Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_00s0207g00190.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:Un:12505400:12507857:-1 gene:VIT_00s0207g00190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGAGAGGACTCAAGCTGCTGCATGCCCAAATCATCCTCCACGGATTGACCAATGAGACC
CTTACGCTTGGTAAATTGATTTCTTTCTGTGCTGTTGATGATGCCGGCGATCTCCAATAT
GCGCAGCGCATGTTCGACCAAATACCCCAACCCAACAAATTCATGTACAATAGTTTGATT
AGGGGGTATTCAAATAGTGATGACCCAATAGACGCTGTTTTACTTTTCCGTCGGATGATT
TGTTCTGGCCTTTCCCCCAATGAATTCACTTTGCCTTTCGTTCTTAAGGCTTGTGGTTGC
AAATCAGCATACTGGGAAGCTGTTCTTGTTCATGGGCTCGCCATCAAATTGGGAATTGGA
TCCCTAGTTTTTGTGCAAAATGCTCTCATTGCTGTTTATGTTGTTTGTGGGTTGATTCAT
TGTGCGCGGAAACTGTTTGATGATATTACTGATAAAACTCTCGTTTCTTGGAATTCGATG
ATTGGTGGGTATGCTCATATGGGTAATTGGAAGGAAGCCTTTTTGCTGTTTCGGAAGATG
AGAGAATGGGGAATGGAACCTGATGGGTTTACTTTTGTTAATCTGCTTTCTGTGTGTTCT
CAAAGTCGTGATTTAGATTTGGGAAGATATGTGCACTTTTGTATAGAGATTACTGGGGTT
AAGATTGATATAATAGTGAGAAATGCTCTCGTGGATATGTATGCTAAGTGTGGGAATTTG
CATTCAGCTCAAGCAATTTTTGACCGAACCCAGGAGAAAAACGTGGTGTCATGGACTTCA
ATGATTAGTGCCTACGCTCAACATGGGTCCATTGAAGTTGCTCGTCAAATTTTTGACCAA
ATGCCTGGGAAAAATGTTGTTTCTTGGAATTCTATGATTTCTTGCTACCTTCGGGAAGGT
CAATACAGGGAAGCCTTGGATCTCTTCAACAAGATGCGTAATTCAAGAGTGGTGCCTGAT
GAGGCTACCCTGGTTAGCATTCTTGCAGCTTGTAGTCAACTTGGTGATTTGGTCATGGGA
AAGAAAATCCACAATTACATACTCAGTAACAAAGGCGCATATGGTGTTACACTGTATAAT
TCCCTTATAGACATGTATGCAAAATGTGGTCCTGTTGTAACCGCCCTGGACATCTTTTTG
GAAATGCCAGGGAAGAATTTGGTGTCATGGAATGTCATCATTGGGGCGCTTGCACTGCAT
GGGTGTGGATTGGAAGCAATCAAGCTCTTTGAGGAGATGCAAGCTGATGGGACGTTGCCT
GATGAGATCACATTGACAGGGTTGCTTTCTGCTTGCAGTCATAGCGGCCTCGTAGACATG
GGCCTATATTACTTTGACAGAATGGGTGTGATTTACAGAGTACCGCGTGAAATAGAGCAT
TATGCTTGCATGGTGGATCTACTTGGGCGAGGGGGCCTCTTGGGGGAGGCTATTGAGCTG
ATAGGAAGAATGCCAATGAAGCCGGATGTTGTGGTTTGGGGTGCTTTGCTAGGTGCCTGT
AGGATTCATGGAAATGTAGAGATTGGAAAGCAAATTCTAAAACAGCTATTGGAGTTGGAG
CCGCACAGTGGAGGGCTTTATGTGCTTATCTCAAACATATATTGGGAAGCTCAAAGATGG
GAGGATGTGAAGAAGATTAGGAAACTGATGATAGACCGTGGGATCAAAAAGGGTAGAGCA
ATTAGCTCGATCGAGATCGATGGTTGTATTTATGAATTCATGGTTGACGACAAAAGACAT
AAAATATCGAGCAGCATCTATGCAATGCTTGATCAATTAACTGACCACCTGAGATCTGCA
GGCTATTTATGCAACATTTCAAGTGTGTTTTTCGAAGCAGAGGAAATTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_00s0207g00190.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:Un:12505400:12507857:-1 gene:VIT_00s0207g00190 transcript:VIT_00s0207g00190.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MRGLKLLHAQIILHGLTNETLTLGKLISFCAVDDAGDLQYAQRMFDQIPQPNKFMYNSLI
RGYSNSDDPIDAVLLFRRMICSGLSPNEFTLPFVLKACGCKSAYWEAVLVHGLAIKLGIG
SLVFVQNALIAVYVVCGLIHCARKLFDDITDKTLVSWNSMIGGYAHMGNWKEAFLLFRKM
REWGMEPDGFTFVNLLSVCSQSRDLDLGRYVHFCIEITGVKIDIIVRNALVDMYAKCGNL
HSAQAIFDRTQEKNVVSWTSMISAYAQHGSIEVARQIFDQMPGKNVVSWNSMISCYLREG
