Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Zea mays ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Zea mays

CDS Sequence

CDS ID	Zm00001d053552_T001
CDS Infomation	cds chromosome:B73_RefGen_v4:4:233795513:233798629:-1 gene:Zm00001d053552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGCCCGACTCCGCCGATCCCCTCCCCACGCAAGCCTCGCCGGATCCGGACATGCCGCCG CGGAAGCCTACAGCTGGCTGCGGCGGCGGCAAGCTCAAGAAGCCTCTCACTGACAAGCAG CGCGCTGCCGCGGAGCAGCGCCTGTCCCACCTCCGCGCCCACCTCATCCTCCGATCCCTC GAGTCCTCAGCTGCCGGGGCCCGTGCCCTACCGCCGGCGCAGGAGGCGGCGCTCGATGCC CTAGGTCTGCTCGAGTTTTTCCGCCTCGACCTGCAATCCGACACCCTGCGCCCCGACCTC ATCGCCCCGCTCGTCGCCTACTACGACCCGGTCTGCAAGCGCAGCTTCGTCCGAGGCGTC CGTGTCGCCGTCTCGCGCCACAACTTTACCCGCGCGCTCTGCCTACCCTCGAAGCCCTCC CCCTCGGCGCCGGCCCCAGCCGACATCGACCCCGCAGCCGTGGTGCCTGCCGTTATGCAG CTCCTGAAGGATTACGTTCTGCTCCCGTTCCTAGGAGACGACATGTGCATACTGCCGCAG GAAGTGGCCGCCGCGGAGCAGGCGGTCAGGGAGGGGGCGGCGCATAGGGTTGACTGGGCG GGCCTGATGTGGGGCCTCGTCGAGAAGGAGATCCTCGAGCTGCCTAAGAGGGAAGACGGG GTGTGCTACTACGGGCCTCATCTGCAGAGGCTCATTTATGCCCAAAAGCCACATTTGTTG GAGCTGGTGGAGGAAGGGGGCACAGGAGAGCCTGCTCCGGAGGCATCCACTGATGTGGAG ATGGAGGAGGATGGTGATGTGGATATGAAAAGCAAGAGCTTGGTGGAGCTGGAGCTGGGG GATAGGGATGGGGATGCCAGTAACGACGTGAGGAGCAAGAGCTTGGAGGAGTCGGAATTG GGAAATGCTAGTGCAAGGAGTGATGGTTTGGACGAGTTGGAATTGGGGGTTTCTGTTACT AGGAACAAGGTCATGGAGGAGTTGGGTTTAGGGGATATGGATGACAGGAACAACAGTATA GAGGAACTAGAGGTGGTTGAGGAAGATGCAAGGAGCAAGAGGTTGGATGAATATGAGTCT GTGGATGTGGATCCGGATGCCATGGATAACAATATAGATGAAATAAACACAGTCAATGAA GACTCAAGGAGGAAAAGCTTGAATGAATCTGAGACTGTGGATGTGGATCCGGATGCCATG GACAACAATATAGATGAAATGCAGGCGGTCAATGAAGACTCAAGGAGCAAGAGCTTGAAT GAATCTGAGGATGTGGATGTGGATCCGCATGCCATGGACAACAATATAGATGAAATGGAG ATGGTCAATGAAGATGCAAGGACCAAGAGCTTGGATGAATCTGAGGCTGTGGATGTGGAT CCGGATGCCATGGACAACAATATAGATGAAATGGAGGCAGTCAGTGAAGATTCAAGGAGC AAGACCTTCAATGAGTCTGAGTCTGTGGATGCCATGAACAACAATATAGTCGAATTGGAT GCGGTCAATGAAGACACAAGGAGCCAGAGATTGAATGATGAATCAGAGTTGGTGGAAGAG GATGTTAAGGGTCCAAACTTAGATGACAAGAACACTGCGGATGAGCATGTCAATGGCACA AACATTGATGGAATATGTTTGGGATTTGTGGCAGTTGAAGTGGTGCCTGCTGTACATGAG