Brassica rapa| ゲノム配列名 | Bio Sample | アセンブリレベル | アノテーション (gff / gff3) |
遺伝子 (cds / gene) |
Hayai Annotation ZEN |
トランスクリプト (cDNA / mRNA) |
タンパク (pep / aa) |
ダウンロード | JBrowse | コメント |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
subsp. pekinensis, inbred line Chiifu-401-42, Chinese cabbage |
Chromosome |
● |
● |
● |
● |
|
|
Chinese Cabbage, accession Chiifu-401-42 |
||
ssp. trilocularis, A doubled haploid line Z1, Yellow sarson |
Chromosome |
● |
● |
● |
● |
|
|
Yellow sarson, A doubled haploid line |
||
ssp. chinensis, cv. PC-fu, Pakchoi |
Chromosome |
● |
● |
● |
|
NA |
||||
ssp. trilocularis, A doubled haploid line Z1, Yellow sarson |
Chromosome |
● |
● |
● |
● |
|
Yellow sarson, A doubled haploid line |
配列の種類 |
Bio Sample | 配列名 | Accession | JBrowse | コメント | |||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Brapa_sequence_v3.0 |
||||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_136 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_140 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_152 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_153 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_160 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_170 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_176 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_186 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_189 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_195 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_196 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_197 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_050 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_053 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_054 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_056 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_057 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_058 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_060 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_072 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_073 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_074 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_077 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_080 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_081 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_087 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_097 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_098 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_099 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Brassica rapa SamA_100 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
a49 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
a71 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
a11 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
a66 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
a68 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
a94 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
a99 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
a10 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
a7 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
a1 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
a88 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
a107 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
a105 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
a106 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
115 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
32 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
34 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
33 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
35 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
192 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
191 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
158 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
7 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
9 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
139 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
140 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
55 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
54 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
110 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
51 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
109 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
28 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
126 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
79 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
78 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
80 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
165 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
164 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
46 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
48 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
60 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
56 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
185 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
181 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
102 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
83 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
105 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
20 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
21 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
121 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
64 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
63 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
168 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
36 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
38 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
39 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
43 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
44 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
96 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
99 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
100 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
142 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
190 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
187 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
186 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
138 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
11 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
49 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
50 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
70 |
|
subsp. pekinensis |
|||||