QYREALDLFNKMRNSRVVPDEATLVSILAACSQLGDLVMGKKIHNYILSNKGAYGVTLYN
SLIDMYAKCGPVVTALDIFLEMPGKNLVSWNVIIGALALHGCGLEAIKLFEEMQADGTLP
DEITLTGLLSACSHSGLVDMGLYYFDRMGVIYRVPREIEHYACMVDLLGRGGLLGEAIEL
IGRMPMKPDVVVWGALLGACRIHGNVEIGKQILKQLLELEPHSGGLYVLISNIYWEAQRW
EDVKKIRKLMIDRGIKKGRAISSIEIDGCIYEFMVDDKRHKISSSIYAMLDQLTDHLRSA
GYLCNISSVFFEAEEI

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_00s0207g00190.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:Un:12505400:12507857:-1 gene:VIT_00s0207g00190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

TTTTCTCCTTTGTCTGGCCATTGCCGTTTGTTATAGAAATCAAATTAGCCATTGATAAAG
TCACGGTATGGTACAAATTAAGATAGCCTTCAACCTGTAAATTTAAAATCTTGAATGATG
CAATTGTAGCAATGTGTATTTGATAAACTAGGAAAGGCCAATTACTACTTGATTTGACCT
AACTTCAAATAAGAATGAATGGATTAAATGTTAAAAAAATGCTCATCCATGAGAGGACTC
AAGCTGCTGCATGCCCAAATCATCCTCCACGGATTGACCAATGAGACCCTTACGCTTGGT
AAATTGATTTCTTTCTGTGCTGTTGATGATGCCGGCGATCTCCAATATGCGCAGCGCATG
TTCGACCAAATACCCCAACCCAACAAATTCATGTACAATAGTTTGATTAGGGGGTATTCA
AATAGTGATGACCCAATAGACGCTGTTTTACTTTTCCGTCGGATGATTTGTTCTGGCCTT
TCCCCCAATGAATTCACTTTGCCTTTCGTTCTTAAGGCTTGTGGTTGCAAATCAGCATAC
TGGGAAGCTGTTCTTGTTCATGGGCTCGCCATCAAATTGGGAATTGGATCCCTAGTTTTT
GTGCAAAATGCTCTCATTGCTGTTTATGTTGTTTGTGGGTTGATTCATTGTGCGCGGAAA
CTGTTTGATGATATTACTGATAAAACTCTCGTTTCTTGGAATTCGATGATTGGTGGGTAT
GCTCATATGGGTAATTGGAAGGAAGCCTTTTTGCTGTTTCGGAAGATGAGAGAATGGGGA
ATGGAACCTGATGGGTTTACTTTTGTTAATCTGCTTTCTGTGTGTTCTCAAAGTCGTGAT
TTAGATTTGGGAAGATATGTGCACTTTTGTATAGAGATTACTGGGGTTAAGATTGATATA
ATAGTGAGAAATGCTCTCGTGGATATGTATGCTAAGTGTGGGAATTTGCATTCAGCTCAA
GCAATTTTTGACCGAACCCAGGAGAAAAACGTGGTGTCATGGACTTCAATGATTAGTGCC
TACGCTCAACATGGGTCCATTGAAGTTGCTCGTCAAATTTTTGACCAAATGCCTGGGAAA
AATGTTGTTTCTTGGAATTCTATGATTTCTTGCTACCTTCGGGAAGGTCAATACAGGGAA
GCCTTGGATCTCTTCAACAAGATGCGTAATTCAAGAGTGGTGCCTGATGAGGCTACCCTG
GTTAGCATTCTTGCAGCTTGTAGTCAACTTGGTGATTTGGTCATGGGAAAGAAAATCCAC
AATTACATACTCAGTAACAAAGGCGCATATGGTGTTACACTGTATAATTCCCTTATAGAC
ATGTATGCAAAATGTGGTCCTGTTGTAACCGCCCTGGACATCTTTTTGGAAATGCCAGGG
AAGAATTTGGTGTCATGGAATGTCATCATTGGGGCGCTTGCACTGCATGGGTGTGGATTG
GAAGCAATCAAGCTCTTTGAGGAGATGCAAGCTGATGGGACGTTGCCTGATGAGATCACA
TTGACAGGGTTGCTTTCTGCTTGCAGTCATAGCGGCCTCGTAGACATGGGCCTATATTAC
TTTGACAGAATGGGTGTGATTTACAGAGTACCGCGTGAAATAGAGCATTATGCTTGCATG
GTGGATCTACTTGGGCGAGGGGGCCTCTTGGGGGAGGCTATTGAGCTGATAGGAAGAATG
CCAATGAAGCCGGATGTTGTGGTTTGGGGTGCTTTGCTAGGTGCCTGTAGGATTCATGGA
AATGTAGAGATTGGAAAGCAAATTCTAAAACAGCTATTGGAGTTGGAGCCGCACAGTGGA
GGGCTTTATGTGCTTATCTCAAACATATATTGGGAAGCTCAAAGATGGGAGGATGTGAAG
AAGATTAGGAAACTGATGATAGACCGTGGGATCAAAAAGGGTAGAGCAATTAGCTCGATC
GAGATCGATGGTTGTATTTATGAATTCATGGTTGACGACAAAAGACATAAAATATCGAGC
AGCATCTATGCAATGCTTGATCAATTAACTGACCACCTGAGATCTGCAGGCTATTTATGC
AACATTTCAAGTGTGTTTTTCGAAGCAGAGGAAATTTAG