Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Zea mays ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Zea mays

CDS Sequence

CDS ID	Zm00001d052072_T013
CDS Infomation	cds chromosome:B73_RefGen_v4:4:178596029:178607801:-1 gene:Zm00001d052072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Anaphase-promoting complex subunit 4
Sequence	ATGGTTGAAGTTGTCCGTGCTTCTGTATCTTTAATATCCAAACAATGGTCAAACGCCATG AGTTTATTCCATGAGAAATTTAGTGCCTTGCCCAATCTGATATCTACACATGGAGTGGAA TCTAGTTCTGAGGATGAGTTTCTTAGCCTTTTGTTTGGGACACGAACAAGTCCAGCCCTT CACCATTTTTTAGCTAGTTCACTTGGTGAAGCGGGTCTCAAGAGGATAGCCAAGGCTGTT GACAGTGCTGGAAGAGATATTCGTGGCATTATCACTGAGCATCTTCAGCCTGCAGTGGAG ATTATTTCATTCAGACTCGCAGAATTAAGAGGCCTTTCAAGATGGCGTTCACGATTTCAA ACTATCGGGTTAGATGGAAACCTTATTGATGGTGTAACTGAGAGTATAGGGATGCTAGTT GTTCAAGTGGAGCGCTTTTCAAGGGTGGCAGCCACTGTTGTTTATCTGTTTCAAAATTTC TTTGCCTGGGTTTTAAAGTCTGTTAGAATATTATTAAATGAACCTACCGACCAAGTTCCA GCAGCAAACAGTGAACTTGTGGTGATTTTTCTTAAGTTTCTTCTTGATAAGGATCCAATC AAACAACTACTTGAAGCAGATGAGAGAATTGAGTGTGATATGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Zm00001d052072_P013
PEP Infomation	pep chromosome:B73_RefGen_v4:4:178596029:178607801:-1 gene:Zm00001d052072 transcript:Zm00001d052072_T013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Anaphase-promoting complex subunit 4
Sequence	MVEVVRASVSLISKQWSNAMSLFHEKFSALPNLISTHGVESSSEDEFLSLLFGTRTSPAL HHFLASSLGEAGLKRIAKAVDSAGRDIRGIITEHLQPAVEIISFRLAELRGLSRWRSRFQ TIGLDGNLIDGVTESIGMLVVQVERFSRVAATVVYLFQNFFAWVLKSVRILLNEPTDQVP AANSELVVIFLKFLLDKDPIKQLLEADERIECDM

Transcript Sequence

Transcript ID	Zm00001d052072_T013
Transcript Infomation	cdna chromosome:B73_RefGen_v4:4:178596029:178607801:-1 gene:Zm00001d052072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Anaphase-promoting complex subunit 4
Sequence	AAAATCTTGTTGTCCAAAACCCTTCTCTACGCGTCTCGGTGCCTCGCCGGCTCGCCGCTC GCAATCGCCGGTTCGCCGTCGCCATTTGTCCCCTTCCCCCCCCTCGCGACCGCCCGCTTC GAGTGTCCCCCAAACAAAAAATCCCTCCCGCCTGCACGGCCCTCGCTGGACGCGGAGCAT GGCGGAGGAGCAGATCGAAGAGGCGTCCATGGCCGCGGCGGCGGCCACGCCGTTCCAGCT CCAGTTCGACAAGCCCATCCCGTTCCAGATAAAAATGGCAGAATGGAATCCAGAGAAGGA TCTGCTTGCTATGGTTACTGATGACTCCAAGGTTCTCCTCCATCGCTTCAATTGGCAAAG GCTTTGGACAATCTCTCCAGGGAAGTGCATCACATCAATTTGTTGGAGCCCTGATGGTAA