配列名:brapa_z1_v2
ゲノム配列名 | brapa_z1_v2 | 系統名 | ssp. trilocularis, A doubled haploid line Z1, Yellow sarson |
配列数 | 210 | 染色体数 | 2n = 2x = 20 |
配列長 (bp) | 443,953,949 | N50長 (bp) | 39,217,719 |
遺伝子の数 | 52,701 | 遺伝子数由来ファイル | GCA_900412535.3_brapa_z1_v2_protein.faa.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Oxford Nanopore, Bionano Optical Mapping, Omni-C | 取得した配列量 | 186x |
アセンブリ方法 | Smartdenovo, Wtdbg2/Redbean, Flye v2.8.3, Necat, bionano solve and tools v1.6.1, 3D-DNA v180419 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | NA |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | Yellow sarson, A doubled haploid line |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Jean-Marc Aury (Paris-Saclay University) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.3390/biology10080732 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |