Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_00s0179g00220.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:Un:7481806:7484925:1 gene:VIT_00s0179g00220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCTGCGCCAATTCCATCCTTTTATTTGAACTGCCACCCAGTCCTGAAGAAAATCCAT CAAAACCCACCTCTCAAAATCTCCAAATTCCCTCTAAAACCCGTTGAAACTCCTTCTCTC AGAGAGATTTGCAAACGTGGGAGCGTCAATGAAGCTTTTCAATCGCTTACCGATCTGTTT GCGAACCAAAGCCCATCTCAGTTTTCTCTGGATGAGGCTTATTCATCAGTTCTCGAGCTC TGTGGAAGCAAGAAAGCTTTGTCAGAAGGACAGCAAGTTCATGCCCATATGATAACCTCT AATGCTTTGTTCAATTCTGTGTTTCTGAGTACTAGGCTTGTGTTTATGTATGGTAAGTGT GGATGTCTTGTGGATGCTGAGAAGTTGTTTGATGGAATGCCTCATAAAACTATTTTCACA TGGAATGCCATGATTGGTGCTTATGTTACAAACGGAGAACCATTAGGCTCCCTTGAATTG TATCGAGAAATGCGGGTTTCTGGAATTCCTCTTGATGCTTGTACCTTTCCCTGTATTCTT AAAGCATGTGGTCTGCTTAAAGATCGCCGCTGTGGGGCTGAAGTTCATGGTTTAGCAATC AAAGAAGGATATGTTTCAATTGTGTTTGTTGCCAATTCAATAGTGGGTATGTACACAAAG TGCAATGATCTTAATGGGGCAAGGCAGTTGTTTGATAGAATGCCGGAAAAAGAGGATGTT GTATCCTGGAATTCGATGATTTCTGCATATTCTTCAAATGGCCAGTCCATTGAGGCATTG AGACTGTTCGGAGAAATGCAGAAGGCTAGTCTGGCTCCCAACACCTATACTTTTGTTGCT GCTCTTCAAGCCTGTGAAGACTCTTCCTTCATTAAACAAGGTATGTTCATCCATGCCACT GTCCTCAAATCTAGTTACTATATCAATGTTTTCGTGGCCAATGCTTTGATTGCAATGTAT GCAAGATTTGGCAAAATGGGTGAAGCTGCAAACATCTTTTATAATATGGATGATTGGGAT ACTATATCATGGAATTCAATGCTCTCTGGTTTTGTCCAAAATGGTCTTTACCACGAAGCT CTGCAATTCTACCATGAGATGAGGGATGCAGGTCAGAAGCCTGACCTGGTTGCCGTCATA AGCATCATAGCAGCATCTGCTCGATCAGGAAACACACTTAATGGAATGCAAATTCATGCT TACGCAATGAAAAATGGGTTAGACTCGGATTTGCAGGTTGGAAACTCACTTGTAGACATG TATGCAAAATTTTGTTCAATGAAATATATGGATTGTATTTTTGATAAGATGCCTGATAAA GACGTTGTTTCTTGGACAACGATCATTGCTGGCCATGCTCAGAATGGTAGTCACTCAAGA GCCTTAGAATTGTTCAGGGAAGTACAGTTGGAAGGTATTGATCTTGATGTGATGATGATT AGCAGCATCCTGCTGGCTTGCAGTGGGTTGAAACTCATTTCCTCTGTGAAAGAAATTCAT AGCTACATCATCAGGAAGGGTCTATCAGACCTCGTGCTGCAGAATGGGATTGTGGATGTA TATGGAGAGTGTGGGAATGTAGATTATGCGGCTCGAATGTTTGAACTGATTGAATTTAAA GATGTGGTATCTTGGACTAGCATGATATCTTGTTATGTCCATAATGGACTTGCAAATGAA