AATAATAGCACTTGGCACAGAAGATGGTTTGATTCTTTTGCATGATGTGGAGGTGTGTAT CTGGATGATGATAAAAACTGTCAGTGCCTTTTGTGTCTTTGTATGAACATTCGTTTGTAC TTCATAGAAACCTGATCCAGTGCCTATCTTCTCTTAATATTTTTCTAATTGCTTATTCTC ATTTTTATATCATGCTTAAACCTTTATGAGCGAACTATTAGGAGACAATTAAGGGATACA GGCCTCAAGGACTTCTTGCCCAATTATGTTTTCGATAGAGGCATTTTAATACTTCTTGAA GATTATTGCGTATCAGCTATACTATTGTCAATTGTGTTTGACAGGCAGGACCACTTGATC ACATACAGTTGGGGATCTTGCAGCCACTGCTTGAACATCTGTGCAGATTCTCAAGACCTC ACTCTTCCATGATAAACTTCTCACAATATTTTATTGAAATGAAACTTTTCCAATGACGCT CCCTTAGTATCTTACTATCTTGCATCCTCTGCAAAGCTAGCTTGACCTGCTTCTAGCTAG CCACCTGCTGCCTGCATCAAAACAAACTTTACAATTTGACGCCATCACTCAACAAGTACT CTGTAATAAGTGTAATGTTTTTTTACCATCTTTCAATGGTTAATTTTCTTTATAAGCTTG AATGGCTAAAAAACAATTTGGTGGGAGAAATTTATCCAAAACTCCGCCGTAATGCTTAGG CACAGGTGATTGCTTGGCACTATAATCACACACACAGACACAAAGGGAAATGTATTGCAG TGTCATAATTTCTTTTTTTGCAGTTTCACTCAAATTGTTAGTACTAGTAGTGTATGTAAT CTTTCATACTCCCTTTCACCTTTAATTTGAAAACAAGACCAAATCTGCACAGCTTGCCAC TGTCAGTTAATTTTGAAATATAACAATATCTCATGTGTGTCAAGATCTACTTGTTACTTT TCTTTTACACTGTCACTTTGTGCATTTATAACTGAATAAAAATCTCATTGCAGAATGGGA AGATGCTAAGAACTACAAAATCCCACGATGTTGCCATTGTATCTTTGAATTGGGCAGAAG ACGATCCACTGTCAAAGGTATGCTATTGCCTTTGCGATATAAGTATCATATAATAACACA TGTGTAGTTACAAAAAATTTCAGTTGATTTACAAATTCAGCACTAATCAAAATTAGTTTA GGTCTCTACTAAAACTTCTCATTACTGATTCTTCTGCTAATTTATTCAGTCTGACAAGGA TGAGTTTTTATCCTATGAAGACCGCACCACACGTTTCTTTCCTCCTCCTCCTGTGATGCC TAGGATAGGTGGACTACGTTCTGGAGATACTGGTCTTGCGGATGAGAACGAAGAAGCTAT TCCAGAATTTTCTAGTGCTTCCTGTCAGCGTTTTAACATTCTGTGCAGTGGTGGCAAAGA TGGTTGTGTTTGCTTCAGCGTTTTTGGAATATTTCCTGTTGGAAAGATAGTAAGTAAATA CAGTAACTCACTTGTCCATAATTTGAACTCAACAAAAAATAGTCTGTCATGCATGCTCTC TCCTGCTTCAGCATTTCCTGTTATTGGTTCTGGGGACCTTTCTACCCTAACAGCTCCTCT GGAAATCTGTTCTACACAGAAATATTTTGTGAAGTTAATATGCTCATTTAAACAGAGCAA ATAGAAGTTGAGCACTAGCCTTTTAGGCTTGGCTATTGTTATTGGTGGTAGACCCACAGT ACATCTGTTTTCCGCAGAATCAACAAACTCTAGGTGTCATCTGTGTATCTGAACATGTAC AATTCATCTTTTCCATGTATTGACTAGCTGCTGGTGTAATATGAGAGAAGTTTCAGATAT TTTATGCATTTGCATATTTATTTACTTTCCTGTGTAATCTCACGCGTTGAACTTATGGGC ATTTCAGCAACCTTTGCCAACTTTTTTGTGTCATTTTGTATTTGTTCTTTGTCCAGTTCA ATGCTCTATGAACCAGTAGCTTTATGCCTTTGAAATTTCAGAACATAACTAAAATCCCAA TCAATGTTGGATCCTCTAGAAAGAGTTACCAACTCCAGGATGCTTCAGTCAGCAAGGTCT CTTTATCAAGAAACCTCCAGAAATTTGTTATTCTGTGCTTTGGAAAGTTGGTTGATACCG ACAACCTCTCTGACAGCTGCGAAAATTCTGGATTACATTGTCTCTACCTAGATACTTCTA