GCAAGGCTTGACAATAATGAGGAAACAGCAGAGGTAGCACCAATGGGGGGCGATGATGTG CCAGTGCCTACAGATGTGGATGGTGAAGAACCCTTGGTGGAGGCAGCAGCTGTAACACAG GAGGTAGTGGCTGTTGCAGAGGAATTGGGGGATGATGAGGCTGAGGAGGATGAAGAGAAG GATGCAATGGGATTGAGCTTGGGGTTTGACTCTACCAATGGTTATGTTGCTATGGATGTG GAAGAGGAAACTAATGTTGAGAATCTGGACGAGGATGAGAGTGACAGTGCCAATGAAGAG GCAGAGGAGTCAGAGGATGATGCATTTGAGGTTAATGATGGAGAGGACATGAATTGGAGA ATTGGGGATGGCAGGGGGGATGAGGGAATGTCACATTCTTTGCAACGCTGTAACACATTT GGAGGCATGGAGTTTGAGAACCTGAATGAAGGGGAGACTGTAATGAAGGATGAGTTGAGG TTTGATGATTTCCCTGCGAGGGCATCTTCAGAAAGGATGACACCATCAAACCTCCTCCAA GCCATGAACTCAATTCCCTCAACGTACAATGTAGCAGGGAATGTGCATGATCTGCCTTCT GGGGATTTCTTGGCTATGGGGGCTGATGCACATAAGAATGGAGTGGATCTGGGACCAGGG AGCTCATATTTATTTGGGAATAATGGTAAGAGGAATATTGATGATATTGATGGTTACGAT GACAATATGCAGGCGCAAGAGGACTTTCCTCAGTCTAATCAGCAGAAGAGGATGCGCCAT AGTAACAGTGGCAACATATCACCTGGATCAGGCTTTTTCAACGCAAGCTTTTCGGTACCT ATACAGAACTTGATGGTTGAGGCAAGCAGGCTCTATGAGCAGAAGGAGCAAAAACTTCAG AGTTTGCAATTTGAGAAACAACATTGGTCTGACATGCTGCAAGAGAAGGAAGCCATTATC CAATCCCTAAACTCAGCTCGGTTTGAGCAACAGAACAAGTATCAAGTGGAGCTTAGACGC TTCGAGCATGATCTGAATGTTATGGCCCATTTGGTAACTACCTACAAAAGAGCTTTAAAA CAGACCCGGGCTTCTTTTGATGAGTACAGGAAGAAGTTCCCTTGCAATGTTCCTCTTTAT GATGATGTTGCTGGTGGTGGTGGTCTTGTTCTTAGTGTGAGGGAGTTGGAGAAGAGGCGG TGTGAGGAGGAGCAGCAAAAAATTGCCATGGTAAATGATATGATCGAAAGATTCCAGTAC AAATGGTTCTCAAAGCTTGAAGAGTGGGGACTGTCTGTCAACTCACTGTGGAGCAGAATG GAAGGACTCTATAAGGAGATTGAGCTTCTGAAGGAAAATAGAAGATCAAGATTTGCTACC CCAGCTACAGAGGAATCTCTAGCTACAGAAGAACCTACCCCAGCTACAGAGGAATGA

Peptide Sequence

PEP ID	Zm00001d053552_P001
PEP Infomation	pep chromosome:B73_RefGen_v4:4:233795513:233798629:-1 gene:Zm00001d053552 transcript:Zm00001d053552_T001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MPDSADPLPTQASPDPDMPPRKPTAGCGGGKLKKPLTDKQRAAAEQRLSHLRAHLILRSL ESSAAGARALPPAQEAALDALGLLEFFRLDLQSDTLRPDLIAPLVAYYDPVCKRSFVRGV RVAVSRHNFTRALCLPSKPSPSAPAPADIDPAAVVPAVMQLLKDYVLLPFLGDDMCILPQ EVAAAEQAVREGAAHRVDWAGLMWGLVEKEILELPKREDGVCYYGPHLQRLIYAQKPHLL ELVEEGGTGEPAPEASTDVEMEEDGDVDMKSKSLVELELGDRDGDASNDVRSKSLEESEL GNASARSDGLDELELGVSVTRNKVMEELGLGDMDDRNNSIEELEVVEEDARSKRLDEYES