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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Brassica rapa subsp. chinensis , Pakchoi , パクチョイ, パクチー

Brassica rapa

Genome Assembly ID:t3711.G003

配列名:Bchinensis_genome_201910_v2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Bchinensis_genome_201910_v2 系統名 ssp. chinensis, cv. PC-fu, Pakchoi
配列数 1,319 染色体数 2n = 2x = 20
配列長 (bp) 411,504,040 N50長 (bp) 39,389,933
遺伝子の数 52,511 遺伝子数由来ファイル Bchinensis_pep.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, Oxford Nanopore, Hi-C 取得した配列量 73x(Illumina), 147.52x(Oxford Nanopore)
アセンブリ方法 WTDBG2, SMARTdenovo 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Shuang Wu (Fujian Agriculture and Forestry University) データソース名 FigShare
論文 (DOIコード) 10.1093/hr/uhac123 データソースURL https://figshare.com
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
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