TCTTCTTCAACCGGTAATAACATAACTGTTTCATTGATTGTACTTTCTTCCTTCCTTGTT CAGAAACCATATCTTGTTGTCTTGCTGCATGCTGAGTTTTATATTAAGATCCACGTTTAG TTCTAGAATTATCTATCTTTTCATGGGCCAACGATTCACTTTACACACTACAGTTAGGCT TTATAGAGAAGTGCAAAAATTCATTACTAAAAACATATCCAAAGTATTTCATTGATAAAC TTGTAAGGTTGTTAACTCTTGGTCTATGTATCAATTTATGGTTATTATTGTCATGTACTA AAATTTGTATGTATCATCCATAAATGCTGTAAAGAAAAAATGAGCTGCATCAGGTGTCCC AACAAGCATCAAGTATTCAAGATATGGTTGAAGTTGTCCGTGCTTCTGTATCTTTAATAT CCAAACAATGGTCAAACGCCATGAGTTTATTCCATGAGAAATTTAGTGCCTTGCCCAATC TGATATCTACACATGGAGTGGAATCTAGTTCTGAGGATGAGTTTCTTAGCCTTTTGTTTG GGACACGAACAAGTCCAGCCCTTCACCATTTTTTAGCTAGTTCACTTGGTGAAGCGGGTC TCAAGAGGATAGCCAAGGCTGTTGACAGTGCTGGAAGAGATATTCGTGGCATTATCACTG AGCATCTTCAGCCTGCAGTGGAGATTATTTCATTCAGACTCGCAGAATTAAGAGGCCTTT CAAGATGGCGTTCACGATTTCAAACTATCGGGTTAGATGGAAACCTTATTGATGGTGTAA CTGAGAGTATAGGGATGCTAGTTGTTCAAGTGGAGCGCTTTTCAAGGGTGGCAGCCACTG TTGTTTATCTGTTTCAAAATTTCTTTGCCTGGGTTTTAAAGTCTGTTAGAATATTATTAA ATGAACCTACCGACCAAGTTCCAGCAGCAAACAGTGAACTTGTGGTGATTTTTCTTAAGT TTCTTCTTGATAAGGATCCAATCAAACAACTACTTGAAGCAGATGAGAGAATTGAGTGTG ATATGTAAGTAACATTCTGTTGTATATTTTCTGTGTAAAAGTTAAAAAGTGTTATTAAGT TCTGTTCATTCATTTGTTTTTATATGATAACTTTTTCGAGGTGTGTCGTGTATGTTCTCT TGTCTTGCTGGATTCATTCCAGCTGTCTGTACTTTATCTCTCCTCTTCTATAATGATGAG CAGCTCTCCAGCTGGTTCGAGAGAAAAAGATATATGACACTATTGTCTAAACCAGCAAAA GTGATTAAAAGTCAATCACATGGAGCTGTTGTTTGTTCCTAAATGTGGTATTGCCATCAC TATTTAGTTTAAAAAAATCTCGACCTGTTAGGGTAACACAACCCTGGTTATTATATAAAG AAGACTTTCTCACACAGGTCGAGAAAACCCTCGAACTACCCCACTCTTACACAACGGCAT CATAGTTCATGTGAGAACGACCTCAACCGGGGCCCTGTGCTTTGGCGTGGACCGTGGAGC AAACGAGGGAAATTTTTTAAACCCAACCTAAAATTCGCTCCCACGAGAAGTTGAACTCAG GACCTAGGAAGTGCTACTCAGATCACCTAACCAACCCAGCTAGAGACCCTTTCGCTCATT ATTTAGTTTAACTGTTTTTAATTTGTGACGATGCTTTCATGGGTTCCCACATTTATTGTT TCTGTTCAACATGAGTTTTCAGGGATACTGCAAGACATGTAGAACAGCTAGTAGTTTTTG GAGGATTTACAGACACCCAATTTTTGGAAAAGAGTTTGGTAAATCAATTCAATGAATTGG AAGATAGCTTGAAGGAGGCTTTCTTGATGCCATTTACTGCTATCTCTTCGCAGATACAAT GTCAAGGATTGCTTCCTTTATATCCTGTTACATCATCAGCTACCTTGTCATCATCCTGCT CGCCAACATCAATATCATTTTATAAGGATGAAGATTCATCGCATGAGGAATCCTCCTATA GCTTGACTGACTATGTATGCTTGAAGATACCTGATGGATCATTAAATAAAGTAAATTGCA TCGGTGTGATAAAGGGCTCTGGTAACTGTTGTACTACCCTCAGCATGATGTCACTTTCAG GTTTTCTGTTGCATATACCTGACGGATATGAGTGTGTTGACCTGTCACTTTATAAGGACA