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SNP , Variant , バリアント , 多型 , Brassica rapa , Chinese cabbage, Turnip, Yellow sarson, Purple-stem mustard, Pac-choy, Bok-choy, Birdsrape mustard, Field mustard , アブラナ, 在来ナタネ, ハクサイ, カブ, イエローサルソン, コウサイタイ, タイサイ, チンゲンサイ, アブラナ (oleifera亜種), アブラナ (campestris亜種)

Brassica rapa
ID Population Name Line List Variant
Type
Reference Sequence Sequence Type Variant Counts Data Source Comments Download TASUKE+ JBrowse
Table Vcf
file

t3711.SNP000001

Brassica_rapa_SRA_100_lines_20191102

SNPs, In/dels

Brapa_sequence_v3.0

WGS

4,574,450

Plant GARDEN

Bwa/bcftools 1.9, (QUAL≥200, 10≤DP≤200, max-missing=0.7)