Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Zea mays ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Zea mays

CDS Sequence

CDS ID	Zm00001d051214_T002
CDS Infomation	cds chromosome:B73_RefGen_v4:4:148918820:148925044:1 gene:Zm00001d051214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:nitrilase2 description: nitrilase2
Sequence	ATGAGCTTATATATAAATATGGAATTGTTGTCAACTATTTTCTCTACAGATAAAGCAGAG AGATTGATAGCAGAGGCTGCTGGGTATGGTTCACAGTTAGTTGTCTTTCCAGAAGCTTTT ATTGGAGGCTATCCTCGTGGATCCACATTTGGTTTCGGGATCAGTATTAGTATTATTAAT CCAAAAGACAAGGGAAAGGAAGCATTCCGGAGGTATCATGCATCTGCTATAGATGTGCCT GGTCCAGAAGTTACACGCTTGGCTGCTATGGCTGCAAAATATAAGGTTTTCTTGGTCATG GGGGTGATTGAAAGGGAAGGTTACACCCTTTATTGTTCCGTGCTTTTCTTTGACCCTCTT GGCCGTTACCTGGGTAAGCACCGGAAGCTCATGCCTACAGCATTAGAGAGAATTATATGG GGATTTGGGGATGGATCGACTATTCCAGTTTATGATACTCCACTTGGAAAGATTGGGGCG CTCATTTGCTGGGAAAATAAAATGCCACTTTTGAGGACAGCGCTGTATGGTAAAGGTATT GAGATATACTGTGCCCCCACTGCTGACTCCAGGCCTGTTTGGCAAGCCTCCATGACACAC ATTGCTTTGGAGGGGGGATGCTTTGTCTTGTCAGCAAACCAATTCTGCCGCAGAAAGGAC TATCCTCCCCCACCGGAGTATGAGTTTGCTGGTTTAGGTGAAGAGCCATCCGCGGACACT GTTGTTTGCCCTGGAGGCAGCGTTATCATTTCTCCATCTGGAGAAGTCTTGGCAGGTCCC AACTATGAAGGAGAGGCACTGATTACAGCCGACCTTGACCTGGGAGAGATTGTTCGAGCC AAGTTTGATTTCGACGTGGTGGGCCACTATTCTCGACCTGAAGTCCTTAGATTGGTAGTG AACGACCAACCGCAGCTCCCTGTGTCTTTCACGTCTGCCGCTGAGAGGACTCCAGCTGCC AAGAGTGATATCGATACTAAGTCTTACTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Zm00001d051214_P002
PEP Infomation	pep chromosome:B73_RefGen_v4:4:148918820:148925044:1 gene:Zm00001d051214 transcript:Zm00001d051214_T002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:nitrilase2 description: nitrilase2
Sequence	MSLYINMELLSTIFSTDKAERLIAEAAGYGSQLVVFPEAFIGGYPRGSTFGFGISISIIN PKDKGKEAFRRYHASAIDVPGPEVTRLAAMAAKYKVFLVMGVIEREGYTLYCSVLFFDPL GRYLGKHRKLMPTALERIIWGFGDGSTIPVYDTPLGKIGALICWENKMPLLRTALYGKGI EIYCAPTADSRPVWQASMTHIALEGGCFVLSANQFCRRKDYPPPPEYEFAGLGEEPSADT VVCPGGSVIISPSGEVLAGPNYEGEALITADLDLGEIVRAKFDFDVVGHYSRPEVLRLVV NDQPQLPVSFTSAAERTPAAKSDIDTKSY