VDVDPDAMDNNIDEINTVNEDSRRKSLNESETVDVDPDAMDNNIDEMQAVNEDSRSKSLN ESEDVDVDPHAMDNNIDEMEMVNEDARTKSLDESEAVDVDPDAMDNNIDEMEAVSEDSRS KTFNESESVDAMNNNIVELDAVNEDTRSQRLNDESELVEEDVKGPNLDDKNTADEHVNGT NIDGICLGFVAVEVVPAVHEARLDNNEETAEVAPMGGDDVPVPTDVDGEEPLVEAAAVTQ EVVAVAEELGDDEAEEDEEKDAMGLSLGFDSTNGYVAMDVEEETNVENLDEDESDSANEE AEESEDDAFEVNDGEDMNWRIGDGRGDEGMSHSLQRCNTFGGMEFENLNEGETVMKDELR FDDFPARASSERMTPSNLLQAMNSIPSTYNVAGNVHDLPSGDFLAMGADAHKNGVDLGPG SSYLFGNNGKRNIDDIDGYDDNMQAQEDFPQSNQQKRMRHSNSGNISPGSGFFNASFSVP IQNLMVEASRLYEQKEQKLQSLQFEKQHWSDMLQEKEAIIQSLNSARFEQQNKYQVELRR FEHDLNVMAHLVTTYKRALKQTRASFDEYRKKFPCNVPLYDDVAGGGGLVLSVRELEKRR CEEEQQKIAMVNDMIERFQYKWFSKLEEWGLSVNSLWSRMEGLYKEIELLKENRRSRFAT PATEESLATEEPTPATEE

Transcript Sequence

Transcript ID	Zm00001d053552_T001
Transcript Infomation	cdna chromosome:B73_RefGen_v4:4:233795513:233798629:-1 gene:Zm00001d053552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGCCCGACTCCGCCGATCCCCTCCCCACGCAAGCCTCGCCGGATCCGGACATGCCGCCG CGGAAGCCTACAGCTGGCTGCGGCGGCGGCAAGCTCAAGAAGCCTCTCACTGACAAGCAG CGCGCTGCCGCGGAGCAGCGCCTGTCCCACCTCCGCGCCCACCTCATCCTCCGATCCCTC GAGTCCTCAGCTGCCGGGGCCCGTGCCCTACCGCCGGCGCAGGAGGCGGCGCTCGATGCC CTAGGTCTGCTCGAGTTTTTCCGCCTCGACCTGCAATCCGACACCCTGCGCCCCGACCTC ATCGCCCCGCTCGTCGCCTACTACGACCCGGTCTGCAAGCGCAGCTTCGTCCGAGGCGTC CGTGTCGCCGTCTCGCGCCACAACTTTACCCGCGCGCTCTGCCTACCCTCGAAGCCCTCC CCCTCGGCGCCGGCCCCAGCCGACATCGACCCCGCAGCCGTGGTGCCTGCCGTTATGCAG CTCCTGAAGGATTACGTTCTGCTCCCGTTCCTAGGAGACGACATGTGCATACTGCCGCAG GAAGTGGCCGCCGCGGAGCAGGCGGTCAGGGAGGGGGCGGCGCATAGGGTTGACTGGGCG GGCCTGATGTGGGGCCTCGTCGAGAAGGAGATCCTCGAGCTGCCTAAGAGGGAAGACGGG GTGTGCTACTACGGGCCTCATCTGCAGAGGCTCATTTATGCCCAAAAGCCACATTTGTTG GAGCTGGTGGAGGAAGGGGGCACAGGAGAGCCTGCTCCGGAGGCATCCACTGATGTGGAG ATGGAGGAGGATGGTGATGTGGATATGAAAAGCAAGAGCTTGGTGGAGCTGGAGCTGGGG GATAGGGATGGGGATGCCAGTAACGACGTGAGGAGCAAGAGCTTGGAGGAGTCGGAATTG GGAAATGCTAGTGCAAGGAGTGATGGTTTGGACGAGTTGGAATTGGGGGTTTCTGTTACT AGGAACAAGGTCATGGAGGAGTTGGGTTTAGGGGATATGGATGACAGGAACAACAGTATA GAGGAACTAGAGGTGGTTGAGGAAGATGCAAGGAGCAAGAGGTTGGATGAATATGAGTCT GTGGATGTGGATCCGGATGCCATGGATAACAATATAGATGAAATAAACACAGTCAATGAA