GCTCTTGAACTTTTCCACCTGATGAAAGAAACTGGGGTTGAACCTGATTCGATTTCACTG GTAAGCATACTCTCTGCAGCTGCTAGTTTGTCTGCATTGAAGAAAGGAAAAGAGATTCAT GGTTTTTTGATCAGGAAAGGCTTCGTCTTAGAGGGGTCTCTTGCGAGCACGCTTGTGGAC ATGTATGCCCGCTGTGGAACTCTGGAGAAATCGCGTAATGTGTTCAATTTTATCAGAAAT AAAGACTTGGTTCTGTGGACTAGTATGATCAATGCATATGGAATGCATGGCTGTGGTAGG GCAGCCATTGATTTGTTCAGAAGGATGGAGGATGAAAGCATTGCTCCTGATCATATTGCC TTTGTGGCAGTTCTTTACGCGTGCAGCCATTCAGGATTGATGAATGAAGGTAGAAGATTC CTGGAAAGTATGAAATATGAGTATCAATTGGAGCCATGGCCAGAGCATTATGTTTGTCTG GTTGATCTTCTTGGACGGGCAAATCACTTAGAAGAGGCATACCAGTTTGTGAAGGGCATG GAGGTTGAGCCTACTGCTGAGGTCTGGTGTGCTTTGCTTGGGGCTTGCCAGATTCACTCA AACAAAGAATTGGGTGAAATTGCAGCTCAGAAGCTCCTTGAGATGGATCCAGAGAATCCG GGAAATTACGTGCTGGTATCAAATGTGTATGCTGCAGAACGAAGATGGAAAGATGTAGAA GAAGTGAGAATGAGAATGAAAGCCAGTGGATTGAAGAAGAATCCTGGATGTAGTTGGATT GAAGTTGGAAACAAGGTCCATACATTCATGGCAAGGGACAAGTCTCATCCACAGTCCTAT GAGATTTATTCAAAATTATCTCAAATCACTGAGAAGTTGGCAAAGGAGGGAGGCTATGTA GCTCAGACCAAGTTTGTTCTTCACAATGCCAAGGAAGAAGAGAAGGTTCAGATGCTTTAT GGCCACAGTGAACGGCTGGCGATCGCGTATGGTATGCTCACAACTCCTGAGGGCGCCAGT CTTAGAATCACAAAGAATCTTCGTGTCTGTGGCGATTGCCATAACTTCTGTAAGTTAATC TCAAAATTCTTTGAACGAGAACTTGTCATGAGGGATGCCAACAGATTTCATCATTTCAAG GGTGGGGTTTGTTCATGTGGAGATGTCTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_00s0179g00220.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:Un:7481806:7484925:1 gene:VIT_00s0179g00220 transcript:VIT_00s0179g00220.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MAAPIPSFYLNCHPVLKKIHQNPPLKISKFPLKPVETPSLREICKRGSVNEAFQSLTDLF ANQSPSQFSLDEAYSSVLELCGSKKALSEGQQVHAHMITSNALFNSVFLSTRLVFMYGKC GCLVDAEKLFDGMPHKTIFTWNAMIGAYVTNGEPLGSLELYREMRVSGIPLDACTFPCIL KACGLLKDRRCGAEVHGLAIKEGYVSIVFVANSIVGMYTKCNDLNGARQLFDRMPEKEDV VSWNSMISAYSSNGQSIEALRLFGEMQKASLAPNTYTFVAALQACEDSSFIKQGMFIHAT VLKSSYYINVFVANALIAMYARFGKMGEAANIFYNMDDWDTISWNSMLSGFVQNGLYHEA LQFYHEMRDAGQKPDLVAVISIIAASARSGNTLNGMQIHAYAMKNGLDSDLQVGNSLVDM YAKFCSMKYMDCIFDKMPDKDVVSWTTIIAGHAQNGSHSRALELFREVQLEGIDLDVMMI