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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Brassica rapa subsp. trilocularis , Yellow sarson , ヒノナ, イエローサルソン

Brassica rapa

Genome Assembly ID:t3711.G008

配列名:brapa_z1_v2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 brapa_z1_v2 系統名 ssp. trilocularis, A doubled haploid line Z1, Yellow sarson
配列数 210 染色体数 2n = 2x = 20
配列長 (bp) 443,953,949 N50長 (bp) 39,217,719
遺伝子の数 52,701 遺伝子数由来ファイル GCA_900412535.3_brapa_z1_v2_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Oxford Nanopore, Bionano Optical Mapping, Omni-C 取得した配列量 186x
アセンブリ方法 Smartdenovo, Wtdbg2/Redbean, Flye v2.8.3, Necat, bionano solve and tools v1.6.1, 3D-DNA v180419 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Yellow sarson, A doubled haploid line
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jean-Marc Aury (Paris-Saclay University) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.3390/biology10080732 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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