ACCAGGTAGTTTTACTACTGAGTGAAACGTCTTGTTCTGATAGCCCTGGAAAATCTTGGA TGGTGATGCTGCAAATAGAGAACTTTTCCTTTATGCCACTCTCAGGAACATTCCCTGCAA ATATTTACAGTTTGCAAAAACTGGTGGTAACAATTCTTATTTCCCCTATGTTTGATCTCC TGGTATACACTTCATTTCATAGCAGCTCTATATAATCATTAACGATGTCTTCAAATTGGT GTACTGGCAACAACTTAGTTTTGTGCTATTTTATTGCTCGTTAGTAATCGCATGCGGAGG GCCCAGCAGAGCTCAGCAAAAAAACTGATCCAAGACGCCCTTGGTCTAGCCTGTCCATTC AAGTCCCTAGCATAGCCCGATCCTTCTTCTCTAAGGTGCTGATCTCTGAGGCGGGGAATG GGACCAACACCATGTGTTGGACAGATAAATGGATCCATGGCAAAAGGGTCTCAGATATTG CTCCCAAATTATTCAGCATTGTCCCAAAAAAAAATTATTAAAAGGACTGTGCAGCATGCT CTATTGAACAGACGATGGATTGCAGACATCAAAGGGGCTCTTACAGTTGGAGCCGTTGTA GATTATCTACACCTTTAGAATATCCTCGTAGATTTTGTGCTGCAGCCTAACACTGAGGAT AGACACATTTTCAGCTTATCATCGAATGGCAGATACTCTGCAAAGTCAGCTTATATTGGT TTTTTCTTTGGGTCTACCACCTTTGGGCACTATAAAAGGGTTTGGAGATCTTGGGCTCCT CCAAAGTGTTGTTTTTTCATTTAGTTGGTGGCACATAATAGATGTTAGACAACTGATAGC TTGGCAAAAAGGGGATTGAATCACCCTATCAGATGTCCTTTATGTGACCAGCAAGGTGAA ACCCTGAACCACTTGCTCGTGAATTATGTCTTCTCAAGAGTTTTCTGGTACAACCTGCTA AGAAAGTTTGGGCTGCATAGTTTAGCCCCACAGCCAGATACAGTTTCCTTTACGGATTGG TGGGAGATGGTATCAGAGACAACAAATAGTCTGGTCAGGGAAGGTCTTGACTTCCTCATC ATTTTAGGATCTTGGATGATTTGGAAGCATCACAATAGAGTCATTTTTTATGGAGGGTCT CCCAGCCTTCCTCTGATTATGGAGCATGCAGATGAGGAAAGAAGCTAGGAAATTGCTGGA GTCAAAGGTCTTTCCTTCTTGGCTGACCCCCTGCATAGGTTGTTGCTGTAGGGAGTGTGT GTGTTTTTATGGATCCTTTCGTGTACGAGTGTTACTGGCCTCCATAAGGAGTGCGTTATT TTTTTGGGTCTCTTAGATCCTTGTCTCCCTCTTTTTAATATATATCTAAAATGCAGTCCT CCTGCGTTTTTCGAGAAAAAAAATTGCTCGTTAGTAATTATGTTACTTGACCTTACCTTT TTTCTGTTAAATGGTACTAATATTTTTCTTCTTTCCTGTCACGCCACTTGCAGGCACTCG ATCTGCAATTGGACACAGATTATGGGAAAGTTCGTAGCATACCTCACACCGTATCTACTC CATTTGCAGTTAGTGCATCGAGAGGAGTAGCCTGTGTCTTTTCATCCCGGAGGCATGCCT TGGTTTATATCCTTGATGAGGATGAGGAAGCGGAGGGGGATGAAACTTCCGATATGGAGT GATTATTATCCGATTCCTTCACCTTCGGCTCAGCCATTTCAGCTTCAGGCTTCAGCATTG TCTTATGTCTTGTTGCAATGGAGGCAGAGGCCCGGAGATATCAATATGTACGGAAACGTC GTCTCATTTTCACGGCAATGCATGCCCGGGTTCAGAAGCTACGTCGCGTGGTAACAGCCT AACAGGTCACCACGCACGCGCAGCCGCTTTTAGAGCTCATGAAATTGTCAGTCGTCACCC TGATGTGTGTAGGCCCTGCAGGTTGGACTTCATCGTGGTTATTTGGAAAGCGAGCAAAAT TGTACACCCATTTCTGATCGTGTTGTGTTATACGAGTGCTTGCTAGTTGTGTAAAAAATC TAGAGGTAACGTCAACGTGCAAAAAAAAAGGGTCTGTCGCAAATCTTGACGGTCACTAGA GCTATCGCATTTCTAATCGTGTTTGTGTTATGTGGATTCATTATTTTATTGTTCGAGCTG CTAATGTACTTGGTAAAATACATTGTTGACT