SSILLACSGLKLISSVKEIHSYIIRKGLSDLVLQNGIVDVYGECGNVDYAARMFELIEFK DVVSWTSMISCYVHNGLANEALELFHLMKETGVEPDSISLVSILSAAASLSALKKGKEIH GFLIRKGFVLEGSLASTLVDMYARCGTLEKSRNVFNFIRNKDLVLWTSMINAYGMHGCGR AAIDLFRRMEDESIAPDHIAFVAVLYACSHSGLMNEGRRFLESMKYEYQLEPWPEHYVCL VDLLGRANHLEEAYQFVKGMEVEPTAEVWCALLGACQIHSNKELGEIAAQKLLEMDPENP GNYVLVSNVYAAERRWKDVEEVRMRMKASGLKKNPGCSWIEVGNKVHTFMARDKSHPQSY EIYSKLSQITEKLAKEGGYVAQTKFVLHNAKEEEKVQMLYGHSERLAIAYGMLTTPEGAS LRITKNLRVCGDCHNFCKLISKFFERELVMRDANRFHHFKGGVCSCGDVW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_00s0179g00220.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:Un:7481806:7484925:1 gene:VIT_00s0179g00220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCTGCGCCAATTCCATCCTTTTATTTGAACTGCCACCCAGTCCTGAAGAAAATCCAT CAAAACCCACCTCTCAAAATCTCCAAATTCCCTCTAAAACCCGTTGAAACTCCTTCTCTC AGAGAGATTTGCAAACGTGGGAGCGTCAATGAAGCTTTTCAATCGCTTACCGATCTGTTT GCGAACCAAAGCCCATCTCAGTTTTCTCTGGATGAGGCTTATTCATCAGTTCTCGAGCTC TGTGGAAGCAAGAAAGCTTTGTCAGAAGGACAGCAAGTTCATGCCCATATGATAACCTCT AATGCTTTGTTCAATTCTGTGTTTCTGAGTACTAGGCTTGTGTTTATGTATGGTAAGTGT GGATGTCTTGTGGATGCTGAGAAGTTGTTTGATGGAATGCCTCATAAAACTATTTTCACA TGGAATGCCATGATTGGTGCTTATGTTACAAACGGAGAACCATTAGGCTCCCTTGAATTG TATCGAGAAATGCGGGTTTCTGGAATTCCTCTTGATGCTTGTACCTTTCCCTGTATTCTT AAAGCATGTGGTCTGCTTAAAGATCGCCGCTGTGGGGCTGAAGTTCATGGTTTAGCAATC AAAGAAGGATATGTTTCAATTGTGTTTGTTGCCAATTCAATAGTGGGTATGTACACAAAG TGCAATGATCTTAATGGGGCAAGGCAGTTGTTTGATAGAATGCCGGAAAAAGAGGATGTT GTATCCTGGAATTCGATGATTTCTGCATATTCTTCAAATGGCCAGTCCATTGAGGCATTG AGACTGTTCGGAGAAATGCAGAAGGCTAGTCTGGCTCCCAACACCTATACTTTTGTTGCT GCTCTTCAAGCCTGTGAAGACTCTTCCTTCATTAAACAAGGTATGTTCATCCATGCCACT GTCCTCAAATCTAGTTACTATATCAATGTTTTCGTGGCCAATGCTTTGATTGCAATGTAT GCAAGATTTGGCAAAATGGGTGAAGCTGCAAACATCTTTTATAATATGGATGATTGGGAT ACTATATCATGGAATTCAATGCTCTCTGGTTTTGTCCAAAATGGTCTTTACCACGAAGCT CTGCAATTCTACCATGAGATGAGGGATGCAGGTCAGAAGCCTGACCTGGTTGCCGTCATA AGCATCATAGCAGCATCTGCTCGATCAGGAAACACACTTAATGGAATGCAAATTCATGCT