Transcript Sequence

Transcript ID	Zm00001d051214_T002
Transcript Infomation	cdna chromosome:B73_RefGen_v4:4:148918820:148925044:1 gene:Zm00001d051214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:nitrilase2 description: nitrilase2
Sequence	GCTCAGGGTCCACTACTGATCCGCTCCACGCGAGCTCCCTTGTCCCCGCGTCACACTCGC GCCCAAGCAAGCGGTTGCTGCAAAGGAAGCCTCCCCTGATGGCTCTCGTGACCTCGGGCT CGGGTGCCGACCAGGTGATCGCCGAGGTGGCGATGAACGGCGGCGCCGACCCAAGTGCAA CCACCGTGCGTGCTACTGTCGTGCAGGCGTCCACCATCTTCCACGACACGCCCGCCACTC TTGGTGAGCACGCGCTCGTGTTCCAACCCCCTTCTCTGTTCTACGACTGCTATTCCGTCC GTGCGCGCCTACTCAAGTTGTTCGTCTGATTGCCTCTTACGCGCGCACGGAACTGGGATA TGACGGCGCGCCGCCGAATTGTGGCGCTCCTCGCCCAGTCGCCCTGCTAGCAGAGATGTA CTCTGTAGGAGCTAGCGTGAAGGCTTCCTATTCCCCTGCCTGTTTTTACTTACTATTTAT GAAAGAACAGCCAGCCAAAATGATTAGCCGGAATCACAATCAATCATTAAAGAAATTAAA AAGGGATTACAGAAAGTAAAAATCAAAGTCTTAAATGAAAGGATTTGGTTAGAACCGTAG TCCGTAGAAGGGTGGTAGAAACTTTCTATGGAATCATAAAAGGGTGGTACGATGCCGTTT GTCACAGATCCATTTCACTAGTGCAGCTCCATGAGCAGCTCTACCCGTGGAGTGGAAGCT GTTTTCGTGGCCATTTTGCCAAATGATTTAACATATGCAACTCCTTAGAACACTCAAAAT CCCATACAAGGAAAGGCCCAACCACGGCAAGAGCTGGGAGAAGCTACTATTTTAAGCTTC ATCTTCCATCCACCACATGTGACAGCGCACATTAAGGAGCTCCTTAGGTGGAGCTGTTTT ATTTTTTCCTGTTTGGCACAAAACACCTCTAGACAGCTCCTAGAGCTCCAAACATGTAGT TTCTTCTAAAACACTCTGGATTCGTTTCTATTATATTACCTTGAATCTACATAGAATTGA TTAGTAGATTAAAATAGTAGTCTACTTTGACTTTTTTTTCACTGCATCCACTTAATTTCA ATAAATTCAAATTAAAATAATAAAAAATTTAAAAGTAATTCTTCATTGAAATAATCCATG AAGAGGGAGAAAATCAATACGAGAATAGATTATATAGTAAAAAGGAAAAAACTGGCAATC TCTCTGCTTCTTCTAGCTAATTACTTTCAAAACTTAACAGCTAATTTCAACATTAAGGCT ATCATAGATTCATGAGTAGGAAAGCTGTTTGTTCAATTTCATACATTTCATTGGAGGATC TTTAAGCAGAAAACACAATGCTTGAGTTTAACTAAAGCAAGTGTCACCTGTCTAAATTTG GAGGATTTTGCCGGAGGTAGGGATAGTGTTGTTGTAGATGTATTTGACGTGCAGTATGGT GTGGGCTACGTTGGTGGAGTTGCTGACTGCGTAGATGTGGACGCCGAGGTAGTCTGATGA CATCCTAGATGCATCTGTAGAAAAAAAATTAGGGTAGTTTGGATGTTAGATTTGGTGGGT