配列名:BrapaZ1
ゲノム配列名 | BrapaZ1 | 系統名 | ssp. trilocularis, A doubled haploid line Z1, Yellow sarson |
配列数 | 304 | 染色体数 | 2n = 2x = 20 |
配列長 (bp) | 401,926,910 | N50長 (bp) | 34,481,995 |
遺伝子の数 | 46,721 | 遺伝子数由来ファイル | BrapaZ1_proteins.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 46,721 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Nanopore | 取得した配列量 | NA |
アセンブリ方法 | BioNano optical map | 推定ゲノムサイズ (Mb) | NA |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | Yellow sarson, A doubled haploid line |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Jean-Marc Aury(Universite Paris-Saclay) | データソース名 | Chromosome-scale assemblies of plant genomes |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41477-018-0289-4 | データソースURL | http://www.genoscope.cns.fr/externe/plants |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.2%[S:84.6%,D:14.6%],F:0.3%,M:0.5%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:96.2%[S:82.8%,D:13.4%],F:1.2%,M:2.6%,n:1614 |