TACGCAATGAAAAATGGGTTAGACTCGGATTTGCAGGTTGGAAACTCACTTGTAGACATG TATGCAAAATTTTGTTCAATGAAATATATGGATTGTATTTTTGATAAGATGCCTGATAAA GACGTTGTTTCTTGGACAACGATCATTGCTGGCCATGCTCAGAATGGTAGTCACTCAAGA GCCTTAGAATTGTTCAGGGAAGTACAGTTGGAAGGTATTGATCTTGATGTGATGATGATT AGCAGCATCCTGCTGGCTTGCAGTGGGTTGAAACTCATTTCCTCTGTGAAAGAAATTCAT AGCTACATCATCAGGAAGGGTCTATCAGACCTCGTGCTGCAGAATGGGATTGTGGATGTA TATGGAGAGTGTGGGAATGTAGATTATGCGGCTCGAATGTTTGAACTGATTGAATTTAAA GATGTGGTATCTTGGACTAGCATGATATCTTGTTATGTCCATAATGGACTTGCAAATGAA GCTCTTGAACTTTTCCACCTGATGAAAGAAACTGGGGTTGAACCTGATTCGATTTCACTG GTAAGCATACTCTCTGCAGCTGCTAGTTTGTCTGCATTGAAGAAAGGAAAAGAGATTCAT GGTTTTTTGATCAGGAAAGGCTTCGTCTTAGAGGGGTCTCTTGCGAGCACGCTTGTGGAC ATGTATGCCCGCTGTGGAACTCTGGAGAAATCGCGTAATGTGTTCAATTTTATCAGAAAT AAAGACTTGGTTCTGTGGACTAGTATGATCAATGCATATGGAATGCATGGCTGTGGTAGG GCAGCCATTGATTTGTTCAGAAGGATGGAGGATGAAAGCATTGCTCCTGATCATATTGCC TTTGTGGCAGTTCTTTACGCGTGCAGCCATTCAGGATTGATGAATGAAGGTAGAAGATTC CTGGAAAGTATGAAATATGAGTATCAATTGGAGCCATGGCCAGAGCATTATGTTTGTCTG GTTGATCTTCTTGGACGGGCAAATCACTTAGAAGAGGCATACCAGTTTGTGAAGGGCATG GAGGTTGAGCCTACTGCTGAGGTCTGGTGTGCTTTGCTTGGGGCTTGCCAGATTCACTCA AACAAAGAATTGGGTGAAATTGCAGCTCAGAAGCTCCTTGAGATGGATCCAGAGAATCCG GGAAATTACGTGCTGGTATCAAATGTGTATGCTGCAGAACGAAGATGGAAAGATGTAGAA GAAGTGAGAATGAGAATGAAAGCCAGTGGATTGAAGAAGAATCCTGGATGTAGTTGGATT GAAGTTGGAAACAAGGTCCATACATTCATGGCAAGGGACAAGTCTCATCCACAGTCCTAT GAGATTTATTCAAAATTATCTCAAATCACTGAGAAGTTGGCAAAGGAGGGAGGCTATGTA GCTCAGACCAAGTTTGTTCTTCACAATGCCAAGGAAGAAGAGAAGGTTCAGATGCTTTAT GGCCACAGTGAACGGCTGGCGATCGCGTATGGTATGCTCACAACTCCTGAGGGCGCCAGT CTTAGAATCACAAAGAATCTTCGTGTCTGTGGCGATTGCCATAACTTCTGTAAGTTAATC TCAAAATTCTTTGAACGAGAACTTGTCATGAGGGATGCCAACAGATTTCATCATTTCAAG GGTGGGGTTTGTTCATGTGGAGATGTCTGGTGACAATTAAGAATAATGATCAAGATGTTT GTATGACAAAGAACCCCCAAGTTGCAAGAGCTATGGTTTCAGTTGAAGTCTCCCACCCTG CCATACAAAATTAGTGCATGTGGGCAGACCATGGGGGAAAGGAGCATCTCTCCAAGGAAT TTAGTTGGCTTTATGTCCAAGAGGAAGGCTAACTCGATAACTTCAAGTGTCTTGTCTAAG TGCTGCATTGGTGCTATATTCGTGACATTTAGCTTCCTATTCATGCATATAATCTGTTTT