GACTCAAGGAGGAAAAGCTTGAATGAATCTGAGACTGTGGATGTGGATCCGGATGCCATG GACAACAATATAGATGAAATGCAGGCGGTCAATGAAGACTCAAGGAGCAAGAGCTTGAAT GAATCTGAGGATGTGGATGTGGATCCGCATGCCATGGACAACAATATAGATGAAATGGAG ATGGTCAATGAAGATGCAAGGACCAAGAGCTTGGATGAATCTGAGGCTGTGGATGTGGAT CCGGATGCCATGGACAACAATATAGATGAAATGGAGGCAGTCAGTGAAGATTCAAGGAGC AAGACCTTCAATGAGTCTGAGTCTGTGGATGCCATGAACAACAATATAGTCGAATTGGAT GCGGTCAATGAAGACACAAGGAGCCAGAGATTGAATGATGAATCAGAGTTGGTGGAAGAG GATGTTAAGGGTCCAAACTTAGATGACAAGAACACTGCGGATGAGCATGTCAATGGCACA AACATTGATGGAATATGTTTGGGATTTGTGGCAGTTGAAGTGGTGCCTGCTGTACATGAG GCAAGGCTTGACAATAATGAGGAAACAGCAGAGGTAGCACCAATGGGGGGCGATGATGTG CCAGTGCCTACAGATGTGGATGGTGAAGAACCCTTGGTGGAGGCAGCAGCTGTAACACAG GAGGTAGTGGCTGTTGCAGAGGAATTGGGGGATGATGAGGCTGAGGAGGATGAAGAGAAG GATGCAATGGGATTGAGCTTGGGGTTTGACTCTACCAATGGTTATGTTGCTATGGATGTG GAAGAGGAAACTAATGTTGAGAATCTGGACGAGGATGAGAGTGACAGTGCCAATGAAGAG GCAGAGGAGTCAGAGGATGATGCATTTGAGGTTAATGATGGAGAGGACATGAATTGGAGA ATTGGGGATGGCAGGGGGGATGAGGGAATGTCACATTCTTTGCAACGCTGTAACACATTT GGAGGCATGGAGTTTGAGAACCTGAATGAAGGGGAGACTGTAATGAAGGATGAGTTGAGG TTTGATGATTTCCCTGCGAGGGCATCTTCAGAAAGGATGACACCATCAAACCTCCTCCAA GCCATGAACTCAATTCCCTCAACGTACAATGTAGCAGGGAATGTGCATGATCTGCCTTCT GGGGATTTCTTGGCTATGGGGGCTGATGCACATAAGAATGGAGTGGATCTGGGACCAGGG AGCTCATATTTATTTGGGAATAATGGTAAGAGGAATATTGATGATATTGATGGTTACGAT GACAATATGCAGGCGCAAGAGGACTTTCCTCAGTCTAATCAGCAGAAGAGGATGCGCCAT AGTAACAGTGGCAACATATCACCTGGATCAGGCTTTTTCAACGCAAGCTTTTCGGTACCT ATACAGAACTTGATGGTTGAGGCAAGCAGGCTCTATGAGCAGAAGGAGCAAAAACTTCAG AGTTTGCAATTTGAGAAACAACATTGGTCTGACATGCTGCAAGAGAAGGAAGCCATTATC CAATCCCTAAACTCAGCTCGGTTTGAGCAACAGAACAAGTATCAAGTGGAGCTTAGACGC TTCGAGCATGATCTGAATGTTATGGCCCATTTGGTAACTACCTACAAAAGAGCTTTAAAA CAGACCCGGGCTTCTTTTGATGAGTACAGGAAGAAGTTCCCTTGCAATGTTCCTCTTTAT GATGATGTTGCTGGTGGTGGTGGTCTTGTTCTTAGTGTGAGGGAGTTGGAGAAGAGGCGG TGTGAGGAGGAGCAGCAAAAAATTGCCATGGTAAATGATATGATCGAAAGATTCCAGTAC AAATGGTTCTCAAAGCTTGAAGAGTGGGGACTGTCTGTCAACTCACTGTGGAGCAGAATG GAAGGACTCTATAAGGAGATTGAGCTTCTGAAGGAAAATAGAAGATCAAGATTTGCTACC CCAGCTACAGAGGAATCTCTAGCTACAGAAGAACCTACCCCAGCTACAGAGGAATGA