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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Brassica rapa subsp. trilocularis , Yellow sarson , ヒノナ, イエローサルソン

Brassica rapa

Genome Assembly ID:t3711.G002

配列名:BrapaZ1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 BrapaZ1 系統名 ssp. trilocularis, A doubled haploid line Z1, Yellow sarson
配列数 304 染色体数 2n = 2x = 20
配列長 (bp) 401,926,910 N50長 (bp) 34,481,995
遺伝子の数 46,721 遺伝子数由来ファイル BrapaZ1_proteins.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 46,721 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Nanopore 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 BioNano optical map 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Yellow sarson, A doubled haploid line
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jean-Marc Aury(Universite Paris-Saclay) データソース名 Chromosome-scale assemblies of plant genomes
論文 (DOIコード) 10.1038/s41477-018-0289-4 データソースURL http://www.genoscope.cns.fr/externe/plants
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.2%[S:84.6%,D:14.6%],F:0.3%,M:0.5%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:96.2%[S:82.8%,D:13.4%],F:1.2%,M:2.6%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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