GTTTCTATTGTTGCTCCTCTTTCGGCTTTGGTTGGCACCTTTGATGCATTGTTCTCTATT TATCAATGGAGAACTTTGGTGTCGTGCAAAAATTCTATGCAGTTCTTTTCTCCAATGATC GAGTGCTGGTGTAGATGGCATTGGTGGTGGAGTCCTTGCTGGTGTATATGTTGTCAACGT CGAGTTTAGTCTGTTGATCGATGTGCAACCGTTCTTGACGATGTTGTAGAAGTTGTTCCC ATTTGAAGACACCCTAATCTGTCTCTAGCAGCTTACCCGTCCTATCTGGCCATCTCTCAT GTCATCTCTTGTTTTAAACTTTACTCTGTGAACAATACAGTGTACAATGTTTTACACGAC CATATGCGCAACCTGCTGTAGACAGCCTAAATGCATCCGTAGAAAAATTAGGTATAGTTT GGATGTCGAATGCACTGCTTGGTGGAGTTGTTGGTAGGGGAACGATGATGGGCGCCTCAG GCACCTTGTTCTTGGATTGGTTTGAATCTGTTGTTGGGTAACCTTGGTAGCATGTCGAAC TCTTGTCCAATTCCCTCGTTCATCGATCATAGATGTTGCTGAAGCTTAGTGGTGGACCGA AACATGGCTCTGTATACCAAGTTGTCACCCTCCTAAATTTGGGGGTACGTGGGAGGGATA GAATTGAGGGAATTATTGAGGGATTAGAGGGGAGGAATCGCGACCCTAGGACTGGCTGCA CCTTAGAGAAGGAGAGGGAACGACGGCGGCAGGGTGTTGCAGTCGAGGTTTTAAAGTCGG CTAGTCGACTCTAGTCGCCTGAGCACTGATAAGGTGACTAATCACGATTAGTCATCGATT TGCTCGATTAGTCGAGCCTAGTCGACTTCTAGTTGTCCACCTATAACAGGACCATGTGTG TGTGTGTGTATCAATATATATAGCTGTAGCAGGACTGCAGGACAACAATACACTATAGCT ATAGCAGGAGAGCGGTATTACTATATTGCAGATCAACAGATCTATTGGTATATCACAATG TAAATGTACAAGCATTTTTTCACTAAAAGTAAAAGGTAAAGATCACTTACCTTGGATTAT ACAGCAGCACACTGATTTCAACTCAAGGAATTATTAAATTGCCAAACTTGTAGGGTGCTG TCAGTGACTATAACATGAGGTCAGGACTTCAGGAGCATATGTAGAGGGCCGCCGGAGCAT AGCAGGGCGGCAGGAGAGGAGGGCGACGGCGATGGAGAAGGGCAGGACGGCTGCGATGGA GAAGGGGCATCGGTGCTGGAGAAGGGTGCATGCTCGAATGTGCGCTGCGTAATGTGTGTA CCGTAATGGTACAATTAATGCAGAAAAGTGTTTGTGTTGTACAGATAGTGGGCCGACCCA TGTAATGGAGACCGGATTAGTGGCCCAAAACAGGCATAACTAGTCGACCATTACCCTTAG TCGGACGACTAATCACGATTAGTCGGCGACTAGGACGACTAATCGCTTCCTAGTCGTTCT AGTCGAGTCGGAGACCCTAATCGAGCTCGCTCTAGCGGTAAGGCCGACTAATCACGATTA GTCGGACGACTTTAAAACCTTGGTTGCAGTCGGCCTGGCATGCGGTGGGTGGTATGGTCA CCACGGTTGGGGGTGGTGGCAGTGCGGTGGGCGGCACGACATGGTGGCTAGGGGTGGGTG ATGACACGTGGGCATGGTACCGACGGCAGCTAGGGTTGGCGGCGGGCATGCACAAGGAGA GAGAGGCAAGGCTAGATGGATGAAGAGAGACAAAGGAGAGAAGCGATTAGTACATTCTAC TACTACTTATCAGTTGTACAATCTTAAAAATTATAGGTAAAATAACACATCAGGTAAGGT AACAAAATTCTAGTTAAAAAATACATCTTTCTATTATGTTTTTCTCAAGTTATATCTTTC