAGGCAAGTGAGATGCTTGCTTATGCACATGAGACACAGCATGAGAAGATTATTAGG
GGTTTAGCATTGGGAATAGCCCTTACGGTGTATGGAAGAGAAGAAGAAGCTGACACATTG
ATTGAGCAGATGACTAGGGATCAGGATCCTATACTACGTTATGGTGGTATGTATGCATTG
GCCTTGGCCTACCAAGGAACAGCAAACAACAAGGCCATTCGCCAGCTGTTGCACTTTGCT
GTATCAGATGTGAGTGATGATGTCAGAGGAACCGCTGAATTTCCTGTTGTTGGTAGTGGC
TGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_00s0215g00040.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:Un:13536489:13543310:1 gene:VIT_00s0215g00040 transcript:VIT_00s0215g00040.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MATKVSSAGGLLAMLNESHPMLKFHALSNLNAFVDYFWPEISTSVPIIESLYEDEEFDQR
QRQLAALLVSKVFYYLGELNDSLSYALGAGPLFDVSEDSDYVHTLLAKAIDEYASLKSKA
AESNNEALVDPRLEAIVERMLDKCIVDGRYQQAMGMAVECRRLDKLEEAISRSDNVHGTL
SYCINISHSFVNRREYRHEVLRRLVKVYQKLPSPDYLSICQCLMFLDEPEGVASILEKLL
RSENKDDALLAFQIAFDLVENEHQAFLLNVRDRLSNPRSQPSESVQPGNNDTDSTQNGNP
GASEDVEMADGSHASNGSQHEMDPIEASYAERLTKIKGVLSGETLIQLTLQFLYSHNKSD
LLILKTIKQSVEMRNSVCHSATIYANAIMHAGTTVDTFLRENLDWLSRATNWAKFSATAG
LGVIHRGHLQQGRSLMAPYLPQSGAGGGGSPYSEGGALYALGLIHANHGEGIKQFLRDSL
RSSNVEVIQHGACLGLGLAALGTADEDVYDDIKNVLYTDSAVAGEAAGISMGLLMVGTAS
EKASEMLAYAHETQHEKIIRGLALGIALTVYGREEEADTLIEQMTRDQDPILRYGGMYAL
ALAYQGTANNKAIRQLLHFAVSDVSDDVRGTAEFPVVGSG

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_00s0215g00040.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:Un:13536489:13543310:1 gene:VIT_00s0215g00040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

CTCTAAATTTTCTTCGTAAGCGCCAACCCTAGCCAAGACTACCAGAGACTTGGAACCCTA
GAGCTTGGTGTTGCAGCTATGGCGACGAAGGTGAGCTCCGCCGGTGGCCTTTTAGCGATG
CTGAACGAGAGCCATCCCATGCTCAAGTTTCACGCACTCTCCAATCTCAACGCTTTCGTT
GACTATTTCTGGCCTGAGATCTCCACCAGCGTACCCATCATAGAAAGTTTATATGAAGAT
GAAGAGTTTGATCAAAGACAAAGGCAACTTGCTGCATTGCTAGTTTCAAAGGTTTTCTAT
TACCTAGGCGAGCTCAATGACTCGTTGTCGTACGCACTTGGAGCTGGTCCCTTATTTGAT
GTTTCAGAGGATTCTGATTATGTACACACTCTTCTTGCTAAAGCTATAGATGAATATGCC
AGTCTTAAGTCTAAGGCAGCAGAATCAAATAATGAAGCGCTGGTGGATCCTCGGTTGGAG
GCAATTGTGGAGAGAATGTTGGATAAGTGTATTGTGGATGGAAGATACCAACAAGCTATG
GGAATGGCAGTTGAATGCAGAAGATTGGATAAACTTGAGGAAGCAATCTCTAGGAGTGAT
AATGTTCATGGAACTCTGTCATATTGCATTAACATCTCTCATTCCTTTGTTAATCGTAGA
GAATATCGCCATGAGGTTCTTCGTCGTCTTGTTAAAGTGTATCAAAAGCTTCCATCTCCT
GATTATTTGAGTATTTGCCAGTGTCTGATGTTCTTGGATGAACCTGAAGGTGTTGCAAGC
ATATTAGAAAAGCTCCTTCGTTCTGAAAATAAAGATGATGCTCTGCTGGCATTTCAAATA
GCCTTTGATCTTGTAGAGAATGAGCACCAAGCTTTTCTCTTGAATGTGAGAGATCGCCTT
TCTAATCCCAGGTCTCAACCTTCTGAATCAGTGCAGCCAGGAAACAATGATACTGATTCT
ACTCAAAATGGAAATCCTGGTGCCTCAGAGGATGTTGAGATGGCAGATGGATCTCATGCT
TCTAATGGGAGTCAGCATGAAATGGATCCTATTGAAGCATCATATGCTGAGAGACTGACA
AAAATCAAGGGAGTTTTGTCTGGAGAGACATTGATACAATTGACTCTACAGTTTTTATAT
AGTCATAACAAATCGGATCTTCTAATTCTAAAGACAATAAAGCAATCTGTTGAGATGAGA
AATAGTGTCTGCCACAGTGCAACAATTTATGCTAATGCAATTATGCATGCTGGGACAACA
GTGGATACATTTCTCAGGGAGAATCTGGACTGGCTGAGCAGAGCCACAAATTGGGCTAAG
TTCAGTGCAACAGCAGGGCTAGGTGTGATTCATAGAGGCCACCTGCAACAGGGAAGGTCA
CTGATGGCGCCTTACTTGCCTCAGAGTGGGGCTGGTGGTGGTGGCAGTCCATACTCAGAA
GGTGGAGCCCTCTATGCTCTTGGTCTGATTCATGCTAACCATGGAGAGGGAATCAAGCAA
TTCCTTCGTGATAGCTTGCGCAGTAGCAATGTTGAGGTTATACAGCATGGTGCATGCTTG
GGTCTTGGTTTAGCTGCTCTTGGGACTGCTGATGAAGATGTCTATGACGATATAAAAAAT
GTGCTCTATACTGACAGTGCTGTTGCTGGTGAAGCAGCTGGCATCAGTATGGGTTTACTA
ATGGTTGGTACTGCAAGTGAGAAGGCAAGTGAGATGCTTGCTTATGCACATGAGACACAG
CATGAGAAGATTATTAGGGGTTTAGCATTGGGAATAGCCCTTACGGTGTATGGAAGAGAA
GAAGAAGCTGACACATTGATTGAGCAGATGACTAGGGATCAGGATCCTATACTACGTTAT
GGTGGTATGTATGCATTGGCCTTGGCCTACCAAGGAACAGCAAACAACAAGGCCATTCGC
CAGCTGTTGCACTTTGCTGTATCAGATGTGAGTGATGATGTCAGAGGAACCGCTGAATTT
CCTGTTGTTGGTAGTGGCTGAGCGGAGGCAAATAATCTTTGCTAGAGCCTCTGACATCAG
ATGTTGTTGATTTTGTTCGTCAAGGTGCCCTTATTGCA