TATTGTATAATTCTACACGAGTAGATAAAATAAATATAATATAAATCATTAGTTTTATGA GCAATGTCCCATTTTATCTTTAATGCAAACAATTAGCACTTGTCTGAAATGAAAAAATAT TAAAGATGGTGTATAGTTTTTTAAGCCAACATCAAGTCTAATATTTTTAAACTGGTATTA ATGTTTGATATTATTATCCTTTTTTTTTGCCGACACTTATAGACTGCACCCCCCTATATC TGAATTCTGGTTTCGCCCCTGCCTAGATTATTCTTGTTTAATCTCAATAGATATATATCT ACTTATATTTATAGGGAGGACCTGACTCAACTTGAATTCCAAGTAATCCTATCTTCTGAA CTCTTGCATAACTTGTTGAAAGAAACTGCAGACAGTGTAATCCTATGAAATAAAGTTCTA TCAATCCAAATAAAATTTTCAAAAAAAAAAGCATTGCAGTTATGCTTTCTAGGCTTACCA TTCTAGTGAACTGTGTTCTGGATAAAGTTTTGGAATTCCATGTTCACCACATTCAGTCAA TGCCATTGCCCAGGAGGCCAGGAGAGGAACATGATGAATGATTTTCTAGTTTTATTTGGA TATGTATGAACTATTAATATTGTTGAGAGGGCAAGACACATTTCAATGAGCTTATATATA AATATGGAATTGTTGTCAACTATTTTCTCTACAGATAAAGCAGAGAGATTGATAGCAGAG GCTGCTGGGTATGGTTCACAGTTAGTTGTCTTTCCAGAAGCTTTTATTGGAGGCTATCCT CGTGGATCCACATTTGGTTTCGGGATCAGTATTAGTATTATTAATCCAAAAGACAAGGGA AAGGAAGCATTCCGGAGGTATCATGCATCTGCTATAGATGTGCCTGGTCCAGAAGTTACA CGCTTGGCTGCTATGGCTGCAAAATATAAGGTTTTCTTGGTCATGGGGGTGATTGAAAGG GAAGGTTACACCCTTTATTGTTCCGTGCTTTTCTTTGACCCTCTTGGCCGTTACCTGGGT AAGCACCGGAAGCTCATGCCTACAGCATTAGAGAGAATTATATGGGGATTTGGGGATGGA TCGACTATTCCAGTTTATGATACTCCACTTGGAAAGATTGGGGCGCTCATTTGCTGGGAA AATAAAATGCCACTTTTGAGGACAGCGCTGTATGGTAAAGGTATTGAGATATACTGTGCC CCCACTGCTGACTCCAGGCCTGTTTGGCAAGCCTCCATGACACACATTGCTTTGGAGGGG GGATGCTTTGTCTTGTCAGCAAACCAATTCTGCCGCAGAAAGGACTATCCTCCCCCACCG GAGTATGAGTTTGCTGGTTTAGGTGAAGAGCCATCCGCGGACACTGTTGTTTGCCCTGGA GGCAGCGTTATCATTTCTCCATCTGGAGAAGTCTTGGCAGGTCCCAACTATGAAGGAGAG GCACTGATTACAGCCGACCTTGACCTGGGAGAGATTGTTCGAGCCAAGTTTGATTTCGAC GTGGTGGGCCACTATTCTCGACCTGAAGTCCTTAGATTGGTAGTGAACGACCAACCGCAG CTCCCTGTGTCTTTCACGTCTGCCGCTGAGAGGACTCCAGCTGCCAAGAGTGATATCGAT ACTAAGTCTTACTGATTGACTGGTCATGAAACTGTGTTGCGCCGAACACTTGGTGATGGT CGCTCAGCTCCTCTAGTTTGCTGTTGTGTCTCGTGGATGGGAGTTGGGAGTTGTAGCTTT GAACTAAAAAAAAAACTCTTGCCTTCCCAACGTAAAAAAATGGTGGCCGCAGTTATGTTC CTTGTGAAAGCTGTTCGCTTGGCTTTAATCTAAAACTGTTTCTACTTTTTCT